MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 22807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007356	TAT	3	9	179055	179063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748120
3002	NC_007356	GAAGCC	2	12	179077	179088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748120
3003	NC_007356	GGCT	2	8	179136	179143	0 %	25 %	50 %	25 %	73748120
3004	NC_007356	GGC	2	6	179173	179178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748120
3005	NC_007356	ATAA	2	8	179208	179215	75 %	25 %	0 %	0 %	73748120
3006	NC_007356	GCA	2	6	179249	179254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748120
3007	NC_007356	CCG	3	9	179291	179299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748120
3008	NC_007356	CAG	2	6	179317	179322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748120
3009	NC_007356	A	6	6	179431	179436	100 %	0 %	0 %	0 %	73748120
3010	NC_007356	AGC	2	6	179466	179471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748120
3011	NC_007356	CTT	2	6	179515	179520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748120
3012	NC_007356	TGGC	2	8	179621	179628	0 %	25 %	50 %	25 %	73748120
3013	NC_007356	TAC	2	6	179686	179691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748120
3014	NC_007356	GTG	2	6	179702	179707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748120
3015	NC_007356	CCG	2	6	179780	179785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748120
3016	NC_007356	GCGG	2	8	179809	179816	0 %	0 %	75 %	25 %	73748120
3017	NC_007356	GGC	2	6	179836	179841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748120
3018	NC_007356	GGC	2	6	179853	179858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748120
3019	NC_007356	CAGG	2	8	179915	179922	25 %	0 %	50 %	25 %	73748120
3020	NC_007356	CGAA	2	8	180009	180016	50 %	0 %	25 %	25 %	73748120
3021	NC_007356	GCC	2	6	180017	180022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748120
3022	NC_007356	CTGGC	2	10	180053	180062	0 %	20 %	40 %	40 %	73748120
3023	NC_007356	AGA	2	6	180104	180109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748120
3024	NC_007356	TTC	2	6	180115	180120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748120
3025	NC_007356	GCA	2	6	180182	180187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748120
3026	NC_007356	TTC	2	6	180265	180270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748120
3027	NC_007356	CGG	2	6	180285	180290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748120
3028	NC_007356	TAT	2	6	180321	180326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748120
3029	NC_007356	GCCG	2	8	180415	180422	0 %	0 %	50 %	50 %	73748120
3030	NC_007356	TGG	3	9	180471	180479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748120
3031	NC_007356	CTA	2	6	180605	180610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748120
3032	NC_007356	TCA	2	6	180621	180626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748120
3033	NC_007356	ATT	2	6	181009	181014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748121
3034	NC_007356	ATT	2	6	181039	181044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748121
3035	NC_007356	ATG	2	6	181096	181101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748121
3036	NC_007356	TTG	2	6	181211	181216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748121
3037	NC_007356	TGT	3	9	181228	181236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748121
3038	NC_007356	ATA	2	6	181240	181245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748121
3039	NC_007356	CTT	2	6	181320	181325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748121
3040	NC_007356	CCG	2	6	181357	181362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748121
3041	NC_007356	CAG	2	6	181372	181377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748121
3042	NC_007356	TA	3	6	181530	181535	50 %	50 %	0 %	0 %	73748121
3043	NC_007356	ATT	2	6	181643	181648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748122
3044	NC_007356	GCC	2	6	181688	181693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748122
3045	NC_007356	TCA	2	6	181707	181712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748122
3046	NC_007356	GAAATG	2	12	181841	181852	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73748122
3047	NC_007356	CCG	2	6	181864	181869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748122
3048	NC_007356	TTG	2	6	181891	181896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748122
3049	NC_007356	CAGTAC	2	12	181913	181924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73748122
3050	NC_007356	A	6	6	182008	182013	100 %	0 %	0 %	0 %	73748122
3051	NC_007356	GTCT	2	8	182023	182030	0 %	50 %	25 %	25 %	73748122
3052	NC_007356	ATT	2	6	182214	182219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748123
3053	NC_007356	TG	3	6	182295	182300	0 %	50 %	50 %	0 %	73748123
3054	NC_007356	AAGTAA	2	12	182370	182381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73748123
3055	NC_007356	TCA	2	6	182517	182522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748124
3056	NC_007356	AAG	2	6	182555	182560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748124
3057	NC_007356	AACCG	2	10	182588	182597	40 %	0 %	20 %	40 %	73748124
3058	NC_007356	C	6	6	182673	182678	0 %	0 %	0 %	100 %	73748124
3059	NC_007356	AGC	2	6	182724	182729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748124
3060	NC_007356	GGT	2	6	182741	182746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748124
3061	NC_007356	TATCAG	2	12	182762	182773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73748124
3062	NC_007356	CGGC	2	8	182847	182854	0 %	0 %	50 %	50 %	73748124
3063	NC_007356	TAT	2	6	182867	182872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748124
3064	NC_007356	CCA	2	6	182878	182883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748124
3065	NC_007356	GGC	2	6	183101	183106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748125
3066	NC_007356	CTT	2	6	183142	183147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748125
3067	NC_007356	CGG	2	6	183166	183171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748125
3068	NC_007356	CCG	2	6	183177	183182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748125
3069	NC_007356	CTT	2	6	183280	183285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748125
3070	NC_007356	AGAA	2	8	183336	183343	75 %	0 %	25 %	0 %	73748125
3071	NC_007356	TA	3	6	183403	183408	50 %	50 %	0 %	0 %	73748125
3072	NC_007356	GGCAG	2	10	183471	183480	20 %	0 %	60 %	20 %	73748125
3073	NC_007356	CATGCC	2	12	183491	183502	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73748125
3074	NC_007356	CAC	2	6	183533	183538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748125
3075	NC_007356	CGC	2	6	183556	183561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748125
3076	NC_007356	AAT	2	6	183587	183592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748125
3077	NC_007356	CAG	2	6	183671	183676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748125
3078	NC_007356	GGT	2	6	183716	183721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748125
3079	NC_007356	AGGT	2	8	183744	183751	25 %	25 %	50 %	0 %	73748125
3080	NC_007356	T	7	7	183804	183810	0 %	100 %	0 %	0 %	73748125
3081	NC_007356	CCG	2	6	183849	183854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748125
3082	NC_007356	CAC	2	6	183879	183884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748126
3083	NC_007356	TA	3	6	183910	183915	50 %	50 %	0 %	0 %	73748126
3084	NC_007356	CAG	2	6	183936	183941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748126
3085	NC_007356	CCGG	2	8	184000	184007	0 %	0 %	50 %	50 %	73748126
3086	NC_007356	AAT	2	6	184044	184049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748126
3087	NC_007356	TTC	2	6	184077	184082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748126
3088	NC_007356	G	6	6	184157	184162	0 %	0 %	100 %	0 %	73748126
3089	NC_007356	AGCA	2	8	184170	184177	50 %	0 %	25 %	25 %	73748126
3090	NC_007356	GT	3	6	184196	184201	0 %	50 %	50 %	0 %	73748126
3091	NC_007356	GCC	2	6	184225	184230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748126
3092	NC_007356	GGC	2	6	184272	184277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748126
3093	NC_007356	TCT	2	6	184319	184324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748126
3094	NC_007356	CAGC	2	8	184422	184429	25 %	0 %	25 %	50 %	73748126
3095	NC_007356	CATTC	2	10	184454	184463	20 %	40 %	0 %	40 %	73748126
3096	NC_007356	GCC	2	6	184464	184469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748126
3097	NC_007356	CCA	2	6	184529	184534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748126
3098	NC_007356	TGG	2	6	184579	184584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748126
3099	NC_007356	AAT	2	6	184593	184598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748126
3100	NC_007356	TAT	2	6	184638	184643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748126
3101	NC_007356	GAA	2	6	184668	184673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748126
3102	NC_007356	CCG	2	6	184711	184716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748126
3103	NC_007356	GAA	2	6	184810	184815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748126
3104	NC_007356	TCC	2	6	184857	184862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748126
3105	NC_007356	TA	3	6	185181	185186	50 %	50 %	0 %	0 %	73748126
3106	NC_007356	CTT	2	6	185454	185459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748126
3107	NC_007356	TA	3	6	185460	185465	50 %	50 %	0 %	0 %	73748126
3108	NC_007356	CCG	2	6	185474	185479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748126
3109	NC_007356	GGT	2	6	185493	185498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748126
3110	NC_007356	CGGG	2	8	185562	185569	0 %	0 %	75 %	25 %	73748126
3111	NC_007356	T	6	6	185675	185680	0 %	100 %	0 %	0 %	73748126
3112	NC_007356	GTG	2	6	185764	185769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748126
3113	NC_007356	ACC	2	6	185800	185805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748126
3114	NC_007356	GCAG	2	8	185927	185934	25 %	0 %	50 %	25 %	73748126
3115	NC_007356	GGC	2	6	185984	185989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748126
3116	NC_007356	CATTA	2	10	186093	186102	40 %	40 %	0 %	20 %	73748126
3117	NC_007356	CCG	2	6	186137	186142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748126
3118	NC_007356	TTTGGG	2	12	186213	186224	0 %	50 %	50 %	0 %	73748126
3119	NC_007356	GCC	2	6	186256	186261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748126
3120	NC_007356	T	8	8	186276	186283	0 %	100 %	0 %	0 %	73748126
3121	NC_007356	GCGG	2	8	186525	186532	0 %	0 %	75 %	25 %	73748127
3122	NC_007356	GGC	2	6	186539	186544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748127
3123	NC_007356	GCG	2	6	186552	186557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748127
3124	NC_007356	GCG	2	6	186562	186567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748127
3125	NC_007356	CTG	2	6	186579	186584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748127
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3130	NC_007356	GGC	2	6	186786	186791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748127
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3156	NC_007356	T	6	6	188527	188532	0 %	100 %	0 %	0 %	73748129
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3230	NC_007356	AT	3	6	193255	193260	50 %	50 %	0 %	0 %	73748136
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3248	NC_007356	GCA	2	6	194278	194283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748137
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3499	NC_007356	ATAA	2	8	210487	210494	75 %	25 %	0 %	0 %	73748153
3500	NC_007356	TGA	2	6	210553	210558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748153

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