MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022579	AT	3	6	310816	310821	50 %	50 %	0 %	0 %	551593928
6002	NC_022579	CGC	2	6	310830	310835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593928
6003	NC_022579	ATCA	2	8	310859	310866	50 %	25 %	0 %	25 %	551593928
6004	NC_022579	AT	3	6	310963	310968	50 %	50 %	0 %	0 %	551593928
6005	NC_022579	ATTC	2	8	310973	310980	25 %	50 %	0 %	25 %	551593928
6006	NC_022579	TTC	2	6	310996	311001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593929
6007	NC_022579	AT	3	6	311034	311039	50 %	50 %	0 %	0 %	551593929
6008	NC_022579	GGC	2	6	311179	311184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593929
6009	NC_022579	AGA	2	6	311201	311206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593929
6010	NC_022579	T	6	6	311261	311266	0 %	100 %	0 %	0 %	551593929
6011	NC_022579	T	7	7	311331	311337	0 %	100 %	0 %	0 %	551593929
6012	NC_022579	TCA	2	6	311357	311362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593929
6013	NC_022579	CAA	2	6	311607	311612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593929
6014	NC_022579	TTTC	2	8	311728	311735	0 %	75 %	0 %	25 %	551593929
6015	NC_022579	CTTTGC	2	12	311787	311798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	551593929
6016	NC_022579	A	6	6	311856	311861	100 %	0 %	0 %	0 %	551593929
6017	NC_022579	AAT	2	6	311905	311910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593929
6018	NC_022579	TGA	2	6	311959	311964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593929
6019	NC_022579	CTTCAT	2	12	312010	312021	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	551593929
6020	NC_022579	TCCC	2	8	312132	312139	0 %	25 %	0 %	75 %	551593929
6021	NC_022579	CACCTT	2	12	312264	312275	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	551593929
6022	NC_022579	TGCC	2	8	312354	312361	0 %	25 %	25 %	50 %	551593929
6023	NC_022579	TCTT	2	8	312382	312389	0 %	75 %	0 %	25 %	551593929
6024	NC_022579	CCG	2	6	312407	312412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593929
6025	NC_022579	CTT	2	6	312531	312536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593929
6026	NC_022579	CGA	2	6	312557	312562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593929
6027	NC_022579	TTC	2	6	312568	312573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593929
6028	NC_022579	CAA	2	6	312708	312713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593929
6029	NC_022579	GA	3	6	312768	312773	50 %	0 %	50 %	0 %	551593929
6030	NC_022579	GCT	2	6	312807	312812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593929
6031	NC_022579	AAAG	2	8	312862	312869	75 %	0 %	25 %	0 %	551593929
6032	NC_022579	AGC	2	6	312892	312897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593929
6033	NC_022579	TTGG	2	8	312901	312908	0 %	50 %	50 %	0 %	551593929
6034	NC_022579	GCT	2	6	312927	312932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593929
6035	NC_022579	CTT	2	6	312951	312956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593929
6036	NC_022579	CGG	2	6	312983	312988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593929
6037	NC_022579	TC	3	6	313040	313045	0 %	50 %	0 %	50 %	551593929
6038	NC_022579	CAT	2	6	313050	313055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593929
6039	NC_022579	TAT	2	6	313086	313091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593929
6040	NC_022579	GCT	2	6	313111	313116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_022579	CAC	2	6	313145	313150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593930
6042	NC_022579	T	6	6	313179	313184	0 %	100 %	0 %	0 %	551593930
6043	NC_022579	CATGC	2	10	313218	313227	20 %	20 %	20 %	40 %	551593930
6044	NC_022579	TATC	2	8	313229	313236	25 %	50 %	0 %	25 %	551593930
6045	NC_022579	ATTT	2	8	313305	313312	25 %	75 %	0 %	0 %	551593930
6046	NC_022579	CTC	2	6	313328	313333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_022579	AAAG	2	8	313431	313438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_022579	TAT	2	6	313482	313487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593931
6049	NC_022579	CCG	2	6	313595	313600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593931
6050	NC_022579	TGC	2	6	313606	313611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593931
6051	NC_022579	GGC	2	6	313647	313652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593931
6052	NC_022579	TCA	2	6	313678	313683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593931
6053	NC_022579	TGG	2	6	313864	313869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593931
6054	NC_022579	AT	3	6	313955	313960	50 %	50 %	0 %	0 %	551593931
6055	NC_022579	GACA	2	8	314019	314026	50 %	0 %	25 %	25 %	551593932
6056	NC_022579	GCG	2	6	314088	314093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593932
6057	NC_022579	TTG	2	6	314207	314212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593932
6058	NC_022579	GGATG	2	10	314460	314469	20 %	20 %	60 %	0 %	551593932
6059	NC_022579	GTT	2	6	314470	314475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593932
6060	NC_022579	TGG	2	6	314529	314534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593932
6061	NC_022579	TTTC	2	8	314574	314581	0 %	75 %	0 %	25 %	551593932
6062	NC_022579	TG	3	6	314589	314594	0 %	50 %	50 %	0 %	551593932
6063	NC_022579	CTC	2	6	314671	314676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593932
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6065	NC_022579	CGT	2	6	314735	314740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593932
6066	NC_022579	T	6	6	314740	314745	0 %	100 %	0 %	0 %	551593932
6067	NC_022579	GAT	2	6	314752	314757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593932
6068	NC_022579	TCC	2	6	314782	314787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593933
6069	NC_022579	CAT	2	6	314825	314830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593933
6070	NC_022579	CCA	2	6	314843	314848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593933
6071	NC_022579	GTG	2	6	314866	314871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593933
6072	NC_022579	CGGCTG	2	12	314879	314890	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	551593933
6073	NC_022579	GGT	2	6	314964	314969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593933
6074	NC_022579	CCA	2	6	315008	315013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593933
6075	NC_022579	CCT	2	6	315108	315113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593934
6076	NC_022579	GAC	2	6	315184	315189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593934
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6080	NC_022579	TCA	2	6	315591	315596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593934
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6082	NC_022579	GATGTG	2	12	315725	315736	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	551593934
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6088	NC_022579	ACC	2	6	315972	315977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593934
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6090	NC_022579	ATGA	2	8	316126	316133	50 %	25 %	25 %	0 %	551593935
6091	NC_022579	CTT	2	6	316137	316142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593935
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6093	NC_022579	T	7	7	316286	316292	0 %	100 %	0 %	0 %	551593935
6094	NC_022579	TGGA	2	8	316299	316306	25 %	25 %	50 %	0 %	551593935
6095	NC_022579	T	6	6	316379	316384	0 %	100 %	0 %	0 %	551593936
6096	NC_022579	GAG	2	6	316416	316421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593936
6097	NC_022579	TCC	2	6	316572	316577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_022579	CTCAG	2	10	316578	316587	20 %	20 %	20 %	40 %	551593937
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6103	NC_022579	TGG	2	6	316827	316832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593937
6104	NC_022579	TTG	2	6	316886	316891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593937
6105	NC_022579	GAC	2	6	317017	317022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593937
6106	NC_022579	GT	3	6	317068	317073	0 %	50 %	50 %	0 %	551593937
6107	NC_022579	TAA	2	6	317271	317276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593937
6108	NC_022579	ATC	2	6	317383	317388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593937
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6110	NC_022579	CGT	2	6	317457	317462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593937
6111	NC_022579	GGT	2	6	317473	317478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593937
6112	NC_022579	TGAAT	2	10	317526	317535	40 %	40 %	20 %	0 %	551593937
6113	NC_022579	CCG	2	6	317541	317546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593937
6114	NC_022579	CAC	2	6	317632	317637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593937
6115	NC_022579	CCGT	2	8	317744	317751	0 %	25 %	25 %	50 %	551593937
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6118	NC_022579	CAT	2	6	317820	317825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593937
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6121	NC_022579	GCA	2	6	317955	317960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593937
6122	NC_022579	GGC	2	6	317966	317971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593937
6123	NC_022579	T	6	6	318232	318237	0 %	100 %	0 %	0 %	551593937
6124	NC_022579	GTT	2	6	318265	318270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593937
6125	NC_022579	TCC	2	6	318302	318307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593937
6126	NC_022579	TGC	2	6	318402	318407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593937
6127	NC_022579	GTG	2	6	318488	318493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593937
6128	NC_022579	GAT	2	6	318499	318504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593937
6129	NC_022579	TAG	2	6	318521	318526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593937
6130	NC_022579	TCA	2	6	318563	318568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593937
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6133	NC_022579	TCA	2	6	318692	318697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593937
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6136	NC_022579	ATA	3	9	318907	318915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593937
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6142	NC_022579	TG	3	6	319220	319225	0 %	50 %	50 %	0 %	551593937
6143	NC_022579	TCT	2	6	319281	319286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593937
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6147	NC_022579	AGC	2	6	319519	319524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593937
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6150	NC_022579	CAG	2	6	319585	319590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593937
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6153	NC_022579	TGG	2	6	319854	319859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593937
6154	NC_022579	ATC	2	6	319919	319924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593937
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6223	NC_022579	TGAAT	2	10	322940	322949	40 %	40 %	20 %	0 %	551593941
6224	NC_022579	CCT	2	6	323053	323058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593942
6225	NC_022579	T	7	7	323058	323064	0 %	100 %	0 %	0 %	551593942
6226	NC_022579	GAA	2	6	323085	323090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593942
6227	NC_022579	CGTC	2	8	323155	323162	0 %	25 %	25 %	50 %	551593942
6228	NC_022579	GAA	2	6	323237	323242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593943
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6230	NC_022579	ACC	2	6	323346	323351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593943
6231	NC_022579	T	6	6	323400	323405	0 %	100 %	0 %	0 %	551593943
6232	NC_022579	GGTTC	2	10	323416	323425	0 %	40 %	40 %	20 %	551593943
6233	NC_022579	GCTC	2	8	323509	323516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6234	NC_022579	T	10	10	323518	323527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6235	NC_022579	TCAT	2	8	323532	323539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6236	NC_022579	ATGA	2	8	323579	323586	50 %	25 %	25 %	0 %	551593944
6237	NC_022579	AGA	2	6	323600	323605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593944
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6239	NC_022579	ATT	2	6	323663	323668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593944
6240	NC_022579	GTT	2	6	323731	323736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593944
6241	NC_022579	CAAAA	2	10	323871	323880	80 %	0 %	0 %	20 %	551593945
6242	NC_022579	GGC	2	6	323881	323886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593945
6243	NC_022579	TCA	2	6	324009	324014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6245	NC_022579	AAGG	2	8	324113	324120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6495	NC_022579	TAA	2	6	336878	336883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593958
6496	NC_022579	TGAAA	2	10	336893	336902	60 %	20 %	20 %	0 %	551593959
6497	NC_022579	GGA	2	6	336914	336919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593959
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6499	NC_022579	GGAC	2	8	337067	337074	25 %	0 %	50 %	25 %	551593959
6500	NC_022579	GTT	2	6	337080	337085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593959

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