MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005863	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
502	NC_005863	GT	3	6	26280	26285	0 %	50 %	50 %	0 %	304570524
503	NC_005863	GGTGC	2	10	26348	26357	0 %	20 %	60 %	20 %	304570524
504	NC_005863	TGGCG	2	10	26437	26446	0 %	20 %	60 %	20 %	304570524
505	NC_005863	AG	3	6	26489	26494	50 %	0 %	50 %	0 %	304570524
506	NC_005863	G	7	7	26570	26576	0 %	0 %	100 %	0 %	304570524
507	NC_005863	G	6	6	26641	26646	0 %	0 %	100 %	0 %	46562226
508	NC_005863	CAC	2	6	26794	26799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562226
509	NC_005863	GC	3	6	26843	26848	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
510	NC_005863	TGA	2	6	26937	26942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562226
511	NC_005863	GCA	2	6	26994	26999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562226
512	NC_005863	GC	3	6	27017	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
513	NC_005863	GCGCG	2	10	27039	27048	0 %	0 %	60 %	40 %	46562226
514	NC_005863	CCG	2	6	27060	27065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562226
515	NC_005863	CGG	3	9	27069	27077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562226
516	NC_005863	TCC	2	6	27122	27127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562226
517	NC_005863	TGC	2	6	27140	27145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562226
518	NC_005863	GGC	2	6	27148	27153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562226
519	NC_005863	CG	3	6	27207	27212	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
520	NC_005863	CTG	2	6	27223	27228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562226
521	NC_005863	CTGC	2	8	27238	27245	0 %	25 %	25 %	50 %	46562226
522	NC_005863	TCG	2	6	27254	27259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562226
523	NC_005863	GCGG	2	8	27358	27365	0 %	0 %	75 %	25 %	46562226
524	NC_005863	CGC	2	6	27483	27488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562226
525	NC_005863	CGA	2	6	27528	27533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562226
526	NC_005863	TCCTC	2	10	27561	27570	0 %	40 %	0 %	60 %	46562226
527	NC_005863	CGC	2	6	27577	27582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562226
528	NC_005863	G	6	6	27612	27617	0 %	0 %	100 %	0 %	46562226
529	NC_005863	ACGCC	2	10	27648	27657	20 %	0 %	20 %	60 %	46562226
530	NC_005863	ATG	2	6	27659	27664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562226
531	NC_005863	ATG	2	6	27692	27697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562226
532	NC_005863	TTC	2	6	27719	27724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562225
533	NC_005863	CAC	2	6	27738	27743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562225
534	NC_005863	ATG	2	6	27760	27765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562225
535	NC_005863	GTC	2	6	27768	27773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562225
536	NC_005863	ACC	4	12	27781	27792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562225
537	NC_005863	GCCC	3	12	27793	27804	0 %	0 %	25 %	75 %	46562225
538	NC_005863	ATC	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562225
539	NC_005863	TGG	2	6	27848	27853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562225
540	NC_005863	GCC	2	6	27862	27867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562225
541	NC_005863	TCG	2	6	27874	27879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562225
542	NC_005863	GC	4	8	27910	27917	0 %	0 %	50 %	50 %	46562225
543	NC_005863	GCT	2	6	27929	27934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562225
544	NC_005863	CGC	2	6	27941	27946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562225
545	NC_005863	GCC	2	6	27975	27980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562225
546	NC_005863	CGC	2	6	28037	28042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562225
547	NC_005863	GCC	2	6	28215	28220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562225
548	NC_005863	ATG	2	6	28222	28227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562225
549	NC_005863	CAG	2	6	28230	28235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562225
550	NC_005863	GGT	2	6	28236	28241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562225
551	NC_005863	GCA	2	6	28265	28270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562225
552	NC_005863	GA	3	6	28294	28299	50 %	0 %	50 %	0 %	46562225
553	NC_005863	TC	3	6	28328	28333	0 %	50 %	0 %	50 %	46562225
554	NC_005863	AGG	2	6	28369	28374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562225
555	NC_005863	CGC	2	6	28550	28555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562224
556	NC_005863	CGC	2	6	28589	28594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562224
557	NC_005863	TGA	2	6	28693	28698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562224
558	NC_005863	ATG	3	9	28710	28718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562224
559	NC_005863	GC	3	6	28738	28743	0 %	0 %	50 %	50 %	46562224
560	NC_005863	GGT	2	6	28774	28779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562224
561	NC_005863	TGG	3	9	28783	28791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562224
562	NC_005863	CAC	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562224
563	NC_005863	GCC	2	6	28842	28847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562224
564	NC_005863	CCGC	2	8	28860	28867	0 %	0 %	25 %	75 %	46562224
565	NC_005863	TCT	2	6	28897	28902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562224
566	NC_005863	GGT	2	6	28916	28921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562224
567	NC_005863	GCG	2	6	28947	28952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562224
568	NC_005863	GC	3	6	28959	28964	0 %	0 %	50 %	50 %	46562224
569	NC_005863	TCC	2	6	28968	28973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562224
570	NC_005863	GGC	2	6	28988	28993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562224
571	NC_005863	GGT	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562224
572	NC_005863	CGA	2	6	29131	29136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562224
573	NC_005863	GC	3	6	29157	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	46562224
574	NC_005863	CGT	2	6	29203	29208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562224
575	NC_005863	GCC	2	6	29252	29257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562224
576	NC_005863	CGA	2	6	29281	29286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562224
577	NC_005863	CCG	2	6	29304	29309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562224
578	NC_005863	CTT	2	6	29315	29320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562224
579	NC_005863	CCA	3	9	29335	29343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562224
580	NC_005863	GCG	2	6	29349	29354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562224
581	NC_005863	CTG	2	6	29381	29386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562224
582	NC_005863	GGGCAT	2	12	29399	29410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46562224
583	NC_005863	CTG	2	6	29460	29465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562224
584	NC_005863	TGG	2	6	29485	29490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562224
585	NC_005863	TGA	2	6	29491	29496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562224
586	NC_005863	CAC	2	6	29531	29536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562224
587	NC_005863	GCA	2	6	29712	29717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562223
588	NC_005863	GCCT	2	8	29759	29766	0 %	25 %	25 %	50 %	46562223
589	NC_005863	C	6	6	29774	29779	0 %	0 %	0 %	100 %	46562223
590	NC_005863	CGCGC	2	10	29832	29841	0 %	0 %	40 %	60 %	46562223
591	NC_005863	AGGGC	2	10	29853	29862	20 %	0 %	60 %	20 %	46562223
592	NC_005863	C	7	7	29874	29880	0 %	0 %	0 %	100 %	46562223
593	NC_005863	CGTG	2	8	29883	29890	0 %	25 %	50 %	25 %	46562223
594	NC_005863	CCG	2	6	29910	29915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
595	NC_005863	TGC	2	6	29974	29979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562223
596	NC_005863	GCCC	2	8	30007	30014	0 %	0 %	25 %	75 %	46562223
597	NC_005863	GTCG	2	8	30040	30047	0 %	25 %	50 %	25 %	46562223
598	NC_005863	GC	3	6	30052	30057	0 %	0 %	50 %	50 %	46562223
599	NC_005863	GCT	2	6	30082	30087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562223
600	NC_005863	TGG	2	6	30111	30116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562223
601	NC_005863	TCGCCA	2	12	30143	30154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46562223
602	NC_005863	CACG	2	8	30192	30199	25 %	0 %	25 %	50 %	46562223
603	NC_005863	CCG	2	6	30240	30245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
604	NC_005863	GCC	2	6	30262	30267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
605	NC_005863	GAT	2	6	30310	30315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562223
606	NC_005863	CGG	2	6	30337	30342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562223
607	NC_005863	CAG	2	6	30343	30348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562223
608	NC_005863	CAG	2	6	30373	30378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562223
609	NC_005863	GTC	2	6	30379	30384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562223
610	NC_005863	TTG	2	6	30422	30427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562223
611	NC_005863	GCC	2	6	30431	30436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
612	NC_005863	GCC	2	6	30466	30471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
613	NC_005863	CTT	2	6	30514	30519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562223
614	NC_005863	GCC	2	6	30565	30570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
615	NC_005863	GCCT	2	8	30575	30582	0 %	25 %	25 %	50 %	46562223
616	NC_005863	GCC	2	6	30605	30610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
617	NC_005863	TGA	2	6	30687	30692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562223
618	NC_005863	GCC	2	6	30697	30702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562223
619	NC_005863	TGCCCG	2	12	30747	30758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46562223
620	NC_005863	GCA	3	9	30768	30776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562223
621	NC_005863	CGG	2	6	30831	30836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562222
622	NC_005863	GCC	2	6	30885	30890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562222
623	NC_005863	AGG	2	6	30893	30898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562222
624	NC_005863	AGC	2	6	30910	30915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562222
625	NC_005863	GC	3	6	30925	30930	0 %	0 %	50 %	50 %	46562222
626	NC_005863	CAG	2	6	30969	30974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562222
627	NC_005863	GCC	2	6	30976	30981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562222
628	NC_005863	ACG	2	6	31012	31017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562222
629	NC_005863	ACC	2	6	31018	31023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562222
630	NC_005863	GCC	2	6	31030	31035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562222
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635	NC_005863	GAC	2	6	31149	31154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562222
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753	NC_005863	GCG	2	6	38102	38107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562213
754	NC_005863	TGCAG	2	10	38108	38117	20 %	20 %	40 %	20 %	46562213
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