MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	TTTGC	2	10	322	331	0 %	60 %	20 %	20 %	146328959
2	NC_009446	ATTAC	2	10	1258	1267	40 %	40 %	0 %	20 %	146328959
3	NC_009446	GTTGG	2	10	6437	6446	0 %	40 %	60 %	0 %	146329819
4	NC_009446	GCATC	2	10	11751	11760	20 %	20 %	20 %	40 %	146329561
5	NC_009446	CGCGG	2	10	11800	11809	0 %	0 %	60 %	40 %	146329561
6	NC_009446	GGTTG	2	10	12727	12736	0 %	40 %	60 %	0 %	146329262
7	NC_009446	TTGCG	2	10	13964	13973	0 %	40 %	40 %	20 %	146328674
8	NC_009446	TTTTC	2	10	14524	14533	0 %	80 %	0 %	20 %	146328674
9	NC_009446	CAAAC	2	10	20687	20696	60 %	0 %	0 %	40 %	146329246
10	NC_009446	TGCAA	2	10	21319	21328	40 %	20 %	20 %	20 %	146329246
11	NC_009446	GCGCA	2	10	21683	21692	20 %	0 %	40 %	40 %	146329246
12	NC_009446	ATTTC	2	10	22098	22107	20 %	60 %	0 %	20 %	146329246
13	NC_009446	CTTTG	2	10	22584	22593	0 %	60 %	20 %	20 %	146328875
14	NC_009446	TGGCA	2	10	27733	27742	20 %	20 %	40 %	20 %	146329366
15	NC_009446	GCGCC	2	10	29365	29374	0 %	0 %	40 %	60 %	146329642
16	NC_009446	GCATT	2	10	30500	30509	20 %	40 %	20 %	20 %	146329774
17	NC_009446	GCGTC	2	10	33551	33560	0 %	20 %	40 %	40 %	146328987
18	NC_009446	ATTTT	2	10	35093	35102	20 %	80 %	0 %	0 %	146329713
19	NC_009446	TAAAT	2	10	39194	39203	60 %	40 %	0 %	0 %	146329480
20	NC_009446	ATTGA	2	10	40037	40046	40 %	40 %	20 %	0 %	146328869
21	NC_009446	ACGGT	2	10	42976	42985	20 %	20 %	40 %	20 %	146329143
22	NC_009446	CAATT	2	10	44306	44315	40 %	40 %	0 %	20 %	146329873
23	NC_009446	GCGAT	2	10	46177	46186	20 %	20 %	40 %	20 %	146329406
24	NC_009446	TACCA	2	10	46244	46253	40 %	20 %	0 %	40 %	146329406
25	NC_009446	AAAAT	2	10	49686	49695	80 %	20 %	0 %	0 %	146328806
26	NC_009446	TTATT	2	10	51953	51962	20 %	80 %	0 %	0 %	146329167
27	NC_009446	TAAAA	2	10	52957	52966	80 %	20 %	0 %	0 %	146329631
28	NC_009446	AACGC	2	10	53616	53625	40 %	0 %	20 %	40 %	146329700
29	NC_009446	TGGAC	2	10	56247	56256	20 %	20 %	40 %	20 %	146328805
30	NC_009446	ATAGG	2	10	56559	56568	40 %	20 %	40 %	0 %	146328805
31	NC_009446	GGGCA	2	10	59386	59395	20 %	0 %	60 %	20 %	146329379
32	NC_009446	TGGCG	2	10	60292	60301	0 %	20 %	60 %	20 %	146328929
33	NC_009446	AACAA	2	10	60375	60384	80 %	0 %	0 %	20 %	146328929
34	NC_009446	GATAA	2	10	61685	61694	60 %	20 %	20 %	0 %	146328921
35	NC_009446	ATGTA	2	10	63868	63877	40 %	40 %	20 %	0 %	146328681
36	NC_009446	TGGAA	2	10	64097	64106	40 %	20 %	40 %	0 %	146329368
37	NC_009446	TGGAT	2	10	65459	65468	20 %	40 %	40 %	0 %	146329838
38	NC_009446	TGATT	2	10	66015	66024	20 %	60 %	20 %	0 %	146329833
39	NC_009446	ATCAA	2	10	70922	70931	60 %	20 %	0 %	20 %	146329305
40	NC_009446	GCCAC	2	10	73401	73410	20 %	0 %	20 %	60 %	146329858
41	NC_009446	TGCGC	2	10	73980	73989	0 %	20 %	40 %	40 %	146328800
42	NC_009446	TTAAA	2	10	74286	74295	60 %	40 %	0 %	0 %	146328800
43	NC_009446	TGCGC	2	10	76799	76808	0 %	20 %	40 %	40 %	146329227
44	NC_009446	TTGCA	2	10	81855	81864	20 %	40 %	20 %	20 %	146329527
45	NC_009446	GTTTG	2	10	83054	83063	0 %	60 %	40 %	0 %	146329527
46	NC_009446	ATTTT	2	10	84356	84365	20 %	80 %	0 %	0 %	146329202
47	NC_009446	TAAAA	2	10	85000	85009	80 %	20 %	0 %	0 %	146329771
48	NC_009446	ATTTA	2	10	86748	86757	40 %	60 %	0 %	0 %	146329030
49	NC_009446	GCGCC	2	10	88716	88725	0 %	0 %	40 %	60 %	146329901
50	NC_009446	TATTG	2	10	89706	89715	20 %	60 %	20 %	0 %	146329187
51	NC_009446	TTGGT	2	10	91841	91850	0 %	60 %	40 %	0 %	146328658
52	NC_009446	CGATC	2	10	95551	95560	20 %	20 %	20 %	40 %	146328856
53	NC_009446	CAACG	2	10	102045	102054	40 %	0 %	20 %	40 %	146329493
54	NC_009446	GGCGT	2	10	103061	103070	0 %	20 %	60 %	20 %	146328926
55	NC_009446	TTTGC	2	10	106917	106926	0 %	60 %	20 %	20 %	146329835
56	NC_009446	AAAAT	2	10	108773	108782	80 %	20 %	0 %	0 %	146329373
57	NC_009446	GGAAG	2	10	113740	113749	40 %	0 %	60 %	0 %	146328652
58	NC_009446	TGCAT	2	10	115009	115018	20 %	40 %	20 %	20 %	146329388
59	NC_009446	CGGCG	2	10	115557	115566	0 %	0 %	60 %	40 %	146329388
60	NC_009446	AAAAG	2	10	115610	115619	80 %	0 %	20 %	0 %	146329388
61	NC_009446	GCGTG	2	10	119424	119433	0 %	20 %	60 %	20 %	146328798
62	NC_009446	CAATC	2	10	121403	121412	40 %	20 %	0 %	40 %	146329586
63	NC_009446	GCGCG	2	10	125537	125546	0 %	0 %	60 %	40 %	146329696
64	NC_009446	CTGCC	2	10	126729	126738	0 %	20 %	20 %	60 %	146328964
65	NC_009446	GGCGG	2	10	127593	127602	0 %	0 %	80 %	20 %	146329831
66	NC_009446	TTACG	2	10	127789	127798	20 %	40 %	20 %	20 %	146329831
67	NC_009446	CGTTG	2	10	130405	130414	0 %	40 %	40 %	20 %	146329809
68	NC_009446	TTCGG	2	10	131675	131684	0 %	40 %	40 %	20 %	146329311
69	NC_009446	GCACG	2	10	133467	133476	20 %	0 %	40 %	40 %	146329392
70	NC_009446	TGCCG	2	10	134591	134600	0 %	20 %	40 %	40 %	146329416
71	NC_009446	TGATG	2	10	135207	135216	20 %	40 %	40 %	0 %	146328678
72	NC_009446	TTTGC	2	10	135217	135226	0 %	60 %	20 %	20 %	146328678
73	NC_009446	CCACG	2	10	136889	136898	20 %	0 %	20 %	60 %	146329123
74	NC_009446	GTTTT	2	10	136945	136954	0 %	80 %	20 %	0 %	146329123
75	NC_009446	CAAAC	2	10	137323	137332	60 %	0 %	0 %	40 %	146329123
76	NC_009446	TTATG	2	10	137344	137353	20 %	60 %	20 %	0 %	146329123
77	NC_009446	TATTT	2	10	138385	138394	20 %	80 %	0 %	0 %	146329737
78	NC_009446	ATTTT	2	10	141818	141827	20 %	80 %	0 %	0 %	146329115
79	NC_009446	ATCGT	2	10	142699	142708	20 %	40 %	20 %	20 %	146329115
80	NC_009446	ATAAA	2	10	148410	148419	80 %	20 %	0 %	0 %	146328918
81	NC_009446	CGCGG	2	10	154791	154800	0 %	0 %	60 %	40 %	146328774
82	NC_009446	AAATT	2	10	154871	154880	60 %	40 %	0 %	0 %	146328774
83	NC_009446	AATAA	2	10	155292	155301	80 %	20 %	0 %	0 %	146329497
84	NC_009446	CACCG	2	10	159008	159017	20 %	0 %	20 %	60 %	146329048
85	NC_009446	TTGAA	2	10	159398	159407	40 %	40 %	20 %	0 %	146329048
86	NC_009446	CGCAG	2	10	161809	161818	20 %	0 %	40 %	40 %	146329347
87	NC_009446	GCCGA	2	10	164651	164660	20 %	0 %	40 %	40 %	146328740
88	NC_009446	GCGCC	2	10	165537	165546	0 %	0 %	40 %	60 %	146329783
89	NC_009446	GCAAA	2	10	167365	167374	60 %	0 %	20 %	20 %	146328823
90	NC_009446	GATTT	2	10	167386	167395	20 %	60 %	20 %	0 %	146328823
91	NC_009446	CAATT	2	10	174185	174194	40 %	40 %	0 %	20 %	146329148
92	NC_009446	GCCGC	2	10	174513	174522	0 %	0 %	40 %	60 %	146329148
93	NC_009446	ACGCC	2	10	180427	180436	20 %	0 %	20 %	60 %	146329180
94	NC_009446	CCATC	2	10	181713	181722	20 %	20 %	0 %	60 %	146329710
95	NC_009446	AAGCC	2	10	181871	181880	40 %	0 %	20 %	40 %	146329710
96	NC_009446	GCATG	2	10	183171	183180	20 %	20 %	40 %	20 %	146329710
97	NC_009446	TCAGT	2	10	184110	184119	20 %	40 %	20 %	20 %	146329710
98	NC_009446	GTCCA	2	10	185831	185840	20 %	20 %	20 %	40 %	146328877
99	NC_009446	CGCTG	2	10	185863	185872	0 %	20 %	40 %	40 %	146328877
100	NC_009446	GGAAT	2	10	186313	186322	40 %	20 %	40 %	0 %	146328877
101	NC_009446	AGGCC	2	10	187320	187329	20 %	0 %	40 %	40 %	146329856
102	NC_009446	CGAGG	2	10	188766	188775	20 %	0 %	60 %	20 %	146329165
103	NC_009446	GCCGC	2	10	190800	190809	0 %	0 %	40 %	60 %	146329165
104	NC_009446	AGCGG	2	10	191313	191322	20 %	0 %	60 %	20 %	146329165
105	NC_009446	GCAAC	2	10	191498	191507	40 %	0 %	20 %	40 %	146328733
106	NC_009446	TGGTC	2	10	191979	191988	0 %	40 %	40 %	20 %	146328764
107	NC_009446	CATCG	2	10	192044	192053	20 %	20 %	20 %	40 %	146328764
108	NC_009446	GGTCG	2	10	193336	193345	0 %	20 %	60 %	20 %	146329329
109	NC_009446	CCTTT	2	10	194946	194955	0 %	60 %	0 %	40 %	146329329
110	NC_009446	CTTTC	2	10	195037	195046	0 %	60 %	0 %	40 %	146329329
111	NC_009446	GGCCG	2	10	196013	196022	0 %	0 %	60 %	40 %	146329396
112	NC_009446	CTGGC	2	10	196914	196923	0 %	20 %	40 %	40 %	146329396
113	NC_009446	AAGCG	2	10	198967	198976	40 %	0 %	40 %	20 %	146329396
114	NC_009446	TCGGC	2	10	200151	200160	0 %	20 %	40 %	40 %	146328698
115	NC_009446	CCCGG	2	10	201531	201540	0 %	0 %	40 %	60 %	146328955
116	NC_009446	CGGCG	2	10	203034	203043	0 %	0 %	60 %	40 %	146329023
117	NC_009446	CTTCG	2	10	203671	203680	0 %	40 %	20 %	40 %	146329559
118	NC_009446	ACACC	2	10	204717	204726	40 %	0 %	0 %	60 %	146329075
119	NC_009446	CGCAG	2	10	205113	205122	20 %	0 %	40 %	40 %	146329075
120	NC_009446	GCCGC	2	10	205180	205189	0 %	0 %	40 %	60 %	146329075
121	NC_009446	GAGCC	2	10	206297	206306	20 %	0 %	40 %	40 %	146329075
122	NC_009446	CCATT	2	10	209682	209691	20 %	40 %	0 %	40 %	146329528
123	NC_009446	ATTAA	2	10	211286	211295	60 %	40 %	0 %	0 %	146328841
124	NC_009446	CTCAA	2	10	213762	213771	40 %	20 %	0 %	40 %	146329683
125	NC_009446	GGAAA	2	10	219294	219303	60 %	0 %	40 %	0 %	146329759
126	NC_009446	CGCGC	2	10	220339	220348	0 %	0 %	40 %	60 %	146329458
127	NC_009446	GCTGT	2	10	222268	222277	0 %	40 %	40 %	20 %	146329645
128	NC_009446	CACAA	2	10	225076	225085	60 %	0 %	0 %	40 %	146328731
129	NC_009446	CAAAA	2	10	226777	226786	80 %	0 %	0 %	20 %	146328637
130	NC_009446	GGCGA	2	10	230500	230509	20 %	0 %	60 %	20 %	146329122
131	NC_009446	TTTTG	2	10	231226	231235	0 %	80 %	20 %	0 %	146328684
132	NC_009446	GGCAA	2	10	232363	232372	40 %	0 %	40 %	20 %	146329166
133	NC_009446	GGTGA	2	10	235868	235877	20 %	20 %	60 %	0 %	146328807
134	NC_009446	CGTAA	2	10	238443	238452	40 %	20 %	20 %	20 %	146329854
135	NC_009446	CCAAA	2	10	238665	238674	60 %	0 %	0 %	40 %	146329854
136	NC_009446	AACCA	2	10	249413	249422	60 %	0 %	0 %	40 %	146329429
137	NC_009446	TCAAT	2	10	251264	251273	40 %	40 %	0 %	20 %	146329491
138	NC_009446	ATCTC	2	10	251335	251344	20 %	40 %	0 %	40 %	146329491
139	NC_009446	CGGCG	2	10	252486	252495	0 %	0 %	60 %	40 %	146329011
140	NC_009446	CGGCG	2	10	252717	252726	0 %	0 %	60 %	40 %	146329011
141	NC_009446	CGAAG	2	10	252924	252933	40 %	0 %	40 %	20 %	146329011
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148	NC_009446	TCCAT	2	10	277334	277343	20 %	40 %	0 %	40 %	146329264
149	NC_009446	GTTTT	2	10	279180	279189	0 %	80 %	20 %	0 %	146329884
150	NC_009446	TTCCG	2	10	279220	279229	0 %	40 %	20 %	40 %	146329884
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152	NC_009446	ATTTT	2	10	279743	279752	20 %	80 %	0 %	0 %	146329781
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261	NC_009446	TTTTG	2	10	477897	477906	0 %	80 %	20 %	0 %	146329400
262	NC_009446	GTTTG	2	10	477963	477972	0 %	60 %	40 %	0 %	146329400
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