MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_005863	CAG	2	6	91330	91335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562183
2002	NC_005863	GGA	2	6	91353	91358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562183
2003	NC_005863	TTG	2	6	91412	91417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562183
2004	NC_005863	TCT	2	6	91458	91463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562183
2005	NC_005863	CCA	2	6	91505	91510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562183
2006	NC_005863	CTG	2	6	91634	91639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562183
2007	NC_005863	CGGAA	2	10	91640	91649	40 %	0 %	40 %	20 %	46562183
2008	NC_005863	CCCG	3	12	91689	91700	0 %	0 %	25 %	75 %	46562183
2009	NC_005863	GGT	2	6	91785	91790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562183
2010	NC_005863	TCG	2	6	91842	91847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562183
2011	NC_005863	GCA	2	6	92022	92027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562183
2012	NC_005863	CGT	2	6	92138	92143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2013	NC_005863	GCC	2	6	92191	92196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2014	NC_005863	CCG	2	6	92202	92207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2015	NC_005863	CCTG	2	8	92225	92232	0 %	25 %	25 %	50 %	46562182
2016	NC_005863	AGC	2	6	92233	92238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2017	NC_005863	GTCT	2	8	92313	92320	0 %	50 %	25 %	25 %	46562182
2018	NC_005863	GGCGGG	2	12	92326	92337	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	46562182
2019	NC_005863	TC	3	6	92349	92354	0 %	50 %	0 %	50 %	46562182
2020	NC_005863	GTGCG	2	10	92394	92403	0 %	20 %	60 %	20 %	46562182
2021	NC_005863	TCG	2	6	92404	92409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2022	NC_005863	CGT	3	9	92412	92420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2023	NC_005863	TGC	3	9	92461	92469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2024	NC_005863	CCCG	2	8	92565	92572	0 %	0 %	25 %	75 %	46562182
2025	NC_005863	GGC	2	6	92579	92584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562182
2026	NC_005863	AGA	2	6	92710	92715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562182
2027	NC_005863	CGA	3	9	92720	92728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2028	NC_005863	CCG	2	6	92740	92745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2029	NC_005863	GA	3	6	92770	92775	50 %	0 %	50 %	0 %	46562182
2030	NC_005863	TCG	2	6	92845	92850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2031	NC_005863	GCA	2	6	92879	92884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2032	NC_005863	GTC	2	6	92896	92901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2033	NC_005863	CGC	2	6	92939	92944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2034	NC_005863	CGG	2	6	93011	93016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562182
2035	NC_005863	CGT	2	6	93019	93024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2036	NC_005863	CGT	2	6	93095	93100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2037	NC_005863	GTC	2	6	93101	93106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2038	NC_005863	GTC	2	6	93135	93140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2039	NC_005863	CG	3	6	93142	93147	0 %	0 %	50 %	50 %	46562182
2040	NC_005863	TC	3	6	93164	93169	0 %	50 %	0 %	50 %	46562182
2041	NC_005863	CG	3	6	93183	93188	0 %	0 %	50 %	50 %	46562182
2042	NC_005863	GGA	2	6	93200	93205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562182
2043	NC_005863	TGAG	2	8	93206	93213	25 %	25 %	50 %	0 %	46562182
2044	NC_005863	GCG	2	6	93283	93288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562182
2045	NC_005863	CTC	2	6	93342	93347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562182
2046	NC_005863	AGA	2	6	93398	93403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562182
2047	NC_005863	GCG	2	6	93424	93429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562182
2048	NC_005863	CCG	2	6	93452	93457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2049	NC_005863	AGGC	2	8	93487	93494	25 %	0 %	50 %	25 %	46562182
2050	NC_005863	CGC	2	6	93498	93503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2051	NC_005863	GGT	2	6	93552	93557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562182
2052	NC_005863	C	6	6	93567	93572	0 %	0 %	0 %	100 %	46562182
2053	NC_005863	TGA	2	6	93583	93588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562182
2054	NC_005863	CCA	2	6	93693	93698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562182
2055	NC_005863	CGC	2	6	93704	93709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562182
2056	NC_005863	GGCG	2	8	93726	93733	0 %	0 %	75 %	25 %	46562182
2057	NC_005863	GGCGT	2	10	93738	93747	0 %	20 %	60 %	20 %	46562182
2058	NC_005863	GTC	2	6	93753	93758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2059	NC_005863	CGA	2	6	93792	93797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2060	NC_005863	TGG	2	6	93893	93898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562182
2061	NC_005863	CGA	2	6	93917	93922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562182
2062	NC_005863	TGA	3	9	93941	93949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562182
2063	NC_005863	CCAT	2	8	94168	94175	25 %	25 %	0 %	50 %	46562181
2064	NC_005863	GAA	2	6	94280	94285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562181
2065	NC_005863	GCCT	2	8	94319	94326	0 %	25 %	25 %	50 %	46562181
2066	NC_005863	GCAG	2	8	94363	94370	25 %	0 %	50 %	25 %	46562181
2067	NC_005863	GCC	2	6	94392	94397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562181
2068	NC_005863	TGA	2	6	94453	94458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562181
2069	NC_005863	GAGG	2	8	94538	94545	25 %	0 %	75 %	0 %	46562181
2070	NC_005863	GCA	2	6	94553	94558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562181
2071	NC_005863	GGC	2	6	94559	94564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562181
2072	NC_005863	CAC	3	9	94607	94615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562181
2073	NC_005863	ATC	2	6	94695	94700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562181
2074	NC_005863	CGA	2	6	94793	94798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562181
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2076	NC_005863	GC	3	6	94856	94861	0 %	0 %	50 %	50 %	46562181
2077	NC_005863	TCG	2	6	94893	94898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562181
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2083	NC_005863	AGC	2	6	95148	95153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562181
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2089	NC_005863	GTG	2	6	95469	95474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562181
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2091	NC_005863	GTG	2	6	95499	95504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562181
2092	NC_005863	TCG	2	6	95532	95537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562181
2093	NC_005863	GTT	2	6	95552	95557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562181
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2095	NC_005863	TTC	2	6	95567	95572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562181
2096	NC_005863	GCGAA	2	10	95631	95640	40 %	0 %	40 %	20 %	46562181
2097	NC_005863	TCC	2	6	95673	95678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562181
2098	NC_005863	GCCC	3	12	95686	95697	0 %	0 %	25 %	75 %	46562181
2099	NC_005863	AGA	2	6	95737	95742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562181
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2101	NC_005863	GCAG	2	8	95787	95794	25 %	0 %	50 %	25 %	46562181
2102	NC_005863	GTC	2	6	95933	95938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562181
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2106	NC_005863	CGA	2	6	96091	96096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562181
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2108	NC_005863	TTG	2	6	96165	96170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562181
2109	NC_005863	CAT	2	6	96398	96403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562180
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2111	NC_005863	TC	3	6	96463	96468	0 %	50 %	0 %	50 %	46562180
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2113	NC_005863	ATG	2	6	96506	96511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562180
2114	NC_005863	AT	4	8	96520	96527	50 %	50 %	0 %	0 %	46562180
2115	NC_005863	T	6	6	96548	96553	0 %	100 %	0 %	0 %	46562180
2116	NC_005863	GA	3	6	96595	96600	50 %	0 %	50 %	0 %	46562180
2117	NC_005863	AGC	2	6	96617	96622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562180
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2123	NC_005863	CG	3	6	97062	97067	0 %	0 %	50 %	50 %	46562180
2124	NC_005863	GTCGT	2	10	97079	97088	0 %	40 %	40 %	20 %	46562180
2125	NC_005863	CTT	2	6	97111	97116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562180
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2127	NC_005863	GCCA	2	8	97151	97158	25 %	0 %	25 %	50 %	46562180
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2251	NC_005863	GGC	2	6	103469	103474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562176
2252	NC_005863	CGA	2	6	103548	103553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562176
2253	NC_005863	CGT	2	6	103577	103582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562176
2254	NC_005863	CTG	2	6	103644	103649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562176
2255	NC_005863	CGA	2	6	103682	103687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562176
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2263	NC_005863	GCA	3	9	104099	104107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562176
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2272	NC_005863	GGA	2	6	104691	104696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562266
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2281	NC_005863	TG	3	6	105024	105029	0 %	50 %	50 %	0 %	46562266
2282	NC_005863	TG	3	6	105067	105072	0 %	50 %	50 %	0 %	46562266
2283	NC_005863	AT	3	6	105099	105104	50 %	50 %	0 %	0 %	46562266
2284	NC_005863	CTAG	2	8	105114	105121	25 %	25 %	25 %	25 %	46562266
2285	NC_005863	GCTT	2	8	105223	105230	0 %	50 %	25 %	25 %	46562265
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2370	NC_005863	TCCG	2	8	109857	109864	0 %	25 %	25 %	50 %	46562173
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2372	NC_005863	CGG	2	6	109934	109939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562173
2373	NC_005863	CAG	2	6	110017	110022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562173
2374	NC_005863	CGG	2	6	110025	110030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562173
2375	NC_005863	ACGT	2	8	110101	110108	25 %	25 %	25 %	25 %	46562173
2376	NC_005863	CGG	2	6	110145	110150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562173
2377	NC_005863	GGT	2	6	110187	110192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562173
2378	NC_005863	CG	3	6	110193	110198	0 %	0 %	50 %	50 %	46562173
2379	NC_005863	CTT	2	6	110238	110243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562173
2380	NC_005863	GCA	2	6	110319	110324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562173
2381	NC_005863	GAA	2	6	110347	110352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562173
2382	NC_005863	TGG	2	6	110373	110378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562173
2383	NC_005863	GGC	2	6	110398	110403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562173
2384	NC_005863	GAA	2	6	110476	110481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562173
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2387	NC_005863	CGG	2	6	110634	110639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562173
2388	NC_005863	CCGA	2	8	110833	110840	25 %	0 %	25 %	50 %	46562172
2389	NC_005863	CG	3	6	110867	110872	0 %	0 %	50 %	50 %	46562172
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2392	NC_005863	CACT	2	8	111359	111366	25 %	25 %	0 %	50 %	46562170
2393	NC_005863	ACC	2	6	111458	111463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562170
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2399	NC_005863	GTC	2	6	111716	111721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562170
2400	NC_005863	CGT	2	6	111733	111738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562170
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2404	NC_005863	AAG	2	6	111989	111994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562170
2405	NC_005863	GCC	2	6	112079	112084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562170
2406	NC_005863	GCCA	2	8	112127	112134	25 %	0 %	25 %	50 %	46562170
2407	NC_005863	TCA	2	6	112147	112152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562170
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2409	NC_005863	TCC	2	6	112195	112200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562170
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2412	NC_005863	TCA	2	6	112338	112343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562170
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2417	NC_005863	GCAG	2	8	112567	112574	25 %	0 %	50 %	25 %	46562170
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2443	NC_005863	TGG	3	9	114129	114137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562170
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2478	NC_005863	GCC	2	6	115636	115641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562169
2479	NC_005863	TCC	2	6	115647	115652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562169
2480	NC_005863	TTC	2	6	115655	115660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562169
2481	NC_005863	GCA	2	6	115714	115719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562169
2482	NC_005863	GC	3	6	115721	115726	0 %	0 %	50 %	50 %	46562169
2483	NC_005863	CGAA	2	8	115765	115772	50 %	0 %	25 %	25 %	46562169
2484	NC_005863	TGA	2	6	115786	115791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562169
2485	NC_005863	GGC	2	6	115814	115819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562169
2486	NC_005863	GACGCC	2	12	115835	115846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46562169
2487	NC_005863	GAT	2	6	115856	115861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562169
2488	NC_005863	CCT	2	6	115876	115881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562169
2489	NC_005863	GCGTG	2	10	115882	115891	0 %	20 %	60 %	20 %	46562169
2490	NC_005863	ACG	2	6	115900	115905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562169
2491	NC_005863	CGA	2	6	115933	115938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562169
2492	NC_005863	GCA	2	6	115969	115974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562169
2493	NC_005863	TCGAGG	2	12	116013	116024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46562169
2494	NC_005863	GCG	2	6	116037	116042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562169
2495	NC_005863	CGC	2	6	116049	116054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562169
2496	NC_005863	TCG	3	9	116064	116072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562169
2497	NC_005863	ATG	2	6	116073	116078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562169
2498	NC_005863	TGC	2	6	116492	116497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562168
2499	NC_005863	CGGG	2	8	116537	116544	0 %	0 %	75 %	25 %	46562168
2500	NC_005863	GCC	2	6	116562	116567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562168

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