MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 90159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022444	GTG	2	6	147628	147633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640494
3502	NC_022444	CGG	2	6	147657	147662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640494
3503	NC_022444	ATT	2	6	147683	147688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545640494
3504	NC_022444	AAG	2	6	147739	147744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640494
3505	NC_022444	CGGGA	2	10	147805	147814	20 %	0 %	60 %	20 %	545640494
3506	NC_022444	CGG	2	6	147871	147876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640494
3507	NC_022444	CTG	2	6	147880	147885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3508	NC_022444	GCG	2	6	147890	147895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640494
3509	NC_022444	TCC	2	6	147904	147909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640494
3510	NC_022444	GCT	2	6	147966	147971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3511	NC_022444	TGC	2	6	147995	148000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3512	NC_022444	CCGG	2	8	148008	148015	0 %	0 %	50 %	50 %	545640494
3513	NC_022444	TGG	2	6	148091	148096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640494
3514	NC_022444	A	6	6	148147	148152	100 %	0 %	0 %	0 %	545640494
3515	NC_022444	CGGC	2	8	148197	148204	0 %	0 %	50 %	50 %	545640494
3516	NC_022444	GTG	2	6	148219	148224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640494
3517	NC_022444	TGC	2	6	148268	148273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3518	NC_022444	TGGACG	2	12	148322	148333	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545640494
3519	NC_022444	CGGCC	2	10	148344	148353	0 %	0 %	40 %	60 %	545640494
3520	NC_022444	CTG	2	6	148417	148422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3521	NC_022444	GCC	2	6	148468	148473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640494
3522	NC_022444	TCC	2	6	148679	148684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640494
3523	NC_022444	CCGG	2	8	148697	148704	0 %	0 %	50 %	50 %	545640494
3524	NC_022444	CCG	2	6	148723	148728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640494
3525	NC_022444	TGC	2	6	148742	148747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3526	NC_022444	GGC	2	6	148750	148755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640494
3527	NC_022444	CGA	2	6	148785	148790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640494
3528	NC_022444	GGGGA	2	10	148926	148935	20 %	0 %	80 %	0 %	545640495
3529	NC_022444	GAA	2	6	148945	148950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640495
3530	NC_022444	GAAG	2	8	148958	148965	50 %	0 %	50 %	0 %	545640495
3531	NC_022444	TCC	2	6	148968	148973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640495
3532	NC_022444	CA	3	6	149031	149036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_022444	ATT	2	6	149127	149132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_022444	GCC	2	6	149139	149144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_022444	CGG	2	6	149153	149158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_022444	CT	3	6	149189	149194	0 %	50 %	0 %	50 %	545640496
3537	NC_022444	CTG	2	6	149210	149215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640496
3538	NC_022444	GCC	2	6	149217	149222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640496
3539	NC_022444	CCAG	2	8	149229	149236	25 %	0 %	25 %	50 %	545640496
3540	NC_022444	ACT	2	6	149247	149252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640496
3541	NC_022444	CCAG	2	8	149287	149294	25 %	0 %	25 %	50 %	545640496
3542	NC_022444	CCG	2	6	149296	149301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640496
3543	NC_022444	TGG	2	6	149313	149318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640496
3544	NC_022444	GC	3	6	149366	149371	0 %	0 %	50 %	50 %	545640496
3545	NC_022444	GTG	2	6	149390	149395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640496
3546	NC_022444	CGG	2	6	149424	149429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640496
3547	NC_022444	ATC	2	6	149436	149441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640496
3548	NC_022444	GAT	2	6	149474	149479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640496
3549	NC_022444	CCA	2	6	149505	149510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640496
3550	NC_022444	CGC	2	6	149530	149535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640496
3551	NC_022444	CAC	2	6	149560	149565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640496
3552	NC_022444	GCC	2	6	149591	149596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640496
3553	NC_022444	CCA	2	6	149620	149625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640496
3554	NC_022444	GAA	2	6	149678	149683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640496
3555	NC_022444	CGAG	2	8	149728	149735	25 %	0 %	50 %	25 %	545640496
3556	NC_022444	CAC	2	6	149747	149752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640496
3557	NC_022444	TTC	2	6	149777	149782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640496
3558	NC_022444	GCC	2	6	149819	149824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640496
3559	NC_022444	CGA	2	6	149860	149865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640496
3560	NC_022444	CCG	2	6	149890	149895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640496
3561	NC_022444	ACG	3	9	149913	149921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640496
3562	NC_022444	CG	3	6	149953	149958	0 %	0 %	50 %	50 %	545640496
3563	NC_022444	CGT	2	6	149978	149983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_022444	TGC	2	6	150026	150031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_022444	GC	3	6	150030	150035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_022444	TTTATC	2	12	150079	150090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3567	NC_022444	T	7	7	150099	150105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022444	T	6	6	150123	150128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_022444	CGCC	2	8	150160	150167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3570	NC_022444	C	6	6	150195	150200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3571	NC_022444	GGA	2	6	150218	150223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_022444	CTG	2	6	150358	150363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3573	NC_022444	CAC	2	6	150390	150395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640497
3574	NC_022444	AGG	2	6	150410	150415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545640497
3575	NC_022444	AAC	2	6	150427	150432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640497
3576	NC_022444	GC	4	8	150456	150463	0 %	0 %	50 %	50 %	545640497
3577	NC_022444	GTC	2	6	150516	150521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3578	NC_022444	TC	3	6	150525	150530	0 %	50 %	0 %	50 %	545640497
3579	NC_022444	TCCT	2	8	150550	150557	0 %	50 %	0 %	50 %	545640497
3580	NC_022444	GCCAAG	2	12	150661	150672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3581	NC_022444	AGG	2	6	150707	150712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545640497
3582	NC_022444	CTG	2	6	150713	150718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3583	NC_022444	CCTC	2	8	150740	150747	0 %	25 %	0 %	75 %	545640497
3584	NC_022444	AAC	2	6	150748	150753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640497
3585	NC_022444	TCT	2	6	150881	150886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640497
3586	NC_022444	GCCC	2	8	150917	150924	0 %	0 %	25 %	75 %	545640497
3587	NC_022444	TCG	3	9	150953	150961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3588	NC_022444	CTG	2	6	150976	150981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3589	NC_022444	CGC	2	6	151020	151025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640497
3590	NC_022444	ATC	2	6	151048	151053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640497
3591	NC_022444	TAC	2	6	151105	151110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640497
3592	NC_022444	TGC	2	6	151127	151132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3593	NC_022444	CAA	2	6	151152	151157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640497
3594	NC_022444	GGT	2	6	151197	151202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640497
3595	NC_022444	TGG	2	6	151217	151222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640497
3596	NC_022444	GTG	2	6	151246	151251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640497
3597	NC_022444	GCG	2	6	151304	151309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640497
3598	NC_022444	AAG	2	6	151348	151353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640497
3599	NC_022444	CAT	2	6	151398	151403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640497
3600	NC_022444	TGG	2	6	151406	151411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640497
3601	NC_022444	ATC	2	6	151423	151428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640497
3602	NC_022444	GGC	2	6	151471	151476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640497
3603	NC_022444	GCC	2	6	151543	151548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640497
3604	NC_022444	GAT	2	6	151557	151562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640497
3605	NC_022444	GGCC	2	8	151632	151639	0 %	0 %	50 %	50 %	545640497
3606	NC_022444	TCT	2	6	151712	151717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640497
3607	NC_022444	TCT	2	6	151724	151729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640497
3608	NC_022444	ATG	2	6	151742	151747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640497
3609	NC_022444	CCA	2	6	151757	151762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640497
3610	NC_022444	TGC	2	6	151775	151780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3611	NC_022444	ACT	2	6	151868	151873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640497
3612	NC_022444	GGC	2	6	151879	151884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640497
3613	NC_022444	GCT	2	6	151935	151940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640497
3614	NC_022444	TGT	2	6	152002	152007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_022444	TTCT	2	8	152031	152038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_022444	C	7	7	152059	152065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3617	NC_022444	GAA	2	6	152101	152106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_022444	CGG	2	6	152133	152138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640498
3619	NC_022444	GCT	2	6	152139	152144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640498
3620	NC_022444	TGGC	2	8	152145	152152	0 %	25 %	50 %	25 %	545640498
3621	NC_022444	GCC	2	6	152182	152187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640498
3622	NC_022444	TCG	3	9	152195	152203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640498
3623	NC_022444	AGGCCC	2	12	152231	152242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	545640498
3624	NC_022444	CCAA	2	8	152276	152283	50 %	0 %	0 %	50 %	545640498
3625	NC_022444	TAT	2	6	152287	152292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545640498
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3627	NC_022444	GAT	2	6	152414	152419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_022444	G	6	6	152423	152428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_022444	CGG	2	6	152429	152434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_022444	CTA	2	6	152478	152483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_022444	GCC	2	6	152595	152600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3634	NC_022444	GCT	2	6	152670	152675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3636	NC_022444	GCA	2	6	152700	152705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3639	NC_022444	GC	3	6	152762	152767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3640	NC_022444	CTG	2	6	152782	152787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3642	NC_022444	GAG	2	6	152836	152841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3681	NC_022444	GTA	2	6	154676	154681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3685	NC_022444	GCAC	2	8	154775	154782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3686	NC_022444	ATC	2	6	154809	154814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3688	NC_022444	TTG	2	6	154827	154832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3733	NC_022444	CGA	2	6	156486	156491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640502
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3740	NC_022444	CAT	2	6	156708	156713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640502
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3872	NC_022444	GTT	2	6	161431	161436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545640508
3873	NC_022444	GTA	2	6	161437	161442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640508
3874	NC_022444	GCC	2	6	161458	161463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640508
3875	NC_022444	GCG	3	9	161484	161492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640508
3876	NC_022444	CCAGC	2	10	161514	161523	20 %	0 %	20 %	60 %	545640508
3877	NC_022444	GCC	2	6	161596	161601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640508
3878	NC_022444	CGCC	2	8	161637	161644	0 %	0 %	25 %	75 %	545640508
3879	NC_022444	GCG	2	6	161675	161680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640508
3880	NC_022444	GCA	2	6	161685	161690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640508
3881	NC_022444	CGC	2	6	161803	161808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640508
3882	NC_022444	CCA	2	6	161882	161887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640508
3883	NC_022444	CAGCGC	2	12	161893	161904	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	545640508
3884	NC_022444	GCA	2	6	161994	161999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640508
3885	NC_022444	GGC	2	6	162052	162057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640508
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3887	NC_022444	CCA	2	6	162081	162086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640508
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3889	NC_022444	GC	3	6	162139	162144	0 %	0 %	50 %	50 %	545640508
3890	NC_022444	CAC	2	6	162217	162222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640508
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3892	NC_022444	CGA	2	6	162378	162383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640508
3893	NC_022444	GCA	2	6	162444	162449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640508
3894	NC_022444	GC	4	8	162484	162491	0 %	0 %	50 %	50 %	545640508
3895	NC_022444	GCC	2	6	162576	162581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640508
3896	NC_022444	TCCAGG	2	12	162628	162639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545640509
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3898	NC_022444	TCA	2	6	162707	162712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640509
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3902	NC_022444	GCC	2	6	162828	162833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640509
3903	NC_022444	GCA	2	6	162893	162898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640509
3904	NC_022444	TCA	2	6	162901	162906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640509
3905	NC_022444	GGC	2	6	163077	163082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640509
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3907	NC_022444	CGGG	2	8	163142	163149	0 %	0 %	75 %	25 %	545640509
3908	NC_022444	CCG	2	6	163169	163174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640509
3909	NC_022444	GTC	2	6	163190	163195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640509
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3912	NC_022444	CTGTT	2	10	163365	163374	0 %	60 %	20 %	20 %	545640509
3913	NC_022444	GCT	2	6	163409	163414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640509
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3915	NC_022444	G	6	6	163480	163485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3916	NC_022444	G	6	6	163489	163494	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3917	NC_022444	C	6	6	163500	163505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3918	NC_022444	CAGC	2	8	163539	163546	25 %	0 %	25 %	50 %	545640510
3919	NC_022444	GC	3	6	163545	163550	0 %	0 %	50 %	50 %	545640510
3920	NC_022444	GC	3	6	163614	163619	0 %	0 %	50 %	50 %	545640510
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3930	NC_022444	CCGTGG	2	12	163998	164009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545640510
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3933	NC_022444	G	6	6	164152	164157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3934	NC_022444	C	6	6	164163	164168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3935	NC_022444	GAAA	2	8	164170	164177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3936	NC_022444	CATTCC	2	12	164196	164207	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545640511
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3950	NC_022444	CGA	2	6	164818	164823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640511
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3952	NC_022444	GCC	2	6	164841	164846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640511
3953	NC_022444	TGG	2	6	164884	164889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640511
3954	NC_022444	CGT	3	9	164911	164919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640511
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3957	NC_022444	TGA	2	6	165223	165228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640511
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3971	NC_022444	CAGA	3	12	165838	165849	50 %	0 %	25 %	25 %	545640511
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3977	NC_022444	GTGG	2	8	166073	166080	0 %	25 %	75 %	0 %	545640511
3978	NC_022444	GCG	2	6	166097	166102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640511
3979	NC_022444	CTC	2	6	166120	166125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3980	NC_022444	GCA	2	6	166146	166151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3981	NC_022444	CG	3	6	166179	166184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3982	NC_022444	CCTTG	2	10	166227	166236	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3983	NC_022444	GAC	2	6	166294	166299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3984	NC_022444	GGTT	2	8	166367	166374	0 %	50 %	50 %	0 %	545640512
3985	NC_022444	GCA	2	6	166397	166402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640512
3986	NC_022444	TGCGG	2	10	166429	166438	0 %	20 %	60 %	20 %	545640512
3987	NC_022444	GCCG	2	8	166467	166474	0 %	0 %	50 %	50 %	545640512
3988	NC_022444	CA	3	6	166506	166511	50 %	0 %	0 %	50 %	545640512
3989	NC_022444	CCG	2	6	166558	166563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640512
3990	NC_022444	CCGTGG	2	12	166580	166591	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545640512
3991	NC_022444	CCA	2	6	166613	166618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640512
3992	NC_022444	GCA	2	6	166637	166642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640512
3993	NC_022444	TGA	2	6	166652	166657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640512
3994	NC_022444	CCG	2	6	166666	166671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640512
3995	NC_022444	AGCC	2	8	166695	166702	25 %	0 %	25 %	50 %	545640512
3996	NC_022444	CAG	2	6	166734	166739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640512
3997	NC_022444	CAC	2	6	166794	166799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640512
3998	NC_022444	GGC	2	6	166800	166805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640512
3999	NC_022444	CAG	2	6	166833	166838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640512
4000	NC_022444	CGG	3	9	166898	166906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640512

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