MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 3311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_000958	GTCA	2	8	109719	109726	25 %	25 %	25 %	25 %	10957480
2002	NC_000958	GCA	3	9	109733	109741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957480
2003	NC_000958	GCG	2	6	109748	109753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957480
2004	NC_000958	ACG	2	6	109835	109840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957480
2005	NC_000958	CT	3	6	110053	110058	0 %	50 %	0 %	50 %	10957406
2006	NC_000958	TGG	2	6	110088	110093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957406
2007	NC_000958	AC	3	6	110120	110125	50 %	0 %	0 %	50 %	10957406
2008	NC_000958	GCC	2	6	110161	110166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957406
2009	NC_000958	GCGG	2	8	110224	110231	0 %	0 %	75 %	25 %	10957406
2010	NC_000958	CGG	2	6	110274	110279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957406
2011	NC_000958	AGC	2	6	110396	110401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957406
2012	NC_000958	CAG	2	6	110407	110412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957406
2013	NC_000958	CG	5	10	110481	110490	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
2014	NC_000958	CG	4	8	110553	110560	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
2015	NC_000958	AGC	3	9	110561	110569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957406
2016	NC_000958	GCG	2	6	110649	110654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957406
2017	NC_000958	GCGA	2	8	110657	110664	25 %	0 %	50 %	25 %	10957406
2018	NC_000958	GCC	2	6	110687	110692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957406
2019	NC_000958	GCG	3	9	110714	110722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957406
2020	NC_000958	CACG	2	8	110745	110752	25 %	0 %	25 %	50 %	10957406
2021	NC_000958	AAG	2	6	110769	110774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957406
2022	NC_000958	GTC	2	6	110793	110798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957406
2023	NC_000958	TCG	2	6	110804	110809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957406
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2033	NC_000958	CGA	2	6	111060	111065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957406
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2043	NC_000958	CCA	2	6	111288	111293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957406
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2054	NC_000958	CG	3	6	111690	111695	0 %	0 %	50 %	50 %	10957407
2055	NC_000958	GCG	3	9	111693	111701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957407
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2059	NC_000958	C	6	6	111841	111846	0 %	0 %	0 %	100 %	10957407
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2121	NC_000958	CCCCA	2	10	114534	114543	20 %	0 %	0 %	80 %	10957481
2122	NC_000958	GA	3	6	114549	114554	50 %	0 %	50 %	0 %	10957481
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2124	NC_000958	GGCG	2	8	114869	114876	0 %	0 %	75 %	25 %	10957481
2125	NC_000958	GCA	2	6	114899	114904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957481
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2245	NC_000958	AG	3	6	119963	119968	50 %	0 %	50 %	0 %	10957485
2246	NC_000958	GTC	2	6	120017	120022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957485
2247	NC_000958	TCG	2	6	120057	120062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957485
2248	NC_000958	CGC	2	6	120094	120099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957485
2249	NC_000958	TCA	2	6	120204	120209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957485
2250	NC_000958	ACG	2	6	120249	120254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957485
2251	NC_000958	CCT	2	6	120256	120261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957485
2252	NC_000958	GCG	2	6	120290	120295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957485
2253	NC_000958	CTG	2	6	122163	122168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957470
2254	NC_000958	GAT	2	6	122237	122242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957470
2255	NC_000958	ACC	2	6	122274	122279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957470
2256	NC_000958	CGAACA	2	12	122293	122304	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	10957470
2257	NC_000958	GTC	2	6	122369	122374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957470
2258	NC_000958	GAC	2	6	122419	122424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957470
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2260	NC_000958	CCA	2	6	122467	122472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957470
2261	NC_000958	CAGC	2	8	122477	122484	25 %	0 %	25 %	50 %	10957470
2262	NC_000958	GAC	2	6	122693	122698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957470
2263	NC_000958	GCT	2	6	122728	122733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957470
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2265	NC_000958	TGA	2	6	122811	122816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957470
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2267	NC_000958	ATC	2	6	122835	122840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957470
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2270	NC_000958	TCG	2	6	123217	123222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957410
2271	NC_000958	CG	3	6	123403	123408	0 %	0 %	50 %	50 %	10957410
2272	NC_000958	TGT	2	6	123434	123439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957410
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2274	NC_000958	TGC	2	6	123552	123557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957410
2275	NC_000958	GCT	2	6	123590	123595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957410
2276	NC_000958	GAC	2	6	123723	123728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957410
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2279	NC_000958	GC	3	6	123859	123864	0 %	0 %	50 %	50 %	10957410
2280	NC_000958	GTC	2	6	123866	123871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957410
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2282	NC_000958	GGTCA	2	10	123893	123902	20 %	20 %	40 %	20 %	10957410
2283	NC_000958	G	6	6	124018	124023	0 %	0 %	100 %	0 %	10957410
2284	NC_000958	CAG	2	6	124046	124051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957410
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2286	NC_000958	CTG	2	6	124079	124084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957410
2287	NC_000958	CTG	2	6	124184	124189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957410
2288	NC_000958	GAA	2	6	124232	124237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957410
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2299	NC_000958	CGCT	2	8	124757	124764	0 %	25 %	25 %	50 %	10957411
2300	NC_000958	ACA	2	6	124783	124788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957411
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2320	NC_000958	GTG	2	6	126181	126186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957412
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2325	NC_000958	CTG	3	9	126625	126633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957413
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2336	NC_000958	ACCC	2	8	126906	126913	25 %	0 %	0 %	75 %	10957413
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2342	NC_000958	G	6	6	127475	127480	0 %	0 %	100 %	0 %	10957414
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2349	NC_000958	CGGCG	2	10	127906	127915	0 %	0 %	60 %	40 %	10957414
2350	NC_000958	CTG	2	6	127965	127970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957414
2351	NC_000958	CAC	2	6	128057	128062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957414
2352	NC_000958	CCTCG	2	10	128129	128138	0 %	20 %	20 %	60 %	10957414
2353	NC_000958	CGG	2	6	128162	128167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957414
2354	NC_000958	CGGG	2	8	128174	128181	0 %	0 %	75 %	25 %	10957414
2355	NC_000958	CGGCG	2	10	128186	128195	0 %	0 %	60 %	40 %	10957414
2356	NC_000958	GC	3	6	128217	128222	0 %	0 %	50 %	50 %	10957414
2357	NC_000958	CCA	2	6	128224	128229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957414
2358	NC_000958	CGG	2	6	128245	128250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957414
2359	NC_000958	GC	3	6	128255	128260	0 %	0 %	50 %	50 %	10957414
2360	NC_000958	ACG	2	6	128263	128268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957414
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2362	NC_000958	CGC	2	6	128528	128533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957414
2363	NC_000958	AAC	2	6	128575	128580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957414
2364	NC_000958	GGA	2	6	128585	128590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957414
2365	NC_000958	CGCCAG	2	12	128666	128677	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	10957414
2366	NC_000958	CAT	2	6	128678	128683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957414
2367	NC_000958	CAA	2	6	128717	128722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957414
2368	NC_000958	TAC	2	6	128772	128777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957414
2369	NC_000958	GCC	2	6	128823	128828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957414
2370	NC_000958	CCA	2	6	128884	128889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957414
2371	NC_000958	CACG	2	8	128890	128897	25 %	0 %	25 %	50 %	10957414
2372	NC_000958	CTA	2	6	128906	128911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957414
2373	NC_000958	TAC	2	6	128946	128951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957414
2374	NC_000958	GTG	2	6	128994	128999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957414
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2379	NC_000958	AGGTG	2	10	129262	129271	20 %	20 %	60 %	0 %	10957415
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2383	NC_000958	A	6	6	129512	129517	100 %	0 %	0 %	0 %	10957415
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2386	NC_000958	GGGCAG	2	12	129587	129598	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	10957415
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2475	NC_000958	G	6	6	135918	135923	0 %	0 %	100 %	0 %	15795188
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2486	NC_000958	G	6	6	136440	136445	0 %	0 %	100 %	0 %	10957528
2487	NC_000958	TGACGA	2	12	136559	136570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10957486
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2491	NC_000958	CTG	2	6	136754	136759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957486
2492	NC_000958	CCAT	2	8	136771	136778	25 %	25 %	0 %	50 %	10957486
2493	NC_000958	CGC	2	6	136802	136807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957486
2494	NC_000958	CGC	2	6	136905	136910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957486
2495	NC_000958	CTGC	2	8	136932	136939	0 %	25 %	25 %	50 %	10957486
2496	NC_000958	CAG	2	6	136956	136961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957486
2497	NC_000958	AGC	2	6	136978	136983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957486
2498	NC_000958	C	6	6	137062	137067	0 %	0 %	0 %	100 %	10957486
2499	NC_000958	GCCC	2	8	137101	137108	0 %	0 %	25 %	75 %	10957486
2500	NC_000958	CCA	2	6	137129	137134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957486

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