MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	GC	3	6	256	261	0 %	0 %	50 %	50 %	120586809
2	NC_008741	GC	3	6	384	389	0 %	0 %	50 %	50 %	120586809
3	NC_008741	GC	3	6	435	440	0 %	0 %	50 %	50 %	120586809
4	NC_008741	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	120586809
5	NC_008741	GC	3	6	1982	1987	0 %	0 %	50 %	50 %	120586809
6	NC_008741	CT	4	8	2246	2253	0 %	50 %	0 %	50 %	120586809
7	NC_008741	GT	3	6	2571	2576	0 %	50 %	50 %	0 %	120586809
8	NC_008741	GT	3	6	3035	3040	0 %	50 %	50 %	0 %	120586809
9	NC_008741	GC	3	6	3054	3059	0 %	0 %	50 %	50 %	120586809
10	NC_008741	GT	3	6	3291	3296	0 %	50 %	50 %	0 %	120586809
11	NC_008741	GT	3	6	3782	3787	0 %	50 %	50 %	0 %	120586810
12	NC_008741	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	120586812
13	NC_008741	GC	3	6	6443	6448	0 %	0 %	50 %	50 %	120586812
14	NC_008741	GC	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	120586812
15	NC_008741	AG	3	6	7168	7173	50 %	0 %	50 %	0 %	120586812
16	NC_008741	CG	3	6	7577	7582	0 %	0 %	50 %	50 %	120586813
17	NC_008741	AG	3	6	8506	8511	50 %	0 %	50 %	0 %	120586814
18	NC_008741	CG	4	8	8865	8872	0 %	0 %	50 %	50 %	120586814
19	NC_008741	CG	3	6	10051	10056	0 %	0 %	50 %	50 %	120586815
20	NC_008741	CG	3	6	10184	10189	0 %	0 %	50 %	50 %	120586815
21	NC_008741	CG	3	6	10322	10327	0 %	0 %	50 %	50 %	120586815
22	NC_008741	GC	3	6	11173	11178	0 %	0 %	50 %	50 %	120586816
23	NC_008741	GC	3	6	11226	11231	0 %	0 %	50 %	50 %	120586816
24	NC_008741	CG	4	8	11934	11941	0 %	0 %	50 %	50 %	120586816
25	NC_008741	CG	3	6	13187	13192	0 %	0 %	50 %	50 %	120586816
26	NC_008741	GC	3	6	13690	13695	0 %	0 %	50 %	50 %	120586816
27	NC_008741	CG	3	6	14062	14067	0 %	0 %	50 %	50 %	120586817
28	NC_008741	CG	3	6	14180	14185	0 %	0 %	50 %	50 %	120586817
29	NC_008741	GC	3	6	14964	14969	0 %	0 %	50 %	50 %	120586817
30	NC_008741	GC	3	6	15725	15730	0 %	0 %	50 %	50 %	120586818
31	NC_008741	GC	3	6	16399	16404	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
32	NC_008741	GC	3	6	17801	17806	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
33	NC_008741	GC	3	6	17933	17938	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
34	NC_008741	CG	3	6	17942	17947	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
35	NC_008741	GC	3	6	18167	18172	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
36	NC_008741	CG	3	6	19097	19102	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
37	NC_008741	GA	3	6	19469	19474	50 %	0 %	50 %	0 %	120586819
38	NC_008741	GC	3	6	19667	19672	0 %	0 %	50 %	50 %	120586819
39	NC_008741	GC	3	6	21102	21107	0 %	0 %	50 %	50 %	120586820
40	NC_008741	CG	3	6	21263	21268	0 %	0 %	50 %	50 %	120586820
41	NC_008741	CG	3	6	21638	21643	0 %	0 %	50 %	50 %	120586820
42	NC_008741	GC	3	6	24650	24655	0 %	0 %	50 %	50 %	120586822
43	NC_008741	CT	3	6	24915	24920	0 %	50 %	0 %	50 %	120586822
44	NC_008741	AC	3	6	26317	26322	50 %	0 %	0 %	50 %	120586823
45	NC_008741	TC	3	6	27252	27257	0 %	50 %	0 %	50 %	120586823
46	NC_008741	GC	3	6	27383	27388	0 %	0 %	50 %	50 %	120586823
47	NC_008741	CG	3	6	27490	27495	0 %	0 %	50 %	50 %	120586823
48	NC_008741	CA	3	6	27694	27699	50 %	0 %	0 %	50 %	120586823
49	NC_008741	CG	3	6	27782	27787	0 %	0 %	50 %	50 %	120586823
50	NC_008741	TC	3	6	29326	29331	0 %	50 %	0 %	50 %	120586825
51	NC_008741	GC	3	6	33467	33472	0 %	0 %	50 %	50 %	120586827
52	NC_008741	CT	3	6	34330	34335	0 %	50 %	0 %	50 %	120586828
53	NC_008741	GC	3	6	34359	34364	0 %	0 %	50 %	50 %	120586828
54	NC_008741	GA	3	6	35992	35997	50 %	0 %	50 %	0 %	120586830
55	NC_008741	GC	3	6	36413	36418	0 %	0 %	50 %	50 %	120586830
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58	NC_008741	CT	3	6	39089	39094	0 %	50 %	0 %	50 %	120586832
59	NC_008741	GC	4	8	39617	39624	0 %	0 %	50 %	50 %	120586832
60	NC_008741	GT	3	6	40311	40316	0 %	50 %	50 %	0 %	120586832
61	NC_008741	TG	3	6	41035	41040	0 %	50 %	50 %	0 %	120586833
62	NC_008741	GC	4	8	42742	42749	0 %	0 %	50 %	50 %	120586833
63	NC_008741	CG	3	6	43157	43162	0 %	0 %	50 %	50 %	120586833
64	NC_008741	CG	3	6	43177	43182	0 %	0 %	50 %	50 %	120586833
65	NC_008741	GC	3	6	43275	43280	0 %	0 %	50 %	50 %	120586834
66	NC_008741	GC	3	6	44474	44479	0 %	0 %	50 %	50 %	120586835
67	NC_008741	GC	3	6	45271	45276	0 %	0 %	50 %	50 %	120586835
68	NC_008741	AG	3	6	45768	45773	50 %	0 %	50 %	0 %	120586836
69	NC_008741	GA	3	6	45804	45809	50 %	0 %	50 %	0 %	120586837
70	NC_008741	CG	3	6	46406	46411	0 %	0 %	50 %	50 %	120586838
71	NC_008741	CG	3	6	47473	47478	0 %	0 %	50 %	50 %	120586839
72	NC_008741	GA	3	6	48127	48132	50 %	0 %	50 %	0 %	120586839
73	NC_008741	GA	3	6	48439	48444	50 %	0 %	50 %	0 %	120586840
74	NC_008741	CG	4	8	49100	49107	0 %	0 %	50 %	50 %	120586841
75	NC_008741	TC	3	6	49263	49268	0 %	50 %	0 %	50 %	120586841
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77	NC_008741	GA	3	6	50227	50232	50 %	0 %	50 %	0 %	120586842
78	NC_008741	GA	3	6	50479	50484	50 %	0 %	50 %	0 %	120586842
79	NC_008741	CG	3	6	51639	51644	0 %	0 %	50 %	50 %	120586843
80	NC_008741	GC	3	6	51776	51781	0 %	0 %	50 %	50 %	120586844
81	NC_008741	CG	3	6	52225	52230	0 %	0 %	50 %	50 %	120586844
82	NC_008741	CG	3	6	53134	53139	0 %	0 %	50 %	50 %	120586845
83	NC_008741	GC	3	6	54156	54161	0 %	0 %	50 %	50 %	120586846
84	NC_008741	CG	3	6	55201	55206	0 %	0 %	50 %	50 %	120586849
85	NC_008741	GC	3	6	55371	55376	0 %	0 %	50 %	50 %	120586849
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87	NC_008741	CG	3	6	56508	56513	0 %	0 %	50 %	50 %	120586850
88	NC_008741	GC	3	6	57307	57312	0 %	0 %	50 %	50 %	120586851
89	NC_008741	TA	3	6	57833	57838	50 %	50 %	0 %	0 %	120586851
90	NC_008741	CG	3	6	58252	58257	0 %	0 %	50 %	50 %	120586851
91	NC_008741	CG	3	6	58429	58434	0 %	0 %	50 %	50 %	120586851
92	NC_008741	TG	3	6	58929	58934	0 %	50 %	50 %	0 %	120586851
93	NC_008741	GC	3	6	59779	59784	0 %	0 %	50 %	50 %	120586852
94	NC_008741	GA	3	6	60501	60506	50 %	0 %	50 %	0 %	120586853
95	NC_008741	GC	3	6	61284	61289	0 %	0 %	50 %	50 %	120586854
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102	NC_008741	GC	3	6	66435	66440	0 %	0 %	50 %	50 %	120586862
103	NC_008741	GC	3	6	66491	66496	0 %	0 %	50 %	50 %	120586862
104	NC_008741	CG	3	6	66997	67002	0 %	0 %	50 %	50 %	120586862
105	NC_008741	CT	3	6	67107	67112	0 %	50 %	0 %	50 %	120586862
106	NC_008741	CG	3	6	67282	67287	0 %	0 %	50 %	50 %	120586862
107	NC_008741	GC	3	6	67458	67463	0 %	0 %	50 %	50 %	120586862
108	NC_008741	TC	3	6	67478	67483	0 %	50 %	0 %	50 %	120586862
109	NC_008741	GC	3	6	69494	69499	0 %	0 %	50 %	50 %	120586865
110	NC_008741	CG	3	6	69996	70001	0 %	0 %	50 %	50 %	120586865
111	NC_008741	GC	3	6	70319	70324	0 %	0 %	50 %	50 %	120586865
112	NC_008741	GC	3	6	70988	70993	0 %	0 %	50 %	50 %	120586866
113	NC_008741	GC	3	6	71083	71088	0 %	0 %	50 %	50 %	120586866
114	NC_008741	GC	3	6	71306	71311	0 %	0 %	50 %	50 %	120586866
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119	NC_008741	GC	3	6	74132	74137	0 %	0 %	50 %	50 %	120586868
120	NC_008741	GC	3	6	74190	74195	0 %	0 %	50 %	50 %	120586868
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123	NC_008741	CT	3	6	75615	75620	0 %	50 %	0 %	50 %	120586869
124	NC_008741	GC	3	6	77226	77231	0 %	0 %	50 %	50 %	120586870
125	NC_008741	GC	3	6	77301	77306	0 %	0 %	50 %	50 %	120586870
126	NC_008741	GA	3	6	77495	77500	50 %	0 %	50 %	0 %	120586870
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.