MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	TA	3	6	2371	2376	50 %	50 %	0 %	0 %	51246972
2	NC_006139	CA	3	6	2603	2608	50 %	0 %	0 %	50 %	51246972
3	NC_006139	CA	3	6	2928	2933	50 %	0 %	0 %	50 %	51246972
4	NC_006139	AG	3	6	2995	3000	50 %	0 %	50 %	0 %	51246972
5	NC_006139	TC	3	6	3014	3019	0 %	50 %	0 %	50 %	51246972
6	NC_006139	TC	3	6	3115	3120	0 %	50 %	0 %	50 %	51246973
7	NC_006139	CT	3	6	3223	3228	0 %	50 %	0 %	50 %	51246973
8	NC_006139	AT	3	6	3282	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	51246973
9	NC_006139	CG	3	6	4830	4835	0 %	0 %	50 %	50 %	51246975
10	NC_006139	CG	3	6	5374	5379	0 %	0 %	50 %	50 %	51246975
11	NC_006139	AT	3	6	8787	8792	50 %	50 %	0 %	0 %	51246977
12	NC_006139	CT	3	6	12200	12205	0 %	50 %	0 %	50 %	51246981
13	NC_006139	TA	3	6	14150	14155	50 %	50 %	0 %	0 %	51246984
14	NC_006139	CA	3	6	14457	14462	50 %	0 %	0 %	50 %	51246985
15	NC_006139	TA	3	6	16062	16067	50 %	50 %	0 %	0 %	51246985
16	NC_006139	AT	3	6	16864	16869	50 %	50 %	0 %	0 %	51246985
17	NC_006139	CA	3	6	17061	17066	50 %	0 %	0 %	50 %	51246986
18	NC_006139	CA	3	6	17995	18000	50 %	0 %	0 %	50 %	51246987
19	NC_006139	AT	3	6	18207	18212	50 %	50 %	0 %	0 %	51246987
20	NC_006139	TA	5	10	18460	18469	50 %	50 %	0 %	0 %	51246987
21	NC_006139	GA	4	8	19879	19886	50 %	0 %	50 %	0 %	51246988
22	NC_006139	CA	3	6	20450	20455	50 %	0 %	0 %	50 %	51246989
23	NC_006139	AT	3	6	20666	20671	50 %	50 %	0 %	0 %	51246989
24	NC_006139	TA	3	6	20752	20757	50 %	50 %	0 %	0 %	51246989
25	NC_006139	TA	3	6	21361	21366	50 %	50 %	0 %	0 %	51246990
26	NC_006139	AG	3	6	21751	21756	50 %	0 %	50 %	0 %	51246991
27	NC_006139	GA	3	6	23891	23896	50 %	0 %	50 %	0 %	51246993
28	NC_006139	GA	3	6	24485	24490	50 %	0 %	50 %	0 %	51246993
29	NC_006139	CT	3	6	25654	25659	0 %	50 %	0 %	50 %	51246994
30	NC_006139	CT	4	8	26150	26157	0 %	50 %	0 %	50 %	51246994
31	NC_006139	TC	3	6	27481	27486	0 %	50 %	0 %	50 %	51246997
32	NC_006139	TA	3	6	29333	29338	50 %	50 %	0 %	0 %	51246999
33	NC_006139	CA	3	6	30067	30072	50 %	0 %	0 %	50 %	51246999
34	NC_006139	AT	3	6	32638	32643	50 %	50 %	0 %	0 %	51247000
35	NC_006139	AT	3	6	33366	33371	50 %	50 %	0 %	0 %	51247002
36	NC_006139	AT	3	6	33745	33750	50 %	50 %	0 %	0 %	51247003
37	NC_006139	CA	3	6	34107	34112	50 %	0 %	0 %	50 %	51247003
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39	NC_006139	AT	3	6	35646	35651	50 %	50 %	0 %	0 %	51247005
40	NC_006139	AT	3	6	36152	36157	50 %	50 %	0 %	0 %	51247006
41	NC_006139	AT	3	6	36549	36554	50 %	50 %	0 %	0 %	51247006
42	NC_006139	GC	3	6	39037	39042	0 %	0 %	50 %	50 %	51247008
43	NC_006139	CG	3	6	39182	39187	0 %	0 %	50 %	50 %	51247008
44	NC_006139	GA	3	6	43245	43250	50 %	0 %	50 %	0 %	51247013
45	NC_006139	GA	3	6	43894	43899	50 %	0 %	50 %	0 %	51247013
46	NC_006139	TC	3	6	44166	44171	0 %	50 %	0 %	50 %	51247014
47	NC_006139	CT	3	6	44453	44458	0 %	50 %	0 %	50 %	51247014
48	NC_006139	CT	3	6	44617	44622	0 %	50 %	0 %	50 %	51247014
49	NC_006139	TC	3	6	47084	47089	0 %	50 %	0 %	50 %	51247016
50	NC_006139	AT	3	6	48279	48284	50 %	50 %	0 %	0 %	51247017
51	NC_006139	TC	3	6	48552	48557	0 %	50 %	0 %	50 %	51247018
52	NC_006139	CT	3	6	49312	49317	0 %	50 %	0 %	50 %	51247019
53	NC_006139	AT	3	6	50745	50750	50 %	50 %	0 %	0 %	51247021
54	NC_006139	AC	3	6	50824	50829	50 %	0 %	0 %	50 %	51247021
55	NC_006139	GT	3	6	50862	50867	0 %	50 %	50 %	0 %	51247021
56	NC_006139	GA	3	6	52101	52106	50 %	0 %	50 %	0 %	51247022
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58	NC_006139	TA	3	6	54032	54037	50 %	50 %	0 %	0 %	51247025
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60	NC_006139	AT	3	6	54726	54731	50 %	50 %	0 %	0 %	51247025
61	NC_006139	TA	3	6	55652	55657	50 %	50 %	0 %	0 %	51247026
62	NC_006139	AG	3	6	56247	56252	50 %	0 %	50 %	0 %	51247026
63	NC_006139	AT	3	6	56267	56272	50 %	50 %	0 %	0 %	51247026
64	NC_006139	AG	4	8	57305	57312	50 %	0 %	50 %	0 %	51247026
65	NC_006139	AG	3	6	60277	60282	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
66	NC_006139	AC	3	6	60714	60719	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
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69	NC_006139	GC	3	6	66297	66302	0 %	0 %	50 %	50 %	51247027
70	NC_006139	AG	3	6	69352	69357	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
71	NC_006139	AG	3	6	69937	69942	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
72	NC_006139	GA	3	6	70192	70197	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
73	NC_006139	TA	3	6	70311	70316	50 %	50 %	0 %	0 %	51247027
74	NC_006139	CT	3	6	73083	73088	0 %	50 %	0 %	50 %	51247028
75	NC_006139	CT	3	6	73247	73252	0 %	50 %	0 %	50 %	51247028
76	NC_006139	TG	3	6	73515	73520	0 %	50 %	50 %	0 %	51247028
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103	NC_006139	AT	3	6	91446	91451	50 %	50 %	0 %	0 %	51247046
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105	NC_006139	TA	3	6	92520	92525	50 %	50 %	0 %	0 %	51247047
106	NC_006139	AT	3	6	92921	92926	50 %	50 %	0 %	0 %	51247047
107	NC_006139	TA	3	6	93392	93397	50 %	50 %	0 %	0 %	51247047
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111	NC_006139	AT	3	6	94504	94509	50 %	50 %	0 %	0 %	51247048
112	NC_006139	CT	3	6	94724	94729	0 %	50 %	0 %	50 %	51247049
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129	NC_006139	AG	3	6	103547	103552	50 %	0 %	50 %	0 %	51247054
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.