MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009955	CGTGG	2	10	26853	26862	0 %	20 %	60 %	20 %	159046167
502	NC_009955	AG	3	6	26908	26913	50 %	0 %	50 %	0 %	159046167
503	NC_009955	CGT	2	6	26915	26920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046167
504	NC_009955	TCC	2	6	26956	26961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046167
505	NC_009955	CGC	2	6	27078	27083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
506	NC_009955	CCG	2	6	27086	27091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
507	NC_009955	GCC	2	6	27101	27106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
508	NC_009955	ACC	2	6	27130	27135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046167
509	NC_009955	GAG	2	6	27141	27146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046167
510	NC_009955	TCG	2	6	27201	27206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
511	NC_009955	CCT	2	6	27234	27239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046168
512	NC_009955	TCG	2	6	27254	27259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
513	NC_009955	CTT	2	6	27339	27344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046168
514	NC_009955	CG	3	6	27345	27350	0 %	0 %	50 %	50 %	159046168
515	NC_009955	TCGC	2	8	27356	27363	0 %	25 %	25 %	50 %	159046168
516	NC_009955	CGG	2	6	27368	27373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
517	NC_009955	TCG	2	6	27410	27415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
518	NC_009955	TCA	2	6	27422	27427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046168
519	NC_009955	CCA	2	6	27493	27498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046168
520	NC_009955	GGT	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046168
521	NC_009955	GTC	2	6	27544	27549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
522	NC_009955	GCT	2	6	27564	27569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
523	NC_009955	TCA	2	6	27653	27658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046168
524	NC_009955	CGG	2	6	27660	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
525	NC_009955	TCC	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046168
526	NC_009955	ACA	2	6	27683	27688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046168
527	NC_009955	CT	3	6	27725	27730	0 %	50 %	0 %	50 %	159046168
528	NC_009955	CGG	2	6	27759	27764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
529	NC_009955	CGT	2	6	27816	27821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
530	NC_009955	TCA	2	6	27858	27863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046168
531	NC_009955	GGC	2	6	27894	27899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
532	NC_009955	CGT	2	6	27912	27917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
533	NC_009955	AGG	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046168
534	NC_009955	GAC	2	6	28118	28123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046168
535	NC_009955	CCG	2	6	28315	28320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046169
536	NC_009955	TGG	2	6	28329	28334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046169
537	NC_009955	TTG	2	6	28346	28351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046169
538	NC_009955	CTCG	2	8	28785	28792	0 %	25 %	25 %	50 %	159046170
539	NC_009955	T	6	6	28815	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	159046170
540	NC_009955	GC	5	10	28834	28843	0 %	0 %	50 %	50 %	159046170
541	NC_009955	TGG	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046170
542	NC_009955	CGG	2	6	28936	28941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046170
543	NC_009955	CCG	2	6	28963	28968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046170
544	NC_009955	CAG	2	6	29022	29027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046170
545	NC_009955	CG	3	6	29140	29145	0 %	0 %	50 %	50 %	159046170
546	NC_009955	CTTC	2	8	29326	29333	0 %	50 %	0 %	50 %	159046170
547	NC_009955	TCG	2	6	29396	29401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046170
548	NC_009955	ACT	2	6	29444	29449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046170
549	NC_009955	GCC	2	6	29719	29724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046171
550	NC_009955	GC	3	6	29849	29854	0 %	0 %	50 %	50 %	159046171
551	NC_009955	CAA	2	6	29900	29905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046171
552	NC_009955	TCT	2	6	29926	29931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046171
553	NC_009955	ACC	2	6	29937	29942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046171
554	NC_009955	GCG	2	6	29985	29990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046171
555	NC_009955	AAG	2	6	29991	29996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046171
556	NC_009955	GAG	2	6	30018	30023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046171
557	NC_009955	CGAG	3	12	30105	30116	25 %	0 %	50 %	25 %	159046171
558	NC_009955	CA	3	6	30119	30124	50 %	0 %	0 %	50 %	159046171
559	NC_009955	CAAGG	2	10	30174	30183	40 %	0 %	40 %	20 %	159046171
560	NC_009955	TGC	3	9	30226	30234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
561	NC_009955	ATT	2	6	30238	30243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159046171
562	NC_009955	GTT	2	6	30269	30274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046171
563	NC_009955	AAG	2	6	30357	30362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046171
564	NC_009955	CTG	2	6	30405	30410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
565	NC_009955	GAGG	2	8	30411	30418	25 %	0 %	75 %	0 %	159046171
566	NC_009955	TGC	2	6	30442	30447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
567	NC_009955	CTG	2	6	30531	30536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
568	NC_009955	CGC	2	6	30633	30638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046172
569	NC_009955	CCG	2	6	30703	30708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046172
570	NC_009955	CGG	2	6	30713	30718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046172
571	NC_009955	CTGC	2	8	30727	30734	0 %	25 %	25 %	50 %	159046172
572	NC_009955	GC	3	6	30828	30833	0 %	0 %	50 %	50 %	159046172
573	NC_009955	TGT	2	6	30934	30939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046172
574	NC_009955	CTG	2	6	30960	30965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046172
575	NC_009955	CAC	2	6	31047	31052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046172
576	NC_009955	GCATGT	2	12	31055	31066	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046172
577	NC_009955	TTC	2	6	31128	31133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046172
578	NC_009955	CTT	2	6	31217	31222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046172
579	NC_009955	CGC	2	6	31273	31278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046172
580	NC_009955	GTT	2	6	31296	31301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046172
581	NC_009955	CGG	2	6	31319	31324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046172
582	NC_009955	ACC	2	6	31381	31386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046172
583	NC_009955	GCG	2	6	31447	31452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046172
584	NC_009955	CGG	2	6	31494	31499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046172
585	NC_009955	CA	3	6	31542	31547	50 %	0 %	0 %	50 %	159046172
586	NC_009955	CGT	2	6	31569	31574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046172
587	NC_009955	CGC	2	6	31769	31774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046172
588	NC_009955	CGGAT	2	10	32238	32247	20 %	20 %	40 %	20 %	159046173
589	NC_009955	GGT	2	6	32277	32282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046173
590	NC_009955	CGCAA	2	10	32297	32306	40 %	0 %	20 %	40 %	159046173
591	NC_009955	AGC	2	6	32341	32346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046173
592	NC_009955	CGCGGG	2	12	32348	32359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046173
593	NC_009955	GAA	2	6	32366	32371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046173
594	NC_009955	AGT	2	6	32375	32380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046173
595	NC_009955	AT	3	6	32438	32443	50 %	50 %	0 %	0 %	159046173
596	NC_009955	ACG	3	9	32503	32511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046173
597	NC_009955	AGG	2	6	32558	32563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046173
598	NC_009955	GCCGT	2	10	32565	32574	0 %	20 %	40 %	40 %	159046173
599	NC_009955	CAG	2	6	32646	32651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046173
600	NC_009955	CTC	2	6	32742	32747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046173
601	NC_009955	ACCC	2	8	32801	32808	25 %	0 %	0 %	75 %	159046173
602	NC_009955	CCA	2	6	32917	32922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046173
603	NC_009955	ATG	3	9	32923	32931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046173
604	NC_009955	CAC	2	6	33060	33065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046173
605	NC_009955	GCAG	2	8	33080	33087	25 %	0 %	50 %	25 %	159046173
606	NC_009955	TGGA	2	8	33133	33140	25 %	25 %	50 %	0 %	159046173
607	NC_009955	ATG	2	6	33319	33324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046174
608	NC_009955	GGT	2	6	33642	33647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046174
609	NC_009955	GCAC	2	8	33652	33659	25 %	0 %	25 %	50 %	159046174
610	NC_009955	CCT	2	6	33710	33715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046174
611	NC_009955	CGC	2	6	33719	33724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046174
612	NC_009955	CTG	2	6	33838	33843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046174
613	NC_009955	GAGCTG	2	12	33907	33918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046174
614	NC_009955	GCG	2	6	33921	33926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046174
615	NC_009955	CAA	2	6	33945	33950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046174
616	NC_009955	ACC	2	6	34052	34057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046174
617	NC_009955	GCA	2	6	34292	34297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046174
618	NC_009955	TGGC	2	8	34306	34313	0 %	25 %	50 %	25 %	159046174
619	NC_009955	TGGC	2	8	34399	34406	0 %	25 %	50 %	25 %	159046174
620	NC_009955	GAT	2	6	34408	34413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046174
621	NC_009955	A	6	6	34427	34432	100 %	0 %	0 %	0 %	159046174
622	NC_009955	CCG	2	6	34433	34438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046174
623	NC_009955	GCCAGA	2	12	34440	34451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046174
624	NC_009955	CCG	2	6	34472	34477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046174
625	NC_009955	CGC	2	6	34490	34495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046174
626	NC_009955	GCG	3	9	34508	34516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046174
627	NC_009955	GACC	2	8	34574	34581	25 %	0 %	25 %	50 %	159046174
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