MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005863	GC	3	6	140958	140963	0 %	0 %	50 %	50 %	46562153
3002	NC_005863	GGC	2	6	140999	141004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562153
3003	NC_005863	TCG	2	6	141010	141015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3004	NC_005863	CAT	2	6	141075	141080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562153
3005	NC_005863	CG	3	6	141134	141139	0 %	0 %	50 %	50 %	46562153
3006	NC_005863	GA	3	6	141308	141313	50 %	0 %	50 %	0 %	46562153
3007	NC_005863	GAT	2	6	141321	141326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562153
3008	NC_005863	GTC	2	6	141345	141350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3009	NC_005863	CTG	2	6	141354	141359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3010	NC_005863	GCC	2	6	141363	141368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562153
3011	NC_005863	CCG	2	6	141389	141394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562153
3012	NC_005863	AGCG	2	8	141400	141407	25 %	0 %	50 %	25 %	46562153
3013	NC_005863	GC	3	6	141418	141423	0 %	0 %	50 %	50 %	46562153
3014	NC_005863	GGTC	2	8	141425	141432	0 %	25 %	50 %	25 %	46562153
3015	NC_005863	GCG	2	6	141453	141458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562153
3016	NC_005863	CCG	2	6	141475	141480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562153
3017	NC_005863	GCCAGC	2	12	141484	141495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46562153
3018	NC_005863	C	7	7	141549	141555	0 %	0 %	0 %	100 %	46562153
3019	NC_005863	GCC	2	6	141615	141620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562153
3020	NC_005863	TGA	2	6	141638	141643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562153
3021	NC_005863	CAG	2	6	141666	141671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3022	NC_005863	CGCC	2	8	141734	141741	0 %	0 %	25 %	75 %	46562153
3023	NC_005863	TGC	2	6	141751	141756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3024	NC_005863	GCC	2	6	141774	141779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562153
3025	NC_005863	CGA	2	6	141797	141802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3026	NC_005863	CTGCG	2	10	141892	141901	0 %	20 %	40 %	40 %	46562153
3027	NC_005863	GC	3	6	141925	141930	0 %	0 %	50 %	50 %	46562153
3028	NC_005863	GC	3	6	141981	141986	0 %	0 %	50 %	50 %	46562153
3029	NC_005863	ACC	2	6	142057	142062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562153
3030	NC_005863	CAC	2	6	142068	142073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562153
3031	NC_005863	GCC	2	6	142080	142085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562153
3032	NC_005863	CGAAGA	2	12	142100	142111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46562153
3033	NC_005863	CTGC	2	8	142127	142134	0 %	25 %	25 %	50 %	46562153
3034	NC_005863	GTG	3	9	142150	142158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562153
3035	NC_005863	GTG	2	6	142183	142188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562153
3036	NC_005863	AGC	2	6	142192	142197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3037	NC_005863	TGG	2	6	142199	142204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562153
3038	NC_005863	CAT	2	6	142245	142250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562153
3039	NC_005863	ACGA	2	8	142258	142265	50 %	0 %	25 %	25 %	46562153
3040	NC_005863	GCG	2	6	142301	142306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562153
3041	NC_005863	ATC	2	6	142321	142326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562153
3042	NC_005863	ACC	3	9	142336	142344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562153
3043	NC_005863	AGC	3	9	142345	142353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562153
3044	NC_005863	CGG	2	6	142391	142396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562153
3045	NC_005863	AGC	2	6	143191	143196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562277
3046	NC_005863	CGG	2	6	143198	143203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562277
3047	NC_005863	TCCACG	2	12	143209	143220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46562277
3048	NC_005863	CAC	2	6	143253	143258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562277
3049	NC_005863	CCG	2	6	143266	143271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562277
3050	NC_005863	GCC	2	6	143277	143282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562277
3051	NC_005863	GGCAC	2	10	143359	143368	20 %	0 %	40 %	40 %	46562277
3052	NC_005863	CAG	2	6	143382	143387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562277
3053	NC_005863	GTC	2	6	143391	143396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562277
3054	NC_005863	GCC	2	6	143414	143419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562277
3055	NC_005863	GCG	2	6	143497	143502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562277
3056	NC_005863	CCT	2	6	143527	143532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562152
3057	NC_005863	AGC	2	6	143595	143600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3058	NC_005863	CCGTC	2	10	143614	143623	0 %	20 %	20 %	60 %	46562152
3059	NC_005863	CCA	2	6	143764	143769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562152
3060	NC_005863	AGC	2	6	143778	143783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3061	NC_005863	TCA	2	6	143836	143841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562152
3062	NC_005863	AGC	2	6	143871	143876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3063	NC_005863	GTGC	2	8	143912	143919	0 %	25 %	50 %	25 %	46562152
3064	NC_005863	TCG	2	6	143997	144002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3065	NC_005863	CGTT	2	8	144009	144016	0 %	50 %	25 %	25 %	46562152
3066	NC_005863	TGG	2	6	144019	144024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562152
3067	NC_005863	GGT	2	6	144041	144046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562152
3068	NC_005863	GTC	3	9	144224	144232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3069	NC_005863	CGT	2	6	144247	144252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3070	NC_005863	GGC	2	6	144257	144262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3071	NC_005863	CCT	2	6	144298	144303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562152
3072	NC_005863	GC	3	6	144305	144310	0 %	0 %	50 %	50 %	46562152
3073	NC_005863	CCCTG	2	10	144316	144325	0 %	20 %	20 %	60 %	46562152
3074	NC_005863	GTC	2	6	144464	144469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3075	NC_005863	GGT	2	6	144470	144475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562152
3076	NC_005863	CGG	2	6	144478	144483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3077	NC_005863	CGG	2	6	144499	144504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3078	NC_005863	AGC	2	6	144513	144518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3079	NC_005863	GCG	2	6	144523	144528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3080	NC_005863	CAG	2	6	144554	144559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3081	NC_005863	TCGA	2	8	144636	144643	25 %	25 %	25 %	25 %	46562152
3082	NC_005863	GCC	2	6	145455	145460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570523
3083	NC_005863	CGG	2	6	145483	145488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570523
3084	NC_005863	GCC	2	6	145505	145510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570523
3085	NC_005863	CGCAGG	2	12	145531	145542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	304570523
3086	NC_005863	GCGAGG	2	12	145555	145566	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	304570523
3087	NC_005863	CAC	2	6	145583	145588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570523
3088	NC_005863	GCCACG	2	12	145593	145604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	304570523
3089	NC_005863	CGC	2	6	145632	145637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570523
3090	NC_005863	CCAG	2	8	145667	145674	25 %	0 %	25 %	50 %	304570519
3091	NC_005863	CAT	2	6	145687	145692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304570519
3092	NC_005863	AAC	2	6	145703	145708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3093	NC_005863	ACA	2	6	145824	145829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3094	NC_005863	AAG	2	6	145832	145837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304570519
3095	NC_005863	AGG	2	6	145851	145856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304570519
3096	NC_005863	GCC	2	6	145871	145876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570519
3097	NC_005863	GC	3	6	145889	145894	0 %	0 %	50 %	50 %	304570519
3098	NC_005863	AAC	2	6	145916	145921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3099	NC_005863	ACC	2	6	145928	145933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570519
3100	NC_005863	CCG	2	6	145941	145946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570519
3101	NC_005863	CTT	2	6	145957	145962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304570519
3102	NC_005863	AAC	2	6	145970	145975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3103	NC_005863	ACG	2	6	145998	146003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3104	NC_005863	CAA	2	6	146011	146016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3105	NC_005863	ACA	2	6	146031	146036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3106	NC_005863	CAG	2	6	146039	146044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3107	NC_005863	GCA	2	6	146080	146085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3108	NC_005863	CAG	2	6	146156	146161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3109	NC_005863	GCA	2	6	146316	146321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562149
3110	NC_005863	CCG	2	6	146366	146371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562149
3111	NC_005863	CG	3	6	146401	146406	0 %	0 %	50 %	50 %	46562149
3112	NC_005863	ACG	2	6	146426	146431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562149
3113	NC_005863	GCAG	2	8	146459	146466	25 %	0 %	50 %	25 %	46562149
3114	NC_005863	GCC	2	6	146515	146520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562149
3115	NC_005863	CG	3	6	146592	146597	0 %	0 %	50 %	50 %	46562149
3116	NC_005863	GCC	2	6	146650	146655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562149
3117	NC_005863	CTG	2	6	146686	146691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562149
3118	NC_005863	CGG	2	6	146723	146728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562278
3119	NC_005863	CAC	2	6	146738	146743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562278
3120	NC_005863	CAC	2	6	146789	146794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562278
3121	NC_005863	CGG	2	6	146819	146824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562278
3122	NC_005863	GCAG	2	8	146923	146930	25 %	0 %	50 %	25 %	46562278
3123	NC_005863	GCC	2	6	146967	146972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562278
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3232	NC_005863	GCCAC	2	10	151377	151386	20 %	0 %	20 %	60 %	46562146
3233	NC_005863	CCG	2	6	151403	151408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562146
3234	NC_005863	ACG	2	6	151466	151471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562146
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3240	NC_005863	CTG	2	6	151834	151839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562146
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3242	NC_005863	TGC	2	6	151853	151858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562146
3243	NC_005863	GGT	2	6	151872	151877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562146
3244	NC_005863	CGCC	2	8	151894	151901	0 %	0 %	25 %	75 %	46562146
3245	NC_005863	CG	3	6	151915	151920	0 %	0 %	50 %	50 %	46562146
3246	NC_005863	GCG	2	6	151930	151935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562146
3247	NC_005863	GTC	2	6	151993	151998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562146
3248	NC_005863	GCT	2	6	152004	152009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562146
3249	NC_005863	GAC	2	6	152011	152016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562146
3250	NC_005863	CTG	2	6	152056	152061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562146
3251	NC_005863	TGC	2	6	152099	152104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562146
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3275	NC_005863	CCA	2	6	153014	153019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562146
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3277	NC_005863	CGA	2	6	153076	153081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562145
3278	NC_005863	GAAG	2	8	153109	153116	50 %	0 %	50 %	0 %	46562145
3279	NC_005863	CGA	2	6	153172	153177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562145
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3330	NC_005863	GCC	2	6	156769	156774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562261
3331	NC_005863	CTG	2	6	156775	156780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562261
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3333	NC_005863	GCC	2	6	156820	156825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562261
3334	NC_005863	ACG	2	6	156881	156886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562261
3335	NC_005863	TCCTC	2	10	156935	156944	0 %	40 %	0 %	60 %	46562261
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3337	NC_005863	GAC	3	9	157024	157032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562261
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3339	NC_005863	CAG	2	6	157081	157086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562261
3340	NC_005863	GCC	2	6	157141	157146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562261
3341	NC_005863	TGC	2	6	157148	157153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562261
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3349	NC_005863	CTG	2	6	157780	157785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562141
3350	NC_005863	GAC	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562141
3351	NC_005863	GGT	2	6	157821	157826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562141
3352	NC_005863	CGC	2	6	157856	157861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562141
3353	NC_005863	CGCC	2	8	157883	157890	0 %	0 %	25 %	75 %	46562141
3354	NC_005863	TC	3	6	157917	157922	0 %	50 %	0 %	50 %	46562141
3355	NC_005863	CGG	2	6	157983	157988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562141
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3357	NC_005863	CGC	2	6	158050	158055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562141
3358	NC_005863	ATC	2	6	158056	158061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562141
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3360	NC_005863	GCGG	2	8	158146	158153	0 %	0 %	75 %	25 %	46562141
3361	NC_005863	CAT	2	6	158178	158183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562141
3362	NC_005863	TG	3	6	158202	158207	0 %	50 %	50 %	0 %	46562141
3363	NC_005863	AAG	2	6	158284	158289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562141
3364	NC_005863	TGG	2	6	158297	158302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562141
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3366	NC_005863	GCG	2	6	158385	158390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562141
3367	NC_005863	TGC	2	6	158396	158401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562141
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3440	NC_005863	GTC	2	6	161710	161715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562139
3441	NC_005863	GCA	2	6	161745	161750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562139
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3443	NC_005863	CAT	2	6	161784	161789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562139
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3457	NC_005863	GCT	2	6	162240	162245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562139
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3470	NC_005863	CT	3	6	162652	162657	0 %	50 %	0 %	50 %	46562137
3471	NC_005863	AGC	2	6	162719	162724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562137
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3479	NC_005863	TGG	2	6	162986	162991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562137
3480	NC_005863	TACAGC	2	12	162997	163008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46562137
3481	NC_005863	CAC	2	6	163009	163014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562137
3482	NC_005863	CAC	2	6	163073	163078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562136
3483	NC_005863	TGC	2	6	163145	163150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3484	NC_005863	GC	3	6	163149	163154	0 %	0 %	50 %	50 %	46562136
3485	NC_005863	GGTGCT	2	12	163159	163170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46562136
3486	NC_005863	CGG	2	6	163191	163196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562136
3487	NC_005863	CAT	2	6	163222	163227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562136
3488	NC_005863	GCGG	2	8	163310	163317	0 %	0 %	75 %	25 %	46562136
3489	NC_005863	ACC	2	6	163532	163537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562136
3490	NC_005863	CCG	2	6	163554	163559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562136
3491	NC_005863	GCCC	2	8	163595	163602	0 %	0 %	25 %	75 %	46562136
3492	NC_005863	CAC	2	6	163708	163713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562136
3493	NC_005863	CCGGC	2	10	163728	163737	0 %	0 %	40 %	60 %	46562136
3494	NC_005863	CGG	2	6	163746	163751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562136
3495	NC_005863	GAC	2	6	163768	163773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3496	NC_005863	CGTC	2	8	163833	163840	0 %	25 %	25 %	50 %	46562136
3497	NC_005863	CGTC	2	8	163857	163864	0 %	25 %	25 %	50 %	46562136
3498	NC_005863	GTCT	2	8	163906	163913	0 %	50 %	25 %	25 %	46562136
3499	NC_005863	GCA	2	6	163915	163920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3500	NC_005863	GC	3	6	163982	163987	0 %	0 %	50 %	50 %	46562136

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