MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001264	CTCGA	2	10	1304	1313	20 %	20 %	20 %	40 %	15807673
2	NC_001264	GCGTA	2	10	1407	1416	20 %	20 %	40 %	20 %	15807673
3	NC_001264	TGCCC	2	10	1521	1530	0 %	20 %	20 %	60 %	15807674
4	NC_001264	GACCG	2	10	2877	2886	20 %	0 %	40 %	40 %	15807675
5	NC_001264	GCGCG	2	10	3795	3804	0 %	0 %	60 %	40 %	15807675
6	NC_001264	ATGCG	2	10	6184	6193	20 %	20 %	40 %	20 %	15807678
7	NC_001264	GCCGC	2	10	7320	7329	0 %	0 %	40 %	60 %	15807679
8	NC_001264	CGAAA	2	10	11932	11941	60 %	0 %	20 %	20 %	15807683
9	NC_001264	CGTCA	2	10	13205	13214	20 %	20 %	20 %	40 %	161579495
10	NC_001264	TCGCC	2	10	13928	13937	0 %	20 %	20 %	60 %	15807685
11	NC_001264	CGGCC	2	10	14319	14328	0 %	0 %	40 %	60 %	15807685
12	NC_001264	GCGCA	2	10	14926	14935	20 %	0 %	40 %	40 %	15807685
13	NC_001264	GGGCT	2	10	15327	15336	0 %	20 %	60 %	20 %	15807686
14	NC_001264	GGCCG	2	10	17027	17036	0 %	0 %	60 %	40 %	15807688
15	NC_001264	GTTCG	2	10	20179	20188	0 %	40 %	40 %	20 %	15807690
16	NC_001264	GCGCC	2	10	21221	21230	0 %	0 %	40 %	60 %	15807691
17	NC_001264	CCGCC	2	10	21320	21329	0 %	0 %	20 %	80 %	15807691
18	NC_001264	CGCAG	2	10	25318	25327	20 %	0 %	40 %	40 %	15807694
19	NC_001264	CCGGC	2	10	26814	26823	0 %	0 %	40 %	60 %	15808029
20	NC_001264	TTGGC	2	10	27968	27977	0 %	40 %	40 %	20 %	15807696
21	NC_001264	CGTGA	2	10	28079	28088	20 %	20 %	40 %	20 %	15807696
22	NC_001264	CTTCC	2	10	31762	31771	0 %	40 %	0 %	60 %	15807700
23	NC_001264	GGCGA	2	10	32941	32950	20 %	0 %	60 %	20 %	15807700
24	NC_001264	CGCGG	2	10	35072	35081	0 %	0 %	60 %	40 %	15807702
25	NC_001264	GGGCC	2	10	36454	36463	0 %	0 %	60 %	40 %	15807703
26	NC_001264	GACCG	2	10	36770	36779	20 %	0 %	40 %	40 %	15807703
27	NC_001264	TTGAT	2	10	38437	38446	20 %	60 %	20 %	0 %	15807704
28	NC_001264	TGGGG	2	10	39155	39164	0 %	20 %	80 %	0 %	15807705
29	NC_001264	TCTAT	2	10	39493	39502	20 %	60 %	0 %	20 %	15807705
30	NC_001264	TTTAT	2	10	39629	39638	20 %	80 %	0 %	0 %	15807705
31	NC_001264	ATACA	2	10	41371	41380	60 %	20 %	0 %	20 %	15807706
32	NC_001264	AGAAT	2	10	43881	43890	60 %	20 %	20 %	0 %	15807709
33	NC_001264	AGGAC	2	10	44087	44096	40 %	0 %	40 %	20 %	15807709
34	NC_001264	TACTC	2	10	44643	44652	20 %	40 %	0 %	40 %	15807710
35	NC_001264	CATCA	2	10	46048	46057	40 %	20 %	0 %	40 %	15807711
36	NC_001264	CGGGC	2	10	47206	47215	0 %	0 %	60 %	40 %	15807712
37	NC_001264	GTGGC	2	10	48026	48035	0 %	20 %	60 %	20 %	15807713
38	NC_001264	CGCGC	2	10	48585	48594	0 %	0 %	40 %	60 %	15807714
39	NC_001264	CTGGT	2	10	50277	50286	0 %	40 %	40 %	20 %	15807716
40	NC_001264	GCAGC	2	10	52732	52741	20 %	0 %	40 %	40 %	15807718
41	NC_001264	GCCCC	2	10	54815	54824	0 %	0 %	20 %	80 %	15807720
42	NC_001264	CGCTG	2	10	54907	54916	0 %	20 %	40 %	40 %	15807720
43	NC_001264	CGGCG	2	10	57822	57831	0 %	0 %	60 %	40 %	15807721
44	NC_001264	CGGCC	2	10	59039	59048	0 %	0 %	40 %	60 %	15807722
45	NC_001264	GGACT	2	10	59766	59775	20 %	20 %	40 %	20 %	15807723
46	NC_001264	TGCGC	2	10	60303	60312	0 %	20 %	40 %	40 %	15807723
47	NC_001264	AGGGC	2	10	61096	61105	20 %	0 %	60 %	20 %	15807724
48	NC_001264	GAAGT	2	10	61539	61548	40 %	20 %	40 %	0 %	15807725
49	NC_001264	GCAGG	2	10	63968	63977	20 %	0 %	60 %	20 %	15807727
50	NC_001264	TTCGT	2	10	65355	65364	0 %	60 %	20 %	20 %	15807728
51	NC_001264	GACCA	2	10	65736	65745	40 %	0 %	20 %	40 %	15807729
52	NC_001264	CGGCG	2	10	66020	66029	0 %	0 %	60 %	40 %	15807729
53	NC_001264	ACGGC	2	10	66349	66358	20 %	0 %	40 %	40 %	15807729
54	NC_001264	CCGAC	2	10	66475	66484	20 %	0 %	20 %	60 %	15807729
55	NC_001264	GGGCG	2	10	67040	67049	0 %	0 %	80 %	20 %	15807729
56	NC_001264	GGGTG	2	10	68324	68333	0 %	20 %	80 %	0 %	15807731
57	NC_001264	GCGGG	2	10	68342	68351	0 %	0 %	80 %	20 %	15807731
58	NC_001264	AGGCG	2	10	69752	69761	20 %	0 %	60 %	20 %	15807732
59	NC_001264	GCCGC	2	10	69866	69875	0 %	0 %	40 %	60 %	15807732
60	NC_001264	GTGCC	2	10	70036	70045	0 %	20 %	40 %	40 %	15807732
61	NC_001264	GTGCC	2	10	70108	70117	0 %	20 %	40 %	40 %	15807732
62	NC_001264	CGCCC	2	10	72898	72907	0 %	0 %	20 %	80 %	15807735
63	NC_001264	GCGCG	2	10	73245	73254	0 %	0 %	60 %	40 %	15807735
64	NC_001264	CGGCT	2	10	74324	74333	0 %	20 %	40 %	40 %	15807737
65	NC_001264	GCGCC	2	10	74434	74443	0 %	0 %	40 %	60 %	15807737
66	NC_001264	GGGCA	2	10	75236	75245	20 %	0 %	60 %	20 %	15807737
67	NC_001264	GTCCG	2	10	76407	76416	0 %	20 %	40 %	40 %	15807739
68	NC_001264	GCGCG	2	10	78954	78963	0 %	0 %	60 %	40 %	15807741
69	NC_001264	CTGGG	2	10	80739	80748	0 %	20 %	60 %	20 %	15807743
70	NC_001264	CTGAC	2	10	83409	83418	20 %	20 %	20 %	40 %	15807744
71	NC_001264	CGTGG	2	10	83432	83441	0 %	20 %	60 %	20 %	15807744
72	NC_001264	CCCCG	2	10	87114	87123	0 %	0 %	20 %	80 %	15807754
73	NC_001264	CGGGG	2	10	87400	87409	0 %	0 %	80 %	20 %	15807754
74	NC_001264	AGCGC	2	10	90248	90257	20 %	0 %	40 %	40 %	15807761
75	NC_001264	GTGGC	2	10	90584	90593	0 %	20 %	60 %	20 %	15807762
76	NC_001264	CTGAC	2	10	90720	90729	20 %	20 %	20 %	40 %	15807762
77	NC_001264	GGACG	2	10	91264	91273	20 %	0 %	60 %	20 %	15807762
78	NC_001264	GCCCT	2	10	91383	91392	0 %	20 %	20 %	60 %	15807762
79	NC_001264	ACGCC	2	10	95659	95668	20 %	0 %	20 %	60 %	15807767
80	NC_001264	CACCG	2	10	97412	97421	20 %	0 %	20 %	60 %	15807771
81	NC_001264	AAAAG	2	10	98618	98627	80 %	0 %	20 %	0 %	15807773
82	NC_001264	GGCCG	2	10	101225	101234	0 %	0 %	60 %	40 %	15807776
83	NC_001264	GCAGA	2	10	102909	102918	40 %	0 %	40 %	20 %	15807776
84	NC_001264	GGCAG	2	10	103237	103246	20 %	0 %	60 %	20 %	15807777
85	NC_001264	GGGCG	2	10	104491	104500	0 %	0 %	80 %	20 %	15807777
86	NC_001264	CGGCC	2	10	105902	105911	0 %	0 %	40 %	60 %	15807778
87	NC_001264	CCCGA	2	10	106377	106386	20 %	0 %	20 %	60 %	15807778
88	NC_001264	ACTGG	2	10	107169	107178	20 %	20 %	40 %	20 %	15807779
89	NC_001264	ACCTG	2	10	108949	108958	20 %	20 %	20 %	40 %	15807780
90	NC_001264	CCGGC	2	10	112162	112171	0 %	0 %	40 %	60 %	15807785
91	NC_001264	CGCGC	2	10	113453	113462	0 %	0 %	40 %	60 %	15807787
92	NC_001264	CGGCG	2	10	113664	113673	0 %	0 %	60 %	40 %	15807787
93	NC_001264	TGGCC	2	10	115105	115114	0 %	20 %	40 %	40 %	15807788
94	NC_001264	GCGCG	2	10	117806	117815	0 %	0 %	60 %	40 %	15807790
95	NC_001264	GCACG	2	10	120496	120505	20 %	0 %	40 %	40 %	15807793
96	NC_001264	AGCGC	2	10	121890	121899	20 %	0 %	40 %	40 %	15807794
97	NC_001264	GCACG	2	10	122761	122770	20 %	0 %	40 %	40 %	15807795
98	NC_001264	GCGAG	2	10	124265	124274	20 %	0 %	60 %	20 %	15807796
99	NC_001264	GCCGC	2	10	125660	125669	0 %	0 %	40 %	60 %	15807796
100	NC_001264	GCGAG	2	10	125966	125975	20 %	0 %	60 %	20 %	15807796
101	NC_001264	GCGCG	2	10	129602	129611	0 %	0 %	60 %	40 %	15807800
102	NC_001264	GGCAG	2	10	129823	129832	20 %	0 %	60 %	20 %	15807800
103	NC_001264	CGCCT	2	10	130884	130893	0 %	20 %	20 %	60 %	15807800
104	NC_001264	GCCGG	2	10	131998	132007	0 %	0 %	60 %	40 %	15807801
105	NC_001264	CCGCC	2	10	132756	132765	0 %	0 %	20 %	80 %	15807802
106	NC_001264	GCGCT	2	10	133782	133791	0 %	20 %	40 %	40 %	15807803
107	NC_001264	CGGCG	2	10	136408	136417	0 %	0 %	60 %	40 %	15807805
108	NC_001264	CGCGG	2	10	137191	137200	0 %	0 %	60 %	40 %	15807805
109	NC_001264	GGGCA	2	10	139691	139700	20 %	0 %	60 %	20 %	15807808
110	NC_001264	GCGCC	2	10	139921	139930	0 %	0 %	40 %	60 %	15807809
111	NC_001264	TGGTC	2	10	140049	140058	0 %	40 %	40 %	20 %	15807809
112	NC_001264	GCGCC	2	10	140268	140277	0 %	0 %	40 %	60 %	15807809
113	NC_001264	AGGTG	2	10	142769	142778	20 %	20 %	60 %	0 %	15807812
114	NC_001264	CCATG	2	10	144297	144306	20 %	20 %	20 %	40 %	15807814
115	NC_001264	GACCT	2	10	145417	145426	20 %	20 %	20 %	40 %	15807814
116	NC_001264	GCGCC	2	10	146239	146248	0 %	0 %	40 %	60 %	15807815
117	NC_001264	GCCCG	2	10	146491	146500	0 %	0 %	40 %	60 %	15807815
118	NC_001264	GCCGC	2	10	147054	147063	0 %	0 %	40 %	60 %	15807816
119	NC_001264	GCGCC	2	10	148712	148721	0 %	0 %	40 %	60 %	15807817
120	NC_001264	GCGAG	2	10	149123	149132	20 %	0 %	60 %	20 %	15807817
121	NC_001264	GCCGG	2	10	149463	149472	0 %	0 %	60 %	40 %	15807817
122	NC_001264	GCCGC	2	10	150108	150117	0 %	0 %	40 %	60 %	15807818
123	NC_001264	TCAGC	2	10	150758	150767	20 %	20 %	20 %	40 %	15807819
124	NC_001264	CCGAG	2	10	150881	150890	20 %	0 %	40 %	40 %	15807819
125	NC_001264	CCGGG	2	10	151634	151643	0 %	0 %	60 %	40 %	15807819
126	NC_001264	CTGGT	2	10	152673	152682	0 %	40 %	40 %	20 %	15807820
127	NC_001264	GCGCC	2	10	152998	153007	0 %	0 %	40 %	60 %	15807820
128	NC_001264	CGCAG	2	10	155673	155682	20 %	0 %	40 %	40 %	15807823
129	NC_001264	GCCGC	2	10	156844	156853	0 %	0 %	40 %	60 %	15807824
130	NC_001264	CCCCA	2	10	159221	159230	20 %	0 %	0 %	80 %	15807827
131	NC_001264	CGTGA	2	10	159832	159841	20 %	20 %	40 %	20 %	15807827
132	NC_001264	GCCGC	2	10	160914	160923	0 %	0 %	40 %	60 %	15807828
133	NC_001264	GCGCA	2	10	162545	162554	20 %	0 %	40 %	40 %	15807830
134	NC_001264	TCGGC	2	10	163595	163604	0 %	20 %	40 %	40 %	15807832
135	NC_001264	GCGCC	2	10	165187	165196	0 %	0 %	40 %	60 %	15807835
136	NC_001264	GCGCG	2	10	166765	166774	0 %	0 %	60 %	40 %	15807835
137	NC_001264	CGTGG	2	10	168157	168166	0 %	20 %	60 %	20 %	15807835
138	NC_001264	CGGCG	2	10	168659	168668	0 %	0 %	60 %	40 %	15807835
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.