MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009952	CGG	2	6	207035	207040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042765
4502	NC_009952	CAG	2	6	207047	207052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042765
4503	NC_009952	TGT	2	6	207076	207081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042765
4504	NC_009952	CCGG	2	8	207128	207135	0 %	0 %	50 %	50 %	159042765
4505	NC_009952	TCT	2	6	207163	207168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042765
4506	NC_009952	CGGG	2	8	207223	207230	0 %	0 %	75 %	25 %	159042766
4507	NC_009952	GCA	2	6	207273	207278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042766
4508	NC_009952	AGC	2	6	207303	207308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042766
4509	NC_009952	GCG	2	6	207329	207334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042766
4510	NC_009952	GGCG	2	8	207352	207359	0 %	0 %	75 %	25 %	159042766
4511	NC_009952	CGA	2	6	207379	207384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042766
4512	NC_009952	GCG	2	6	207408	207413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042766
4513	NC_009952	CGA	2	6	207478	207483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042766
4514	NC_009952	CG	3	6	207497	207502	0 %	0 %	50 %	50 %	159042766
4515	NC_009952	CGGTC	2	10	207508	207517	0 %	20 %	40 %	40 %	159042766
4516	NC_009952	CG	3	6	207531	207536	0 %	0 %	50 %	50 %	159042766
4517	NC_009952	GCCC	2	8	207572	207579	0 %	0 %	25 %	75 %	159042766
4518	NC_009952	GCCCG	2	10	207603	207612	0 %	0 %	40 %	60 %	159042766
4519	NC_009952	GGC	2	6	207614	207619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042766
4520	NC_009952	TGG	2	6	207625	207630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042766
4521	NC_009952	AG	3	6	207660	207665	50 %	0 %	50 %	0 %	159042767
4522	NC_009952	CG	3	6	207683	207688	0 %	0 %	50 %	50 %	159042767
4523	NC_009952	G	6	6	207693	207698	0 %	0 %	100 %	0 %	159042767
4524	NC_009952	GTC	2	6	207709	207714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4525	NC_009952	CGC	2	6	207747	207752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042767
4526	NC_009952	GAT	2	6	207763	207768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042767
4527	NC_009952	CGAGGC	2	12	207783	207794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159042767
4528	NC_009952	CG	3	6	207904	207909	0 %	0 %	50 %	50 %	159042767
4529	NC_009952	CGC	2	6	207945	207950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042767
4530	NC_009952	CAG	2	6	207976	207981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4531	NC_009952	GGC	2	6	208037	208042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042767
4532	NC_009952	TGA	2	6	208050	208055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042767
4533	NC_009952	CTT	2	6	208077	208082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042767
4534	NC_009952	TCC	3	9	208136	208144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042767
4535	NC_009952	CGC	2	6	208392	208397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042767
4536	NC_009952	GGC	2	6	208401	208406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042767
4537	NC_009952	GC	3	6	208420	208425	0 %	0 %	50 %	50 %	159042767
4538	NC_009952	CGG	2	6	208497	208502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042767
4539	NC_009952	CAG	2	6	208564	208569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4540	NC_009952	CCA	2	6	208572	208577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042767
4541	NC_009952	CGA	2	6	208650	208655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4542	NC_009952	CAG	2	6	208675	208680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4543	NC_009952	TGG	2	6	208737	208742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042767
4544	NC_009952	GCA	2	6	208764	208769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4545	NC_009952	TGA	2	6	208866	208871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042767
4546	NC_009952	TCG	2	6	208872	208877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4547	NC_009952	GC	4	8	208934	208941	0 %	0 %	50 %	50 %	159042767
4548	NC_009952	CCG	2	6	208953	208958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042767
4549	NC_009952	CCA	2	6	209004	209009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042767
4550	NC_009952	ACC	2	6	209165	209170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042767
4551	NC_009952	GAT	2	6	209200	209205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042767
4552	NC_009952	GC	3	6	209209	209214	0 %	0 %	50 %	50 %	159042767
4553	NC_009952	CCCGA	2	10	209256	209265	20 %	0 %	20 %	60 %	159042767
4554	NC_009952	GC	3	6	209266	209271	0 %	0 %	50 %	50 %	159042767
4555	NC_009952	CCGC	2	8	209283	209290	0 %	0 %	25 %	75 %	159042767
4556	NC_009952	CGC	3	9	209301	209309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042767
4557	NC_009952	CCG	2	6	209313	209318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042767
4558	NC_009952	CTG	2	6	209361	209366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042767
4559	NC_009952	TTC	2	6	209376	209381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042767
4560	NC_009952	TTGTAC	2	12	209383	209394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	159042768
4561	NC_009952	ATC	2	6	209505	209510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042768
4562	NC_009952	GCA	3	9	209573	209581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042768
4563	NC_009952	CCGTCA	2	12	209588	209599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159042768
4564	NC_009952	GGC	2	6	209720	209725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042768
4565	NC_009952	GCA	2	6	209726	209731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042768
4566	NC_009952	CCA	2	6	209747	209752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042768
4567	NC_009952	CTT	2	6	209772	209777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042768
4568	NC_009952	GTC	2	6	209784	209789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042768
4569	NC_009952	TCG	2	6	209815	209820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042768
4570	NC_009952	TCA	2	6	209824	209829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042768
4571	NC_009952	GACG	2	8	210024	210031	25 %	0 %	50 %	25 %	159042768
4572	NC_009952	GTC	3	9	210045	210053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042768
4573	NC_009952	GGA	2	6	210445	210450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042769
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4578	NC_009952	TGC	2	6	210825	210830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042769
4579	NC_009952	ATC	2	6	210878	210883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042769
4580	NC_009952	CTGATC	2	12	210965	210976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159042769
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4582	NC_009952	TGC	2	6	211035	211040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042769
4583	NC_009952	TTC	2	6	211112	211117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042769
4584	NC_009952	GAC	2	6	211138	211143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042769
4585	NC_009952	CGG	2	6	211149	211154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042769
4586	NC_009952	GGC	2	6	211223	211228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042769
4587	NC_009952	AGCCG	2	10	211261	211270	20 %	0 %	40 %	40 %	159042769
4588	NC_009952	TGCGC	2	10	211377	211386	0 %	20 %	40 %	40 %	159042769
4589	NC_009952	CAT	3	9	211447	211455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042769
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4592	NC_009952	CTG	2	6	211684	211689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042769
4593	NC_009952	CGG	2	6	211711	211716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042769
4594	NC_009952	GCT	2	6	211762	211767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042769
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4599	NC_009952	CGA	2	6	211975	211980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042769
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4601	NC_009952	AGCC	2	8	212195	212202	25 %	0 %	25 %	50 %	159042770
4602	NC_009952	CAG	2	6	212221	212226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042770
4603	NC_009952	GGT	2	6	212334	212339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042770
4604	NC_009952	TCG	2	6	212360	212365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042770
4605	NC_009952	TA	3	6	212400	212405	50 %	50 %	0 %	0 %	159042770
4606	NC_009952	ATC	2	6	212417	212422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042770
4607	NC_009952	CAG	2	6	212503	212508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042770
4608	NC_009952	CCA	2	6	212553	212558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042770
4609	NC_009952	CACCGG	2	12	212566	212577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159042770
4610	NC_009952	ATCGAA	2	12	212639	212650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159042770
4611	NC_009952	GGTC	2	8	212754	212761	0 %	25 %	50 %	25 %	159042770
4612	NC_009952	GTG	3	9	212786	212794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042770
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4614	NC_009952	TCA	2	6	212913	212918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042770
4615	NC_009952	TGGCG	2	10	213184	213193	0 %	20 %	60 %	20 %	159042771
4616	NC_009952	CCG	2	6	213194	213199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042771
4617	NC_009952	GGGA	2	8	213286	213293	25 %	0 %	75 %	0 %	159042771
4618	NC_009952	GGC	2	6	213439	213444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042771
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4620	NC_009952	CCCG	2	8	213623	213630	0 %	0 %	25 %	75 %	159042771
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4742	NC_009952	CG	3	6	219828	219833	0 %	0 %	50 %	50 %	159042777
4743	NC_009952	CTG	2	6	219834	219839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042777
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4745	NC_009952	CGG	2	6	219868	219873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042777
4746	NC_009952	GCT	2	6	219890	219895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042777
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4750	NC_009952	CG	3	6	220105	220110	0 %	0 %	50 %	50 %	159042777
4751	NC_009952	ACA	2	6	220123	220128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042777
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4862	NC_009952	GGC	2	6	225680	225685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042784
4863	NC_009952	ATC	2	6	225696	225701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042784
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4865	NC_009952	CTGC	2	8	225863	225870	0 %	25 %	25 %	50 %	159042784
4866	NC_009952	GC	4	8	225904	225911	0 %	0 %	50 %	50 %	159042784
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