MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 3311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000958	CGGCG	2	10	160853	160862	0 %	0 %	60 %	40 %	10957431
3002	NC_000958	CT	3	6	160910	160915	0 %	50 %	0 %	50 %	10957431
3003	NC_000958	AGTG	2	8	161014	161021	25 %	25 %	50 %	0 %	10957431
3004	NC_000958	GCG	2	6	161061	161066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957431
3005	NC_000958	CGC	3	9	161168	161176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957431
3006	NC_000958	CAG	2	6	161185	161190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3007	NC_000958	GAA	2	6	161195	161200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957431
3008	NC_000958	GCG	2	6	161203	161208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957431
3009	NC_000958	GCTTC	2	10	161241	161250	0 %	40 %	20 %	40 %	10957431
3010	NC_000958	G	6	6	161255	161260	0 %	0 %	100 %	0 %	10957431
3011	NC_000958	CGC	2	6	161298	161303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957431
3012	NC_000958	TGC	2	6	161304	161309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3013	NC_000958	ACGGCG	2	12	161319	161330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	10957431
3014	NC_000958	TGGC	2	8	161353	161360	0 %	25 %	50 %	25 %	10957431
3015	NC_000958	AGCA	2	8	161423	161430	50 %	0 %	25 %	25 %	10957431
3016	NC_000958	GCC	2	6	161453	161458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957431
3017	NC_000958	GGA	2	6	161459	161464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957431
3018	NC_000958	TGC	2	6	161517	161522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3019	NC_000958	GCGG	2	8	161549	161556	0 %	0 %	75 %	25 %	10957431
3020	NC_000958	TGA	2	6	161568	161573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957431
3021	NC_000958	GGA	2	6	161611	161616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957431
3022	NC_000958	TGC	2	6	161637	161642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3023	NC_000958	CTG	2	6	161669	161674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3024	NC_000958	GCC	2	6	161747	161752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957431
3025	NC_000958	GCG	2	6	161753	161758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957431
3026	NC_000958	CTG	2	6	161765	161770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3027	NC_000958	C	6	6	161808	161813	0 %	0 %	0 %	100 %	10957431
3028	NC_000958	CGG	2	6	161817	161822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957431
3029	NC_000958	TGA	2	6	161853	161858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957431
3030	NC_000958	CTG	3	9	161912	161920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3031	NC_000958	GCG	2	6	161984	161989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957431
3032	NC_000958	CGCC	2	8	162085	162092	0 %	0 %	25 %	75 %	10957431
3033	NC_000958	GGC	2	6	162115	162120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957431
3034	NC_000958	CAC	2	6	162143	162148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957431
3035	NC_000958	CGT	2	6	162214	162219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3036	NC_000958	GCA	2	6	162237	162242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957431
3037	NC_000958	CATT	2	8	162270	162277	25 %	50 %	0 %	25 %	10957431
3038	NC_000958	GTGC	2	8	162319	162326	0 %	25 %	50 %	25 %	10957432
3039	NC_000958	GTG	2	6	162343	162348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957432
3040	NC_000958	GCG	2	6	162359	162364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3041	NC_000958	CTG	3	9	162373	162381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3042	NC_000958	GGC	2	6	162391	162396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3043	NC_000958	GAG	2	6	162439	162444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957432
3044	NC_000958	C	7	7	162464	162470	0 %	0 %	0 %	100 %	10957432
3045	NC_000958	GCT	3	9	162507	162515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3046	NC_000958	GCG	2	6	162542	162547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3047	NC_000958	GCC	2	6	162569	162574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957432
3048	NC_000958	CTC	2	6	162610	162615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957432
3049	NC_000958	GCCCG	2	10	162632	162641	0 %	0 %	40 %	60 %	10957432
3050	NC_000958	TGA	2	6	162644	162649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957432
3051	NC_000958	CGA	2	6	162654	162659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3052	NC_000958	GCC	2	6	162685	162690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957432
3053	NC_000958	GCT	2	6	162705	162710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3054	NC_000958	GTGG	2	8	162768	162775	0 %	25 %	75 %	0 %	10957432
3055	NC_000958	TGC	2	6	162815	162820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3056	NC_000958	GGT	2	6	162891	162896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957432
3057	NC_000958	GGC	2	6	162926	162931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3058	NC_000958	GAGGGC	2	12	162991	163002	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	10957432
3059	NC_000958	CCA	2	6	163017	163022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957432
3060	NC_000958	GCT	2	6	163032	163037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3061	NC_000958	AGGA	2	8	163051	163058	50 %	0 %	50 %	0 %	10957432
3062	NC_000958	CTG	2	6	163123	163128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3063	NC_000958	GCT	2	6	163131	163136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3064	NC_000958	CG	3	6	163195	163200	0 %	0 %	50 %	50 %	10957432
3065	NC_000958	CGC	2	6	163320	163325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957432
3066	NC_000958	GAC	2	6	163333	163338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3067	NC_000958	TGG	2	6	163405	163410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957432
3068	NC_000958	GCG	2	6	163411	163416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3069	NC_000958	GCT	2	6	163422	163427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3070	NC_000958	AGT	2	6	163441	163446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957432
3071	NC_000958	GCC	4	12	163453	163464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957432
3072	NC_000958	GCG	2	6	163486	163491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3073	NC_000958	GAC	2	6	163492	163497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3074	NC_000958	GA	3	6	163499	163504	50 %	0 %	50 %	0 %	10957432
3075	NC_000958	CGA	2	6	163506	163511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3076	NC_000958	ACC	2	6	163621	163626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957432
3077	NC_000958	GCT	2	6	163632	163637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3078	NC_000958	ACA	2	6	163679	163684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957432
3079	NC_000958	GCT	2	6	163692	163697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3080	NC_000958	TCG	2	6	163718	163723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3081	NC_000958	G	6	6	163793	163798	0 %	0 %	100 %	0 %	10957432
3082	NC_000958	CGA	2	6	163845	163850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3083	NC_000958	GCG	2	6	163887	163892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3084	NC_000958	TGG	2	6	163898	163903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957432
3085	NC_000958	CGAC	2	8	163904	163911	25 %	0 %	25 %	50 %	10957432
3086	NC_000958	CT	3	6	163915	163920	0 %	50 %	0 %	50 %	10957432
3087	NC_000958	GGC	2	6	163938	163943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3088	NC_000958	TGC	2	6	164183	164188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3089	NC_000958	GCT	2	6	164232	164237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3090	NC_000958	CGC	2	6	164277	164282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957432
3091	NC_000958	GAA	2	6	164335	164340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957432
3092	NC_000958	GCGA	2	8	164344	164351	25 %	0 %	50 %	25 %	10957432
3093	NC_000958	GCG	2	6	164523	164528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3094	NC_000958	GCG	2	6	164555	164560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3095	NC_000958	ACC	2	6	164579	164584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957432
3096	NC_000958	AGC	2	6	164594	164599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3097	NC_000958	GGC	3	9	164643	164651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3098	NC_000958	GCT	4	12	164700	164711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3099	NC_000958	GCTG	2	8	164763	164770	0 %	25 %	50 %	25 %	10957432
3100	NC_000958	CGG	2	6	164807	164812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3101	NC_000958	GGC	2	6	164821	164826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957432
3102	NC_000958	AGA	2	6	164898	164903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957432
3103	NC_000958	GC	3	6	164970	164975	0 %	0 %	50 %	50 %	10957432
3104	NC_000958	CGC	3	9	164973	164981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957432
3105	NC_000958	GCT	2	6	164982	164987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957432
3106	NC_000958	CG	4	8	165015	165022	0 %	0 %	50 %	50 %	10957432
3107	NC_000958	C	6	6	165057	165062	0 %	0 %	0 %	100 %	10957432
3108	NC_000958	CCTGCC	2	12	165087	165098	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	10957432
3109	NC_000958	ACC	2	6	165120	165125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957432
3110	NC_000958	CAT	2	6	165132	165137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957433
3111	NC_000958	GGCCTG	2	12	165150	165161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	10957433
3112	NC_000958	CGA	2	6	165164	165169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3113	NC_000958	CTG	2	6	165174	165179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3114	NC_000958	C	6	6	165243	165248	0 %	0 %	0 %	100 %	10957433
3115	NC_000958	GAA	2	6	165261	165266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957433
3116	NC_000958	GAC	2	6	165285	165290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3117	NC_000958	CAG	2	6	165315	165320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3118	NC_000958	CTG	2	6	165357	165362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3119	NC_000958	CG	3	6	165363	165368	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
3120	NC_000958	G	6	6	165386	165391	0 %	0 %	100 %	0 %	10957433
3121	NC_000958	CGGCG	2	10	165392	165401	0 %	0 %	60 %	40 %	10957433
3122	NC_000958	GGC	2	6	165402	165407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957433
3123	NC_000958	CGA	2	6	165488	165493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3124	NC_000958	GCT	2	6	165593	165598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3125	NC_000958	TGC	2	6	165655	165660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3126	NC_000958	GCT	3	9	165695	165703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3127	NC_000958	GCG	2	6	165721	165726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957433
3128	NC_000958	GC	3	6	165779	165784	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
3129	NC_000958	GCT	2	6	165860	165865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3130	NC_000958	GCG	2	6	165880	165885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957433
3131	NC_000958	CG	3	6	165909	165914	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
3132	NC_000958	ACC	2	6	165921	165926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957433
3133	NC_000958	CTG	2	6	165969	165974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3134	NC_000958	CCCGCG	2	12	166018	166029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957433
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3136	NC_000958	GCT	2	6	166121	166126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
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3138	NC_000958	CTG	2	6	166179	166184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
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3142	NC_000958	GCA	2	6	166321	166326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957433
3143	NC_000958	CTG	2	6	166338	166343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957433
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3153	NC_000958	TGA	2	6	166837	166842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957433
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3155	NC_000958	CGA	2	6	166922	166927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957433
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3163	NC_000958	AC	3	6	167432	167437	50 %	0 %	0 %	50 %	10957434
3164	NC_000958	CGC	2	6	167489	167494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957434
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3173	NC_000958	CGA	2	6	167927	167932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957434
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3199	NC_000958	AGA	2	6	170653	170658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957478
3200	NC_000958	TCAG	2	8	170848	170855	25 %	25 %	25 %	25 %	10957478
3201	NC_000958	ACC	2	6	170862	170867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957478
3202	NC_000958	AT	3	6	170906	170911	50 %	50 %	0 %	0 %	10957478
3203	NC_000958	GCA	2	6	170974	170979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957478
3204	NC_000958	CCAG	2	8	171020	171027	25 %	0 %	25 %	50 %	10957520
3205	NC_000958	TTTG	2	8	171286	171293	0 %	75 %	25 %	0 %	10957520
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3209	NC_000958	ATG	2	6	171506	171511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957520
3210	NC_000958	GTC	2	6	171517	171522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957520
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3213	NC_000958	AGCATC	2	12	171675	171686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	10957435
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3216	NC_000958	CTC	2	6	171915	171920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957435
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3218	NC_000958	GGC	2	6	172100	172105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957435
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3230	NC_000958	CAG	2	6	172725	172730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957435
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3232	NC_000958	GCT	2	6	172817	172822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957435
3233	NC_000958	GAG	2	6	172887	172892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957435
3234	NC_000958	CCGGCA	2	12	173002	173013	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	10957435
3235	NC_000958	GTG	2	6	173025	173030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957435
3236	NC_000958	CG	3	6	173091	173096	0 %	0 %	50 %	50 %	10957435
3237	NC_000958	ACG	2	6	173113	173118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957435
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3240	NC_000958	CT	3	6	173220	173225	0 %	50 %	0 %	50 %	10957435
3241	NC_000958	TGC	2	6	173230	173235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957435
3242	NC_000958	GCGGT	2	10	173256	173265	0 %	20 %	60 %	20 %	10957435
3243	NC_000958	GGT	2	6	173271	173276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957435
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.