MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

< Previous12345678910111213...144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2125	NC_022579	AGG	2	6	109725	109730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593705
2126	NC_022579	ATT	2	6	109863	109868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593706
2127	NC_022579	ACA	2	6	109902	109907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593706
2128	NC_022579	TA	3	6	109954	109959	50 %	50 %	0 %	0 %	551593706
2129	NC_022579	AGA	2	6	110111	110116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593706
2130	NC_022579	CGC	2	6	110157	110162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593706
2131	NC_022579	AGC	2	6	110194	110199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593706
2132	NC_022579	TGA	2	6	110252	110257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593706
2133	NC_022579	TTA	2	6	110281	110286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593706
2134	NC_022579	A	7	7	110310	110316	100 %	0 %	0 %	0 %	551593706
2135	NC_022579	CAA	2	6	110318	110323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593706
2136	NC_022579	ATA	2	6	110415	110420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593706
2137	NC_022579	CAG	2	6	110429	110434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593706
2138	NC_022579	CTG	2	6	110442	110447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593706
2139	NC_022579	GAATT	2	10	110563	110572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_022579	TTG	2	6	110574	110579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_022579	CTG	2	6	110627	110632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_022579	TTG	2	6	110641	110646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_022579	TA	3	6	110729	110734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_022579	CTG	2	6	110775	110780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2145	NC_022579	CTG	2	6	110813	110818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_022579	TAATG	2	10	110857	110866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_022579	TCTTT	2	10	110872	110881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2148	NC_022579	ATA	2	6	110885	110890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2149	NC_022579	TTC	2	6	110985	110990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593707
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2151	NC_022579	A	6	6	111176	111181	100 %	0 %	0 %	0 %	551593707
2152	NC_022579	TAT	2	6	111310	111315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593707
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2154	NC_022579	CTG	2	6	111458	111463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593707
2155	NC_022579	GTT	2	6	111464	111469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593707
2156	NC_022579	GAA	2	6	111473	111478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593707
2157	NC_022579	A	6	6	111524	111529	100 %	0 %	0 %	0 %	551593707
2158	NC_022579	CAA	2	6	111540	111545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593707
2159	NC_022579	GCA	2	6	111575	111580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593707
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2162	NC_022579	AGC	2	6	111880	111885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593707
2163	NC_022579	TGT	2	6	111949	111954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593707
2164	NC_022579	ATG	2	6	111986	111991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593707
2165	NC_022579	GAA	2	6	112093	112098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593707
2166	NC_022579	CAA	2	6	112132	112137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593707
2167	NC_022579	TTG	2	6	112155	112160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593707
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2172	NC_022579	ATC	2	6	112331	112336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593707
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2175	NC_022579	GTC	2	6	112382	112387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2176	NC_022579	GCA	2	6	112390	112395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593708
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2179	NC_022579	CGG	2	6	112549	112554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593708
2180	NC_022579	CTG	2	6	112601	112606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593708
2181	NC_022579	GGC	2	6	112667	112672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593708
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2185	NC_022579	TGA	2	6	112867	112872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593708
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2189	NC_022579	TGT	2	6	113083	113088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593708
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2193	NC_022579	TGC	2	6	113151	113156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593708
2194	NC_022579	TGA	2	6	113170	113175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593708
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2198	NC_022579	GAA	2	6	113453	113458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593708
2199	NC_022579	TCCCGG	2	12	113566	113577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	551593708
2200	NC_022579	GAA	2	6	113609	113614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593708
2201	NC_022579	ATGC	2	8	113660	113667	25 %	25 %	25 %	25 %	551593708
2202	NC_022579	CTG	2	6	113708	113713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593708
2203	NC_022579	GTT	2	6	113885	113890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593708
2204	NC_022579	TCC	2	6	113900	113905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593708
2205	NC_022579	GCC	2	6	113908	113913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593708
2206	NC_022579	T	9	9	114083	114091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2207	NC_022579	ATA	2	6	114110	114115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593709
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2210	NC_022579	ATG	2	6	114245	114250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593709
2211	NC_022579	CTG	3	9	114278	114286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593709
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2213	NC_022579	A	6	6	114334	114339	100 %	0 %	0 %	0 %	551593709
2214	NC_022579	GCAGAA	2	12	114340	114351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	551593709
2215	NC_022579	GCTGAA	2	12	114373	114384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	551593709
2216	NC_022579	AAGAGA	2	12	114496	114507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593710
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2219	NC_022579	GAC	2	6	114645	114650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593710
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2221	NC_022579	GAT	3	9	114663	114671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
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2226	NC_022579	GAT	2	6	114995	115000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
2227	NC_022579	GTA	2	6	115059	115064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
2228	NC_022579	T	6	6	115083	115088	0 %	100 %	0 %	0 %	551593710
2229	NC_022579	TGA	2	6	115100	115105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
2230	NC_022579	ATT	3	9	115157	115165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593710
2231	NC_022579	GCA	2	6	115246	115251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593710
2232	NC_022579	TCTGC	2	10	115282	115291	0 %	40 %	20 %	40 %	551593710
2233	NC_022579	CCG	2	6	115302	115307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593710
2234	NC_022579	A	6	6	115410	115415	100 %	0 %	0 %	0 %	551593710
2235	NC_022579	GAT	2	6	115446	115451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
2236	NC_022579	CGG	2	6	115463	115468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593710
2237	NC_022579	GAGG	2	8	115497	115504	25 %	0 %	75 %	0 %	551593710
2238	NC_022579	TGA	2	6	115514	115519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
2239	NC_022579	GCT	2	6	115533	115538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593710
2240	NC_022579	ATG	2	6	115558	115563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593710
2241	NC_022579	A	6	6	115574	115579	100 %	0 %	0 %	0 %	551593710
2242	NC_022579	ACG	2	6	115615	115620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593710
2243	NC_022579	AG	3	6	115668	115673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_022579	TAC	2	6	115710	115715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593711
2245	NC_022579	TGA	2	6	115811	115816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593711
2246	NC_022579	TGATCT	2	12	115833	115844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	551593711
2247	NC_022579	CAT	2	6	115876	115881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593711
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2249	NC_022579	TTG	2	6	115991	115996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593711
2250	NC_022579	GTG	2	6	115999	116004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593711
2251	NC_022579	ATG	2	6	116036	116041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593711
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2255	NC_022579	CCTA	2	8	116238	116245	25 %	25 %	0 %	50 %	551593711
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2285	NC_022579	TAAAT	2	10	118117	118126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2286	NC_022579	ATT	2	6	118263	118268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2333	NC_022579	ATA	2	6	121035	121040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2354	NC_022579	TTAG	2	8	122103	122110	25 %	50 %	25 %	0 %	551593724
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2492	NC_022579	T	6	6	129497	129502	0 %	100 %	0 %	0 %	551593731
2493	NC_022579	TCAAGA	2	12	129636	129647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	551593731
2494	NC_022579	CGC	2	6	129661	129666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593731
2495	NC_022579	AATT	2	8	129755	129762	50 %	50 %	0 %	0 %	551593731
2496	NC_022579	ATT	2	6	129807	129812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593731
2497	NC_022579	CA	3	6	129844	129849	50 %	0 %	0 %	50 %	551593731
2498	NC_022579	AGG	2	6	129881	129886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593732
2499	NC_022579	TCA	2	6	129905	129910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593732
2500	NC_022579	CTTTCC	2	12	130008	130019	0 %	50 %	0 %	50 %	551593732

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