MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005863	GCT	2	6	49615	49620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562206
1002	NC_005863	GAG	2	6	49682	49687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562206
1003	NC_005863	CG	3	6	49709	49714	0 %	0 %	50 %	50 %	46562206
1004	NC_005863	GAG	2	6	49739	49744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562206
1005	NC_005863	TGC	2	6	49815	49820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562206
1006	NC_005863	CGG	2	6	49833	49838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562206
1007	NC_005863	GCA	2	6	49845	49850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562206
1008	NC_005863	ACC	2	6	49896	49901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562206
1009	NC_005863	CGA	2	6	49942	49947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562206
1010	NC_005863	CGCC	2	8	49953	49960	0 %	0 %	25 %	75 %	46562206
1011	NC_005863	TGACGG	2	12	49980	49991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46562206
1012	NC_005863	CGG	2	6	50019	50024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562206
1013	NC_005863	CCCCCG	2	12	50049	50060	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	46562206
1014	NC_005863	GACGCA	2	12	50104	50115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562206
1015	NC_005863	GCT	2	6	50143	50148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562206
1016	NC_005863	CAGGTG	2	12	50309	50320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46562206
1017	NC_005863	GGC	2	6	50350	50355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562206
1018	NC_005863	GGC	2	6	50405	50410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562206
1019	NC_005863	ACGGC	2	10	50593	50602	20 %	0 %	40 %	40 %	46562205
1020	NC_005863	ATG	2	6	50623	50628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562205
1021	NC_005863	TCT	2	6	50658	50663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562205
1022	NC_005863	GCG	2	6	50671	50676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562205
1023	NC_005863	CGT	2	6	50708	50713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1024	NC_005863	GGC	2	6	50722	50727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562205
1025	NC_005863	ACAACG	2	12	50732	50743	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46562205
1026	NC_005863	CGC	2	6	50752	50757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562205
1027	NC_005863	CGA	2	6	50766	50771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1028	NC_005863	CGA	2	6	50883	50888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1029	NC_005863	TTC	2	6	50941	50946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562205
1030	NC_005863	CG	3	6	50990	50995	0 %	0 %	50 %	50 %	46562205
1031	NC_005863	GACC	2	8	51030	51037	25 %	0 %	25 %	50 %	46562205
1032	NC_005863	TCGGG	2	10	51071	51080	0 %	20 %	60 %	20 %	46562205
1033	NC_005863	CGA	2	6	51132	51137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1034	NC_005863	CCTT	2	8	51164	51171	0 %	50 %	0 %	50 %	46562205
1035	NC_005863	AGC	2	6	51181	51186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1036	NC_005863	AGC	3	9	51215	51223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1037	NC_005863	GCT	2	6	51270	51275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1038	NC_005863	AGC	2	6	51311	51316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1039	NC_005863	TGCGG	2	10	51386	51395	0 %	20 %	60 %	20 %	46562205
1040	NC_005863	CGA	2	6	51414	51419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1041	NC_005863	CTA	2	6	51441	51446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562205
1042	NC_005863	GGCA	2	8	51472	51479	25 %	0 %	50 %	25 %	46562205
1043	NC_005863	AGCG	2	8	51496	51503	25 %	0 %	50 %	25 %	46562205
1044	NC_005863	CTTCGA	2	12	51570	51581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46562205
1045	NC_005863	ACC	2	6	51595	51600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562205
1046	NC_005863	GGC	3	9	51637	51645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562205
1047	NC_005863	ACT	2	6	51671	51676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562205
1048	NC_005863	CCG	2	6	51719	51724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562205
1049	NC_005863	GTC	2	6	51804	51809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1050	NC_005863	GAC	2	6	51911	51916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562205
1051	NC_005863	ACT	2	6	51996	52001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562204
1052	NC_005863	CG	3	6	52061	52066	0 %	0 %	50 %	50 %	46562204
1053	NC_005863	ACCA	2	8	52076	52083	50 %	0 %	0 %	50 %	46562204
1054	NC_005863	TGCG	2	8	52113	52120	0 %	25 %	50 %	25 %	46562204
1055	NC_005863	CTT	2	6	52123	52128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562204
1056	NC_005863	GCTGG	2	10	52132	52141	0 %	20 %	60 %	20 %	46562204
1057	NC_005863	GCG	2	6	52168	52173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562204
1058	NC_005863	CAC	2	6	52228	52233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562204
1059	NC_005863	CGA	2	6	52255	52260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562204
1060	NC_005863	CGG	2	6	52274	52279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562204
1061	NC_005863	CG	3	6	52319	52324	0 %	0 %	50 %	50 %	46562204
1062	NC_005863	GAG	2	6	52376	52381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562204
1063	NC_005863	CAGC	2	8	52441	52448	25 %	0 %	25 %	50 %	46562204
1064	NC_005863	GCG	2	6	52476	52481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562204
1065	NC_005863	GAG	2	6	52487	52492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562204
1066	NC_005863	CAC	2	6	52501	52506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562204
1067	NC_005863	CGC	2	6	52529	52534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562204
1068	NC_005863	GGCG	2	8	52549	52556	0 %	0 %	75 %	25 %	46562204
1069	NC_005863	GCG	2	6	52593	52598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562204
1070	NC_005863	GGC	2	6	52605	52610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562204
1071	NC_005863	CAC	2	6	52771	52776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562204
1072	NC_005863	GGC	2	6	52880	52885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562275
1073	NC_005863	CGG	2	6	52979	52984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562275
1074	NC_005863	TGC	2	6	52999	53004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1075	NC_005863	GCC	2	6	53023	53028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562275
1076	NC_005863	TCTCG	2	10	53042	53051	0 %	40 %	20 %	40 %	46562275
1077	NC_005863	CGG	2	6	53069	53074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562275
1078	NC_005863	GCT	2	6	53075	53080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1079	NC_005863	CCG	2	6	53089	53094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562275
1080	NC_005863	GGC	2	6	53096	53101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562275
1081	NC_005863	CGA	2	6	53114	53119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1082	NC_005863	CTG	2	6	53130	53135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1083	NC_005863	GCA	2	6	53152	53157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1084	NC_005863	GCC	2	6	53177	53182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562275
1085	NC_005863	CTC	2	6	53223	53228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562275
1086	NC_005863	GAC	2	6	53238	53243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1087	NC_005863	GCG	2	6	53329	53334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562275
1088	NC_005863	GCT	2	6	53339	53344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1089	NC_005863	ACG	2	6	53356	53361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1090	NC_005863	CTT	2	6	53411	53416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562275
1091	NC_005863	CAT	2	6	53423	53428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562275
1092	NC_005863	TCG	2	6	53455	53460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1093	NC_005863	GTG	2	6	53481	53486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562275
1094	NC_005863	TCG	2	6	53538	53543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1095	NC_005863	CACC	2	8	53549	53556	25 %	0 %	0 %	75 %	46562275
1096	NC_005863	CAA	2	6	53570	53575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562275
1097	NC_005863	TCG	2	6	53643	53648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1098	NC_005863	CG	3	6	53647	53652	0 %	0 %	50 %	50 %	46562275
1099	NC_005863	GC	4	8	53686	53693	0 %	0 %	50 %	50 %	46562275
1100	NC_005863	CTG	2	6	53718	53723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562275
1101	NC_005863	GGC	2	6	53791	53796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562275
1102	NC_005863	GCC	2	6	53871	53876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562203
1103	NC_005863	GCCC	2	8	53889	53896	0 %	0 %	25 %	75 %	46562203
1104	NC_005863	GCC	2	6	53908	53913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562203
1105	NC_005863	CGG	2	6	53914	53919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1106	NC_005863	GGC	2	6	53947	53952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1107	NC_005863	GCGT	2	8	53983	53990	0 %	25 %	50 %	25 %	46562203
1108	NC_005863	TGC	2	6	53998	54003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562203
1109	NC_005863	CGCTG	2	10	54022	54031	0 %	20 %	40 %	40 %	46562203
1110	NC_005863	CGGG	2	8	54094	54101	0 %	0 %	75 %	25 %	46562203
1111	NC_005863	GTG	2	6	54155	54160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562203
1112	NC_005863	CTG	2	6	54161	54166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562203
1113	NC_005863	GCC	3	9	54194	54202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562203
1114	NC_005863	GCT	2	6	54214	54219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562203
1115	NC_005863	C	6	6	54255	54260	0 %	0 %	0 %	100 %	46562203
1116	NC_005863	GGA	2	6	54265	54270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562203
1117	NC_005863	GAC	2	6	54287	54292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562203
1118	NC_005863	GGT	2	6	54304	54309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562203
1119	NC_005863	CGGGGC	2	12	54367	54378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1120	NC_005863	TGG	2	6	54384	54389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562203
1121	NC_005863	GCG	2	6	54395	54400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1122	NC_005863	CAC	2	6	54439	54444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562203
1123	NC_005863	GTT	2	6	54457	54462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562203
1124	NC_005863	CGG	2	6	54489	54494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1125	NC_005863	CGG	2	6	54499	54504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1126	NC_005863	GAC	3	9	54518	54526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562203
1127	NC_005863	GGC	2	6	54532	54537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1128	NC_005863	GCG	2	6	54563	54568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1129	NC_005863	GCG	2	6	54590	54595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562203
1130	NC_005863	GAC	2	6	54607	54612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562203
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1147	NC_005863	GGA	2	6	55364	55369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562203
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1152	NC_005863	GCT	2	6	55524	55529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562202
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1154	NC_005863	GCG	2	6	55564	55569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562202
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1158	NC_005863	GCCC	2	8	55615	55622	0 %	0 %	25 %	75 %	46562202
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1161	NC_005863	TGC	2	6	55760	55765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562202
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1165	NC_005863	CGG	2	6	55944	55949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562202
1166	NC_005863	CCGCG	2	10	55968	55977	0 %	0 %	40 %	60 %	46562202
1167	NC_005863	ACGCCA	2	12	56012	56023	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	46562202
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1169	NC_005863	GCG	2	6	56117	56122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562202
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1232	NC_005863	CTG	3	9	58546	58554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562200
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1236	NC_005863	TGC	2	6	58688	58693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562200
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1239	NC_005863	ATG	2	6	58732	58737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562200
1240	NC_005863	TGG	2	6	58739	58744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562200
1241	NC_005863	ACG	2	6	58781	58786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562200
1242	NC_005863	GTG	2	6	58858	58863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562200
1243	NC_005863	CGC	2	6	58869	58874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562200
1244	NC_005863	G	6	6	58877	58882	0 %	0 %	100 %	0 %	46562200
1245	NC_005863	CCG	2	6	58883	58888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562200
1246	NC_005863	CCATGA	2	12	58904	58915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46562200
1247	NC_005863	CG	3	6	58922	58927	0 %	0 %	50 %	50 %	46562200
1248	NC_005863	GCT	2	6	58992	58997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562200
1249	NC_005863	TGC	2	6	59006	59011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562200
1250	NC_005863	GGCG	2	8	59013	59020	0 %	0 %	75 %	25 %	46562200
1251	NC_005863	TCT	2	6	59024	59029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562200
1252	NC_005863	ATG	2	6	59146	59151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562200
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1380	NC_005863	GTG	2	6	64495	64500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562268
1381	NC_005863	GCAC	2	8	64511	64518	25 %	0 %	25 %	50 %	46562268
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1479	NC_005863	CTGC	2	8	68202	68209	0 %	25 %	25 %	50 %	46562196
1480	NC_005863	CGA	2	6	68304	68309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562196
1481	NC_005863	TAC	3	9	68320	68328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562196
1482	NC_005863	TCAGG	2	10	68334	68343	20 %	20 %	40 %	20 %	46562196
1483	NC_005863	GGCG	2	8	68355	68362	0 %	0 %	75 %	25 %	46562196
1484	NC_005863	TGCA	2	8	68402	68409	25 %	25 %	25 %	25 %	46562196
1485	NC_005863	CGC	2	6	68418	68423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562196
1486	NC_005863	TCA	2	6	68426	68431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562196
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1488	NC_005863	GGGCG	2	10	68532	68541	0 %	0 %	80 %	20 %	46562196
1489	NC_005863	CGG	2	6	68823	68828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562195
1490	NC_005863	GCC	2	6	68851	68856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562195
1491	NC_005863	GCG	2	6	68894	68899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562195
1492	NC_005863	CCG	2	6	69009	69014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562195
1493	NC_005863	ATC	2	6	69035	69040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562195
1494	NC_005863	CTT	2	6	69049	69054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562195
1495	NC_005863	G	6	6	69070	69075	0 %	0 %	100 %	0 %	46562195
1496	NC_005863	GTG	2	6	69117	69122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562195
1497	NC_005863	G	8	8	69158	69165	0 %	0 %	100 %	0 %	46562195
1498	NC_005863	CGA	2	6	69172	69177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562195
1499	NC_005863	GTCC	2	8	69204	69211	0 %	25 %	25 %	50 %	46562195
1500	NC_005863	GCGG	2	8	69214	69221	0 %	0 %	75 %	25 %	46562195

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