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Tri-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 2517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957476
2	NC_000958	ACA	2	6	612	617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957476
3	NC_000958	CAC	2	6	654	659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957476
4	NC_000958	TGG	2	6	816	821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957476
5	NC_000958	ATT	2	6	877	882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957476
6	NC_000958	TGG	2	6	941	946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957476
7	NC_000958	TCG	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957476
8	NC_000958	TGC	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957476
9	NC_000958	TGG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957476
10	NC_000958	GGC	2	6	1313	1318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957477
11	NC_000958	CTC	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957477
12	NC_000958	GCA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
13	NC_000958	CTG	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957477
14	NC_000958	TCG	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957477
15	NC_000958	GCG	2	6	1535	1540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957477
16	NC_000958	AAG	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957477
17	NC_000958	CAG	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
18	NC_000958	GCT	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957477
19	NC_000958	AGA	2	6	1766	1771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957477
20	NC_000958	TCT	2	6	1792	1797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957477
21	NC_000958	TCC	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957477
22	NC_000958	GCA	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
23	NC_000958	GCA	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
24	NC_000958	GAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
25	NC_000958	GTG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957490
26	NC_000958	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957490
27	NC_000958	TCG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
28	NC_000958	CAG	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
29	NC_000958	ATC	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957490
30	NC_000958	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957490
31	NC_000958	AGG	2	6	3253	3258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
32	NC_000958	CTC	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957490
33	NC_000958	GCA	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
34	NC_000958	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957490
35	NC_000958	AGC	2	6	3598	3603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
36	NC_000958	TCC	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957490
37	NC_000958	CGG	2	6	3636	3641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957490
38	NC_000958	GCG	2	6	3650	3655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957490
39	NC_000958	AGG	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
40	NC_000958	TCA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957490
41	NC_000958	GAG	2	6	3763	3768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
42	NC_000958	ATG	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957490
43	NC_000958	GCT	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
44	NC_000958	CTG	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
45	NC_000958	AAG	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957490
46	NC_000958	GCA	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
47	NC_000958	GAG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
48	NC_000958	CTG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
49	NC_000958	TGC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
50	NC_000958	CCG	2	6	4465	4470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957490
51	NC_000958	CTG	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
52	NC_000958	CCG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957491
53	NC_000958	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957491
54	NC_000958	GGT	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957491
55	NC_000958	AGA	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957491
56	NC_000958	GGT	3	9	4850	4858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957491
57	NC_000958	CAG	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957491
58	NC_000958	CCA	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957491
59	NC_000958	GAT	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957491
60	NC_000958	ATG	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957491
61	NC_000958	CTG	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
62	NC_000958	GCC	2	6	5175	5180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957491
63	NC_000958	GCT	2	6	5298	5303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
64	NC_000958	GTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957491
65	NC_000958	GGC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957491
66	NC_000958	GAC	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957491
67	NC_000958	GGT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957491
68	NC_000958	CAG	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957491
69	NC_000958	GCG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957491
70	NC_000958	TCC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957491
71	NC_000958	GTC	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
72	NC_000958	TCA	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957491
73	NC_000958	GAT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957474
74	NC_000958	GAG	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957474
75	NC_000958	ATC	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957474
76	NC_000958	AAG	2	6	6567	6572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957474
77	NC_000958	AGC	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957474
78	NC_000958	GTC	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957474
79	NC_000958	TGG	2	6	6862	6867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957474
80	NC_000958	TCG	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957474
81	NC_000958	GAC	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957474
82	NC_000958	GGT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957474
83	NC_000958	TCA	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957474
84	NC_000958	CAG	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957474
85	NC_000958	CTG	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
86	NC_000958	GCC	2	6	8061	8066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957436
87	NC_000958	GCT	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
88	NC_000958	GCC	3	9	8128	8136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957436
89	NC_000958	GGT	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957436
90	NC_000958	CGT	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
91	NC_000958	TGC	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
92	NC_000958	TGG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957436
93	NC_000958	GTG	2	6	8305	8310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957436
94	NC_000958	CGA	2	6	8391	8396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957436
95	NC_000958	GGC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957436
96	NC_000958	CAC	2	6	8544	8549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957436
97	NC_000958	CAA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957436
98	NC_000958	TAC	2	6	8611	8616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957436
99	NC_000958	CAT	2	6	8694	8699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957436
100	NC_000958	TCA	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957436
101	NC_000958	GAC	2	6	8785	8790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957436
102	NC_000958	GGC	2	6	8803	8808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957436
103	NC_000958	CGA	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957436
104	NC_000958	GCC	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957436
105	NC_000958	GAT	2	6	8925	8930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957436
106	NC_000958	GAC	2	6	8961	8966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957437
107	NC_000958	GCC	2	6	8988	8993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957437
108	NC_000958	AGC	2	6	9010	9015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957437
109	NC_000958	GCC	2	6	9052	9057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957437
110	NC_000958	GCT	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957437
111	NC_000958	ACC	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957437
112	NC_000958	GCC	2	6	9105	9110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957437
113	NC_000958	TGC	2	6	9121	9126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957437
114	NC_000958	CGG	2	6	9280	9285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957437
115	NC_000958	CGA	2	6	9356	9361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957437
116	NC_000958	GCT	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957437
117	NC_000958	TCA	3	9	9445	9453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957437
118	NC_000958	CGC	2	6	9582	9587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957438
119	NC_000958	ACC	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957438
120	NC_000958	CGC	2	6	9618	9623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957438
121	NC_000958	GCT	2	6	9624	9629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957438
122	NC_000958	CTG	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957438
123	NC_000958	GCG	2	6	9790	9795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957438
124	NC_000958	ACG	2	6	9839	9844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957438
125	NC_000958	CGA	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957438
126	NC_000958	CCG	2	6	9875	9880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957438
127	NC_000958	GCT	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957438
128	NC_000958	GGC	2	6	9928	9933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957438
129	NC_000958	GGC	2	6	9957	9962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957438
130	NC_000958	CTT	2	6	10086	10091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957438
131	NC_000958	GAC	2	6	10099	10104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957438
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257	NC_000958	GAC	2	6	16375	16380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957442
258	NC_000958	AGC	2	6	16423	16428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957443
259	NC_000958	GCT	3	9	16450	16458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
260	NC_000958	CTG	2	6	16460	16465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
261	NC_000958	GTG	2	6	16517	16522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957443
262	NC_000958	CTG	2	6	16529	16534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
263	NC_000958	GAG	2	6	16568	16573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957443
264	NC_000958	GCC	2	6	16580	16585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957443
265	NC_000958	TGG	2	6	16629	16634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957443
266	NC_000958	TCG	2	6	16715	16720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
267	NC_000958	CGC	3	9	16732	16740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957443
268	NC_000958	GTG	2	6	16748	16753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957443
269	NC_000958	ACT	2	6	16776	16781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957443
270	NC_000958	CGC	2	6	16792	16797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957443
271	NC_000958	GCT	2	6	16810	16815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
272	NC_000958	ACC	2	6	16868	16873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957443
273	NC_000958	TGC	2	6	16875	16880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
274	NC_000958	GCG	2	6	16908	16913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957443
275	NC_000958	TGA	2	6	16926	16931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957443
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278	NC_000958	GCG	2	6	17100	17105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957443
279	NC_000958	TGG	2	6	17157	17162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957443
280	NC_000958	TGG	2	6	17217	17222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957443
281	NC_000958	CTG	2	6	17231	17236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
282	NC_000958	GCT	2	6	17239	17244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
283	NC_000958	ACC	2	6	17256	17261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957443
284	NC_000958	GCT	2	6	17266	17271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
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288	NC_000958	CTG	2	6	17402	17407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957443
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291	NC_000958	GCG	2	6	17528	17533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957444
292	NC_000958	GCC	2	6	17662	17667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957444
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295	NC_000958	CTG	2	6	17734	17739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957444
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332	NC_000958	TTG	2	6	23120	23125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957525
333	NC_000958	ATT	2	6	23415	23420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957492
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380	NC_000958	TGG	2	6	26591	26596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957447
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499	NC_000958	GCC	2	6	34672	34677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957452
500	NC_000958	ACG	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957452

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