MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022579	GCTT	2	8	50821	50828	0 %	50 %	25 %	25 %	551593652
1002	NC_022579	ATG	2	6	50838	50843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593652
1003	NC_022579	TGA	2	6	50851	50856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593652
1004	NC_022579	GCAG	2	8	50963	50970	25 %	0 %	50 %	25 %	551593652
1005	NC_022579	ACTGT	2	10	50985	50994	20 %	40 %	20 %	20 %	551593652
1006	NC_022579	CTGCAA	2	12	51000	51011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	551593652
1007	NC_022579	CGG	2	6	51049	51054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593652
1008	NC_022579	TAC	2	6	51238	51243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593652
1009	NC_022579	GAT	2	6	51248	51253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593652
1010	NC_022579	CGC	2	6	51316	51321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593652
1011	NC_022579	ATA	2	6	51339	51344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593652
1012	NC_022579	TCC	2	6	51450	51455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593652
1013	NC_022579	T	6	6	51629	51634	0 %	100 %	0 %	0 %	551593653
1014	NC_022579	GAA	2	6	51651	51656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593653
1015	NC_022579	ATGA	2	8	51699	51706	50 %	25 %	25 %	0 %	551593653
1016	NC_022579	T	7	7	51710	51716	0 %	100 %	0 %	0 %	551593653
1017	NC_022579	TTG	2	6	51760	51765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593653
1018	NC_022579	ATT	2	6	51789	51794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593653
1019	NC_022579	TGT	2	6	51905	51910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593653
1020	NC_022579	AAATG	2	10	51940	51949	60 %	20 %	20 %	0 %	551593653
1021	NC_022579	GCG	2	6	51996	52001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593653
1022	NC_022579	TTG	2	6	52053	52058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593654
1023	NC_022579	AAT	2	6	52280	52285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593654
1024	NC_022579	CGG	2	6	52474	52479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593654
1025	NC_022579	GGC	2	6	52529	52534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593654
1026	NC_022579	TCC	2	6	52558	52563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593654
1027	NC_022579	GTG	2	6	52587	52592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593654
1028	NC_022579	A	6	6	52661	52666	100 %	0 %	0 %	0 %	551593654
1029	NC_022579	ATT	2	6	52676	52681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593654
1030	NC_022579	TTA	2	6	52761	52766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593654
1031	NC_022579	GTTC	2	8	52772	52779	0 %	50 %	25 %	25 %	551593654
1032	NC_022579	CAG	2	6	52800	52805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593654
1033	NC_022579	GCA	2	6	52901	52906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593655
1034	NC_022579	T	8	8	52929	52936	0 %	100 %	0 %	0 %	551593655
1035	NC_022579	TGA	2	6	52951	52956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593655
1036	NC_022579	T	7	7	53020	53026	0 %	100 %	0 %	0 %	551593655
1037	NC_022579	A	7	7	53028	53034	100 %	0 %	0 %	0 %	551593655
1038	NC_022579	GTT	2	6	53048	53053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593655
1039	NC_022579	TGA	2	6	53143	53148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593655
1040	NC_022579	GT	3	6	53341	53346	0 %	50 %	50 %	0 %	551593655
1041	NC_022579	GCA	2	6	53399	53404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593655
1042	NC_022579	TGT	2	6	53438	53443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593655
1043	NC_022579	T	8	8	53568	53575	0 %	100 %	0 %	0 %	551593655
1044	NC_022579	CAA	2	6	53602	53607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593655
1045	NC_022579	T	6	6	53794	53799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022579	GCA	2	6	53920	53925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593656
1047	NC_022579	GAT	2	6	53948	53953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593656
1048	NC_022579	GCA	2	6	53965	53970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593656
1049	NC_022579	GCA	2	6	53981	53986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593656
1050	NC_022579	CGA	2	6	54019	54024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593656
1051	NC_022579	TGC	2	6	54093	54098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593657
1052	NC_022579	TTC	2	6	54103	54108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593657
1053	NC_022579	AT	3	6	54142	54147	50 %	50 %	0 %	0 %	551593657
1054	NC_022579	GAT	2	6	54387	54392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593658
1055	NC_022579	CCG	2	6	54438	54443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593658
1056	NC_022579	CGT	2	6	54482	54487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593658
1057	NC_022579	GAT	2	6	54507	54512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593658
1058	NC_022579	T	7	7	54584	54590	0 %	100 %	0 %	0 %	551593659
1059	NC_022579	AAT	2	6	54681	54686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593659
1060	NC_022579	TGA	2	6	54749	54754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593659
1061	NC_022579	CTG	2	6	54815	54820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593659
1062	NC_022579	TTC	2	6	54930	54935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593659
1063	NC_022579	GTA	2	6	54964	54969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593659
1064	NC_022579	TTC	2	6	54987	54992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593659
1065	NC_022579	ACT	2	6	55255	55260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593659
1066	NC_022579	T	6	6	55317	55322	0 %	100 %	0 %	0 %	551593659
1067	NC_022579	TTA	2	6	55382	55387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593659
1068	NC_022579	CTA	2	6	55388	55393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593659
1069	NC_022579	CAG	2	6	55486	55491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593660
1070	NC_022579	GCC	2	6	55492	55497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593660
1071	NC_022579	CTT	2	6	55518	55523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593660
1072	NC_022579	CAG	2	6	55543	55548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593660
1073	NC_022579	ATC	2	6	55585	55590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593660
1074	NC_022579	CGC	2	6	55617	55622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593660
1075	NC_022579	CTGCA	2	10	55648	55657	20 %	20 %	20 %	40 %	551593660
1076	NC_022579	GATT	2	8	55723	55730	25 %	50 %	25 %	0 %	551593660
1077	NC_022579	G	7	7	55753	55759	0 %	0 %	100 %	0 %	551593660
1078	NC_022579	TAA	2	6	55809	55814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593660
1079	NC_022579	GCG	2	6	55815	55820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593660
1080	NC_022579	AAC	2	6	55884	55889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593660
1081	NC_022579	CAG	2	6	55926	55931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593660
1082	NC_022579	ATC	2	6	55994	55999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593660
1083	NC_022579	T	6	6	56035	56040	0 %	100 %	0 %	0 %	551593660
1084	NC_022579	A	8	8	56123	56130	100 %	0 %	0 %	0 %	551593660
1085	NC_022579	TTC	2	6	56143	56148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593660
1086	NC_022579	CCT	2	6	56234	56239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593660
1087	NC_022579	TTGCTA	2	12	56247	56258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	551593660
1088	NC_022579	TAT	2	6	56281	56286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022579	CTG	2	6	56326	56331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_022579	A	7	7	56366	56372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022579	CCG	2	6	56434	56439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_022579	GGTT	2	8	56574	56581	0 %	50 %	50 %	0 %	551593661
1093	NC_022579	ATC	2	6	56586	56591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593661
1094	NC_022579	TTG	2	6	56714	56719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593661
1095	NC_022579	TGCCT	2	10	56785	56794	0 %	40 %	20 %	40 %	551593661
1096	NC_022579	TAA	2	6	56818	56823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593661
1097	NC_022579	TGT	2	6	56913	56918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022579	TGCT	2	8	56971	56978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_022579	CTGC	2	8	57091	57098	0 %	25 %	25 %	50 %	551593662
1100	NC_022579	AGG	2	6	57106	57111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593662
1101	NC_022579	TGC	2	6	57152	57157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593662
1102	NC_022579	T	7	7	57197	57203	0 %	100 %	0 %	0 %	551593662
1103	NC_022579	AG	3	6	57204	57209	50 %	0 %	50 %	0 %	551593662
1104	NC_022579	TGC	2	6	57257	57262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593662
1105	NC_022579	GGC	2	6	57332	57337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593662
1106	NC_022579	GGA	2	6	57419	57424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593662
1107	NC_022579	GA	3	6	57508	57513	50 %	0 %	50 %	0 %	551593662
1108	NC_022579	TGT	2	6	57572	57577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593662
1109	NC_022579	GGT	2	6	57734	57739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593662
1110	NC_022579	T	6	6	57793	57798	0 %	100 %	0 %	0 %	551593662
1111	NC_022579	GGT	2	6	57821	57826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593662
1112	NC_022579	T	6	6	57862	57867	0 %	100 %	0 %	0 %	551593662
1113	NC_022579	GTT	2	6	57888	57893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022579	T	6	6	57947	57952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022579	A	7	7	57979	57985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022579	TCC	2	6	57991	57996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_022579	TAT	2	6	58082	58087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593663
1118	NC_022579	GTT	2	6	58151	58156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593663
1119	NC_022579	GAG	2	6	58160	58165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593663
1120	NC_022579	T	6	6	58179	58184	0 %	100 %	0 %	0 %	551593663
1121	NC_022579	TCAG	2	8	58217	58224	25 %	25 %	25 %	25 %	551593663
1122	NC_022579	CGC	2	6	58225	58230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593663
1123	NC_022579	TCA	2	6	58249	58254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593663
1124	NC_022579	GGAT	2	8	58353	58360	25 %	25 %	50 %	0 %	551593663
1125	NC_022579	TTA	2	6	58440	58445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593663
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1127	NC_022579	CGC	2	6	58569	58574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593663
1128	NC_022579	TGC	2	6	58591	58596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593663
1129	NC_022579	CAT	2	6	58609	58614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593663
1130	NC_022579	CATG	2	8	58702	58709	25 %	25 %	25 %	25 %	551593663
1131	NC_022579	CTC	2	6	58724	58729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593663
1132	NC_022579	TGAT	2	8	58788	58795	25 %	50 %	25 %	0 %	551593663
1133	NC_022579	TTG	2	6	58806	58811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593663
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1135	NC_022579	AT	3	6	58965	58970	50 %	50 %	0 %	0 %	551593663
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1142	NC_022579	TCTT	2	8	59422	59429	0 %	75 %	0 %	25 %	551593663
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1245	NC_022579	TTTA	2	8	64945	64952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_022579	A	6	6	65116	65121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_022579	TGA	2	6	65131	65136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_022579	T	6	6	65146	65151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_022579	GT	3	6	65171	65176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_022579	TTA	2	6	65227	65232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_022579	AGG	2	6	65250	65255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_022579	TGA	3	9	65446	65454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593667
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