MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009952	GCTGAA	2	12	253809	253820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159042811
5502	NC_009952	GCC	2	6	253831	253836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
5503	NC_009952	GCG	2	6	253851	253856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042811
5504	NC_009952	TGG	2	6	253961	253966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042811
5505	NC_009952	CAC	2	6	253968	253973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042811
5506	NC_009952	CGA	2	6	253979	253984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042811
5507	NC_009952	CGC	2	6	254079	254084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
5508	NC_009952	GCC	3	9	254095	254103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
5509	NC_009952	AAG	2	6	254104	254109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042811
5510	NC_009952	TGA	2	6	254126	254131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042811
5511	NC_009952	GGAGCC	2	12	254181	254192	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159042811
5512	NC_009952	CTG	2	6	254233	254238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042811
5513	NC_009952	GAC	3	9	254245	254253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042811
5514	NC_009952	GAGGAC	2	12	254254	254265	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	159042811
5515	NC_009952	GACGAG	2	12	254320	254331	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	159042811
5516	NC_009952	CG	3	6	254494	254499	0 %	0 %	50 %	50 %	159042812
5517	NC_009952	CG	3	6	254586	254591	0 %	0 %	50 %	50 %	159042812
5518	NC_009952	CTCG	2	8	254593	254600	0 %	25 %	25 %	50 %	159042812
5519	NC_009952	TCA	2	6	254816	254821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042813
5520	NC_009952	CG	3	6	254823	254828	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
5521	NC_009952	GTC	2	6	254832	254837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5522	NC_009952	TGCAGG	2	12	254860	254871	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159042813
5523	NC_009952	GCG	2	6	254872	254877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
5524	NC_009952	CGG	2	6	254920	254925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
5525	NC_009952	CAG	2	6	254979	254984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5526	NC_009952	CGG	2	6	255041	255046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
5527	NC_009952	GGC	2	6	255069	255074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
5528	NC_009952	CAG	2	6	255153	255158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5529	NC_009952	GCG	2	6	255159	255164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
5530	NC_009952	GC	3	6	255239	255244	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
5531	NC_009952	GAT	2	6	255273	255278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042813
5532	NC_009952	TCA	2	6	255284	255289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042813
5533	NC_009952	CCA	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042813
5534	NC_009952	GCA	2	6	255396	255401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5535	NC_009952	CGA	2	6	255443	255448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5536	NC_009952	GC	4	8	255459	255466	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
5537	NC_009952	GGGT	2	8	255487	255494	0 %	25 %	75 %	0 %	159042813
5538	NC_009952	GTC	2	6	255586	255591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5539	NC_009952	GCC	2	6	255602	255607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042813
5540	NC_009952	CCG	2	6	255623	255628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042813
5541	NC_009952	AGC	2	6	255655	255660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5542	NC_009952	CG	3	6	255714	255719	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
5543	NC_009952	GGGC	2	8	255723	255730	0 %	0 %	75 %	25 %	159042813
5544	NC_009952	CCT	2	6	255746	255751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042813
5545	NC_009952	CGG	2	6	255758	255763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
5546	NC_009952	CCG	2	6	255812	255817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042813
5547	NC_009952	AGC	2	6	255895	255900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5548	NC_009952	GC	3	6	255899	255904	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
5549	NC_009952	CG	3	6	255920	255925	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
5550	NC_009952	GAC	2	6	255979	255984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
5551	NC_009952	TG	4	8	256028	256035	0 %	50 %	50 %	0 %	159042813
5552	NC_009952	GCA	2	6	256300	256305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042814
5553	NC_009952	GC	3	6	256309	256314	0 %	0 %	50 %	50 %	159042814
5554	NC_009952	AGG	2	6	256347	256352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042814
5555	NC_009952	TCT	4	12	256401	256412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042814
5556	NC_009952	GAT	2	6	256423	256428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042814
5557	NC_009952	CTT	2	6	256456	256461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042814
5558	NC_009952	CGG	2	6	256462	256467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042814
5559	NC_009952	GGT	2	6	256683	256688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042815
5560	NC_009952	GAA	2	6	256717	256722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042815
5561	NC_009952	GAC	2	6	256769	256774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042815
5562	NC_009952	CCGA	2	8	256793	256800	25 %	0 %	25 %	50 %	159042815
5563	NC_009952	CCG	2	6	256816	256821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042815
5564	NC_009952	AAG	2	6	256826	256831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042815
5565	NC_009952	CCG	2	6	256836	256841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042815
5566	NC_009952	GACC	2	8	256885	256892	25 %	0 %	25 %	50 %	159042815
5567	NC_009952	AGG	2	6	257013	257018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042815
5568	NC_009952	CGC	2	6	257019	257024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042815
5569	NC_009952	GAC	3	9	257111	257119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042815
5570	NC_009952	AAC	2	6	257120	257125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042815
5571	NC_009952	CCG	2	6	257350	257355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042816
5572	NC_009952	C	8	8	257371	257378	0 %	0 %	0 %	100 %	159042816
5573	NC_009952	CAT	2	6	257411	257416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042816
5574	NC_009952	GC	3	6	257464	257469	0 %	0 %	50 %	50 %	159042816
5575	NC_009952	CGC	2	6	257527	257532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042816
5576	NC_009952	CGG	2	6	257533	257538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042816
5577	NC_009952	TTA	2	6	257540	257545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159042816
5578	NC_009952	AAG	2	6	257550	257555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042816
5579	NC_009952	CGAAG	2	10	257639	257648	40 %	0 %	40 %	20 %	159042816
5580	NC_009952	GA	3	6	257651	257656	50 %	0 %	50 %	0 %	159042816
5581	NC_009952	CGCGC	2	10	257761	257770	0 %	0 %	40 %	60 %	159042817
5582	NC_009952	GAA	2	6	257806	257811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042817
5583	NC_009952	CGA	2	6	257850	257855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042817
5584	NC_009952	GGC	2	6	258000	258005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042817
5585	NC_009952	ATG	2	6	258094	258099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042817
5586	NC_009952	TCG	2	6	258104	258109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042817
5587	NC_009952	GCC	2	6	258187	258192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042817
5588	NC_009952	GCC	2	6	258199	258204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042817
5589	NC_009952	GTG	2	6	258244	258249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042817
5590	NC_009952	CGA	2	6	258276	258281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042817
5591	NC_009952	GC	3	6	258303	258308	0 %	0 %	50 %	50 %	159042817
5592	NC_009952	GAA	2	6	258363	258368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042817
5593	NC_009952	CCA	2	6	258383	258388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042817
5594	NC_009952	CGC	2	6	258814	258819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042818
5595	NC_009952	AAC	2	6	258893	258898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042818
5596	NC_009952	CGG	2	6	258913	258918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042818
5597	NC_009952	GGCG	2	8	258964	258971	0 %	0 %	75 %	25 %	159042818
5598	NC_009952	GAC	2	6	258992	258997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042818
5599	NC_009952	CGTGG	2	10	259006	259015	0 %	20 %	60 %	20 %	159042818
5600	NC_009952	CAT	2	6	259024	259029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042818
5601	NC_009952	CCGG	2	8	259046	259053	0 %	0 %	50 %	50 %	159042818
5602	NC_009952	CAG	2	6	259058	259063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042818
5603	NC_009952	ACA	2	6	259065	259070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042818
5604	NC_009952	CCA	2	6	259071	259076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042818
5605	NC_009952	ACC	2	6	259094	259099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042818
5606	NC_009952	CGG	2	6	259188	259193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042818
5607	NC_009952	CCT	2	6	259236	259241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042818
5608	NC_009952	CTA	2	6	259369	259374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042818
5609	NC_009952	ACG	2	6	259385	259390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042818
5610	NC_009952	GCG	2	6	259495	259500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042818
5611	NC_009952	CCG	2	6	259501	259506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042818
5612	NC_009952	CGGGC	2	10	259680	259689	0 %	0 %	60 %	40 %	159042819
5613	NC_009952	CGG	2	6	259772	259777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042819
5614	NC_009952	GC	3	6	259939	259944	0 %	0 %	50 %	50 %	159042819
5615	NC_009952	CTG	3	9	259962	259970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042819
5616	NC_009952	CGA	2	6	259993	259998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042819
5617	NC_009952	GCC	3	9	260016	260024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042819
5618	NC_009952	ACC	2	6	260082	260087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042819
5619	NC_009952	TTCG	2	8	260195	260202	0 %	50 %	25 %	25 %	159042819
5620	NC_009952	GAT	2	6	260210	260215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042819
5621	NC_009952	GCCT	2	8	260235	260242	0 %	25 %	25 %	50 %	159042819
5622	NC_009952	CGA	2	6	260332	260337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042819
5623	NC_009952	GGC	2	6	260339	260344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042819
5624	NC_009952	CG	3	6	260390	260395	0 %	0 %	50 %	50 %	159042819
5625	NC_009952	TCC	2	6	260577	260582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042820
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5627	NC_009952	CGA	2	6	260612	260617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042820
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5630	NC_009952	TCG	2	6	260647	260652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042820
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5636	NC_009952	ATC	2	6	260811	260816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042820
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5642	NC_009952	CGA	2	6	261044	261049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042820
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5644	NC_009952	CGG	2	6	261157	261162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042820
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5647	NC_009952	CTG	2	6	261270	261275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042820
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5652	NC_009952	CGG	3	9	261418	261426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042820
5653	NC_009952	CGG	2	6	261439	261444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042820
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5657	NC_009952	CTGG	2	8	261515	261522	0 %	25 %	50 %	25 %	159042820
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5660	NC_009952	CGTG	2	8	261983	261990	0 %	25 %	50 %	25 %	159042821
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5721	NC_009952	CG	3	6	265389	265394	0 %	0 %	50 %	50 %	159042824
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5731	NC_009952	CGA	2	6	265647	265652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042824
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5742	NC_009952	CGA	2	6	266172	266177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042824
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5986	NC_009952	GCT	2	6	277324	277329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042829
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