MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 15049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007356	ACG	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747957
2	NC_007356	TAC	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747957
3	NC_007356	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747957
4	NC_007356	GCC	2	6	645	650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
5	NC_007356	CCG	2	6	752	757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
6	NC_007356	TCT	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747957
7	NC_007356	GAA	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747957
8	NC_007356	GAT	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747957
9	NC_007356	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747957
10	NC_007356	CCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
11	NC_007356	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
12	NC_007356	ACA	2	6	1424	1429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73747957
13	NC_007356	GAA	2	6	1471	1476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747957
14	NC_007356	ACC	2	6	1567	1572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747957
15	NC_007356	CGG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
16	NC_007356	CGG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
17	NC_007356	CGG	2	6	2033	2038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
18	NC_007356	CGG	2	6	2042	2047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
19	NC_007356	CTA	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747958
20	NC_007356	GGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747958
21	NC_007356	GGC	2	6	2252	2257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
22	NC_007356	GCG	2	6	2368	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
23	NC_007356	TAT	2	6	2417	2422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747958
24	NC_007356	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747958
25	NC_007356	TAC	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747958
26	NC_007356	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747958
27	NC_007356	GGT	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747958
28	NC_007356	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747958
29	NC_007356	AAG	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747958
30	NC_007356	CTG	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747958
31	NC_007356	GCG	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
32	NC_007356	ATT	2	6	3051	3056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747958
33	NC_007356	GGC	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
34	NC_007356	TAT	2	6	3320	3325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747959
35	NC_007356	AAG	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747959
36	NC_007356	ATA	2	6	3560	3565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747959
37	NC_007356	GAT	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747959
38	NC_007356	CAG	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747959
39	NC_007356	CTT	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747959
40	NC_007356	CGG	2	6	3750	3755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747959
41	NC_007356	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747960
42	NC_007356	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747960
43	NC_007356	TCC	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73747960
44	NC_007356	CAT	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747960
45	NC_007356	TAA	2	6	4222	4227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747960
46	NC_007356	GAA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747960
47	NC_007356	TGA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747960
48	NC_007356	TTC	2	6	4388	4393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747960
49	NC_007356	GCG	2	6	4469	4474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747960
50	NC_007356	ACC	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747960
51	NC_007356	GGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747960
52	NC_007356	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747960
53	NC_007356	TTC	2	6	4697	4702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747960
54	NC_007356	CCG	2	6	4950	4955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747960
55	NC_007356	ACC	2	6	5123	5128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747960
56	NC_007356	TAA	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747960
57	NC_007356	TCG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747960
58	NC_007356	TTG	2	6	5190	5195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73747960
59	NC_007356	GTG	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747960
60	NC_007356	GTG	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747960
61	NC_007356	CTT	2	6	5314	5319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747960
62	NC_007356	CCG	2	6	5442	5447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747960
63	NC_007356	GCC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747960
64	NC_007356	GTA	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747960
65	NC_007356	TTA	2	6	6058	6063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747961
66	NC_007356	GTG	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747961
67	NC_007356	TTC	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
68	NC_007356	TTC	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
69	NC_007356	GCA	2	6	6419	6424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747961
70	NC_007356	TGG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747961
71	NC_007356	ACC	2	6	6513	6518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747961
72	NC_007356	CTG	2	6	6530	6535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747961
73	NC_007356	GAG	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747961
74	NC_007356	TGA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747961
75	NC_007356	CTT	2	6	6725	6730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
76	NC_007356	GGT	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747961
77	NC_007356	ACC	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747961
78	NC_007356	TTC	2	6	7046	7051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
79	NC_007356	TCT	2	6	7122	7127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
80	NC_007356	CGG	2	6	7132	7137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
81	NC_007356	GGC	2	6	7154	7159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
82	NC_007356	CGG	2	6	7237	7242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
83	NC_007356	ATC	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747961
84	NC_007356	GGC	2	6	7465	7470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
85	NC_007356	GCG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
86	NC_007356	CCA	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747961
87	NC_007356	GCC	2	6	7847	7852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747961
88	NC_007356	TCT	2	6	7866	7871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
89	NC_007356	GCG	2	6	8112	8117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
90	NC_007356	CCT	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73747961
91	NC_007356	AGA	2	6	8354	8359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747962
92	NC_007356	GCA	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747962
93	NC_007356	GCC	2	6	8406	8411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747962
94	NC_007356	GCC	2	6	8418	8423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747962
95	NC_007356	TTA	2	6	8639	8644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747962
96	NC_007356	ATA	2	6	8754	8759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747962
97	NC_007356	CTG	2	6	8784	8789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747962
98	NC_007356	GCC	2	6	8839	8844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747962
99	NC_007356	TAC	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747962
100	NC_007356	CTG	2	6	8940	8945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747962
101	NC_007356	GCC	2	6	9034	9039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747962
102	NC_007356	ATT	2	6	9106	9111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747962
103	NC_007356	GGC	3	9	9168	9176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747962
104	NC_007356	ATT	2	6	9255	9260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747962
105	NC_007356	GGT	2	6	9464	9469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747962
106	NC_007356	GAA	3	9	9480	9488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747962
107	NC_007356	TTC	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747962
108	NC_007356	AAG	2	6	9573	9578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747962
109	NC_007356	CGG	2	6	9607	9612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747963
110	NC_007356	TGC	2	6	9642	9647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747963
111	NC_007356	GGC	2	6	9680	9685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747963
112	NC_007356	AGA	2	6	9772	9777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747963
113	NC_007356	AAG	2	6	9792	9797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747963
114	NC_007356	TAG	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747963
115	NC_007356	TGG	2	6	9822	9827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747963
116	NC_007356	AGA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747963
117	NC_007356	TCA	2	6	10027	10032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747963
118	NC_007356	CAC	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747963
119	NC_007356	ACT	2	6	10292	10297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747963
120	NC_007356	AAG	2	6	10392	10397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747963
121	NC_007356	CTT	2	6	10523	10528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747963
122	NC_007356	TAG	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747963
123	NC_007356	CGC	2	6	10604	10609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747963
124	NC_007356	TAT	2	6	10619	10624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747963
125	NC_007356	TGG	2	6	10653	10658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747963
126	NC_007356	TGG	2	6	10704	10709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747963
127	NC_007356	TGT	2	6	10818	10823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73747964
128	NC_007356	CAG	2	6	10981	10986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747964
129	NC_007356	GCA	2	6	11025	11030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747964
130	NC_007356	GCC	2	6	11068	11073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747964
131	NC_007356	ATA	2	6	11161	11166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747964
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133	NC_007356	GGT	2	6	11522	11527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747965
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