MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 40088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	ATG	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
2	NC_009253	TAA	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
3	NC_009253	ATA	2	6	480	485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
4	NC_009253	ATT	2	6	488	493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
5	NC_009253	TAT	2	6	547	552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
6	NC_009253	TAT	2	6	571	576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
7	NC_009253	GAA	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297882
8	NC_009253	TGC	2	6	733	738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297882
9	NC_009253	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
10	NC_009253	GGT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297882
11	NC_009253	GAT	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
12	NC_009253	GTA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
13	NC_009253	GAC	2	6	983	988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297882
14	NC_009253	GAA	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297882
15	NC_009253	AAT	2	6	1069	1074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
16	NC_009253	TCC	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134297882
17	NC_009253	TAA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
18	NC_009253	TGA	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
19	NC_009253	TTC	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297882
20	NC_009253	ATT	2	6	1403	1408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
21	NC_009253	TAA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
22	NC_009253	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
23	NC_009253	TGG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297882
24	NC_009253	TTC	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297882
25	NC_009253	AAT	2	6	1686	1691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
26	NC_009253	AAT	2	6	1928	1933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
27	NC_009253	ACT	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297883
28	NC_009253	ATA	2	6	2038	2043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
29	NC_009253	TGT	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297883
30	NC_009253	AAG	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297883
31	NC_009253	TAA	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
32	NC_009253	GAA	3	9	2313	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297883
33	NC_009253	ACA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297883
34	NC_009253	ATT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297883
35	NC_009253	TGC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297883
36	NC_009253	CAA	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297883
37	NC_009253	AAT	2	6	2585	2590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
38	NC_009253	GGA	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297883
39	NC_009253	CTA	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297883
40	NC_009253	TTG	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297883
41	NC_009253	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297883
42	NC_009253	GAA	3	9	2775	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297883
43	NC_009253	ATA	2	6	2917	2922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
44	NC_009253	TGA	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297883
45	NC_009253	AAC	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297883
46	NC_009253	TGG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297884
47	NC_009253	AAG	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
48	NC_009253	TCT	2	6	3484	3489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297885
49	NC_009253	GTA	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297885
50	NC_009253	AGA	2	6	3603	3608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
51	NC_009253	TAA	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297885
52	NC_009253	AAG	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
53	NC_009253	AAC	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297885
54	NC_009253	GGA	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297885
55	NC_009253	GAA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
56	NC_009253	CAT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297885
57	NC_009253	GAT	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297885
58	NC_009253	GCA	2	6	4104	4109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297885
59	NC_009253	TAC	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297885
60	NC_009253	AAC	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297885
61	NC_009253	GGT	2	6	4288	4293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297885
62	NC_009253	GAA	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
63	NC_009253	CTC	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134297885
64	NC_009253	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297885
65	NC_009253	GTA	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297886
66	NC_009253	CAC	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134297886
67	NC_009253	CAG	3	9	4817	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297887
68	NC_009253	AAT	2	6	4826	4831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297887
69	NC_009253	GTA	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297887
70	NC_009253	CAT	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297887
71	NC_009253	TGA	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297887
72	NC_009253	ATT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297887
73	NC_009253	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297887
74	NC_009253	TGC	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297887
75	NC_009253	GTG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297887
76	NC_009253	AAC	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297887
77	NC_009253	GTT	2	6	5573	5578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297887
78	NC_009253	CGG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134297887
79	NC_009253	AGC	2	6	5971	5976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297887
80	NC_009253	CGG	2	6	6102	6107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134297887
81	NC_009253	GAA	2	6	6215	6220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297887
82	NC_009253	TTA	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297887
83	NC_009253	TTG	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297887
84	NC_009253	AGA	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297887
85	NC_009253	ATT	2	6	6481	6486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297887
86	NC_009253	AAC	2	6	6552	6557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297887
87	NC_009253	AGA	2	6	6610	6615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297887
88	NC_009253	AAG	2	6	6670	6675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297887
89	NC_009253	GAA	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
90	NC_009253	ATG	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
91	NC_009253	CCG	2	6	7340	7345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134297888
92	NC_009253	ACC	2	6	7540	7545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134297888
93	NC_009253	TGA	3	9	7578	7586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
94	NC_009253	GAT	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
95	NC_009253	TGA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
96	NC_009253	ACC	2	6	7730	7735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134297888
97	NC_009253	CTT	2	6	7946	7951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297888
98	NC_009253	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297888
99	NC_009253	TAA	2	6	8005	8010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297888
100	NC_009253	TTA	2	6	8169	8174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297888
101	NC_009253	GAA	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
102	NC_009253	ATT	2	6	8390	8395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297888
103	NC_009253	TGG	2	6	8409	8414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297888
104	NC_009253	TGC	2	6	8461	8466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297888
105	NC_009253	TGA	2	6	8494	8499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
106	NC_009253	AGA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
107	NC_009253	GGT	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297888
108	NC_009253	AGA	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
109	NC_009253	TAT	2	6	8746	8751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297888
110	NC_009253	TTA	2	6	8756	8761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297888
111	NC_009253	TGA	2	6	8773	8778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
112	NC_009253	AAC	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297888
113	NC_009253	GAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
114	NC_009253	GAA	2	6	8857	8862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
115	NC_009253	AAG	2	6	8988	8993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
116	NC_009253	GAA	2	6	9014	9019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
117	NC_009253	AGG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297888
118	NC_009253	GTG	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297888
119	NC_009253	ATA	2	6	9203	9208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297888
120	NC_009253	ACC	2	6	9218	9223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134297888
121	NC_009253	GTA	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
122	NC_009253	GAA	2	6	9263	9268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
123	NC_009253	ATG	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297888
124	NC_009253	TAT	2	6	9298	9303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297888
125	NC_009253	TTG	2	6	9390	9395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297888
126	NC_009253	TAA	2	6	9408	9413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297888
127	NC_009253	AGA	2	6	9415	9420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297888
128	NC_009253	ACA	2	6	13502	13507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297889
129	NC_009253	GCA	2	6	13519	13524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297889
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