MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022579	ACTTG	2	10	235648	235657	20 %	40 %	20 %	20 %	551593837
4502	NC_022579	AAT	2	6	235678	235683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593837
4503	NC_022579	TAA	2	6	235849	235854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593837
4504	NC_022579	ACA	2	6	235883	235888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593837
4505	NC_022579	TGA	2	6	235906	235911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593837
4506	NC_022579	AATGG	2	10	235929	235938	40 %	20 %	40 %	0 %	551593837
4507	NC_022579	TA	3	6	235979	235984	50 %	50 %	0 %	0 %	551593837
4508	NC_022579	TCTTT	2	10	236001	236010	0 %	80 %	0 %	20 %	551593837
4509	NC_022579	TTG	2	6	236011	236016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593837
4510	NC_022579	T	6	6	236017	236022	0 %	100 %	0 %	0 %	551593837
4511	NC_022579	T	8	8	236057	236064	0 %	100 %	0 %	0 %	551593837
4512	NC_022579	GAA	2	6	236122	236127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593837
4513	NC_022579	CAG	2	6	236223	236228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593837
4514	NC_022579	T	6	6	236251	236256	0 %	100 %	0 %	0 %	551593837
4515	NC_022579	TAC	2	6	236284	236289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593837
4516	NC_022579	TGG	2	6	236311	236316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593837
4517	NC_022579	GGC	2	6	236503	236508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593837
4518	NC_022579	CCG	2	6	236523	236528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593837
4519	NC_022579	CTTG	2	8	236635	236642	0 %	50 %	25 %	25 %	551593837
4520	NC_022579	CAAA	2	8	236650	236657	75 %	0 %	0 %	25 %	551593837
4521	NC_022579	CCG	2	6	236674	236679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593837
4522	NC_022579	TAA	2	6	236778	236783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593838
4523	NC_022579	GAT	2	6	236794	236799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593838
4524	NC_022579	CGG	2	6	236803	236808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593838
4525	NC_022579	GGC	2	6	236811	236816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593838
4526	NC_022579	AAT	2	6	236851	236856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593838
4527	NC_022579	GAT	2	6	236862	236867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593838
4528	NC_022579	A	6	6	236880	236885	100 %	0 %	0 %	0 %	551593838
4529	NC_022579	TGA	2	6	236991	236996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593838
4530	NC_022579	AGC	2	6	237003	237008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593838
4531	NC_022579	AAT	2	6	237068	237073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593838
4532	NC_022579	TCC	2	6	237087	237092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593839
4533	NC_022579	CAA	2	6	237115	237120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593839
4534	NC_022579	GGT	2	6	237139	237144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593839
4535	NC_022579	TCC	2	6	237149	237154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593839
4536	NC_022579	ATGA	2	8	237206	237213	50 %	25 %	25 %	0 %	551593839
4537	NC_022579	GAA	2	6	237335	237340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593839
4538	NC_022579	GCA	2	6	237491	237496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593839
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4540	NC_022579	GC	3	6	237614	237619	0 %	0 %	50 %	50 %	551593839
4541	NC_022579	TAA	2	6	237664	237669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593839
4542	NC_022579	CAT	2	6	237760	237765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593839
4543	NC_022579	TCTG	2	8	237805	237812	0 %	50 %	25 %	25 %	551593839
4544	NC_022579	AACGAA	2	12	237839	237850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	551593839
4545	NC_022579	CTGT	2	8	237929	237936	0 %	50 %	25 %	25 %	551593839
4546	NC_022579	CGC	2	6	237938	237943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593839
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4548	NC_022579	CA	3	6	238203	238208	50 %	0 %	0 %	50 %	551593839
4549	NC_022579	TTA	2	6	238219	238224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593839
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4551	NC_022579	A	6	6	238289	238294	100 %	0 %	0 %	0 %	551593840
4552	NC_022579	AAG	2	6	238298	238303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593840
4553	NC_022579	TTG	2	6	238314	238319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593840
4554	NC_022579	CTGT	2	8	238367	238374	0 %	50 %	25 %	25 %	551593840
4555	NC_022579	CGG	2	6	238396	238401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593840
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4557	NC_022579	GGT	2	6	238498	238503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593840
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4561	NC_022579	TAA	2	6	238812	238817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593841
4562	NC_022579	GGT	2	6	238842	238847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593841
4563	NC_022579	GAA	2	6	238954	238959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593841
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4570	NC_022579	TCA	2	6	239227	239232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593842
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4572	NC_022579	TCCA	2	8	239282	239289	25 %	25 %	0 %	50 %	551593842
4573	NC_022579	A	8	8	239299	239306	100 %	0 %	0 %	0 %	551593842
4574	NC_022579	CA	3	6	239309	239314	50 %	0 %	0 %	50 %	551593842
4575	NC_022579	AGT	2	6	239381	239386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
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4577	NC_022579	TGCA	2	8	239500	239507	25 %	25 %	25 %	25 %	551593844
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4579	NC_022579	A	6	6	239619	239624	100 %	0 %	0 %	0 %	551593844
4580	NC_022579	ATG	2	6	239645	239650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
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4582	NC_022579	GGC	2	6	239692	239697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593844
4583	NC_022579	GCA	2	6	239730	239735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593844
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4588	NC_022579	ATC	2	6	240018	240023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593844
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4590	NC_022579	TAATG	2	10	240061	240070	40 %	40 %	20 %	0 %	551593844
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4593	NC_022579	GCT	2	6	240167	240172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593844
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4595	NC_022579	GAAA	2	8	240225	240232	75 %	0 %	25 %	0 %	551593844
4596	NC_022579	GAT	2	6	240293	240298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
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4600	NC_022579	AGAA	2	8	240483	240490	75 %	0 %	25 %	0 %	551593844
4601	NC_022579	ACT	2	6	240509	240514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593844
4602	NC_022579	GCAA	2	8	240515	240522	50 %	0 %	25 %	25 %	551593844
4603	NC_022579	TGA	2	6	240531	240536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
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4605	NC_022579	TGC	2	6	240598	240603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593844
4606	NC_022579	GAA	2	6	240647	240652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593844
4607	NC_022579	CTAA	2	8	240662	240669	50 %	25 %	0 %	25 %	551593844
4608	NC_022579	TTC	2	6	240786	240791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593844
4609	NC_022579	GTTGG	2	10	240820	240829	0 %	40 %	60 %	0 %	551593844
4610	NC_022579	G	6	6	240922	240927	0 %	0 %	100 %	0 %	551593844
4611	NC_022579	GCC	2	6	240962	240967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593844
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4614	NC_022579	T	6	6	241117	241122	0 %	100 %	0 %	0 %	551593844
4615	NC_022579	GAT	2	6	241133	241138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
4616	NC_022579	GAGGAA	2	12	241139	241150	50 %	0 %	50 %	0 %	551593844
4617	NC_022579	A	7	7	241170	241176	100 %	0 %	0 %	0 %	551593844
4618	NC_022579	A	6	6	241184	241189	100 %	0 %	0 %	0 %	551593844
4619	NC_022579	GTT	2	6	241196	241201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593844
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4623	NC_022579	ATA	2	6	241359	241364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593844
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4861	NC_022579	CG	3	6	255147	255152	0 %	0 %	50 %	50 %	551593862
4862	NC_022579	T	7	7	255304	255310	0 %	100 %	0 %	0 %	551593862
4863	NC_022579	AGGC	2	8	255365	255372	25 %	0 %	50 %	25 %	551593862
4864	NC_022579	GC	3	6	255413	255418	0 %	0 %	50 %	50 %	551593863
4865	NC_022579	TTC	2	6	255461	255466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593863
4866	NC_022579	CAA	2	6	255541	255546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4867	NC_022579	GTC	3	9	255585	255593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4868	NC_022579	TGCCG	2	10	255613	255622	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4869	NC_022579	GAA	2	6	255628	255633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4870	NC_022579	AAATA	2	10	255665	255674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4871	NC_022579	GTTC	2	8	255685	255692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4999	NC_022579	AGA	2	6	262515	262520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593868
5000	NC_022579	ATGG	2	8	262530	262537	25 %	25 %	50 %	0 %	551593868

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