MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 3165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009956	GTC	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046352
502	NC_009956	GCG	2	6	20210	20215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
503	NC_009956	GCA	2	6	20351	20356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046352
504	NC_009956	TGT	2	6	20360	20365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046352
505	NC_009956	CCG	2	6	20377	20382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
506	NC_009956	ATG	2	6	20443	20448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046352
507	NC_009956	GGGC	2	8	20463	20470	0 %	0 %	75 %	25 %	159046352
508	NC_009956	CCA	2	6	20486	20491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046352
509	NC_009956	CCA	2	6	20660	20665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046352
510	NC_009956	GCC	2	6	20755	20760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
511	NC_009956	CG	3	6	20863	20868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046352
512	NC_009956	CAG	2	6	20877	20882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046352
513	NC_009956	CG	3	6	20903	20908	0 %	0 %	50 %	50 %	159046352
514	NC_009956	GAT	2	6	20940	20945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046352
515	NC_009956	CAC	2	6	20985	20990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046352
516	NC_009956	CGG	2	6	21005	21010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
517	NC_009956	GGC	2	6	21057	21062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
518	NC_009956	TG	3	6	21073	21078	0 %	50 %	50 %	0 %	159046352
519	NC_009956	CCG	2	6	21089	21094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
520	NC_009956	GCG	2	6	21128	21133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
521	NC_009956	GGAT	2	8	21187	21194	25 %	25 %	50 %	0 %	159046352
522	NC_009956	GCGGA	2	10	21202	21211	20 %	0 %	60 %	20 %	159046352
523	NC_009956	CCG	2	6	21228	21233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
524	NC_009956	GCT	2	6	21320	21325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046352
525	NC_009956	CGC	2	6	21453	21458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
526	NC_009956	CGG	2	6	21538	21543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046353
527	NC_009956	GCA	2	6	21544	21549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046353
528	NC_009956	CG	3	6	21594	21599	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
529	NC_009956	CGC	3	9	21617	21625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046353
530	NC_009956	CTC	2	6	21659	21664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046353
531	NC_009956	AGC	2	6	21681	21686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046353
532	NC_009956	CTTCG	2	10	21725	21734	0 %	40 %	20 %	40 %	159046353
533	NC_009956	CG	3	6	21746	21751	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
534	NC_009956	CAG	2	6	21827	21832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046353
535	NC_009956	AG	3	6	21849	21854	50 %	0 %	50 %	0 %	159046353
536	NC_009956	CG	3	6	21879	21884	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
537	NC_009956	GCC	2	6	21898	21903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046353
538	NC_009956	CGA	2	6	22150	22155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046354
539	NC_009956	CCG	2	6	22182	22187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046354
540	NC_009956	ATC	2	6	22211	22216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046354
541	NC_009956	TGCGG	2	10	22339	22348	0 %	20 %	60 %	20 %	159046354
542	NC_009956	CGGGG	2	10	22369	22378	0 %	0 %	80 %	20 %	159046354
543	NC_009956	ATC	2	6	22382	22387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046354
544	NC_009956	CCGC	2	8	22398	22405	0 %	0 %	25 %	75 %	159046354
545	NC_009956	AGG	2	6	22428	22433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046354
546	NC_009956	CCG	2	6	22549	22554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046354
547	NC_009956	GC	3	6	22576	22581	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
548	NC_009956	CCG	2	6	22587	22592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046354
549	NC_009956	CGA	2	6	22615	22620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046354
550	NC_009956	TCG	2	6	22644	22649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046354
551	NC_009956	GCG	2	6	22671	22676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
552	NC_009956	GCG	2	6	22752	22757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
553	NC_009956	AGG	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046354
554	NC_009956	GC	3	6	22786	22791	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
555	NC_009956	TCG	2	6	22812	22817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046354
556	NC_009956	CGG	2	6	22833	22838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
557	NC_009956	GC	3	6	22850	22855	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
558	NC_009956	GGC	2	6	22856	22861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
559	NC_009956	AGG	2	6	22869	22874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046354
560	NC_009956	GC	3	6	22888	22893	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
561	NC_009956	TGCC	2	8	22937	22944	0 %	25 %	25 %	50 %	159046354
562	NC_009956	CGA	2	6	22966	22971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046354
563	NC_009956	TGC	2	6	23078	23083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
564	NC_009956	CGCGC	2	10	23148	23157	0 %	0 %	40 %	60 %	159046355
565	NC_009956	GTG	2	6	23170	23175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046355
566	NC_009956	CGG	3	9	23178	23186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
567	NC_009956	GGC	2	6	23219	23224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
568	NC_009956	TGC	3	9	23237	23245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
569	NC_009956	CGA	2	6	23247	23252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046355
570	NC_009956	CGC	2	6	23313	23318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
571	NC_009956	GC	3	6	23317	23322	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
572	NC_009956	GTG	2	6	23356	23361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046355
573	NC_009956	GAC	2	6	23386	23391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046355
574	NC_009956	CTG	2	6	23413	23418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
575	NC_009956	GGCC	2	8	23424	23431	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
576	NC_009956	TCA	2	6	23447	23452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046355
577	NC_009956	CGC	2	6	23577	23582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
578	NC_009956	CGC	2	6	23657	23662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
579	NC_009956	CGA	2	6	23742	23747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046355
580	NC_009956	CCGA	2	8	23752	23759	25 %	0 %	25 %	50 %	159046355
581	NC_009956	CTGGTT	2	12	23763	23774	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	159046355
582	NC_009956	CTG	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
583	NC_009956	CCG	2	6	23898	23903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
584	NC_009956	GCC	2	6	23975	23980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
585	NC_009956	CCA	2	6	23997	24002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046355
586	NC_009956	GC	4	8	24050	24057	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
587	NC_009956	TCA	2	6	24215	24220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046355
588	NC_009956	GTCA	2	8	24235	24242	25 %	25 %	25 %	25 %	159046355
589	NC_009956	TGC	2	6	24260	24265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
590	NC_009956	GGC	2	6	24311	24316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
591	NC_009956	GT	3	6	24327	24332	0 %	50 %	50 %	0 %	159046355
592	NC_009956	CGC	2	6	24344	24349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
593	NC_009956	CGG	2	6	24372	24377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
594	NC_009956	GC	3	6	24382	24387	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
595	NC_009956	C	6	6	24416	24421	0 %	0 %	0 %	100 %	159046355
596	NC_009956	CTG	2	6	24436	24441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
597	NC_009956	CTG	2	6	24466	24471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
598	NC_009956	CG	3	6	24570	24575	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
599	NC_009956	CCG	2	6	24587	24592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
600	NC_009956	GCC	2	6	24631	24636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
601	NC_009956	GCC	2	6	24670	24675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
602	NC_009956	ACC	2	6	24679	24684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046355
603	NC_009956	CGC	2	6	24755	24760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046356
604	NC_009956	CGC	2	6	24767	24772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046356
605	NC_009956	GCC	2	6	24801	24806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046356
606	NC_009956	GCC	2	6	24867	24872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046356
607	NC_009956	CGC	2	6	25099	25104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
608	NC_009956	GC	3	6	25127	25132	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
609	NC_009956	CGA	2	6	25159	25164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046357
610	NC_009956	GCC	2	6	25178	25183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
611	NC_009956	CG	3	6	25213	25218	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
612	NC_009956	GCC	2	6	25223	25228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
613	NC_009956	GAG	2	6	25247	25252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046357
614	NC_009956	CG	4	8	25312	25319	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
615	NC_009956	CGG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046357
616	NC_009956	CG	3	6	25376	25381	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
617	NC_009956	CGC	2	6	25420	25425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
618	NC_009956	ACC	2	6	25439	25444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046357
619	NC_009956	CCG	2	6	25509	25514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
620	NC_009956	CGC	3	9	25522	25530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
621	NC_009956	CGC	2	6	25564	25569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
622	NC_009956	GCC	3	9	25589	25597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
623	NC_009956	CGA	2	6	25618	25623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046357
624	NC_009956	CCCG	2	8	25689	25696	0 %	0 %	25 %	75 %	159046357
625	NC_009956	GCC	2	6	25706	25711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046357
626	NC_009956	CGG	2	6	25758	25763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046357
627	NC_009956	GCG	2	6	25773	25778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046357
628	NC_009956	ACG	2	6	25782	25787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046357
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746	NC_009956	CG	3	6	30845	30850	0 %	0 %	50 %	50 %	159046364
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750	NC_009956	GAT	2	6	30948	30953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046364
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752	NC_009956	CCT	2	6	31085	31090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046364
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