MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 1024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	GGCCAG	2	12	5956	5967	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134297887
2	NC_009253	TGTAAG	2	12	20897	20908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297894
3	NC_009253	TTGGCC	2	12	21885	21896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297895
4	NC_009253	AGGTTG	2	12	22491	22502	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134297895
5	NC_009253	GCTTTA	2	12	27063	27074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134297899
6	NC_009253	AGTTTT	2	12	27139	27150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134297899
7	NC_009253	TTTTTC	2	12	28421	28432	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134297901
8	NC_009253	GCCTAT	2	12	33420	33431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134297904
9	NC_009253	AAATCG	2	12	34404	34415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134297905
10	NC_009253	GACAGG	2	12	36163	36174	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134297906
11	NC_009253	TTTAGG	2	12	40983	40994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134297912
12	NC_009253	TACCAC	2	12	41665	41676	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134297913
13	NC_009253	TTTAAT	2	12	42614	42625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297914
14	NC_009253	AGCAAA	2	12	45610	45621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134297917
15	NC_009253	TCGTAT	2	12	51303	51314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134297920
16	NC_009253	ACCGCC	2	12	57204	57215	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	134297926
17	NC_009253	AAAGAT	2	12	60193	60204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134297930
18	NC_009253	CAGGTC	2	12	60956	60967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134297931
19	NC_009253	AAACCA	2	12	65031	65042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297934
20	NC_009253	GGAAGG	2	12	69903	69914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297940
21	NC_009253	TAAAAA	2	12	70004	70015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134297940
22	NC_009253	GTTTTG	2	12	77652	77663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297949
23	NC_009253	AACCAC	2	12	87650	87661	50 %	0 %	0 %	50 %	134297960
24	NC_009253	ATATTG	2	12	90492	90503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134297962
25	NC_009253	GTTGAT	2	12	90515	90526	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134297962
26	NC_009253	AGGGGT	2	12	100373	100384	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	134297972
27	NC_009253	GGGACT	2	12	101084	101095	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134297973
28	NC_009253	TTGGAA	2	12	101855	101866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297974
29	NC_009253	GTACGG	2	12	104528	104539	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134297977
30	NC_009253	CCCGGG	2	12	106652	106663	0 %	0 %	50 %	50 %	134297979
31	NC_009253	ATTTAC	2	12	111121	111132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134297984
32	NC_009253	AAAAAG	2	12	114934	114945	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134297988
33	NC_009253	CCAAGG	2	12	117460	117471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297990
34	NC_009253	GCCTAT	2	12	118536	118547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134297990
35	NC_009253	GATAAA	2	12	124247	124258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134297996
36	NC_009253	AAAGTA	2	12	126656	126667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134298001
37	NC_009253	AATGGA	2	12	130029	130040	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134298003
38	NC_009253	AGATCA	2	12	130235	130246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134298003
39	NC_009253	TGTGGG	2	12	132882	132893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134298005
40	NC_009253	CCGGGC	2	12	139619	139630	0 %	0 %	50 %	50 %	134298011
41	NC_009253	CCATGC	2	12	145893	145904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134298016
42	NC_009253	ACCAAA	2	12	147086	147097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134298016
43	NC_009253	CCATGC	2	12	153931	153942	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134298021
44	NC_009253	ACCAAA	2	12	155124	155135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134298021
45	NC_009253	TCATGG	2	12	162109	162120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298028
46	NC_009253	AGCCAC	2	12	162131	162142	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134298028
47	NC_009253	TTAGAT	2	12	162936	162947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134298029
48	NC_009253	TACCAG	2	12	163761	163772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134298031
49	NC_009253	GGTTAT	2	12	163815	163826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134298031
50	NC_009253	GTACCG	2	12	164762	164773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134298032
51	NC_009253	CATGGA	2	12	173058	173069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298042
52	NC_009253	TTGAGG	2	12	174532	174543	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134298043
53	NC_009253	TCAATT	2	12	181733	181744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134298051
54	NC_009253	TCCTGT	2	12	197879	197890	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	134298060
55	NC_009253	AGCTAA	2	12	199537	199548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134298061
56	NC_009253	TTACCT	2	12	210631	210642	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134298073
57	NC_009253	GGCTAA	2	12	214461	214472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298077
58	NC_009253	GCGAGT	2	12	215015	215026	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134298077
59	NC_009253	GTAGAT	2	12	215551	215562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298077
60	NC_009253	TAAAGT	2	12	217166	217177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134298080
61	NC_009253	GAAGCT	2	12	218015	218026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298082
62	NC_009253	GGTCTG	2	12	219480	219491	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134298084
63	NC_009253	GATGTA	2	12	221121	221132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298085
64	NC_009253	GAAGAG	2	12	223338	223349	50 %	0 %	50 %	0 %	134298085
65	NC_009253	CAGGCC	2	12	225985	225996	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134298086
66	NC_009253	TTTGAA	2	12	226657	226668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134298086
67	NC_009253	ACCACT	2	12	228416	228427	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134298090
68	NC_009253	ATTACC	2	12	228527	228538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134298090
69	NC_009253	GGCTAA	2	12	230471	230482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298091
70	NC_009253	GCGAGT	2	12	231025	231036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134298091
71	NC_009253	GTAGAT	2	12	231561	231572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298091
72	NC_009253	GGTGCA	2	12	234197	234208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134298096
73	NC_009253	TGAACC	2	12	239394	239405	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134298108
74	NC_009253	AAAGGT	2	12	239410	239421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134298108
75	NC_009253	ACGAAA	2	12	239429	239440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134298108
76	NC_009253	CAAGCA	2	12	243764	243775	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	134298117
77	NC_009253	AGATTG	2	12	245316	245327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298121
78	NC_009253	CTGGAA	2	12	247359	247370	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298123
79	NC_009253	TGACCA	2	12	248962	248973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134298125
80	NC_009253	CAGTTT	2	12	249731	249742	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134298126
81	NC_009253	ACCGGG	2	12	251290	251301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134298127
82	NC_009253	GAAATT	2	12	258877	258888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134298136
83	NC_009253	ATTTTG	2	12	259114	259125	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134298136
84	NC_009253	GCGGAC	2	12	264701	264712	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134298140
85	NC_009253	CACAGC	2	12	266195	266206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134298141
86	NC_009253	GTTTAA	2	12	274859	274870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134298149
87	NC_009253	CAATGC	2	12	275594	275605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134298150
88	NC_009253	GTTGCA	2	12	276390	276401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298150
89	NC_009253	GGCTTA	2	12	278514	278525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298152
90	NC_009253	ATGCTG	2	12	283832	283843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298155
91	NC_009253	CGGCAT	2	12	283984	283995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134298155
92	NC_009253	GAACTG	2	12	284087	284098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298155
93	NC_009253	CATTGC	2	12	287029	287040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134298157
94	NC_009253	GGCCCA	2	12	288239	288250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134298158
95	NC_009253	GATTTA	2	12	288777	288788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134298158
96	NC_009253	TACACC	2	12	290860	290871	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134298159
97	NC_009253	GATGCA	2	12	291888	291899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298161
98	NC_009253	GCCCAG	2	12	291960	291971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134298161
99	NC_009253	CTTAAA	2	12	294815	294826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134298163
100	NC_009253	TATAAA	2	12	300275	300286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134298167
101	NC_009253	TTTTTC	2	12	301333	301344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134298168
102	NC_009253	AGCGGT	2	12	302944	302955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134298169
103	NC_009253	CATTGG	2	12	308116	308127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298173
104	NC_009253	AAGGTA	2	12	310574	310585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134298174
105	NC_009253	AAAGGC	2	12	316517	316528	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134298178
106	NC_009253	TCCACA	2	12	318811	318822	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134298180
107	NC_009253	ACCAGT	2	12	333014	333025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134298196
108	NC_009253	CGGTAT	2	12	334778	334789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298197
109	NC_009253	TTTGGC	2	12	336731	336742	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	134298199
110	NC_009253	AGTGTA	2	12	348283	348294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298210
111	NC_009253	TGGTGA	3	18	350982	350999	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134298213
112	NC_009253	GGTGAT	2	12	351611	351622	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134298214
113	NC_009253	AACAGC	2	12	354990	355001	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	134298218
114	NC_009253	CTGGCC	2	12	356237	356248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134298219
115	NC_009253	AGGACC	2	12	358532	358543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134298221
116	NC_009253	AAACAA	2	12	367769	367780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	134298226
117	NC_009253	AGTTGT	2	12	368047	368058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134298226
118	NC_009253	CCTAAA	2	12	368731	368742	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134298226
119	NC_009253	CTATGG	2	12	374681	374692	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298232
120	NC_009253	TATGGG	2	12	380107	380118	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134298236
121	NC_009253	TAATTT	2	12	381353	381364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134298236
122	NC_009253	AAGAAT	2	12	384157	384168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134298239
123	NC_009253	GAAGGT	2	12	388118	388129	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	134298242
124	NC_009253	TTAGAC	2	12	389655	389666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134298244
125	NC_009253	GTTCTT	2	12	396131	396142	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	134298250
126	NC_009253	ACCAAC	2	12	397604	397615	50 %	0 %	0 %	50 %	134298251
127	NC_009253	TATCAA	2	12	402468	402479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134298254
128	NC_009253	AATTAT	2	12	403332	403343	50 %	50 %	0 %	0 %	134298255
129	NC_009253	CGAAAT	2	12	413230	413241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134298260
130	NC_009253	AAATGC	2	12	415282	415293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134298261
131	NC_009253	AATGGC	2	12	419610	419621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298264
132	NC_009253	CAAAGA	2	12	426499	426510	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134298270
133	NC_009253	ATTGCC	2	12	426511	426522	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134298270
134	NC_009253	CGGTGG	2	12	428150	428161	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	134298272
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136	NC_009253	GGTGCA	2	12	436505	436516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134298277
137	NC_009253	TATTGA	2	12	449353	449364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134298284
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139	NC_009253	TGGATG	2	12	459655	459666	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134298295
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144	NC_009253	CCTTAA	2	12	473829	473840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134298307
145	NC_009253	TGGGCT	2	12	475891	475902	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134298308
146	NC_009253	AGGAAG	2	12	478147	478158	50 %	0 %	50 %	0 %	134298309
147	NC_009253	AAAGTA	2	12	479796	479807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134298311
148	NC_009253	GTGATT	2	12	482572	482583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134298313
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152	NC_009253	AAAGTA	2	12	492141	492152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134298324
153	NC_009253	TTACTG	2	12	495398	495409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134298328
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217	NC_009253	TCACAG	2	12	709010	709021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134298525
218	NC_009253	TCGGTA	2	12	710228	710239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298527
219	NC_009253	GGTAAT	2	12	712199	712210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298529
220	NC_009253	CACTGC	2	12	726095	726106	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134298540
221	NC_009253	TCCCTA	2	12	730140	730151	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134298543
222	NC_009253	GGTGCC	2	12	732353	732364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134298545
223	NC_009253	GAAATG	2	12	737946	737957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134298552
224	NC_009253	GATTAA	2	12	740271	740282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134298553
225	NC_009253	AAGCGG	2	12	746309	746320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134298559
226	NC_009253	TGGGGT	2	12	757137	757148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134298571
227	NC_009253	CAGATG	2	12	761320	761331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298574
228	NC_009253	TGTGGG	2	12	761630	761641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134298574
229	NC_009253	GATGTG	2	12	764306	764317	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134298577
230	NC_009253	GCCGAA	2	12	770821	770832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134298586
231	NC_009253	CCTATT	2	12	771622	771633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134298586
232	NC_009253	GGTAAG	2	12	771781	771792	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	134298586
233	NC_009253	ACGGAA	2	12	778166	778177	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134298591
234	NC_009253	TGTTTT	2	12	788492	788503	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	134298601
235	NC_009253	AGAGGG	2	12	789147	789158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134298601
236	NC_009253	GCGAAT	2	12	794042	794053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298608
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239	NC_009253	GGGCAA	2	12	800423	800434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134298614
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243	NC_009253	ATGCTG	2	12	817900	817911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298631
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249	NC_009253	TATGGA	2	12	836255	836266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298648
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258	NC_009253	TTTCAG	2	12	881120	881131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134298689
259	NC_009253	ATTAAT	2	12	881934	881945	50 %	50 %	0 %	0 %	134298690
260	NC_009253	TTTCAT	2	12	890934	890945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134298700
261	NC_009253	CAAAAA	2	12	896528	896539	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	134298705
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300	NC_009253	CCGGTA	2	12	1033257	1033268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134298840
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327	NC_009253	CAAAGG	2	12	1129907	1129918	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134298919
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329	NC_009253	AAACAA	2	12	1134164	1134175	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	134298925
330	NC_009253	GGATAC	2	12	1134988	1134999	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134298926
331	NC_009253	AAATAG	2	12	1135525	1135536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134298927
332	NC_009253	AAGTTG	2	12	1139574	1139585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298930
333	NC_009253	TACGAA	2	12	1141347	1141358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134298934
334	NC_009253	GTTGTG	2	12	1142119	1142130	0 %	50 %	50 %	0 %	134298934
335	NC_009253	TTGAAA	2	12	1142762	1142773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134298935
336	NC_009253	TGGCCA	2	12	1144303	1144314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134298936
337	NC_009253	GGAATT	2	12	1146460	1146471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298939
338	NC_009253	TGGATA	2	12	1152025	1152036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134298944
339	NC_009253	GATTAA	2	12	1156535	1156546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134298949
340	NC_009253	AGTGGC	2	12	1157971	1157982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134298950
341	NC_009253	GCAAAG	2	12	1165070	1165081	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134298956
342	NC_009253	TTGGCA	2	12	1165317	1165328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134298956
343	NC_009253	GGTGTG	2	12	1173319	1173330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134298965
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345	NC_009253	TAGTTT	2	12	1190101	1190112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134298983
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444	NC_009253	CTGTCC	2	12	1600445	1600456	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	134299332
445	NC_009253	TTTAAA	2	12	1604363	1604374	50 %	50 %	0 %	0 %	134299337
446	NC_009253	AAATAA	2	12	1610740	1610751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134299346
447	NC_009253	ATTAAC	2	12	1617429	1617440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134299353
448	NC_009253	CAGTGG	2	12	1620844	1620855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134299354
449	NC_009253	TATGGC	2	12	1626693	1626704	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134299358
450	NC_009253	ATCACC	2	12	1628511	1628522	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134299359
451	NC_009253	GCATTG	2	12	1629247	1629258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134299360
452	NC_009253	GCACTG	2	12	1631019	1631030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134299361
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