MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005863	GGT	2	6	164011	164016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562136
3502	NC_005863	CGG	2	6	164118	164123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562136
3503	NC_005863	TCA	2	6	164124	164129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562136
3504	NC_005863	CGA	2	6	164224	164229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3505	NC_005863	GCA	2	6	164278	164283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3506	NC_005863	CTGGCG	2	12	164309	164320	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46562136
3507	NC_005863	CGG	2	6	164356	164361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562136
3508	NC_005863	CGA	2	6	164374	164379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3509	NC_005863	GCG	2	6	164395	164400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562136
3510	NC_005863	GCGAT	2	10	164788	164797	20 %	20 %	40 %	20 %	46562135
3511	NC_005863	CAG	2	6	164817	164822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562135
3512	NC_005863	GAC	2	6	164871	164876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562135
3513	NC_005863	CAA	2	6	164879	164884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562135
3514	NC_005863	CAT	2	6	164918	164923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562135
3515	NC_005863	GTG	2	6	164952	164957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562135
3516	NC_005863	CAT	2	6	164960	164965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562135
3517	NC_005863	CGA	2	6	164984	164989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562135
3518	NC_005863	GCGG	2	8	165042	165049	0 %	0 %	75 %	25 %	46562135
3519	NC_005863	TCCA	2	8	165084	165091	25 %	25 %	0 %	50 %	46562135
3520	NC_005863	CGC	2	6	165152	165157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562135
3521	NC_005863	GC	3	6	165182	165187	0 %	0 %	50 %	50 %	46562135
3522	NC_005863	ACCG	2	8	165230	165237	25 %	0 %	25 %	50 %	46562135
3523	NC_005863	CCG	2	6	165462	165467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3524	NC_005863	GCA	3	9	165484	165492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570522
3525	NC_005863	CGG	2	6	165538	165543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3526	NC_005863	CGG	2	6	165600	165605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3527	NC_005863	CGG	3	9	165637	165645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3528	NC_005863	ACG	2	6	165657	165662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570522
3529	NC_005863	GAT	2	6	165679	165684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304570522
3530	NC_005863	CGCT	2	8	165686	165693	0 %	25 %	25 %	50 %	304570522
3531	NC_005863	GC	4	8	165716	165723	0 %	0 %	50 %	50 %	304570522
3532	NC_005863	GCA	2	6	165754	165759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570522
3533	NC_005863	GCCCA	2	10	165797	165806	20 %	0 %	20 %	60 %	304570522
3534	NC_005863	CGC	2	6	165922	165927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3535	NC_005863	GTG	2	6	165995	166000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570522
3536	NC_005863	CCA	2	6	166071	166076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570522
3537	NC_005863	G	6	6	166105	166110	0 %	0 %	100 %	0 %	304570522
3538	NC_005863	GCC	2	6	166114	166119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3539	NC_005863	GCC	2	6	166155	166160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3540	NC_005863	GCG	2	6	166178	166183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3541	NC_005863	GCC	2	6	166367	166372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3542	NC_005863	GCA	2	6	166387	166392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570522
3543	NC_005863	TCG	2	6	166424	166429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304570522
3544	NC_005863	GGC	2	6	166430	166435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3545	NC_005863	ATG	2	6	166445	166450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304570522
3546	NC_005863	CAC	2	6	166462	166467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570522
3547	NC_005863	CGCT	2	8	166544	166551	0 %	25 %	25 %	50 %	304570522
3548	NC_005863	CGG	2	6	166627	166632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3549	NC_005863	GTG	2	6	166641	166646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570522
3550	NC_005863	GGC	2	6	166685	166690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3551	NC_005863	CAC	2	6	166695	166700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570522
3552	NC_005863	GGC	2	6	166810	166815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3553	NC_005863	GGCCAC	2	12	166825	166836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	304570522
3554	NC_005863	GGC	2	6	166883	166888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3555	NC_005863	GCG	2	6	166901	166906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3556	NC_005863	GACC	2	8	167020	167027	25 %	0 %	25 %	50 %	304570522
3557	NC_005863	GCC	2	6	167087	167092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3558	NC_005863	CGCC	2	8	167133	167140	0 %	0 %	25 %	75 %	304570522
3559	NC_005863	AGC	2	6	167235	167240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570522
3560	NC_005863	GCAGC	2	10	167269	167278	20 %	0 %	40 %	40 %	304570522
3561	NC_005863	CAAC	2	8	167292	167299	50 %	0 %	0 %	50 %	304570522
3562	NC_005863	GGC	2	6	167326	167331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3563	NC_005863	CA	3	6	167425	167430	50 %	0 %	0 %	50 %	304570522
3564	NC_005863	TGG	2	6	167499	167504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570522
3565	NC_005863	GGCAT	2	10	167531	167540	20 %	20 %	40 %	20 %	304570522
3566	NC_005863	CGG	2	6	167563	167568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3567	NC_005863	GGCGGG	2	12	167570	167581	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	304570522
3568	NC_005863	GGC	2	6	167582	167587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570522
3569	NC_005863	CGC	2	6	167644	167649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570522
3570	NC_005863	TGA	2	6	167655	167660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304570522
3571	NC_005863	GAA	2	6	167675	167680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304570522
3572	NC_005863	CCA	3	9	167697	167705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570522
3573	NC_005863	TGG	2	6	167730	167735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570522
3574	NC_005863	ATTC	2	8	168075	168082	25 %	50 %	0 %	25 %	46562133
3575	NC_005863	ATC	2	6	168092	168097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562133
3576	NC_005863	GAG	2	6	168111	168116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562133
3577	NC_005863	CGG	2	6	168133	168138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562133
3578	NC_005863	CGA	2	6	168139	168144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562133
3579	NC_005863	ACA	2	6	168162	168167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562133
3580	NC_005863	GCC	2	6	168266	168271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3581	NC_005863	GCC	2	6	168311	168316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3582	NC_005863	GCT	2	6	168319	168324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3583	NC_005863	ACG	2	6	168327	168332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3584	NC_005863	GAAG	2	8	168368	168375	50 %	0 %	50 %	0 %	46562132
3585	NC_005863	GCA	2	6	168429	168434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3586	NC_005863	GCT	2	6	168442	168447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3587	NC_005863	CGG	2	6	168475	168480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562132
3588	NC_005863	GGC	2	6	168491	168496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562132
3589	NC_005863	CCG	2	6	168543	168548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3590	NC_005863	GCC	2	6	168592	168597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3591	NC_005863	GCC	2	6	168606	168611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3592	NC_005863	CTT	2	6	168637	168642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562132
3593	NC_005863	CTCCC	2	10	168806	168815	0 %	20 %	0 %	80 %	46562132
3594	NC_005863	TGC	2	6	168840	168845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3595	NC_005863	GC	4	8	168857	168864	0 %	0 %	50 %	50 %	46562132
3596	NC_005863	GCG	2	6	168906	168911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562132
3597	NC_005863	CTC	2	6	168922	168927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562132
3598	NC_005863	CAT	2	6	169000	169005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562132
3599	NC_005863	GGACA	2	10	169040	169049	40 %	0 %	40 %	20 %	46562132
3600	NC_005863	CAC	2	6	169061	169066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562132
3601	NC_005863	GGC	2	6	169126	169131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562132
3602	NC_005863	ACC	2	6	169160	169165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562132
3603	NC_005863	TTC	2	6	169175	169180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562132
3604	NC_005863	CGA	2	6	169252	169257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3605	NC_005863	TGG	2	6	169314	169319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562132
3606	NC_005863	GGT	2	6	169336	169341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562132
3607	NC_005863	GAT	2	6	169370	169375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562132
3608	NC_005863	AG	3	6	169387	169392	50 %	0 %	50 %	0 %	46562132
3609	NC_005863	ATC	2	6	169418	169423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562132
3610	NC_005863	GCAG	2	8	169475	169482	25 %	0 %	50 %	25 %	46562132
3611	NC_005863	CGC	2	6	169501	169506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3612	NC_005863	TCG	2	6	169539	169544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3613	NC_005863	CTG	2	6	169577	169582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3614	NC_005863	CCA	2	6	169611	169616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562132
3615	NC_005863	CGG	2	6	169634	169639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562132
3616	NC_005863	TGCCG	2	10	169680	169689	0 %	20 %	40 %	40 %	46562132
3617	NC_005863	TGTCG	2	10	169690	169699	0 %	40 %	40 %	20 %	46562132
3618	NC_005863	GGC	2	6	169806	169811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562132
3619	NC_005863	GTC	3	9	169829	169837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562132
3620	NC_005863	CG	3	6	169855	169860	0 %	0 %	50 %	50 %	46562132
3621	NC_005863	CGC	2	6	169949	169954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562132
3622	NC_005863	AGGA	2	8	169991	169998	50 %	0 %	50 %	0 %	46562132
3623	NC_005863	CGA	3	9	170080	170088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562132
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3855	NC_005863	CGGCA	2	10	184957	184966	20 %	0 %	40 %	40 %	46562252
3856	NC_005863	CCCG	2	8	184970	184977	0 %	0 %	25 %	75 %	46562252
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3863	NC_005863	TGG	2	6	185322	185327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562252
3864	NC_005863	TGC	2	6	185364	185369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562252
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3990	NC_005863	GGT	2	6	191684	191689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562250
3991	NC_005863	GCGG	2	8	191690	191697	0 %	0 %	75 %	25 %	46562250
3992	NC_005863	GCT	2	6	192366	192371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562249
3993	NC_005863	CGC	2	6	192378	192383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
3994	NC_005863	GAC	2	6	192387	192392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562249
3995	NC_005863	CAC	2	6	192409	192414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562249
3996	NC_005863	GCCT	2	8	192417	192424	0 %	25 %	25 %	50 %	46562249
3997	NC_005863	GCC	2	6	192430	192435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
3998	NC_005863	CGC	2	6	192444	192449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
3999	NC_005863	AC	3	6	192476	192481	50 %	0 %	0 %	50 %	46562249
4000	NC_005863	CG	3	6	192500	192505	0 %	0 %	50 %	50 %	46562249

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