MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense Y51 chromosome

Total Repeats: 3178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007907	TCTCC	2	10	2295	2304	0 %	40 %	0 %	60 %	89892748
2	NC_007907	ACCGG	2	10	6885	6894	20 %	0 %	40 %	40 %	89892752
3	NC_007907	CGGAC	2	10	7074	7083	20 %	0 %	40 %	40 %	89892752
4	NC_007907	CATGG	2	10	7787	7796	20 %	20 %	40 %	20 %	89892752
5	NC_007907	GAGCA	2	10	9656	9665	40 %	0 %	40 %	20 %	89892754
6	NC_007907	CATCC	2	10	12122	12131	20 %	20 %	0 %	60 %	89892756
7	NC_007907	ACTTC	2	10	12633	12642	20 %	40 %	0 %	40 %	89892756
8	NC_007907	TTGAT	2	10	15088	15097	20 %	60 %	20 %	0 %	89892759
9	NC_007907	TCAAT	2	10	18291	18300	40 %	40 %	0 %	20 %	89892762
10	NC_007907	TCATT	2	10	18816	18825	20 %	60 %	0 %	20 %	89892762
11	NC_007907	TGTGA	2	10	20077	20086	20 %	40 %	40 %	0 %	89892763
12	NC_007907	CTGTA	2	10	20986	20995	20 %	40 %	20 %	20 %	89892764
13	NC_007907	AAATG	2	10	23288	23297	60 %	20 %	20 %	0 %	89892768
14	NC_007907	TTCTT	2	10	24858	24867	0 %	80 %	0 %	20 %	89892770
15	NC_007907	TTTAT	2	10	25742	25751	20 %	80 %	0 %	0 %	89892771
16	NC_007907	GCCCT	2	10	27115	27124	0 %	20 %	20 %	60 %	89892773
17	NC_007907	ATGGG	2	10	27590	27599	20 %	20 %	60 %	0 %	89892774
18	NC_007907	GATAG	2	10	29581	29590	40 %	20 %	40 %	0 %	89892775
19	NC_007907	GATTC	2	10	32642	32651	20 %	40 %	20 %	20 %	89892776
20	NC_007907	GGTAA	2	10	32998	33007	40 %	20 %	40 %	0 %	89892776
21	NC_007907	ACCAT	2	10	33076	33085	40 %	20 %	0 %	40 %	89892776
22	NC_007907	GCTCT	2	10	33673	33682	0 %	40 %	20 %	40 %	89892777
23	NC_007907	GTACC	2	10	36447	36456	20 %	20 %	20 %	40 %	89892780
24	NC_007907	GGTGC	2	10	38228	38237	0 %	20 %	60 %	20 %	89892782
25	NC_007907	TGCGA	2	10	39396	39405	20 %	20 %	40 %	20 %	89892784
26	NC_007907	GTGCA	2	10	43931	43940	20 %	20 %	40 %	20 %	89892790
27	NC_007907	ACTTA	2	10	47957	47966	40 %	40 %	0 %	20 %	89892792
28	NC_007907	TTGGC	2	10	49440	49449	0 %	40 %	40 %	20 %	89892794
29	NC_007907	TATCC	2	10	50228	50237	20 %	40 %	0 %	40 %	89892795
30	NC_007907	TACTG	2	10	51951	51960	20 %	40 %	20 %	20 %	89892796
31	NC_007907	CCTCG	2	10	59019	59028	0 %	20 %	20 %	60 %	89892802
32	NC_007907	ACGGC	2	10	65675	65684	20 %	0 %	40 %	40 %	89892808
33	NC_007907	GGAAC	2	10	66855	66864	40 %	0 %	40 %	20 %	89892808
34	NC_007907	ACCAC	2	10	67490	67499	40 %	0 %	0 %	60 %	89892808
35	NC_007907	ATGGA	2	10	68972	68981	40 %	20 %	40 %	0 %	89892809
36	NC_007907	TGAAA	2	10	71005	71014	60 %	20 %	20 %	0 %	89892812
37	NC_007907	ATTTC	2	10	72937	72946	20 %	60 %	0 %	20 %	89892815
38	NC_007907	GGACG	2	10	82697	82706	20 %	0 %	60 %	20 %	89892824
39	NC_007907	ACTGG	2	10	87817	87826	20 %	20 %	40 %	20 %	89892829
40	NC_007907	TGAAA	2	10	88461	88470	60 %	20 %	20 %	0 %	89892830
41	NC_007907	TGCCC	2	10	90625	90634	0 %	20 %	20 %	60 %	89892833
42	NC_007907	TCGGA	2	10	94182	94191	20 %	20 %	40 %	20 %	89892836
43	NC_007907	TTTTC	2	10	94203	94212	0 %	80 %	0 %	20 %	89892836
44	NC_007907	TTTCC	2	10	94963	94972	0 %	60 %	0 %	40 %	89892837
45	NC_007907	GCTGG	2	10	96667	96676	0 %	20 %	60 %	20 %	89892839
46	NC_007907	CCTTT	2	10	99790	99799	0 %	60 %	0 %	40 %	89892842
47	NC_007907	TCCTG	2	10	100195	100204	0 %	40 %	20 %	40 %	89892842
48	NC_007907	ATGGG	2	10	100831	100840	20 %	20 %	60 %	0 %	89892842
49	NC_007907	TTCTG	2	10	101907	101916	0 %	60 %	20 %	20 %	89892843
50	NC_007907	GGAAA	2	10	105428	105437	60 %	0 %	40 %	0 %	89892847
51	NC_007907	AAAGC	2	10	105678	105687	60 %	0 %	20 %	20 %	89892847
52	NC_007907	ATTTT	2	10	108878	108887	20 %	80 %	0 %	0 %	89892851
53	NC_007907	TGAAC	2	10	109471	109480	40 %	20 %	20 %	20 %	89892852
54	NC_007907	GATGG	2	10	110771	110780	20 %	20 %	60 %	0 %	89892853
55	NC_007907	TGTTT	2	10	112307	112316	0 %	80 %	20 %	0 %	89892854
56	NC_007907	AAAGC	2	10	115305	115314	60 %	0 %	20 %	20 %	89892857
57	NC_007907	CTCTG	2	10	115432	115441	0 %	40 %	20 %	40 %	89892857
58	NC_007907	ACCAC	2	10	118811	118820	40 %	0 %	0 %	60 %	89892861
59	NC_007907	CGCGG	2	10	119302	119311	0 %	0 %	60 %	40 %	89892861
60	NC_007907	AAGGC	2	10	119768	119777	40 %	0 %	40 %	20 %	89892861
61	NC_007907	TGGTT	2	10	123511	123520	0 %	60 %	40 %	0 %	89892864
62	NC_007907	TGAAG	2	10	123649	123658	40 %	20 %	40 %	0 %	89892864
63	NC_007907	CTGGA	2	10	128178	128187	20 %	20 %	40 %	20 %	89892867
64	NC_007907	GTGCT	2	10	130024	130033	0 %	40 %	40 %	20 %	89892869
65	NC_007907	AATGA	2	10	133466	133475	60 %	20 %	20 %	0 %	89892874
66	NC_007907	GGACT	2	10	135124	135133	20 %	20 %	40 %	20 %	89892875
67	NC_007907	TTATC	2	10	138707	138716	20 %	60 %	0 %	20 %	89892878
68	NC_007907	ATAGA	2	10	142300	142309	60 %	20 %	20 %	0 %	89892883
69	NC_007907	GATCA	2	10	146435	146444	40 %	20 %	20 %	20 %	89892885
70	NC_007907	AGCAG	2	10	149132	149141	40 %	0 %	40 %	20 %	89892887
71	NC_007907	CCAAT	2	10	150978	150987	40 %	20 %	0 %	40 %	89892889
72	NC_007907	CAAGG	2	10	153481	153490	40 %	0 %	40 %	20 %	89892892
73	NC_007907	TACTG	2	10	160459	160468	20 %	40 %	20 %	20 %	89892898
74	NC_007907	GCGGA	2	10	161739	161748	20 %	0 %	60 %	20 %	89892899
75	NC_007907	CTTTG	2	10	162653	162662	0 %	60 %	20 %	20 %	89892900
76	NC_007907	CCCCG	2	10	163021	163030	0 %	0 %	20 %	80 %	89892900
77	NC_007907	CAAGG	2	10	163941	163950	40 %	0 %	40 %	20 %	89892900
78	NC_007907	TTCTC	2	10	164126	164135	0 %	60 %	0 %	40 %	89892900
79	NC_007907	TTGTT	2	10	164616	164625	0 %	80 %	20 %	0 %	89892902
80	NC_007907	CCAAG	2	10	164833	164842	40 %	0 %	20 %	40 %	89892902
81	NC_007907	AATCA	2	10	166823	166832	60 %	20 %	0 %	20 %	89892905
82	NC_007907	TAAAT	2	10	167756	167765	60 %	40 %	0 %	0 %	89892906
83	NC_007907	CTATT	2	10	167788	167797	20 %	60 %	0 %	20 %	89892906
84	NC_007907	ATTGC	2	10	169054	169063	20 %	40 %	20 %	20 %	89892906
85	NC_007907	GCAGA	2	10	169592	169601	40 %	0 %	40 %	20 %	89892907
86	NC_007907	GATAA	2	10	169796	169805	60 %	20 %	20 %	0 %	89892907
87	NC_007907	GGAAT	2	10	172684	172693	40 %	20 %	40 %	0 %	89892910
88	NC_007907	GCTTT	2	10	179476	179485	0 %	60 %	20 %	20 %	89892916
89	NC_007907	ACCTG	2	10	180560	180569	20 %	20 %	20 %	40 %	89892917
90	NC_007907	TACTT	2	10	183157	183166	20 %	60 %	0 %	20 %	89892919
91	NC_007907	TTCGC	2	10	185053	185062	0 %	40 %	20 %	40 %	89892920
92	NC_007907	GCAGA	2	10	185123	185132	40 %	0 %	40 %	20 %	89892920
93	NC_007907	ATTTG	2	10	190034	190043	20 %	60 %	20 %	0 %	89892923
94	NC_007907	GGCCT	2	10	191122	191131	0 %	20 %	40 %	40 %	89892924
95	NC_007907	GGAGT	2	10	191783	191792	20 %	20 %	60 %	0 %	89892925
96	NC_007907	ATAGT	2	10	195265	195274	40 %	40 %	20 %	0 %	89892929
97	NC_007907	GTATT	2	10	196024	196033	20 %	60 %	20 %	0 %	89892929
98	NC_007907	ATTCC	2	10	197373	197382	20 %	40 %	0 %	40 %	89892930
99	NC_007907	GTATT	2	10	197487	197496	20 %	60 %	20 %	0 %	89892930
100	NC_007907	AAAGT	2	10	197798	197807	60 %	20 %	20 %	0 %	89892930
101	NC_007907	CAAAT	2	10	198059	198068	60 %	20 %	0 %	20 %	89892931
102	NC_007907	ACAAA	2	10	200318	200327	80 %	0 %	0 %	20 %	89892932
103	NC_007907	CGCTG	2	10	200400	200409	0 %	20 %	40 %	40 %	89892932
104	NC_007907	ATGAT	2	10	201095	201104	40 %	40 %	20 %	0 %	89892932
105	NC_007907	GCTGG	2	10	203888	203897	0 %	20 %	60 %	20 %	89892935
106	NC_007907	ATGCA	2	10	205080	205089	40 %	20 %	20 %	20 %	89892935
107	NC_007907	GTTAA	2	10	208399	208408	40 %	40 %	20 %	0 %	89892937
108	NC_007907	GGCTG	2	10	212211	212220	0 %	20 %	60 %	20 %	89892942
109	NC_007907	GCTCA	2	10	213211	213220	20 %	20 %	20 %	40 %	89892943
110	NC_007907	TTTGC	2	10	214611	214620	0 %	60 %	20 %	20 %	89892945
111	NC_007907	TGGGG	2	10	214805	214814	0 %	20 %	80 %	0 %	89892945
112	NC_007907	TGGAA	2	10	215365	215374	40 %	20 %	40 %	0 %	89892945
113	NC_007907	GAAGA	2	10	216466	216475	60 %	0 %	40 %	0 %	89892946
114	NC_007907	ACTGT	2	10	216673	216682	20 %	40 %	20 %	20 %	89892946
115	NC_007907	GAAAA	2	10	218276	218285	80 %	0 %	20 %	0 %	89892947
116	NC_007907	GCCGG	2	10	219023	219032	0 %	0 %	60 %	40 %	89892947
117	NC_007907	TCTAA	2	10	224329	224338	40 %	40 %	0 %	20 %	89892952
118	NC_007907	GATCA	2	10	225267	225276	40 %	20 %	20 %	20 %	89892953
119	NC_007907	GCGGA	2	10	225814	225823	20 %	0 %	60 %	20 %	89892954
120	NC_007907	CATTC	2	10	230482	230491	20 %	40 %	0 %	40 %	89892959
121	NC_007907	CAGGG	2	10	231197	231206	20 %	0 %	60 %	20 %	89892960
122	NC_007907	GATTT	2	10	232480	232489	20 %	60 %	20 %	0 %	89892962
123	NC_007907	TCCGT	2	10	233300	233309	0 %	40 %	20 %	40 %	89892963
124	NC_007907	AGCGC	2	10	233574	233583	20 %	0 %	40 %	40 %	89892963
125	NC_007907	GGGAT	2	10	233762	233771	20 %	20 %	60 %	0 %	89892963
126	NC_007907	ATTAT	2	10	234107	234116	40 %	60 %	0 %	0 %	89892963
127	NC_007907	AATTA	2	10	234848	234857	60 %	40 %	0 %	0 %	89892964
128	NC_007907	ATGAA	2	10	235046	235055	60 %	20 %	20 %	0 %	89892965
129	NC_007907	CGATC	2	10	245197	245206	20 %	20 %	20 %	40 %	89892967
130	NC_007907	CCTGA	2	10	245628	245637	20 %	20 %	20 %	40 %	89892967
131	NC_007907	TCTTA	2	10	246707	246716	20 %	60 %	0 %	20 %	89892968
132	NC_007907	TATCT	2	10	248331	248340	20 %	60 %	0 %	20 %	89892970
133	NC_007907	GATAC	2	10	252957	252966	40 %	20 %	20 %	20 %	89892972
134	NC_007907	TCAGC	2	10	253342	253351	20 %	20 %	20 %	40 %	89892973
135	NC_007907	GATCG	2	10	254340	254349	20 %	20 %	40 %	20 %	89892973
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