MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	CTTT	2	8	2085	2092	0 %	75 %	0 %	25 %	51246972
2	NC_006139	CCAA	2	8	2503	2510	50 %	0 %	0 %	50 %	51246972
3	NC_006139	TCAG	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	51246973
4	NC_006139	ATTT	2	8	3510	3517	25 %	75 %	0 %	0 %	51246974
5	NC_006139	GCTC	2	8	5272	5279	0 %	25 %	25 %	50 %	51246975
6	NC_006139	CGTA	2	8	6179	6186	25 %	25 %	25 %	25 %	51246976
7	NC_006139	AGAT	2	8	6861	6868	50 %	25 %	25 %	0 %	51246976
8	NC_006139	TGCC	2	8	6920	6927	0 %	25 %	25 %	50 %	51246976
9	NC_006139	GATG	2	8	7158	7165	25 %	25 %	50 %	0 %	51246976
10	NC_006139	GATA	2	8	8868	8875	50 %	25 %	25 %	0 %	51246977
11	NC_006139	AGCA	2	8	10405	10412	50 %	0 %	25 %	25 %	51246978
12	NC_006139	GCTG	2	8	10500	10507	0 %	25 %	50 %	25 %	51246978
13	NC_006139	ACAA	2	8	10676	10683	75 %	0 %	0 %	25 %	51246979
14	NC_006139	TAAT	2	8	11787	11794	50 %	50 %	0 %	0 %	51246981
15	NC_006139	GGTA	2	8	11818	11825	25 %	25 %	50 %	0 %	51246981
16	NC_006139	GCAG	2	8	12160	12167	25 %	0 %	50 %	25 %	51246981
17	NC_006139	ACAA	2	8	12284	12291	75 %	0 %	0 %	25 %	51246981
18	NC_006139	AAGA	2	8	12329	12336	75 %	0 %	25 %	0 %	51246981
19	NC_006139	GCTT	2	8	12465	12472	0 %	50 %	25 %	25 %	51246981
20	NC_006139	CCTC	2	8	13075	13082	0 %	25 %	0 %	75 %	51246983
21	NC_006139	CAGA	2	8	13513	13520	50 %	0 %	25 %	25 %	51246983
22	NC_006139	CTGT	2	8	14283	14290	0 %	50 %	25 %	25 %	51246985
23	NC_006139	ATCA	2	8	14566	14573	50 %	25 %	0 %	25 %	51246985
24	NC_006139	CGTT	2	8	16167	16174	0 %	50 %	25 %	25 %	51246985
25	NC_006139	ATTT	2	8	16587	16594	25 %	75 %	0 %	0 %	51246985
26	NC_006139	CTTT	2	8	16761	16768	0 %	75 %	0 %	25 %	51246985
27	NC_006139	GTTT	2	8	16906	16913	0 %	75 %	25 %	0 %	51246986
28	NC_006139	CCAA	2	8	17498	17505	50 %	0 %	0 %	50 %	51246986
29	NC_006139	AGTA	2	8	17556	17563	50 %	25 %	25 %	0 %	51246986
30	NC_006139	TAAT	2	8	18123	18130	50 %	50 %	0 %	0 %	51246987
31	NC_006139	TGGC	2	8	18960	18967	0 %	25 %	50 %	25 %	51246987
32	NC_006139	TTTA	2	8	19425	19432	25 %	75 %	0 %	0 %	51246988
33	NC_006139	CATA	2	8	19522	19529	50 %	25 %	0 %	25 %	51246988
34	NC_006139	ACCA	2	8	19869	19876	50 %	0 %	0 %	50 %	51246988
35	NC_006139	TCTT	2	8	19923	19930	0 %	75 %	0 %	25 %	51246988
36	NC_006139	TTTA	2	8	20572	20579	25 %	75 %	0 %	0 %	51246989
37	NC_006139	ACCA	2	8	20586	20593	50 %	0 %	0 %	50 %	51246989
38	NC_006139	CATT	2	8	20855	20862	25 %	50 %	0 %	25 %	51246989
39	NC_006139	AAAT	2	8	20944	20951	75 %	25 %	0 %	0 %	51246989
40	NC_006139	CAAA	2	8	21574	21581	75 %	0 %	0 %	25 %	51246991
41	NC_006139	TACC	2	8	21605	21612	25 %	25 %	0 %	50 %	51246991
42	NC_006139	GAGG	2	8	22017	22024	25 %	0 %	75 %	0 %	51246991
43	NC_006139	CCTT	2	8	22704	22711	0 %	50 %	0 %	50 %	51246992
44	NC_006139	AATC	2	8	22940	22947	50 %	25 %	0 %	25 %	51246993
45	NC_006139	AAGG	2	8	22960	22967	50 %	0 %	50 %	0 %	51246993
46	NC_006139	GATG	2	8	23093	23100	25 %	25 %	50 %	0 %	51246993
47	NC_006139	AAAC	2	8	23256	23263	75 %	0 %	0 %	25 %	51246993
48	NC_006139	CAAC	2	8	23648	23655	50 %	0 %	0 %	50 %	51246993
49	NC_006139	AAAG	2	8	23791	23798	75 %	0 %	25 %	0 %	51246993
50	NC_006139	CAAA	2	8	23934	23941	75 %	0 %	0 %	25 %	51246993
51	NC_006139	GGCA	2	8	23958	23965	25 %	0 %	50 %	25 %	51246993
52	NC_006139	ACCA	2	8	24011	24018	50 %	0 %	0 %	50 %	51246993
53	NC_006139	GGCT	2	8	24138	24145	0 %	25 %	50 %	25 %	51246993
54	NC_006139	GAAA	2	8	24406	24413	75 %	0 %	25 %	0 %	51246993
55	NC_006139	TTCT	2	8	24558	24565	0 %	75 %	0 %	25 %	51246993
56	NC_006139	ATAC	2	8	25031	25038	50 %	25 %	0 %	25 %	51246994
57	NC_006139	TACC	2	8	25501	25508	25 %	25 %	0 %	50 %	51246994
58	NC_006139	ATGG	2	8	26130	26137	25 %	25 %	50 %	0 %	51246994
59	NC_006139	GTTT	2	8	26206	26213	0 %	75 %	25 %	0 %	51246994
60	NC_006139	TCAA	2	8	26833	26840	50 %	25 %	0 %	25 %	51246995
61	NC_006139	CCCA	2	8	26977	26984	25 %	0 %	0 %	75 %	51246996
62	NC_006139	TACT	2	8	27410	27417	25 %	50 %	0 %	25 %	51246997
63	NC_006139	TACT	2	8	29447	29454	25 %	50 %	0 %	25 %	51246999
64	NC_006139	AAAT	2	8	29659	29666	75 %	25 %	0 %	0 %	51246999
65	NC_006139	GAAT	2	8	30096	30103	50 %	25 %	25 %	0 %	51246999
66	NC_006139	TATC	2	8	30305	30312	25 %	50 %	0 %	25 %	51246999
67	NC_006139	TAAA	2	8	30378	30385	75 %	25 %	0 %	0 %	51246999
68	NC_006139	CAAA	2	8	30656	30663	75 %	0 %	0 %	25 %	51246999
69	NC_006139	ACAA	2	8	32361	32368	75 %	0 %	0 %	25 %	51247000
70	NC_006139	GATT	2	8	32969	32976	25 %	50 %	25 %	0 %	51247000
71	NC_006139	AAAG	2	8	33692	33699	75 %	0 %	25 %	0 %	51247002
72	NC_006139	GAAT	2	8	33956	33963	50 %	25 %	25 %	0 %	51247003
73	NC_006139	AAAT	2	8	34051	34058	75 %	25 %	0 %	0 %	51247003
74	NC_006139	TGCT	2	8	34700	34707	0 %	50 %	25 %	25 %	51247004
75	NC_006139	AAAT	2	8	35213	35220	75 %	25 %	0 %	0 %	51247004
76	NC_006139	CTGG	2	8	35606	35613	0 %	25 %	50 %	25 %	51247005
77	NC_006139	TTTC	2	8	36081	36088	0 %	75 %	0 %	25 %	51247006
78	NC_006139	TAAA	2	8	36190	36197	75 %	25 %	0 %	0 %	51247006
79	NC_006139	GGAC	2	8	37694	37701	25 %	0 %	50 %	25 %	51247008
80	NC_006139	GCTG	2	8	37786	37793	0 %	25 %	50 %	25 %	51247008
81	NC_006139	GCGA	2	8	38089	38096	25 %	0 %	50 %	25 %	51247008
82	NC_006139	GTAC	2	8	38321	38328	25 %	25 %	25 %	25 %	51247008
83	NC_006139	ATTG	2	8	39095	39102	25 %	50 %	25 %	0 %	51247008
84	NC_006139	GCGG	2	8	40413	40420	0 %	0 %	75 %	25 %	51247010
85	NC_006139	CGGG	2	8	40697	40704	0 %	0 %	75 %	25 %	51247010
86	NC_006139	GCCT	2	8	41654	41661	0 %	25 %	25 %	50 %	51247011
87	NC_006139	GCTG	2	8	41994	42001	0 %	25 %	50 %	25 %	51247011
88	NC_006139	TTAT	2	8	42888	42895	25 %	75 %	0 %	0 %	51247013
89	NC_006139	CAGA	2	8	43061	43068	50 %	0 %	25 %	25 %	51247013
90	NC_006139	GACT	2	8	43391	43398	25 %	25 %	25 %	25 %	51247013
91	NC_006139	ATCA	2	8	44683	44690	50 %	25 %	0 %	25 %	51247014
92	NC_006139	TTAT	2	8	45079	45086	25 %	75 %	0 %	0 %	51247015
93	NC_006139	AGTT	2	8	45155	45162	25 %	50 %	25 %	0 %	51247015
94	NC_006139	CTTT	2	8	45395	45402	0 %	75 %	0 %	25 %	51247015
95	NC_006139	GCAA	2	8	46753	46760	50 %	0 %	25 %	25 %	51247016
96	NC_006139	TCCT	2	8	47203	47210	0 %	50 %	0 %	50 %	51247016
97	NC_006139	ATTT	2	8	48458	48465	25 %	75 %	0 %	0 %	51247017
98	NC_006139	ATGA	2	8	48694	48701	50 %	25 %	25 %	0 %	51247018
99	NC_006139	GAGC	2	8	50263	50270	25 %	0 %	50 %	25 %	51247020
100	NC_006139	ATGG	2	8	50600	50607	25 %	25 %	50 %	0 %	51247021
101	NC_006139	AAGA	2	8	50969	50976	75 %	0 %	25 %	0 %	51247021
102	NC_006139	AGCA	2	8	52220	52227	50 %	0 %	25 %	25 %	51247023
103	NC_006139	TTTC	2	8	52420	52427	0 %	75 %	0 %	25 %	51247024
104	NC_006139	CATT	2	8	54507	54514	25 %	50 %	0 %	25 %	51247025
105	NC_006139	TTGA	2	8	54616	54623	25 %	50 %	25 %	0 %	51247025
106	NC_006139	TTAT	2	8	55833	55840	25 %	75 %	0 %	0 %	51247026
107	NC_006139	TTCT	2	8	56813	56820	0 %	75 %	0 %	25 %	51247026
108	NC_006139	TAAT	2	8	57624	57631	50 %	50 %	0 %	0 %	51247026
109	NC_006139	CATC	2	8	58425	58432	25 %	25 %	0 %	50 %	51247027
110	NC_006139	ACCA	2	8	58747	58754	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
111	NC_006139	CAGT	2	8	59178	59185	25 %	25 %	25 %	25 %	51247027
112	NC_006139	AACC	2	8	59211	59218	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
113	NC_006139	GTTG	2	8	60724	60731	0 %	50 %	50 %	0 %	51247027
114	NC_006139	AGAT	2	8	61613	61620	50 %	25 %	25 %	0 %	51247027
115	NC_006139	GTCG	2	8	62215	62222	0 %	25 %	50 %	25 %	51247027
116	NC_006139	CAGT	2	8	62298	62305	25 %	25 %	25 %	25 %	51247027
117	NC_006139	TATC	2	8	62379	62386	25 %	50 %	0 %	25 %	51247027
118	NC_006139	CTAC	2	8	62912	62919	25 %	25 %	0 %	50 %	51247027
119	NC_006139	TGAT	2	8	63650	63657	25 %	50 %	25 %	0 %	51247027
120	NC_006139	CAAG	2	8	65043	65050	50 %	0 %	25 %	25 %	51247027
121	NC_006139	ACCA	2	8	65128	65135	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
122	NC_006139	AACT	2	8	65226	65233	50 %	25 %	0 %	25 %	51247027
123	NC_006139	TTGA	2	8	66017	66024	25 %	50 %	25 %	0 %	51247027
124	NC_006139	AACC	2	8	66055	66062	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
125	NC_006139	CCGC	2	8	66065	66072	0 %	0 %	25 %	75 %	51247027
126	NC_006139	TGAT	2	8	66325	66332	25 %	50 %	25 %	0 %	51247027
127	NC_006139	CCAT	2	8	67214	67221	25 %	25 %	0 %	50 %	51247027
128	NC_006139	CGAT	2	8	67469	67476	25 %	25 %	25 %	25 %	51247027
129	NC_006139	CAAC	2	8	68397	68404	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
130	NC_006139	ACGG	2	8	68728	68735	25 %	0 %	50 %	25 %	51247027
131	NC_006139	AAAT	2	8	68774	68781	75 %	25 %	0 %	0 %	51247027
132	NC_006139	AATC	2	8	69207	69214	50 %	25 %	0 %	25 %	51247027
133	NC_006139	ACCA	2	8	71186	71193	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
134	NC_006139	ATCA	2	8	73313	73320	50 %	25 %	0 %	25 %	51247028
135	NC_006139	TTAT	2	8	73703	73710	25 %	75 %	0 %	0 %	51247029
136	NC_006139	AGTT	2	8	73780	73787	25 %	50 %	25 %	0 %	51247029
137	NC_006139	CTTT	2	8	74020	74027	0 %	75 %	0 %	25 %	51247029
138	NC_006139	GCAG	2	8	74597	74604	25 %	0 %	50 %	25 %	51247030
139	NC_006139	ATGA	2	8	74609	74616	50 %	25 %	25 %	0 %	51247030
140	NC_006139	GCCT	2	8	74660	74667	0 %	25 %	25 %	50 %	51247030
141	NC_006139	TTGT	2	8	74734	74741	0 %	75 %	25 %	0 %	51247030
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.