MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009952	GTC	2	6	45623	45628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042600
1002	NC_009952	GTC	2	6	45643	45648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042601
1003	NC_009952	CGG	2	6	45788	45793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042601
1004	NC_009952	CGA	2	6	45876	45881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042601
1005	NC_009952	CGG	2	6	45993	45998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042601
1006	NC_009952	ATG	2	6	46013	46018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042601
1007	NC_009952	AAG	2	6	46343	46348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042602
1008	NC_009952	TGC	2	6	46364	46369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042602
1009	NC_009952	GC	3	6	46457	46462	0 %	0 %	50 %	50 %	159042602
1010	NC_009952	AAG	2	6	46495	46500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042602
1011	NC_009952	GGC	2	6	46578	46583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042602
1012	NC_009952	TGTT	2	8	46626	46633	0 %	75 %	25 %	0 %	159042602
1013	NC_009952	TCTT	2	8	47010	47017	0 %	75 %	0 %	25 %	159042603
1014	NC_009952	CT	3	6	47025	47030	0 %	50 %	0 %	50 %	159042603
1015	NC_009952	TAA	2	6	47094	47099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159042603
1016	NC_009952	TGT	2	6	47154	47159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042603
1017	NC_009952	GTGAT	2	10	47216	47225	20 %	40 %	40 %	0 %	159042603
1018	NC_009952	AGC	2	6	47286	47291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042603
1019	NC_009952	CCT	2	6	47341	47346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042603
1020	NC_009952	CGC	2	6	47486	47491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042604
1021	NC_009952	GC	3	6	47490	47495	0 %	0 %	50 %	50 %	159042604
1022	NC_009952	CATC	2	8	47530	47537	25 %	25 %	0 %	50 %	159042604
1023	NC_009952	GCG	2	6	47579	47584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042604
1024	NC_009952	CGC	2	6	47600	47605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042604
1025	NC_009952	GTG	3	9	47642	47650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042604
1026	NC_009952	GCG	2	6	47666	47671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042604
1027	NC_009952	GAA	2	6	47681	47686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042604
1028	NC_009952	GCA	2	6	47767	47772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042604
1029	NC_009952	CAG	2	6	47794	47799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042604
1030	NC_009952	CGA	2	6	47902	47907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042604
1031	NC_009952	CCG	2	6	47988	47993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042604
1032	NC_009952	CTT	2	6	48046	48051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042604
1033	NC_009952	CGC	2	6	48170	48175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042604
1034	NC_009952	TGG	3	9	48237	48245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042604
1035	NC_009952	GCG	2	6	48266	48271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042604
1036	NC_009952	AGC	2	6	48301	48306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042604
1037	NC_009952	CA	3	6	48312	48317	50 %	0 %	0 %	50 %	159042604
1038	NC_009952	CGCC	2	8	48376	48383	0 %	0 %	25 %	75 %	159042604
1039	NC_009952	GCC	2	6	48417	48422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042604
1040	NC_009952	AGG	2	6	48426	48431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042604
1041	NC_009952	CCT	2	6	48585	48590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042605
1042	NC_009952	AAG	2	6	48653	48658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042605
1043	NC_009952	ATG	2	6	48706	48711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042605
1044	NC_009952	GCA	2	6	48880	48885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042606
1045	NC_009952	GGC	2	6	48920	48925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042606
1046	NC_009952	CGT	2	6	48938	48943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042606
1047	NC_009952	CCA	2	6	48944	48949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042606
1048	NC_009952	CGA	2	6	49015	49020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042606
1049	NC_009952	TTTA	2	8	49035	49042	25 %	75 %	0 %	0 %	159042606
1050	NC_009952	CGG	2	6	49076	49081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042606
1051	NC_009952	ATC	2	6	49104	49109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042606
1052	NC_009952	ATC	2	6	49146	49151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042606
1053	NC_009952	GCT	2	6	49208	49213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042606
1054	NC_009952	TGGTC	2	10	49261	49270	0 %	40 %	40 %	20 %	159042607
1055	NC_009952	GC	3	6	49300	49305	0 %	0 %	50 %	50 %	159042607
1056	NC_009952	AGC	2	6	49335	49340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042607
1057	NC_009952	TC	4	8	49371	49378	0 %	50 %	0 %	50 %	159042607
1058	NC_009952	CGC	2	6	49379	49384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042607
1059	NC_009952	GC	3	6	49395	49400	0 %	0 %	50 %	50 %	159042607
1060	NC_009952	ATC	2	6	49473	49478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042607
1061	NC_009952	A	6	6	49577	49582	100 %	0 %	0 %	0 %	159042607
1062	NC_009952	CAG	2	6	49603	49608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042607
1063	NC_009952	ATA	2	6	49676	49681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159042608
1064	NC_009952	TGG	2	6	49735	49740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042608
1065	NC_009952	GCC	2	6	49755	49760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042608
1066	NC_009952	GCC	2	6	49764	49769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042608
1067	NC_009952	GGT	2	6	49787	49792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042608
1068	NC_009952	GC	3	6	49805	49810	0 %	0 %	50 %	50 %	159042608
1069	NC_009952	CGG	2	6	49812	49817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042608
1070	NC_009952	GCG	2	6	49847	49852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042608
1071	NC_009952	GCC	2	6	50018	50023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042609
1072	NC_009952	AGC	2	6	50025	50030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042609
1073	NC_009952	GGCGG	2	10	50162	50171	0 %	0 %	80 %	20 %	159042609
1074	NC_009952	TGGC	2	8	50177	50184	0 %	25 %	50 %	25 %	159042609
1075	NC_009952	CGC	2	6	50298	50303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042609
1076	NC_009952	CG	3	6	50309	50314	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1077	NC_009952	TGGC	2	8	50315	50322	0 %	25 %	50 %	25 %	159042609
1078	NC_009952	GCGCTG	2	12	50356	50367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159042609
1079	NC_009952	GGTGCG	2	12	50416	50427	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159042609
1080	NC_009952	GCGG	2	8	50431	50438	0 %	0 %	75 %	25 %	159042609
1081	NC_009952	GGGCG	2	10	50452	50461	0 %	0 %	80 %	20 %	159042609
1082	NC_009952	GGC	3	9	50466	50474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042609
1083	NC_009952	GC	3	6	50517	50522	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1084	NC_009952	GC	3	6	50573	50578	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1085	NC_009952	GTC	2	6	50611	50616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042609
1086	NC_009952	GTG	2	6	50624	50629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042609
1087	NC_009952	CG	3	6	50631	50636	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1088	NC_009952	GCG	2	6	50670	50675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042609
1089	NC_009952	CG	3	6	50761	50766	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1090	NC_009952	GC	4	8	50859	50866	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1091	NC_009952	CG	3	6	50874	50879	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1092	NC_009952	CGG	2	6	50883	50888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042609
1093	NC_009952	CG	5	10	50974	50983	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1094	NC_009952	GAC	2	6	50990	50995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042609
1095	NC_009952	TGC	2	6	51003	51008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042609
1096	NC_009952	CCGGC	2	10	51013	51022	0 %	0 %	40 %	60 %	159042609
1097	NC_009952	GCG	2	6	51033	51038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042609
1098	NC_009952	G	6	6	51064	51069	0 %	0 %	100 %	0 %	159042609
1099	NC_009952	GGC	3	9	51145	51153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042609
1100	NC_009952	GGCGG	2	10	51163	51172	0 %	0 %	80 %	20 %	159042609
1101	NC_009952	GC	3	6	51173	51178	0 %	0 %	50 %	50 %	159042610
1102	NC_009952	GCG	2	6	51329	51334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042610
1103	NC_009952	GCA	2	6	51393	51398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042610
1104	NC_009952	GC	3	6	51409	51414	0 %	0 %	50 %	50 %	159042610
1105	NC_009952	TCG	2	6	51440	51445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042610
1106	NC_009952	CGA	2	6	51522	51527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042610
1107	NC_009952	GCT	2	6	51544	51549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042610
1108	NC_009952	CCA	2	6	51573	51578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042610
1109	NC_009952	GCC	2	6	51592	51597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042610
1110	NC_009952	GGC	2	6	51629	51634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042610
1111	NC_009952	GTG	2	6	51640	51645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042610
1112	NC_009952	GCA	2	6	51669	51674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042610
1113	NC_009952	GC	3	6	51782	51787	0 %	0 %	50 %	50 %	159042611
1114	NC_009952	GC	3	6	51878	51883	0 %	0 %	50 %	50 %	159042611
1115	NC_009952	CGGGC	2	10	51916	51925	0 %	0 %	60 %	40 %	159042611
1116	NC_009952	CGG	2	6	51933	51938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042611
1117	NC_009952	CGG	2	6	51959	51964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042611
1118	NC_009952	GCC	2	6	51966	51971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042611
1119	NC_009952	GGC	2	6	51981	51986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042611
1120	NC_009952	GGC	2	6	51995	52000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042611
1121	NC_009952	CGCCCT	2	12	52037	52048	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	159042611
1122	NC_009952	G	8	8	52070	52077	0 %	0 %	100 %	0 %	159042611
1123	NC_009952	GC	3	6	52080	52085	0 %	0 %	50 %	50 %	159042611
1124	NC_009952	CCTCGG	2	12	52088	52099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159042611
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1126	NC_009952	CGG	2	6	52151	52156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042611
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1253	NC_009952	TCG	2	6	57323	57328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042615
1254	NC_009952	GAC	2	6	57334	57339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042615
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1256	NC_009952	TCG	3	9	57398	57406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042615
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1265	NC_009952	GC	3	6	57958	57963	0 %	0 %	50 %	50 %	159042615
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1375	NC_009952	GCC	2	6	62289	62294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042617
1376	NC_009952	CAGC	2	8	62306	62313	25 %	0 %	25 %	50 %	159042617
1377	NC_009952	GCG	2	6	62455	62460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042618
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