MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009955	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	159046137
2	NC_009955	A	6	6	4533	4538	100 %	0 %	0 %	0 %	159046141
3	NC_009955	G	7	7	6660	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
4	NC_009955	G	6	6	6939	6944	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
5	NC_009955	T	7	7	8051	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	159046145
6	NC_009955	A	6	6	11759	11764	100 %	0 %	0 %	0 %	159046147
7	NC_009955	T	6	6	14941	14946	0 %	100 %	0 %	0 %	159046151
8	NC_009955	G	6	6	25501	25506	0 %	0 %	100 %	0 %	159046165
9	NC_009955	T	6	6	28815	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	159046170
10	NC_009955	A	6	6	34427	34432	100 %	0 %	0 %	0 %	159046174
11	NC_009955	A	7	7	47989	47995	100 %	0 %	0 %	0 %	159046190
12	NC_009955	A	6	6	54567	54572	100 %	0 %	0 %	0 %	159046196
13	NC_009955	T	6	6	55557	55562	0 %	100 %	0 %	0 %	159046197
14	NC_009955	C	6	6	55703	55708	0 %	0 %	0 %	100 %	159046197
15	NC_009955	C	6	6	55710	55715	0 %	0 %	0 %	100 %	159046197
16	NC_009955	G	6	6	67606	67611	0 %	0 %	100 %	0 %	159046207
17	NC_009955	T	6	6	68759	68764	0 %	100 %	0 %	0 %	159046209
18	NC_009955	T	6	6	69826	69831	0 %	100 %	0 %	0 %	159046210
19	NC_009955	C	6	6	71683	71688	0 %	0 %	0 %	100 %	159046212
20	NC_009955	T	6	6	71738	71743	0 %	100 %	0 %	0 %	159046212
21	NC_009955	T	6	6	73927	73932	0 %	100 %	0 %	0 %	159046214
22	NC_009955	C	7	7	74730	74736	0 %	0 %	0 %	100 %	159046215
23	NC_009955	T	6	6	77848	77853	0 %	100 %	0 %	0 %	159046217
24	NC_009955	T	6	6	78024	78029	0 %	100 %	0 %	0 %	159046218
25	NC_009955	A	6	6	89391	89396	100 %	0 %	0 %	0 %	159046226
26	NC_009955	G	6	6	90118	90123	0 %	0 %	100 %	0 %	159046226
27	NC_009955	G	6	6	90491	90496	0 %	0 %	100 %	0 %	159046227
28	NC_009955	C	6	6	92464	92469	0 %	0 %	0 %	100 %	159046230
29	NC_009955	A	7	7	92481	92487	100 %	0 %	0 %	0 %	159046230
30	NC_009955	G	6	6	98416	98421	0 %	0 %	100 %	0 %	159046237
31	NC_009955	A	6	6	103465	103470	100 %	0 %	0 %	0 %	159046240
32	NC_009955	C	6	6	104562	104567	0 %	0 %	0 %	100 %	159046241
33	NC_009955	C	6	6	115184	115189	0 %	0 %	0 %	100 %	159046249
34	NC_009955	T	6	6	124539	124544	0 %	100 %	0 %	0 %	159046258
35	NC_009955	T	6	6	127513	127518	0 %	100 %	0 %	0 %	159046259
36	NC_009955	G	6	6	127591	127596	0 %	0 %	100 %	0 %	159046259
37	NC_009955	G	6	6	133561	133566	0 %	0 %	100 %	0 %	159046266
38	NC_009955	C	6	6	138526	138531	0 %	0 %	0 %	100 %	159046272
39	NC_009955	G	6	6	140905	140910	0 %	0 %	100 %	0 %	159046273
40	NC_009955	G	6	6	147568	147573	0 %	0 %	100 %	0 %	159046280
41	NC_009955	G	6	6	155883	155888	0 %	0 %	100 %	0 %	159046287
42	NC_009955	T	6	6	157683	157688	0 %	100 %	0 %	0 %	159046290
43	NC_009955	T	6	6	161664	161669	0 %	100 %	0 %	0 %	159046296
44	NC_009955	G	6	6	161983	161988	0 %	0 %	100 %	0 %	159046296
45	NC_009955	A	7	7	164747	164753	100 %	0 %	0 %	0 %	159046300
46	NC_009955	G	6	6	165465	165470	0 %	0 %	100 %	0 %	159046302
47	NC_009955	A	6	6	168906	168911	100 %	0 %	0 %	0 %	159046307
48	NC_009955	G	6	6	170579	170584	0 %	0 %	100 %	0 %	159046310
49	NC_009955	T	6	6	175787	175792	0 %	100 %	0 %	0 %	159046315
50	NC_009955	A	7	7	180557	180563	100 %	0 %	0 %	0 %	159046319
51	NC_009955	G	6	6	181185	181190	0 %	0 %	100 %	0 %	159046320
52	NC_009955	G	6	6	185478	185483	0 %	0 %	100 %	0 %	159046325

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.