MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	GGTGG	2	10	904	913	0 %	20 %	80 %	0 %	46562243
2	NC_005863	CACGA	2	10	3465	3474	40 %	0 %	20 %	40 %	46562242
3	NC_005863	TCACG	2	10	3708	3717	20 %	20 %	20 %	40 %	46562242
4	NC_005863	GCACG	2	10	4232	4241	20 %	0 %	40 %	40 %	46562242
5	NC_005863	GCGCA	2	10	5772	5781	20 %	0 %	40 %	40 %	46562241
6	NC_005863	TCAGG	2	10	7451	7460	20 %	20 %	40 %	20 %	46562240
7	NC_005863	CGATG	2	10	7537	7546	20 %	20 %	40 %	20 %	46562240
8	NC_005863	GCCTC	2	10	9430	9439	0 %	20 %	20 %	60 %	46562239
9	NC_005863	GCCCG	2	10	10188	10197	0 %	0 %	40 %	60 %	46562239
10	NC_005863	CTGCA	2	10	12890	12899	20 %	20 %	20 %	40 %	46562237
11	NC_005863	TCGAC	2	10	20541	20550	20 %	20 %	20 %	40 %	46562270
12	NC_005863	GGGCA	2	10	20658	20667	20 %	0 %	60 %	20 %	46562270
13	NC_005863	CGTGC	2	10	21548	21557	0 %	20 %	40 %	40 %	46562270
14	NC_005863	GGAAG	2	10	23339	23348	40 %	0 %	60 %	0 %	46562228
15	NC_005863	GGTGC	2	10	26348	26357	0 %	20 %	60 %	20 %	304570524
16	NC_005863	TGGCG	2	10	26437	26446	0 %	20 %	60 %	20 %	304570524
17	NC_005863	GCGCG	2	10	27039	27048	0 %	0 %	60 %	40 %	46562226
18	NC_005863	TCCTC	2	10	27561	27570	0 %	40 %	0 %	60 %	46562226
19	NC_005863	ACGCC	2	10	27648	27657	20 %	0 %	20 %	60 %	46562226
20	NC_005863	CGCGC	2	10	29832	29841	0 %	0 %	40 %	60 %	46562223
21	NC_005863	AGGGC	2	10	29853	29862	20 %	0 %	60 %	20 %	46562223
22	NC_005863	ATAGT	2	10	31313	31322	40 %	40 %	20 %	0 %	46562221
23	NC_005863	TGCCG	2	10	32595	32604	0 %	20 %	40 %	40 %	46562218
24	NC_005863	CGTGC	2	10	35126	35135	0 %	20 %	40 %	40 %	46562216
25	NC_005863	TGGGG	2	10	37358	37367	0 %	20 %	80 %	0 %	46562213
26	NC_005863	TGCGC	2	10	37931	37940	0 %	20 %	40 %	40 %	46562213
27	NC_005863	TGCAG	2	10	38108	38117	20 %	20 %	40 %	20 %	46562213
28	NC_005863	AATGC	2	10	40622	40631	40 %	20 %	20 %	20 %	46562212
29	NC_005863	CAGCG	2	10	42187	42196	20 %	0 %	40 %	40 %	46562211
30	NC_005863	GGGGC	2	10	45197	45206	0 %	0 %	80 %	20 %	46562210
31	NC_005863	TCGCC	2	10	47784	47793	0 %	20 %	20 %	60 %	46562208
32	NC_005863	AGGGC	2	10	48319	48328	20 %	0 %	60 %	20 %	46562207
33	NC_005863	ACGGC	2	10	50593	50602	20 %	0 %	40 %	40 %	46562205
34	NC_005863	TCGGG	2	10	51071	51080	0 %	20 %	60 %	20 %	46562205
35	NC_005863	TGCGG	2	10	51386	51395	0 %	20 %	60 %	20 %	46562205
36	NC_005863	GCTGG	2	10	52132	52141	0 %	20 %	60 %	20 %	46562204
37	NC_005863	TCTCG	2	10	53042	53051	0 %	40 %	20 %	40 %	46562275
38	NC_005863	CGCTG	2	10	54022	54031	0 %	20 %	40 %	40 %	46562203
39	NC_005863	CCCGG	2	10	54632	54641	0 %	0 %	40 %	60 %	46562203
40	NC_005863	CCTGC	2	10	55413	55422	0 %	20 %	20 %	60 %	46562203
41	NC_005863	CCGCG	2	10	55968	55977	0 %	0 %	40 %	60 %	46562202
42	NC_005863	CGGCA	2	10	57700	57709	20 %	0 %	40 %	40 %	46562201
43	NC_005863	CGCGC	2	10	58188	58197	0 %	0 %	40 %	60 %	46562201
44	NC_005863	CGTCC	2	10	59342	59351	0 %	20 %	20 %	60 %	46562200
45	NC_005863	GCGCT	2	10	62254	62263	0 %	20 %	40 %	40 %	46562269
46	NC_005863	GCGCG	2	10	62699	62708	0 %	0 %	60 %	40 %	46562199
47	NC_005863	GGCGT	2	10	64632	64641	0 %	20 %	60 %	20 %	46562268
48	NC_005863	ACGGG	2	10	64706	64715	20 %	0 %	60 %	20 %	46562268
49	NC_005863	GCAGG	2	10	68047	68056	20 %	0 %	60 %	20 %	46562196
50	NC_005863	TCAGG	2	10	68334	68343	20 %	20 %	40 %	20 %	46562196
51	NC_005863	GGGCG	2	10	68532	68541	0 %	0 %	80 %	20 %	46562196
52	NC_005863	GTTCC	2	10	70754	70763	0 %	40 %	20 %	40 %	46562194
53	NC_005863	GCACG	2	10	72011	72020	20 %	0 %	40 %	40 %	46562194
54	NC_005863	GGGCG	2	10	73747	73756	0 %	0 %	80 %	20 %	46562193
55	NC_005863	CGGGG	2	10	74881	74890	0 %	0 %	80 %	20 %	46562192
56	NC_005863	GGTCA	2	10	75913	75922	20 %	20 %	40 %	20 %	46562191
57	NC_005863	TGGCT	2	10	76588	76597	0 %	40 %	40 %	20 %	46562191
58	NC_005863	CACGC	2	10	76870	76879	20 %	0 %	20 %	60 %	46562191
59	NC_005863	GTACC	2	10	77525	77534	20 %	20 %	20 %	40 %	46562190
60	NC_005863	GGCAG	2	10	78540	78549	20 %	0 %	60 %	20 %	46562189
61	NC_005863	GCTGC	2	10	79394	79403	0 %	20 %	40 %	40 %	46562189
62	NC_005863	CGGCA	2	10	81100	81109	20 %	0 %	40 %	40 %	46562188
63	NC_005863	GGGAA	2	10	81140	81149	40 %	0 %	60 %	0 %	46562188
64	NC_005863	CGGGG	2	10	81349	81358	0 %	0 %	80 %	20 %	46562188
65	NC_005863	GACGG	2	10	82013	82022	20 %	0 %	60 %	20 %	46562188
66	NC_005863	GCACC	2	10	83763	83772	20 %	0 %	20 %	60 %	46562187
67	NC_005863	GCATG	2	10	86774	86783	20 %	20 %	40 %	20 %	46562186
68	NC_005863	TCTTT	2	10	88550	88559	0 %	80 %	0 %	20 %	46562184
69	NC_005863	CGAGT	2	10	89479	89488	20 %	20 %	40 %	20 %	46562184
70	NC_005863	CGGAA	2	10	91640	91649	40 %	0 %	40 %	20 %	46562183
71	NC_005863	GTGCG	2	10	92394	92403	0 %	20 %	60 %	20 %	46562182
72	NC_005863	GGCGT	2	10	93738	93747	0 %	20 %	60 %	20 %	46562182
73	NC_005863	GCGAA	2	10	95631	95640	40 %	0 %	40 %	20 %	46562181
74	NC_005863	GTCGT	2	10	97079	97088	0 %	40 %	40 %	20 %	46562180
75	NC_005863	GCCGG	2	10	97852	97861	0 %	0 %	60 %	40 %	46562179
76	NC_005863	CAGGT	2	10	98209	98218	20 %	20 %	40 %	20 %	46562179
77	NC_005863	GCCCC	2	10	99690	99699	0 %	0 %	20 %	80 %	46562179
78	NC_005863	CCGTC	2	10	100938	100947	0 %	20 %	20 %	60 %	46562178
79	NC_005863	TGCAC	2	10	100965	100974	20 %	20 %	20 %	40 %	46562178
80	NC_005863	ATGGT	2	10	102386	102395	20 %	40 %	40 %	0 %	46562177
81	NC_005863	AGGCG	2	10	103724	103733	20 %	0 %	60 %	20 %	46562176
82	NC_005863	GTGCC	2	10	103847	103856	0 %	20 %	40 %	40 %	46562176
83	NC_005863	TGCCC	2	10	106596	106605	0 %	20 %	20 %	60 %	46562264
84	NC_005863	GCCGG	2	10	106654	106663	0 %	0 %	60 %	40 %	46562264
85	NC_005863	GCCCC	2	10	107296	107305	0 %	0 %	20 %	80 %	46562174
86	NC_005863	ACGGC	2	10	107485	107494	20 %	0 %	40 %	40 %	46562174
87	NC_005863	CGACC	2	10	107864	107873	20 %	0 %	20 %	60 %	46562174
88	NC_005863	CCGCG	2	10	108790	108799	0 %	0 %	40 %	60 %	46562174
89	NC_005863	GACTG	2	10	112774	112783	20 %	20 %	40 %	20 %	46562170
90	NC_005863	CGGTG	2	10	115033	115042	0 %	20 %	60 %	20 %	46562169
91	NC_005863	GCGTG	2	10	115882	115891	0 %	20 %	60 %	20 %	46562169
92	NC_005863	TGCGC	2	10	117080	117089	0 %	20 %	40 %	40 %	46562168
93	NC_005863	GCCGT	2	10	120298	120307	0 %	20 %	40 %	40 %	46562263
94	NC_005863	CGATG	2	10	121469	121478	20 %	20 %	40 %	20 %	46562167
95	NC_005863	CCGGC	2	10	122490	122499	0 %	0 %	40 %	60 %	46562166
96	NC_005863	GCGCC	2	10	122910	122919	0 %	0 %	40 %	60 %	46562166
97	NC_005863	GCGCA	2	10	123959	123968	20 %	0 %	40 %	40 %	46562165
98	NC_005863	GCCCT	2	10	124302	124311	0 %	20 %	20 %	60 %	46562165
99	NC_005863	GGCAC	2	10	127948	127957	20 %	0 %	40 %	40 %	46562262
100	NC_005863	CGGCG	2	10	133050	133059	0 %	0 %	60 %	40 %	46562159
101	NC_005863	GCCAC	2	10	139169	139178	20 %	0 %	20 %	60 %	46562155
102	NC_005863	CGCGC	2	10	139389	139398	0 %	0 %	40 %	60 %	46562155
103	NC_005863	CTGCG	2	10	141892	141901	0 %	20 %	40 %	40 %	46562153
104	NC_005863	GGCAC	2	10	143359	143368	20 %	0 %	40 %	40 %	46562277
105	NC_005863	CCGTC	2	10	143614	143623	0 %	20 %	20 %	60 %	46562152
106	NC_005863	CCCTG	2	10	144316	144325	0 %	20 %	20 %	60 %	46562152
107	NC_005863	GCCGC	2	10	148792	148801	0 %	0 %	40 %	60 %	304570521
108	NC_005863	GCCAC	2	10	151377	151386	20 %	0 %	20 %	60 %	46562146
109	NC_005863	CGGCA	2	10	152295	152304	20 %	0 %	40 %	40 %	46562146
110	NC_005863	CCCCG	2	10	152784	152793	0 %	0 %	20 %	80 %	46562146
111	NC_005863	TCGCC	2	10	155286	155295	0 %	20 %	20 %	60 %	46562142
112	NC_005863	TCCTC	2	10	156935	156944	0 %	40 %	0 %	60 %	46562261
113	NC_005863	CGGCA	2	10	160777	160786	20 %	0 %	40 %	40 %	46562140
114	NC_005863	ACGCC	2	10	161142	161151	20 %	0 %	20 %	60 %	46562140
115	NC_005863	AACGC	2	10	161930	161939	40 %	0 %	20 %	40 %	46562139
116	NC_005863	CCGGC	2	10	163728	163737	0 %	0 %	40 %	60 %	46562136
117	NC_005863	GCGAT	2	10	164788	164797	20 %	20 %	40 %	20 %	46562135
118	NC_005863	GCCCA	2	10	165797	165806	20 %	0 %	20 %	60 %	304570522
119	NC_005863	GCAGC	2	10	167269	167278	20 %	0 %	40 %	40 %	304570522
120	NC_005863	GGCAT	2	10	167531	167540	20 %	20 %	40 %	20 %	304570522
121	NC_005863	CTCCC	2	10	168806	168815	0 %	20 %	0 %	80 %	46562132
122	NC_005863	GGACA	2	10	169040	169049	40 %	0 %	40 %	20 %	46562132
123	NC_005863	TGCCG	2	10	169680	169689	0 %	20 %	40 %	40 %	46562132
124	NC_005863	TGTCG	2	10	169690	169699	0 %	40 %	40 %	20 %	46562132
125	NC_005863	CCAGA	2	10	172416	172425	40 %	0 %	20 %	40 %	46562131
126	NC_005863	TGGTC	2	10	173013	173022	0 %	40 %	40 %	20 %	46562130
127	NC_005863	GGCTT	2	10	174583	174592	0 %	40 %	40 %	20 %	46562259
128	NC_005863	GCAGC	2	10	179666	179675	20 %	0 %	40 %	40 %	46562256
129	NC_005863	CGCGC	2	10	180358	180367	0 %	0 %	40 %	60 %	46562256
130	NC_005863	CAGCC	2	10	180402	180411	20 %	0 %	20 %	60 %	46562256
131	NC_005863	ATTTG	2	10	181676	181685	20 %	60 %	20 %	0 %	46562255
132	NC_005863	GCCGT	2	10	181852	181861	0 %	20 %	40 %	40 %	46562255
133	NC_005863	TGCCC	2	10	182543	182552	0 %	20 %	20 %	60 %	46562255
134	NC_005863	TACCG	2	10	183504	183513	20 %	20 %	20 %	40 %	46562255
135	NC_005863	CGCAG	2	10	184910	184919	20 %	0 %	40 %	40 %	46562252
136	NC_005863	CGGCA	2	10	184957	184966	20 %	0 %	40 %	40 %	46562252
137	NC_005863	GCGCC	2	10	187995	188004	0 %	0 %	40 %	60 %	46562281
138	NC_005863	CCGCC	2	10	188592	188601	0 %	0 %	20 %	80 %	46562281
139	NC_005863	CATGG	2	10	193630	193639	20 %	20 %	40 %	20 %	46562248
140	NC_005863	AGGCA	2	10	194226	194235	40 %	0 %	40 %	20 %	46562248
141	NC_005863	GGCAG	2	10	194254	194263	20 %	0 %	60 %	20 %	46562248
142	NC_005863	CGCGC	2	10	194714	194723	0 %	0 %	40 %	60 %	46562248
143	NC_005863	CCCCG	2	10	195252	195261	0 %	0 %	20 %	80 %	46562248
144	NC_005863	CCCGC	3	15	195882	195896	0 %	0 %	20 %	80 %	46562248
145	NC_005863	GTGCC	2	10	196750	196759	0 %	20 %	40 %	40 %	46562247
146	NC_005863	CGCGG	2	10	197609	197618	0 %	0 %	60 %	40 %	46562247
147	NC_005863	ACGGC	2	10	197782	197791	20 %	0 %	40 %	40 %	46562247
148	NC_005863	CTGCG	2	10	201320	201329	0 %	20 %	40 %	40 %	46562245

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.