MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 2318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009957	GCC	2	6	53233	53238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046529
1002	NC_009957	GCC	2	6	53246	53251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046529
1003	NC_009957	GTC	2	6	53320	53325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046529
1004	NC_009957	CAGC	2	8	53429	53436	25 %	0 %	25 %	50 %	159046529
1005	NC_009957	AC	3	6	53447	53452	50 %	0 %	0 %	50 %	159046529
1006	NC_009957	TCT	2	6	53480	53485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046529
1007	NC_009957	GAA	2	6	54156	54161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046530
1008	NC_009957	ATCGGT	2	12	54234	54245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046530
1009	NC_009957	TGGT	2	8	54274	54281	0 %	50 %	50 %	0 %	159046530
1010	NC_009957	ATC	2	6	54941	54946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046531
1011	NC_009957	GCC	2	6	54981	54986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046531
1012	NC_009957	CGGG	2	8	55073	55080	0 %	0 %	75 %	25 %	159046531
1013	NC_009957	CGC	3	9	55112	55120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046531
1014	NC_009957	GCAAC	2	10	55351	55360	40 %	0 %	20 %	40 %	159046531
1015	NC_009957	CGATGT	2	12	55381	55392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046531
1016	NC_009957	CGA	2	6	55468	55473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046531
1017	NC_009957	TTCC	2	8	55552	55559	0 %	50 %	0 %	50 %	159046531
1018	NC_009957	GC	3	6	55614	55619	0 %	0 %	50 %	50 %	159046531
1019	NC_009957	GC	5	10	55640	55649	0 %	0 %	50 %	50 %	159046531
1020	NC_009957	TCG	2	6	55653	55658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046531
1021	NC_009957	GC	3	6	55703	55708	0 %	0 %	50 %	50 %	159046531
1022	NC_009957	CGT	2	6	55774	55779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046531
1023	NC_009957	AGA	2	6	55785	55790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046531
1024	NC_009957	TGC	2	6	55822	55827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046531
1025	NC_009957	CTT	2	6	55988	55993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046532
1026	NC_009957	GCC	2	6	56069	56074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046532
1027	NC_009957	CGC	2	6	56093	56098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046532
1028	NC_009957	GTC	2	6	56105	56110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046532
1029	NC_009957	TCG	2	6	56118	56123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046532
1030	NC_009957	GCC	2	6	56139	56144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046532
1031	NC_009957	GC	3	6	56174	56179	0 %	0 %	50 %	50 %	159046532
1032	NC_009957	CGG	2	6	56386	56391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046532
1033	NC_009957	TGC	2	6	56403	56408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046532
1034	NC_009957	CAG	2	6	56411	56416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046532
1035	NC_009957	CGG	2	6	56473	56478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046532
1036	NC_009957	CCG	3	9	56518	56526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046532
1037	NC_009957	TCA	2	6	56533	56538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046532
1038	NC_009957	CGA	2	6	56551	56556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046532
1039	NC_009957	GC	3	6	56576	56581	0 %	0 %	50 %	50 %	159046532
1040	NC_009957	CGT	2	6	56620	56625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046532
1041	NC_009957	GC	3	6	56638	56643	0 %	0 %	50 %	50 %	159046532
1042	NC_009957	CGG	2	6	56653	56658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046532
1043	NC_009957	CCT	2	6	56668	56673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046532
1044	NC_009957	GCG	2	6	56690	56695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046532
1045	NC_009957	GAT	2	6	56792	56797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046532
1046	NC_009957	CGGT	2	8	56799	56806	0 %	25 %	50 %	25 %	159046532
1047	NC_009957	TCT	2	6	56817	56822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046532
1048	NC_009957	GCC	2	6	57698	57703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046533
1049	NC_009957	GGC	2	6	57874	57879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046533
1050	NC_009957	CTT	2	6	58004	58009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046533
1051	NC_009957	CGGA	2	8	58020	58027	25 %	0 %	50 %	25 %	159046533
1052	NC_009957	GAAG	2	8	58049	58056	50 %	0 %	50 %	0 %	159046533
1053	NC_009957	GCCC	2	8	58093	58100	0 %	0 %	25 %	75 %	159046533
1054	NC_009957	GGC	2	6	58165	58170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046533
1055	NC_009957	GCCG	2	8	58184	58191	0 %	0 %	50 %	50 %	159046533
1056	NC_009957	AGG	2	6	58192	58197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046533
1057	NC_009957	TGC	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046534
1058	NC_009957	GCC	2	6	58363	58368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046534
1059	NC_009957	GACC	2	8	58485	58492	25 %	0 %	25 %	50 %	159046534
1060	NC_009957	ACC	2	6	58615	58620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046534
1061	NC_009957	GCA	2	6	58649	58654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046534
1062	NC_009957	ACG	2	6	58698	58703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046534
1063	NC_009957	GACTC	2	10	58705	58714	20 %	20 %	20 %	40 %	159046534
1064	NC_009957	GCT	2	6	58789	58794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046534
1065	NC_009957	GCC	2	6	58913	58918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046535
1066	NC_009957	GGC	3	9	58945	58953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1067	NC_009957	GCG	2	6	59012	59017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1068	NC_009957	TGG	2	6	59061	59066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046535
1069	NC_009957	CGGG	2	8	59079	59086	0 %	0 %	75 %	25 %	159046535
1070	NC_009957	CGG	2	6	59122	59127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1071	NC_009957	CT	3	6	59181	59186	0 %	50 %	0 %	50 %	159046535
1072	NC_009957	CGCC	2	8	59227	59234	0 %	0 %	25 %	75 %	159046535
1073	NC_009957	GGC	3	9	59237	59245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1074	NC_009957	GCG	2	6	59261	59266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1075	NC_009957	AGG	2	6	59268	59273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046535
1076	NC_009957	CG	3	6	59278	59283	0 %	0 %	50 %	50 %	159046535
1077	NC_009957	CG	3	6	59389	59394	0 %	0 %	50 %	50 %	159046535
1078	NC_009957	TGC	2	6	59415	59420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046535
1079	NC_009957	ATGTC	2	10	59529	59538	20 %	40 %	20 %	20 %	159046535
1080	NC_009957	GCA	2	6	59568	59573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046535
1081	NC_009957	CAT	2	6	59585	59590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046535
1082	NC_009957	CGG	2	6	59600	59605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1083	NC_009957	TCG	2	6	59757	59762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046535
1084	NC_009957	CGG	2	6	59797	59802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1085	NC_009957	CCTG	2	8	59890	59897	0 %	25 %	25 %	50 %	159046535
1086	NC_009957	CCA	2	6	59898	59903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046535
1087	NC_009957	CGC	2	6	59938	59943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046535
1088	NC_009957	GCG	2	6	59951	59956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1089	NC_009957	ATC	3	9	59993	60001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046535
1090	NC_009957	CAC	2	6	60019	60024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046535
1091	NC_009957	TCC	2	6	60049	60054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046535
1092	NC_009957	GGC	2	6	60069	60074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046535
1093	NC_009957	TGCG	2	8	60093	60100	0 %	25 %	50 %	25 %	159046535
1094	NC_009957	TGG	2	6	60128	60133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046535
1095	NC_009957	CGA	2	6	60136	60141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046535
1096	NC_009957	GGCTCT	2	12	60201	60212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046535
1097	NC_009957	GAG	2	6	60340	60345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046536
1098	NC_009957	GCCATC	2	12	60379	60390	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046536
1099	NC_009957	ACCG	2	8	60391	60398	25 %	0 %	25 %	50 %	159046536
1100	NC_009957	GTG	2	6	60415	60420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046536
1101	NC_009957	GAG	2	6	60460	60465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046536
1102	NC_009957	AGCG	2	8	60474	60481	25 %	0 %	50 %	25 %	159046536
1103	NC_009957	GCC	2	6	60536	60541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1104	NC_009957	GCA	2	6	60549	60554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046536
1105	NC_009957	CCG	2	6	60583	60588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1106	NC_009957	CCG	2	6	60665	60670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1107	NC_009957	GCG	2	6	60717	60722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046536
1108	NC_009957	GCC	2	6	60798	60803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1109	NC_009957	CCCGG	2	10	60819	60828	0 %	0 %	40 %	60 %	159046536
1110	NC_009957	TGC	2	6	60854	60859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046536
1111	NC_009957	C	6	6	60893	60898	0 %	0 %	0 %	100 %	159046536
1112	NC_009957	TGA	2	6	60986	60991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046536
1113	NC_009957	CCTG	2	8	61031	61038	0 %	25 %	25 %	50 %	159046536
1114	NC_009957	CGG	2	6	61142	61147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046536
1115	NC_009957	CGG	2	6	61153	61158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046536
1116	NC_009957	CGA	2	6	61218	61223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046536
1117	NC_009957	GCC	2	6	61302	61307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1118	NC_009957	CG	3	6	61404	61409	0 %	0 %	50 %	50 %	159046536
1119	NC_009957	GCC	2	6	61444	61449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1120	NC_009957	GTC	2	6	61456	61461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046536
1121	NC_009957	C	6	6	61489	61494	0 %	0 %	0 %	100 %	159046536
1122	NC_009957	GCC	2	6	61545	61550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1123	NC_009957	GCG	2	6	61578	61583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046536
1124	NC_009957	CGC	2	6	61668	61673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046536
1125	NC_009957	GTC	2	6	61749	61754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046536
1126	NC_009957	GGC	2	6	61821	61826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046536
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