MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	CGCT	2	8	791	798	0 %	25 %	25 %	50 %	120586809
2	NC_008741	GCCC	2	8	1169	1176	0 %	0 %	25 %	75 %	120586809
3	NC_008741	GCCC	2	8	1394	1401	0 %	0 %	25 %	75 %	120586809
4	NC_008741	CGCC	2	8	1418	1425	0 %	0 %	25 %	75 %	120586809
5	NC_008741	CTGC	2	8	1892	1899	0 %	25 %	25 %	50 %	120586809
6	NC_008741	ACGG	2	8	2029	2036	25 %	0 %	50 %	25 %	120586809
7	NC_008741	TCCC	2	8	2674	2681	0 %	25 %	0 %	75 %	120586809
8	NC_008741	TGGC	2	8	2989	2996	0 %	25 %	50 %	25 %	120586809
9	NC_008741	TCAG	2	8	3091	3098	25 %	25 %	25 %	25 %	120586809
10	NC_008741	TCTG	2	8	3450	3457	0 %	50 %	25 %	25 %	120586809
11	NC_008741	GCTG	2	8	3661	3668	0 %	25 %	50 %	25 %	120586810
12	NC_008741	GGGC	2	8	3995	4002	0 %	0 %	75 %	25 %	120586810
13	NC_008741	TGGC	2	8	5068	5075	0 %	25 %	50 %	25 %	120586811
14	NC_008741	GGTC	2	8	6586	6593	0 %	25 %	50 %	25 %	120586812
15	NC_008741	GGGC	2	8	6897	6904	0 %	0 %	75 %	25 %	120586812
16	NC_008741	CTGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	120586814
17	NC_008741	GGGC	2	8	8637	8644	0 %	0 %	75 %	25 %	120586814
18	NC_008741	GTCG	2	8	9713	9720	0 %	25 %	50 %	25 %	120586815
19	NC_008741	GCCC	2	8	10499	10506	0 %	0 %	25 %	75 %	120586815
20	NC_008741	GCCC	2	8	10544	10551	0 %	0 %	25 %	75 %	120586815
21	NC_008741	ATGG	2	8	10629	10636	25 %	25 %	50 %	0 %	120586815
22	NC_008741	CCCG	2	8	11014	11021	0 %	0 %	25 %	75 %	120586816
23	NC_008741	CGCC	2	8	11583	11590	0 %	0 %	25 %	75 %	120586816
24	NC_008741	GCCC	2	8	11848	11855	0 %	0 %	25 %	75 %	120586816
25	NC_008741	CGTT	2	8	12459	12466	0 %	50 %	25 %	25 %	120586816
26	NC_008741	ACCC	2	8	12796	12803	25 %	0 %	0 %	75 %	120586816
27	NC_008741	GATG	2	8	13021	13028	25 %	25 %	50 %	0 %	120586816
28	NC_008741	CCCG	2	8	13336	13343	0 %	0 %	25 %	75 %	120586816
29	NC_008741	TGGG	2	8	13529	13536	0 %	25 %	75 %	0 %	120586816
30	NC_008741	GCGG	2	8	13861	13868	0 %	0 %	75 %	25 %	120586816
31	NC_008741	GCCA	2	8	14784	14791	25 %	0 %	25 %	50 %	120586817
32	NC_008741	CGTG	2	8	14984	14991	0 %	25 %	50 %	25 %	120586817
33	NC_008741	GGCG	2	8	15047	15054	0 %	0 %	75 %	25 %	120586817
34	NC_008741	CCGC	2	8	15757	15764	0 %	0 %	25 %	75 %	120586818
35	NC_008741	CGGG	2	8	17061	17068	0 %	0 %	75 %	25 %	120586819
36	NC_008741	GCTG	2	8	17439	17446	0 %	25 %	50 %	25 %	120586819
37	NC_008741	TGCC	2	8	17509	17516	0 %	25 %	25 %	50 %	120586819
38	NC_008741	GGGC	2	8	18102	18109	0 %	0 %	75 %	25 %	120586819
39	NC_008741	TCGC	2	8	18833	18840	0 %	25 %	25 %	50 %	120586819
40	NC_008741	CGGG	2	8	19782	19789	0 %	0 %	75 %	25 %	120586819
41	NC_008741	CAGG	2	8	22113	22120	25 %	0 %	50 %	25 %	120586820
42	NC_008741	GCGG	2	8	22419	22426	0 %	0 %	75 %	25 %	120586820
43	NC_008741	TCCG	2	8	22937	22944	0 %	25 %	25 %	50 %	120586821
44	NC_008741	GCCT	2	8	23028	23035	0 %	25 %	25 %	50 %	120586821
45	NC_008741	ACGG	2	8	23105	23112	25 %	0 %	50 %	25 %	120586821
46	NC_008741	AGGC	2	8	23164	23171	25 %	0 %	50 %	25 %	120586821
47	NC_008741	ATGG	2	8	23240	23247	25 %	25 %	50 %	0 %	120586821
48	NC_008741	ACAA	2	8	23771	23778	75 %	0 %	0 %	25 %	120586822
49	NC_008741	GAAC	2	8	24757	24764	50 %	0 %	25 %	25 %	120586822
50	NC_008741	GGGT	2	8	25200	25207	0 %	25 %	75 %	0 %	120586822
51	NC_008741	CCAT	2	8	25571	25578	25 %	25 %	0 %	50 %	120586822
52	NC_008741	TTCC	2	8	25946	25953	0 %	50 %	0 %	50 %	120586823
53	NC_008741	GCGG	2	8	26042	26049	0 %	0 %	75 %	25 %	120586823
54	NC_008741	CCCG	2	8	26546	26553	0 %	0 %	25 %	75 %	120586823
55	NC_008741	CTGC	2	8	26609	26616	0 %	25 %	25 %	50 %	120586823
56	NC_008741	TCTG	2	8	26692	26699	0 %	50 %	25 %	25 %	120586823
57	NC_008741	GACG	2	8	28821	28828	25 %	0 %	50 %	25 %	120586825
58	NC_008741	TCGT	2	8	28886	28893	0 %	50 %	25 %	25 %	120586825
59	NC_008741	GGGT	2	8	33111	33118	0 %	25 %	75 %	0 %	120586827
60	NC_008741	TGCC	2	8	33406	33413	0 %	25 %	25 %	50 %	120586827
61	NC_008741	AGGT	2	8	34078	34085	25 %	25 %	50 %	0 %	120586827
62	NC_008741	TGCG	2	8	34557	34564	0 %	25 %	50 %	25 %	120586828
63	NC_008741	GCAC	2	8	34577	34584	25 %	0 %	25 %	50 %	120586828
64	NC_008741	CCGT	2	8	34625	34632	0 %	25 %	25 %	50 %	120586828
65	NC_008741	CGGG	2	8	34821	34828	0 %	0 %	75 %	25 %	120586829
66	NC_008741	CTTT	2	8	35782	35789	0 %	75 %	0 %	25 %	120586830
67	NC_008741	CGGA	2	8	36329	36336	25 %	0 %	50 %	25 %	120586830
68	NC_008741	GGCG	2	8	36339	36346	0 %	0 %	75 %	25 %	120586830
69	NC_008741	GGCT	2	8	36491	36498	0 %	25 %	50 %	25 %	120586830
70	NC_008741	TGTC	2	8	36784	36791	0 %	50 %	25 %	25 %	120586830
71	NC_008741	TGTC	2	8	37715	37722	0 %	50 %	25 %	25 %	120586831
72	NC_008741	TCCT	2	8	38483	38490	0 %	50 %	0 %	50 %	120586832
73	NC_008741	GCCT	2	8	38997	39004	0 %	25 %	25 %	50 %	120586832
74	NC_008741	CCTT	2	8	40105	40112	0 %	50 %	0 %	50 %	120586832
75	NC_008741	GCGT	2	8	40297	40304	0 %	25 %	50 %	25 %	120586832
76	NC_008741	GTCC	2	8	40730	40737	0 %	25 %	25 %	50 %	120586833
77	NC_008741	GTTG	2	8	41166	41173	0 %	50 %	50 %	0 %	120586833
78	NC_008741	TGCG	2	8	41336	41343	0 %	25 %	50 %	25 %	120586833
79	NC_008741	CCGC	2	8	41578	41585	0 %	0 %	25 %	75 %	120586833
80	NC_008741	GAGC	2	8	41913	41920	25 %	0 %	50 %	25 %	120586833
81	NC_008741	GCCC	2	8	42593	42600	0 %	0 %	25 %	75 %	120586833
82	NC_008741	AGCG	2	8	42772	42779	25 %	0 %	50 %	25 %	120586833
83	NC_008741	CGCC	2	8	43336	43343	0 %	0 %	25 %	75 %	120586834
84	NC_008741	TGGA	2	8	43371	43378	25 %	25 %	50 %	0 %	120586834
85	NC_008741	GACG	2	8	44573	44580	25 %	0 %	50 %	25 %	120586835
86	NC_008741	GACG	2	8	44597	44604	25 %	0 %	50 %	25 %	120586835
87	NC_008741	CCGC	2	8	45108	45115	0 %	0 %	25 %	75 %	120586835
88	NC_008741	CTGA	2	8	46188	46195	25 %	25 %	25 %	25 %	120586838
89	NC_008741	AGCC	2	8	46201	46208	25 %	0 %	25 %	50 %	120586838
90	NC_008741	GCCC	2	8	47295	47302	0 %	0 %	25 %	75 %	120586839
91	NC_008741	GCTG	2	8	47648	47655	0 %	25 %	50 %	25 %	120586839
92	NC_008741	CGCC	2	8	47917	47924	0 %	0 %	25 %	75 %	120586839
93	NC_008741	GCCC	2	8	47951	47958	0 %	0 %	25 %	75 %	120586839
94	NC_008741	GAAC	2	8	48013	48020	50 %	0 %	25 %	25 %	120586839
95	NC_008741	GGCT	2	8	48081	48088	0 %	25 %	50 %	25 %	120586839
96	NC_008741	GCAC	2	8	50189	50196	25 %	0 %	25 %	50 %	120586842
97	NC_008741	GCCT	2	8	51768	51775	0 %	25 %	25 %	50 %	120586844
98	NC_008741	GGGC	2	8	52171	52178	0 %	0 %	75 %	25 %	120586844
99	NC_008741	AGAA	2	8	52563	52570	75 %	0 %	25 %	0 %	120586844
100	NC_008741	CGCA	2	8	52655	52662	25 %	0 %	25 %	50 %	120586845
101	NC_008741	CTGC	2	8	53180	53187	0 %	25 %	25 %	50 %	120586845
102	NC_008741	ACGC	2	8	53675	53682	25 %	0 %	25 %	50 %	120586846
103	NC_008741	GCGG	2	8	53695	53702	0 %	0 %	75 %	25 %	120586846
104	NC_008741	CTGG	2	8	54175	54182	0 %	25 %	50 %	25 %	120586846
105	NC_008741	TGCC	2	8	56045	56052	0 %	25 %	25 %	50 %	120586850
106	NC_008741	CAGC	2	8	56585	56592	25 %	0 %	25 %	50 %	120586850
107	NC_008741	AGAC	2	8	56694	56701	50 %	0 %	25 %	25 %	120586850
108	NC_008741	CCGC	2	8	58062	58069	0 %	0 %	25 %	75 %	120586851
109	NC_008741	CCCG	2	8	58295	58302	0 %	0 %	25 %	75 %	120586851
110	NC_008741	GGCG	2	8	58628	58635	0 %	0 %	75 %	25 %	120586851
111	NC_008741	GGCG	2	8	59586	59593	0 %	0 %	75 %	25 %	120586852
112	NC_008741	CGTC	2	8	59669	59676	0 %	25 %	25 %	50 %	120586852
113	NC_008741	CTGC	2	8	59763	59770	0 %	25 %	25 %	50 %	120586852
114	NC_008741	CGGT	2	8	59851	59858	0 %	25 %	50 %	25 %	120586853
115	NC_008741	TGAT	2	8	60045	60052	25 %	50 %	25 %	0 %	120586853
116	NC_008741	GCCT	2	8	61484	61491	0 %	25 %	25 %	50 %	120586854
117	NC_008741	CGAG	2	8	61650	61657	25 %	0 %	50 %	25 %	120586854
118	NC_008741	GCCT	2	8	61948	61955	0 %	25 %	25 %	50 %	120586855
119	NC_008741	TCGA	2	8	63778	63785	25 %	25 %	25 %	25 %	120586858
120	NC_008741	AACG	2	8	64405	64412	50 %	0 %	25 %	25 %	120586858
121	NC_008741	GCAC	2	8	64502	64509	25 %	0 %	25 %	50 %	120586858
122	NC_008741	GCCC	2	8	65454	65461	0 %	0 %	25 %	75 %	120586860
123	NC_008741	TCGT	2	8	66156	66163	0 %	50 %	25 %	25 %	120586862
124	NC_008741	GACC	2	8	66989	66996	25 %	0 %	25 %	50 %	120586862
125	NC_008741	CCCA	2	8	70235	70242	25 %	0 %	0 %	75 %	120586865
126	NC_008741	AGAC	2	8	70612	70619	50 %	0 %	25 %	25 %	120586866
127	NC_008741	CGCC	2	8	70876	70883	0 %	0 %	25 %	75 %	120586866
128	NC_008741	CGTG	2	8	71707	71714	0 %	25 %	50 %	25 %	120586866
129	NC_008741	CCGT	2	8	72047	72054	0 %	25 %	25 %	50 %	120586866
130	NC_008741	ACGG	2	8	72676	72683	25 %	0 %	50 %	25 %	120586867
131	NC_008741	GCCA	2	8	72743	72750	25 %	0 %	25 %	50 %	120586867
132	NC_008741	CGCC	2	8	74434	74441	0 %	0 %	25 %	75 %	120586868
133	NC_008741	GCCC	2	8	74599	74606	0 %	0 %	25 %	75 %	120586868
134	NC_008741	CTGG	2	8	75414	75421	0 %	25 %	50 %	25 %	120586869
135	NC_008741	ACCT	2	8	75900	75907	25 %	25 %	0 %	50 %	120586869
136	NC_008741	CTGC	2	8	76079	76086	0 %	25 %	25 %	50 %	120586869
137	NC_008741	CGGG	2	8	77829	77836	0 %	0 %	75 %	25 %	120586870
138	NC_008741	CGGG	2	8	77853	77860	0 %	0 %	75 %	25 %	120586870
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.