MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 3311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000958	GGC	2	6	27612	27617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
502	NC_000958	CGG	2	6	27662	27667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
503	NC_000958	CGG	2	6	27693	27698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
504	NC_000958	CAGGCA	2	12	27740	27751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957448
505	NC_000958	GTC	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
506	NC_000958	GCG	2	6	27807	27812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
507	NC_000958	GTC	2	6	27846	27851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
508	NC_000958	GAC	2	6	27883	27888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957448
509	NC_000958	AGC	2	6	27889	27894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957448
510	NC_000958	CTG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
511	NC_000958	GCT	2	6	27954	27959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
512	NC_000958	CCT	2	6	27971	27976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957448
513	NC_000958	GAC	2	6	28018	28023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957448
514	NC_000958	CGTG	2	8	28038	28045	0 %	25 %	50 %	25 %	10957448
515	NC_000958	CTG	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
516	NC_000958	CTG	2	6	28140	28145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
517	NC_000958	CGT	2	6	28181	28186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
518	NC_000958	TGC	2	6	28207	28212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
519	NC_000958	CTG	2	6	28272	28277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
520	NC_000958	CGG	2	6	28328	28333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957449
521	NC_000958	CGC	2	6	28380	28385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957449
522	NC_000958	TGCC	2	8	28453	28460	0 %	25 %	25 %	50 %	10957449
523	NC_000958	GTG	2	6	28461	28466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957449
524	NC_000958	AGC	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957449
525	NC_000958	AGC	2	6	28506	28511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957449
526	NC_000958	CCT	2	6	28556	28561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957449
527	NC_000958	GGC	2	6	28571	28576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957449
528	NC_000958	GAG	2	6	28590	28595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957449
529	NC_000958	GTG	2	6	28641	28646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957449
530	NC_000958	ACC	2	6	28707	28712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957449
531	NC_000958	GCT	2	6	28832	28837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
532	NC_000958	GCG	2	6	28845	28850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957449
533	NC_000958	CTG	2	6	28857	28862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
534	NC_000958	GACGTG	2	12	28914	28925	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10957449
535	NC_000958	GC	3	6	28961	28966	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
536	NC_000958	GCT	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
537	NC_000958	ACC	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957449
538	NC_000958	TGC	2	6	29068	29073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
539	NC_000958	TGC	2	6	29137	29142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
540	NC_000958	CGA	2	6	29195	29200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957449
541	NC_000958	GCC	2	6	29239	29244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957449
542	NC_000958	GGCA	2	8	29255	29262	25 %	0 %	50 %	25 %	10957449
543	NC_000958	GCT	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
544	NC_000958	GTT	2	6	29370	29375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957449
545	NC_000958	CTG	2	6	29412	29417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
546	NC_000958	CGA	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957449
547	NC_000958	ACC	2	6	29451	29456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957449
548	NC_000958	CTG	2	6	29457	29462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
549	NC_000958	CG	3	6	29466	29471	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
550	NC_000958	GGAGC	2	10	29524	29533	20 %	0 %	60 %	20 %	10957449
551	NC_000958	GTG	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957449
552	NC_000958	TGCG	2	8	29590	29597	0 %	25 %	50 %	25 %	10957449
553	NC_000958	TGG	2	6	29635	29640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957449
554	NC_000958	GCT	2	6	29646	29651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449
555	NC_000958	GC	3	6	29669	29674	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
556	NC_000958	AAG	2	6	29710	29715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957449
557	NC_000958	TGG	3	9	29849	29857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957450
558	NC_000958	TGC	2	6	29865	29870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957450
559	NC_000958	GCC	2	6	29926	29931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957450
560	NC_000958	CCTGA	2	10	29971	29980	20 %	20 %	20 %	40 %	10957450
561	NC_000958	CGG	2	6	30080	30085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957450
562	NC_000958	GGC	2	6	30124	30129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957450
563	NC_000958	TGC	2	6	30167	30172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957450
564	NC_000958	CCA	2	6	30176	30181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957450
565	NC_000958	TTG	2	6	30190	30195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957450
566	NC_000958	GAG	2	6	30244	30249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957450
567	NC_000958	CG	3	6	30255	30260	0 %	0 %	50 %	50 %	10957450
568	NC_000958	AGCGC	2	10	30281	30290	20 %	0 %	40 %	40 %	10957450
569	NC_000958	CTG	2	6	30308	30313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957450
570	NC_000958	CAT	2	6	30411	30416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957450
571	NC_000958	CTG	2	6	30430	30435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957450
572	NC_000958	GCG	2	6	30438	30443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957450
573	NC_000958	ACA	2	6	30485	30490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957450
574	NC_000958	GCT	2	6	30531	30536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957450
575	NC_000958	GGT	2	6	30672	30677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957450
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577	NC_000958	GTC	2	6	31014	31019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957450
578	NC_000958	CT	3	6	31186	31191	0 %	50 %	0 %	50 %	10957466
579	NC_000958	ATCA	2	8	31212	31219	50 %	25 %	0 %	25 %	10957466
580	NC_000958	CTGAG	2	10	31258	31267	20 %	20 %	40 %	20 %	10957466
581	NC_000958	GCG	2	6	31351	31356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957466
582	NC_000958	AGA	2	6	31459	31464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957466
583	NC_000958	GCA	2	6	31547	31552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957466
584	NC_000958	TCT	2	6	31583	31588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957466
585	NC_000958	GCCA	2	8	31596	31603	25 %	0 %	25 %	50 %	10957466
586	NC_000958	AAG	2	6	31659	31664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957466
587	NC_000958	CAT	2	6	31673	31678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957466
588	NC_000958	TCA	2	6	31720	31725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957466
589	NC_000958	CCA	2	6	31766	31771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957466
590	NC_000958	GGC	2	6	31781	31786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957466
591	NC_000958	CCA	2	6	31811	31816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957466
592	NC_000958	AT	3	6	31819	31824	50 %	50 %	0 %	0 %	10957466
593	NC_000958	AGC	2	6	31861	31866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957466
594	NC_000958	TCAG	2	8	31885	31892	25 %	25 %	25 %	25 %	10957466
595	NC_000958	GTC	2	6	31893	31898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957466
596	NC_000958	GCG	2	6	31907	31912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957466
597	NC_000958	TGACGC	2	12	31985	31996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10957466
598	NC_000958	CATC	2	8	32006	32013	25 %	25 %	0 %	50 %	10957466
599	NC_000958	GAG	2	6	32030	32035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957466
600	NC_000958	G	6	6	32049	32054	0 %	0 %	100 %	0 %	10957466
601	NC_000958	TGG	2	6	32200	32205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957451
602	NC_000958	T	6	6	32268	32273	0 %	100 %	0 %	0 %	10957451
603	NC_000958	A	7	7	32306	32312	100 %	0 %	0 %	0 %	10957451
604	NC_000958	TGCG	2	8	32338	32345	0 %	25 %	50 %	25 %	10957451
605	NC_000958	GCA	2	6	32359	32364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957451
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607	NC_000958	GC	3	6	32417	32422	0 %	0 %	50 %	50 %	10957451
608	NC_000958	CGC	3	9	32420	32428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957451
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610	NC_000958	GA	3	6	32449	32454	50 %	0 %	50 %	0 %	10957451
611	NC_000958	CAT	2	6	32534	32539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957451
612	NC_000958	ATG	2	6	32547	32552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957451
613	NC_000958	TGGC	2	8	32581	32588	0 %	25 %	50 %	25 %	10957451
614	NC_000958	CTC	2	6	32690	32695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957451
615	NC_000958	GTT	2	6	32828	32833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957451
616	NC_000958	CCA	2	6	32916	32921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957451
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618	NC_000958	CT	3	6	33059	33064	0 %	50 %	0 %	50 %	10957451
619	NC_000958	CCG	2	6	33100	33105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957451
620	NC_000958	GGCA	2	8	33157	33164	25 %	0 %	50 %	25 %	10957451
621	NC_000958	CGG	2	6	33177	33182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957451
622	NC_000958	CGC	2	6	33198	33203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957451
623	NC_000958	ATG	3	9	33427	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957526
624	NC_000958	TTA	2	6	33464	33469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957526
625	NC_000958	CCTGA	2	10	33491	33500	20 %	20 %	20 %	40 %	10957526
626	NC_000958	AGTG	2	8	33514	33521	25 %	25 %	50 %	0 %	10957526
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628	NC_000958	GTAGGC	2	12	33600	33611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10957526
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