MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 2523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	436839711
2	NC_020055	TTCTT	2	10	1351	1360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020055	GAATA	2	10	2687	2696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020055	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	436839715
5	NC_020055	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	436839716
6	NC_020055	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	436839718
7	NC_020055	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	436839718
8	NC_020055	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	436839718
9	NC_020055	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	436839719
10	NC_020055	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	436839720
11	NC_020055	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	436839720
12	NC_020055	TACCT	2	10	8495	8504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020055	TGAAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020055	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	436839721
15	NC_020055	TGATA	2	10	9258	9267	40 %	40 %	20 %	0 %	436839722
16	NC_020055	GCAAA	2	10	11836	11845	60 %	0 %	20 %	20 %	436839726
17	NC_020055	AAGTG	2	10	13664	13673	40 %	20 %	40 %	0 %	436839728
18	NC_020055	GAAAG	2	10	13985	13994	60 %	0 %	40 %	0 %	436839729
19	NC_020055	AGGAT	2	10	14058	14067	40 %	20 %	40 %	0 %	436839729
20	NC_020055	ATTTT	2	10	17744	17753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020055	ATAAA	2	10	24872	24881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020055	AAATT	2	10	27868	27877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020055	TGTTT	2	10	28513	28522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020055	TTCTC	2	10	29425	29434	0 %	60 %	0 %	40 %	436839749
25	NC_020055	CATAT	2	10	31013	31022	40 %	40 %	0 %	20 %	436839752
26	NC_020055	GCAGA	2	10	31352	31361	40 %	0 %	40 %	20 %	436839752
27	NC_020055	AGAGG	2	10	36143	36152	40 %	0 %	60 %	0 %	436839756
28	NC_020055	GCTGT	2	10	37825	37834	0 %	40 %	40 %	20 %	436839757
29	NC_020055	CATGT	2	10	38652	38661	20 %	40 %	20 %	20 %	436839758
30	NC_020055	CAGTG	2	10	39315	39324	20 %	20 %	40 %	20 %	436839758
31	NC_020055	TTCTG	2	10	40449	40458	0 %	60 %	20 %	20 %	436839759
32	NC_020055	ATGGA	2	10	41358	41367	40 %	20 %	40 %	0 %	436839760
33	NC_020055	CAATC	2	10	42064	42073	40 %	20 %	0 %	40 %	436839760
34	NC_020055	AAATT	2	10	42402	42411	60 %	40 %	0 %	0 %	436839760
35	NC_020055	TCCTC	2	10	45248	45257	0 %	40 %	0 %	60 %	436839763
36	NC_020055	GTTGC	2	10	46319	46328	0 %	40 %	40 %	20 %	436839764
37	NC_020055	ATTTG	2	10	46405	46414	20 %	60 %	20 %	0 %	436839764
38	NC_020055	TTATC	2	10	49191	49200	20 %	60 %	0 %	20 %	436839766
39	NC_020055	CTGAG	2	10	50628	50637	20 %	20 %	40 %	20 %	436839768
40	NC_020055	ACTGT	2	10	50985	50994	20 %	40 %	20 %	20 %	436839768
41	NC_020055	AAATG	2	10	51940	51949	60 %	20 %	20 %	0 %	436839769
42	NC_020055	CTGCA	2	10	55648	55657	20 %	20 %	20 %	40 %	436839776
43	NC_020055	TGCCT	2	10	56785	56794	0 %	40 %	20 %	40 %	436839777
44	NC_020055	TTTGC	2	10	59405	59414	0 %	60 %	20 %	20 %	436839779
45	NC_020055	CAGCG	2	10	62525	62534	20 %	0 %	40 %	40 %	436839780
46	NC_020055	ATAAG	2	10	67883	67892	60 %	20 %	20 %	0 %	436839784
47	NC_020055	TGTTT	2	10	69809	69818	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020055	TGAAG	2	10	81629	81638	40 %	20 %	40 %	0 %	436839794
49	NC_020055	CTGTA	2	10	82358	82367	20 %	40 %	20 %	20 %	436839795
50	NC_020055	ATACT	2	10	82849	82858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020055	GTAAA	2	10	82907	82916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020055	AATGC	2	10	85811	85820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020055	GGAAA	2	10	86498	86507	60 %	0 %	40 %	0 %	436839797
54	NC_020055	AGGTC	2	10	89324	89333	20 %	20 %	40 %	20 %	436839801
55	NC_020055	ATATT	2	10	89884	89893	40 %	60 %	0 %	0 %	436839802
56	NC_020055	AGAAT	2	10	91297	91306	60 %	20 %	20 %	0 %	436839802
57	NC_020055	GGCTC	2	10	91310	91319	0 %	20 %	40 %	40 %	436839802
58	NC_020055	GCAGG	2	10	92301	92310	20 %	0 %	60 %	20 %	436839804
59	NC_020055	GACCG	2	10	93488	93497	20 %	0 %	40 %	40 %	436839804
60	NC_020055	GTTTT	2	10	94352	94361	0 %	80 %	20 %	0 %	436839805
61	NC_020055	TTTCA	2	10	94549	94558	20 %	60 %	0 %	20 %	436839805
62	NC_020055	ACTGA	2	10	96359	96368	40 %	20 %	20 %	20 %	436839806
63	NC_020055	ACTGG	2	10	97191	97200	20 %	20 %	40 %	20 %	436839807
64	NC_020055	TGAAC	2	10	98355	98364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020055	TCGAA	2	10	98727	98736	40 %	20 %	20 %	20 %	436839809
66	NC_020055	CTTTA	2	10	105227	105236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020055	AAATT	2	10	106613	106622	60 %	40 %	0 %	0 %	436839818
68	NC_020055	GAATT	2	10	110563	110572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020055	TAATG	2	10	110857	110866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020055	TCTTT	2	10	110872	110881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020055	TGCAT	2	10	113124	113133	20 %	40 %	20 %	20 %	436839824
72	NC_020055	TCTGC	2	10	115282	115291	0 %	40 %	20 %	40 %	436839826
73	NC_020055	TAAAT	2	10	118117	118126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020055	GTTTT	2	10	118956	118965	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020055	AAATT	2	10	119733	119742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020055	TAAAA	2	10	120678	120687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020055	CGCTG	2	10	120919	120928	0 %	20 %	40 %	40 %	436839837
78	NC_020055	GTTCA	2	10	121218	121227	20 %	40 %	20 %	20 %	436839839
79	NC_020055	CAGTG	2	10	121320	121329	20 %	20 %	40 %	20 %	436839839
80	NC_020055	TTCCT	2	10	121340	121349	0 %	60 %	0 %	40 %	436839839
81	NC_020055	ACATC	2	10	121766	121775	40 %	20 %	0 %	40 %	436839839
82	NC_020055	CTGAT	2	10	125434	125443	20 %	40 %	20 %	20 %	436839843
83	NC_020055	TTTTG	2	10	128759	128768	0 %	80 %	20 %	0 %	436839846
84	NC_020055	AGGTC	2	10	130524	130533	20 %	20 %	40 %	20 %	436839848
85	NC_020055	GGAAA	2	10	131506	131515	60 %	0 %	40 %	0 %	436839848
86	NC_020055	TTCAT	2	10	133017	133026	20 %	60 %	0 %	20 %	436839849
87	NC_020055	GCATC	2	10	133544	133553	20 %	20 %	20 %	40 %	436839850
88	NC_020055	GGGCT	2	10	134645	134654	0 %	20 %	60 %	20 %	436839851
89	NC_020055	CTTTT	2	10	134841	134850	0 %	80 %	0 %	20 %	436839851
90	NC_020055	TTGAG	2	10	134917	134926	20 %	40 %	40 %	0 %	436839851
91	NC_020055	AATCA	2	10	135640	135649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020055	AGAAT	2	10	136656	136665	60 %	20 %	20 %	0 %	436839853
93	NC_020055	GTGAA	2	10	136671	136680	40 %	20 %	40 %	0 %	436839853
94	NC_020055	TTACT	2	10	138165	138174	20 %	60 %	0 %	20 %	436839853
95	NC_020055	CTGGT	2	10	138789	138798	0 %	40 %	40 %	20 %	436839855
96	NC_020055	CCGGC	2	10	139468	139477	0 %	0 %	40 %	60 %	436839856
97	NC_020055	ATTTT	2	10	140184	140193	20 %	80 %	0 %	0 %	436839856
98	NC_020055	CCTGC	2	10	140220	140229	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_020055	TTCGG	2	10	141109	141118	0 %	40 %	40 %	20 %	436839859
100	NC_020055	GCATG	2	10	141242	141251	20 %	20 %	40 %	20 %	436839859
101	NC_020055	TTTCA	2	10	142857	142866	20 %	60 %	0 %	20 %	436839859
102	NC_020055	TGGTT	2	10	143500	143509	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020055	ATCCC	2	10	144186	144195	20 %	20 %	0 %	60 %	436839860
104	NC_020055	GCGTA	2	10	148291	148300	20 %	20 %	40 %	20 %	436839862
105	NC_020055	TTTCC	2	10	150088	150097	0 %	60 %	0 %	40 %	436839865
106	NC_020055	CAATA	2	10	151840	151849	60 %	20 %	0 %	20 %	436839866
107	NC_020055	GCTTC	2	10	153544	153553	0 %	40 %	20 %	40 %	436839866
108	NC_020055	TTCTT	2	10	154051	154060	0 %	80 %	0 %	20 %	436839868
109	NC_020055	TTCCA	2	10	155499	155508	20 %	40 %	0 %	40 %	436839868
110	NC_020055	TTTTG	2	10	155659	155668	0 %	80 %	20 %	0 %	436839868
111	NC_020055	GCTCG	2	10	156447	156456	0 %	20 %	40 %	40 %	436839869
112	NC_020055	TGATC	2	10	157572	157581	20 %	40 %	20 %	20 %	436839869
113	NC_020055	AAAAG	2	10	157583	157592	80 %	0 %	20 %	0 %	436839869
114	NC_020055	CCAGA	2	10	160011	160020	40 %	0 %	20 %	40 %	436839871
115	NC_020055	GTACT	2	10	160808	160817	20 %	40 %	20 %	20 %	436839871
116	NC_020055	GTTGC	2	10	161073	161082	0 %	40 %	40 %	20 %	436839872
117	NC_020055	CTTGC	2	10	161379	161388	0 %	40 %	20 %	40 %	436839872
118	NC_020055	GCAAG	2	10	162825	162834	40 %	0 %	40 %	20 %	436839873
119	NC_020055	ATTTC	2	10	163499	163508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020055	GAAAA	2	10	163638	163647	80 %	0 %	20 %	0 %	436839874
121	NC_020055	GCGGG	2	10	165464	165473	0 %	0 %	80 %	20 %	436839877
122	NC_020055	TCCTG	2	10	168469	168478	0 %	40 %	20 %	40 %	436839879
123	NC_020055	GGGGA	2	10	168678	168687	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020055	GGCAA	2	10	169137	169146	40 %	0 %	40 %	20 %	436839880
125	NC_020055	TCAGA	2	10	169472	169481	40 %	20 %	20 %	20 %	436839880
126	NC_020055	AAATT	2	10	169801	169810	60 %	40 %	0 %	0 %	436839880
127	NC_020055	AGATA	2	10	173280	173289	60 %	20 %	20 %	0 %	436839884
128	NC_020055	GGCTT	2	10	173483	173492	0 %	40 %	40 %	20 %	436839885
129	NC_020055	AGTGC	2	10	173982	173991	20 %	20 %	40 %	20 %	436839886
130	NC_020055	CAGGC	2	10	175049	175058	20 %	0 %	40 %	40 %	436839886
131	NC_020055	GGATT	2	10	175198	175207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020055	AATTC	2	10	176858	176867	40 %	40 %	0 %	20 %	436839887
133	NC_020055	TTTTC	2	10	178161	178170	0 %	80 %	0 %	20 %	436839888
134	NC_020055	TCAGA	2	10	178571	178580	40 %	20 %	20 %	20 %	436839889
135	NC_020055	CAGGT	2	10	180915	180924	20 %	20 %	40 %	20 %	436839893
136	NC_020055	TTATT	2	10	182488	182497	20 %	80 %	0 %	0 %	436839896
137	NC_020055	TTGTT	2	10	183146	183155	0 %	80 %	20 %	0 %	436839896
138	NC_020055	CAGCG	2	10	184072	184081	20 %	0 %	40 %	40 %	436839899
139	NC_020055	CAGCC	2	10	187260	187269	20 %	0 %	20 %	60 %	436839900
140	NC_020055	TTTGT	2	10	187416	187425	0 %	80 %	20 %	0 %	436839900
141	NC_020055	TAATG	2	10	187481	187490	40 %	40 %	20 %	0 %	436839900
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159	NC_020055	ATTAT	2	10	213195	213204	40 %	60 %	0 %	0 %	436839920
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250	NC_020055	ATTAT	2	10	335940	335949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_020055	CCGCA	2	10	336439	336448	20 %	0 %	20 %	60 %	436840074
252	NC_020055	TGAAA	2	10	336893	336902	60 %	20 %	20 %	0 %	436840075
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262	NC_020055	CTGGG	2	10	349093	349102	0 %	20 %	60 %	20 %	436840087
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267	NC_020055	GTAAT	2	10	357304	357313	40 %	40 %	20 %	0 %	436840094
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269	NC_020055	AAAAC	2	10	365408	365417	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
270	NC_020055	AAAGA	2	10	365958	365967	80 %	0 %	20 %	0 %	436840103
271	NC_020055	GCAAT	2	10	366367	366376	40 %	20 %	20 %	20 %	436840103
272	NC_020055	TTTAT	2	10	366598	366607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_020055	AATTT	2	10	366665	366674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020055	TTGCT	2	10	367046	367055	0 %	60 %	20 %	20 %	436840104
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283	NC_020055	TTCCC	2	10	377061	377070	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
284	NC_020055	GCAAA	2	10	378158	378167	60 %	0 %	20 %	20 %	436840111
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302	NC_020055	TTTTC	2	10	408236	408245	0 %	80 %	0 %	20 %	436840134
303	NC_020055	AACCC	2	10	409060	409069	40 %	0 %	0 %	60 %	436840135
304	NC_020055	GAGCT	2	10	409808	409817	20 %	20 %	40 %	20 %	436840136
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312	NC_020055	TTTTC	2	10	424656	424665	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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331	NC_020055	AATTT	2	10	451520	451529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_020055	TCCGG	2	10	452074	452083	0 %	20 %	40 %	40 %	436840174
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369	NC_020055	CGCTG	2	10	500335	500344	0 %	20 %	40 %	40 %	436840208
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371	NC_020055	CCATG	2	10	502403	502412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
372	NC_020055	ACTTC	2	10	504913	504922	20 %	40 %	0 %	40 %	436840214
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377	NC_020055	CTGGG	2	10	514894	514903	0 %	20 %	60 %	20 %	436840221
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383	NC_020055	CTCAC	2	10	526916	526925	20 %	20 %	0 %	60 %	436840231
384	NC_020055	ATCTG	2	10	528659	528668	20 %	40 %	20 %	20 %	436840233
385	NC_020055	AACCA	2	10	530369	530378	60 %	0 %	0 %	40 %	436840234
386	NC_020055	CTGAT	2	10	530566	530575	20 %	40 %	20 %	20 %	436840234
387	NC_020055	CCGGA	2	10	531307	531316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
388	NC_020055	AGGTC	2	10	531886	531895	20 %	20 %	40 %	20 %	436840235
389	NC_020055	GGCAC	2	10	534149	534158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
390	NC_020055	GAAAA	2	10	534215	534224	80 %	0 %	20 %	0 %	436840237
391	NC_020055	CGGAC	2	10	536040	536049	20 %	0 %	40 %	40 %	436840240
392	NC_020055	CTGCG	2	10	538053	538062	0 %	20 %	40 %	40 %	436840241
393	NC_020055	GAAGT	2	10	538580	538589	40 %	20 %	40 %	0 %	436840241
394	NC_020055	CAACC	2	10	539325	539334	40 %	0 %	0 %	60 %	436840242
395	NC_020055	TGATG	2	10	541128	541137	20 %	40 %	40 %	0 %	436840244
396	NC_020055	AATTA	2	10	542711	542720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_020055	GGATG	2	10	545015	545024	20 %	20 %	60 %	0 %	436840249
398	NC_020055	ATTCA	2	10	546836	546845	40 %	40 %	0 %	20 %	436840251
399	NC_020055	TTTAA	2	10	548867	548876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_020055	AATTT	2	10	550215	550224	40 %	60 %	0 %	0 %	436840254
401	NC_020055	CGGAA	2	10	555128	555137	40 %	0 %	40 %	20 %	436840260
402	NC_020055	TTAGT	2	10	555713	555722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
403	NC_020055	TGACC	2	10	559262	559271	20 %	20 %	20 %	40 %	436840264
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