MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009952	CCCG	2	8	141854	141861	0 %	0 %	25 %	75 %	159042698
3002	NC_009952	CG	3	6	141860	141865	0 %	0 %	50 %	50 %	159042698
3003	NC_009952	GCT	2	6	141873	141878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042698
3004	NC_009952	CCT	2	6	141937	141942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042698
3005	NC_009952	CG	3	6	141968	141973	0 %	0 %	50 %	50 %	159042698
3006	NC_009952	CCA	2	6	142021	142026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042698
3007	NC_009952	CGC	2	6	142043	142048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3008	NC_009952	CCG	2	6	142051	142056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3009	NC_009952	CG	4	8	142111	142118	0 %	0 %	50 %	50 %	159042698
3010	NC_009952	GCC	2	6	142176	142181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3011	NC_009952	CGG	2	6	142233	142238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042698
3012	NC_009952	CAG	2	6	142301	142306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042698
3013	NC_009952	CTG	2	6	142316	142321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042698
3014	NC_009952	GCC	2	6	142334	142339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3015	NC_009952	CG	3	6	142399	142404	0 %	0 %	50 %	50 %	159042698
3016	NC_009952	CCG	2	6	142430	142435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3017	NC_009952	TCC	2	6	142437	142442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042698
3018	NC_009952	GAT	2	6	142448	142453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042698
3019	NC_009952	GCG	2	6	142468	142473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042698
3020	NC_009952	CCG	2	6	142497	142502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3021	NC_009952	CAG	2	6	142544	142549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042698
3022	NC_009952	CGG	2	6	142592	142597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042698
3023	NC_009952	GCC	2	6	142702	142707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3024	NC_009952	GCC	2	6	142723	142728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042698
3025	NC_009952	CGG	2	6	142742	142747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042698
3026	NC_009952	GCG	2	6	142787	142792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042698
3027	NC_009952	GGCTTG	2	12	142794	142805	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159042698
3028	NC_009952	GC	3	6	142872	142877	0 %	0 %	50 %	50 %	159042698
3029	NC_009952	ATC	2	6	143206	143211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042699
3030	NC_009952	GCA	2	6	143212	143217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042699
3031	NC_009952	GGA	2	6	143235	143240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042699
3032	NC_009952	ATG	2	6	143278	143283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042699
3033	NC_009952	GTG	2	6	143336	143341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042699
3034	NC_009952	TCG	3	9	143384	143392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042699
3035	NC_009952	GTC	2	6	143413	143418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042699
3036	NC_009952	ACC	2	6	143431	143436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042699
3037	NC_009952	GCA	2	6	143484	143489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042699
3038	NC_009952	GTCCGC	2	12	143494	143505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159042699
3039	NC_009952	ACG	3	9	143519	143527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042699
3040	NC_009952	GCTG	2	8	143593	143600	0 %	25 %	50 %	25 %	159042700
3041	NC_009952	CGG	2	6	143601	143606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042700
3042	NC_009952	CGC	2	6	143641	143646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042700
3043	NC_009952	CGA	2	6	143656	143661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042700
3044	NC_009952	CAT	2	6	143674	143679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042700
3045	NC_009952	ACC	2	6	143681	143686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042700
3046	NC_009952	TGT	2	6	143688	143693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042700
3047	NC_009952	TTC	2	6	143717	143722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042700
3048	NC_009952	GGC	2	6	143750	143755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042700
3049	NC_009952	CTT	2	6	143887	143892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042700
3050	NC_009952	CTT	3	9	143968	143976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042700
3051	NC_009952	TCG	2	6	143988	143993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042700
3052	NC_009952	GTG	2	6	144062	144067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042700
3053	NC_009952	CAT	2	6	144079	144084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042700
3054	NC_009952	GCG	2	6	144114	144119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042700
3055	NC_009952	GCTG	2	8	144120	144127	0 %	25 %	50 %	25 %	159042700
3056	NC_009952	CGT	2	6	144163	144168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042700
3057	NC_009952	GGCTG	2	10	144182	144191	0 %	20 %	60 %	20 %	159042700
3058	NC_009952	ATC	2	6	144206	144211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042700
3059	NC_009952	GGC	2	6	144329	144334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042700
3060	NC_009952	CCAACA	2	12	144390	144401	50 %	0 %	0 %	50 %	159042700
3061	NC_009952	GCG	2	6	144407	144412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042700
3062	NC_009952	GC	3	6	144543	144548	0 %	0 %	50 %	50 %	159042700
3063	NC_009952	GCT	2	6	144595	144600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042700
3064	NC_009952	CGA	2	6	144616	144621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042700
3065	NC_009952	GTG	2	6	144677	144682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042700
3066	NC_009952	AGG	2	6	144690	144695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042700
3067	NC_009952	CGC	2	6	144727	144732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042700
3068	NC_009952	GCA	2	6	145052	145057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042701
3069	NC_009952	G	6	6	145094	145099	0 %	0 %	100 %	0 %	159042701
3070	NC_009952	CGCATC	2	12	145156	145167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159042701
3071	NC_009952	GCA	2	6	145187	145192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042701
3072	NC_009952	GCC	2	6	145213	145218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042701
3073	NC_009952	GC	3	6	145249	145254	0 %	0 %	50 %	50 %	159042701
3074	NC_009952	TGC	2	6	145302	145307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042701
3075	NC_009952	ACC	2	6	145360	145365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042701
3076	NC_009952	CGG	2	6	145380	145385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042701
3077	NC_009952	CCA	2	6	145436	145441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042701
3078	NC_009952	GCT	2	6	145448	145453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042701
3079	NC_009952	CAG	2	6	145455	145460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042701
3080	NC_009952	GGC	2	6	145547	145552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042701
3081	NC_009952	GGC	2	6	145560	145565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042701
3082	NC_009952	TCCGGG	2	12	145663	145674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159042701
3083	NC_009952	CAC	2	6	145713	145718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042701
3084	NC_009952	CGCCTG	2	12	145725	145736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159042701
3085	NC_009952	GGT	2	6	145838	145843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042701
3086	NC_009952	CCG	2	6	145856	145861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042701
3087	NC_009952	GCC	2	6	145876	145881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042701
3088	NC_009952	CGG	2	6	145919	145924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042701
3089	NC_009952	GCC	2	6	145929	145934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042701
3090	NC_009952	CCG	2	6	145991	145996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042701
3091	NC_009952	GTC	2	6	146190	146195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042701
3092	NC_009952	CGC	2	6	146339	146344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042702
3093	NC_009952	GGT	2	6	146363	146368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042702
3094	NC_009952	CGCC	2	8	146392	146399	0 %	0 %	25 %	75 %	159042702
3095	NC_009952	CG	3	6	146411	146416	0 %	0 %	50 %	50 %	159042702
3096	NC_009952	TCG	2	6	146421	146426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042702
3097	NC_009952	TTC	2	6	146475	146480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042702
3098	NC_009952	CG	3	6	146498	146503	0 %	0 %	50 %	50 %	159042702
3099	NC_009952	GCCC	2	8	146507	146514	0 %	0 %	25 %	75 %	159042702
3100	NC_009952	CTC	2	6	146525	146530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042702
3101	NC_009952	C	6	6	146530	146535	0 %	0 %	0 %	100 %	159042702
3102	NC_009952	ACCG	2	8	146539	146546	25 %	0 %	25 %	50 %	159042702
3103	NC_009952	GC	3	6	146552	146557	0 %	0 %	50 %	50 %	159042702
3104	NC_009952	ACC	2	6	146562	146567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042702
3105	NC_009952	CGC	3	9	146585	146593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042702
3106	NC_009952	CAC	2	6	146657	146662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042702
3107	NC_009952	GGC	2	6	146664	146669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042702
3108	NC_009952	GCC	2	6	146711	146716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042702
3109	NC_009952	CCA	2	6	146759	146764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042702
3110	NC_009952	GGC	2	6	146771	146776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042702
3111	NC_009952	ACC	3	9	146802	146810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042702
3112	NC_009952	TCG	2	6	146907	146912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042702
3113	NC_009952	GCC	2	6	147090	147095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042702
3114	NC_009952	CAA	2	6	147101	147106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042702
3115	NC_009952	CAG	2	6	147407	147412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042703
3116	NC_009952	GTT	2	6	147415	147420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042703
3117	NC_009952	CTT	2	6	147470	147475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042703
3118	NC_009952	CAG	2	6	147602	147607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042703
3119	NC_009952	GCC	3	9	147613	147621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042703
3120	NC_009952	CTC	2	6	147623	147628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042703
3121	NC_009952	ACCA	2	8	147675	147682	50 %	0 %	0 %	50 %	159042703
3122	NC_009952	CAT	2	6	147691	147696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042703
3123	NC_009952	GCC	2	6	147728	147733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042703
3124	NC_009952	CGCGC	2	10	147805	147814	0 %	0 %	40 %	60 %	159042703
3125	NC_009952	CCG	2	6	147815	147820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042703
3126	NC_009952	CG	3	6	148004	148009	0 %	0 %	50 %	50 %	159042704
3127	NC_009952	CCA	2	6	148069	148074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042704
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3129	NC_009952	CGA	2	6	148156	148161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042704
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3131	NC_009952	CCA	2	6	148180	148185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042704
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3133	NC_009952	TGC	2	6	148267	148272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042704
3134	NC_009952	GGC	2	6	148277	148282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042704
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3136	NC_009952	ATC	2	6	148373	148378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042705
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3141	NC_009952	CCT	2	6	148572	148577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042705
3142	NC_009952	GC	3	6	148584	148589	0 %	0 %	50 %	50 %	159042705
3143	NC_009952	CG	3	6	148722	148727	0 %	0 %	50 %	50 %	159042705
3144	NC_009952	TCG	2	6	148761	148766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042705
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3148	NC_009952	CCGG	2	8	148816	148823	0 %	0 %	50 %	50 %	159042705
3149	NC_009952	TGT	2	6	148827	148832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042705
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3151	NC_009952	TTG	2	6	148904	148909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042705
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3154	NC_009952	TGGCG	2	10	148953	148962	0 %	20 %	60 %	20 %	159042705
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3225	NC_009952	GCA	2	6	152046	152051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042707
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3232	NC_009952	ACC	2	6	152210	152215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042707
3233	NC_009952	GTC	2	6	152216	152221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042707
3234	NC_009952	ATC	2	6	152225	152230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042707
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3239	NC_009952	CGC	2	6	152403	152408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042708
3240	NC_009952	CCG	2	6	152411	152416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042708
3241	NC_009952	TTC	2	6	152446	152451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042708
3242	NC_009952	CG	3	6	152513	152518	0 %	0 %	50 %	50 %	159042708
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3244	NC_009952	CGA	2	6	152558	152563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042708
3245	NC_009952	CCG	2	6	152606	152611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042708
3246	NC_009952	CG	3	6	152637	152642	0 %	0 %	50 %	50 %	159042708
3247	NC_009952	CCCCG	2	10	152703	152712	0 %	0 %	20 %	80 %	159042708
3248	NC_009952	GCC	2	6	152719	152724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042708
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3274	NC_009952	GCTGG	2	10	153876	153885	0 %	20 %	60 %	20 %	159042709
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3282	NC_009952	TCT	2	6	154325	154330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042710
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3319	NC_009952	CTG	2	6	156414	156419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042712
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3322	NC_009952	CCG	2	6	156508	156513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042712
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3331	NC_009952	ATC	2	6	156710	156715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042713
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3350	NC_009952	TCG	2	6	157815	157820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042714
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3358	NC_009952	ATC	2	6	158121	158126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042714
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3362	NC_009952	GCGG	2	8	158249	158256	0 %	0 %	75 %	25 %	159042714
3363	NC_009952	CCA	2	6	158263	158268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042714
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3484	NC_009952	GCCA	2	8	163375	163382	25 %	0 %	25 %	50 %	159042717
3485	NC_009952	CGA	2	6	163466	163471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042717
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3487	NC_009952	CCA	2	6	163550	163555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042717
3488	NC_009952	GCA	2	6	163556	163561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042717
3489	NC_009952	GCC	2	6	163624	163629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042717
3490	NC_009952	CGC	2	6	163646	163651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042717
3491	NC_009952	GCG	2	6	163652	163657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042717
3492	NC_009952	AGA	2	6	163720	163725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042717
3493	NC_009952	ACGA	2	8	163735	163742	50 %	0 %	25 %	25 %	159042717
3494	NC_009952	AGG	2	6	163750	163755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042717
3495	NC_009952	TGT	2	6	163817	163822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042717
3496	NC_009952	GCT	2	6	163828	163833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042718
3497	NC_009952	TGGCG	2	10	163853	163862	0 %	20 %	60 %	20 %	159042718
3498	NC_009952	CAG	4	12	163917	163928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042718
3499	NC_009952	GGT	2	6	163956	163961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042718
3500	NC_009952	GCG	2	6	163969	163974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042718

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