MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020055	CAG	2	6	208436	208441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839915
4002	NC_020055	CAT	2	6	208490	208495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839915
4003	NC_020055	GCC	2	6	208496	208501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839915
4004	NC_020055	GCT	2	6	208506	208511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839915
4005	NC_020055	CAT	2	6	208526	208531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839915
4006	NC_020055	ATTA	2	8	208622	208629	50 %	50 %	0 %	0 %	436839915
4007	NC_020055	T	7	7	208675	208681	0 %	100 %	0 %	0 %	436839915
4008	NC_020055	TTTC	2	8	208753	208760	0 %	75 %	0 %	25 %	436839915
4009	NC_020055	TTC	2	6	208772	208777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839915
4010	NC_020055	TTC	2	6	208805	208810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839915
4011	NC_020055	AAC	2	6	208850	208855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839915
4012	NC_020055	TTC	2	6	208919	208924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839915
4013	NC_020055	A	6	6	208934	208939	100 %	0 %	0 %	0 %	436839915
4014	NC_020055	GAT	2	6	208967	208972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839915
4015	NC_020055	AT	3	6	208989	208994	50 %	50 %	0 %	0 %	436839915
4016	NC_020055	T	6	6	209057	209062	0 %	100 %	0 %	0 %	436839915
4017	NC_020055	T	7	7	209182	209188	0 %	100 %	0 %	0 %	436839915
4018	NC_020055	TGT	2	6	209233	209238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839915
4019	NC_020055	CATGCC	2	12	209252	209263	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436839915
4020	NC_020055	CTC	2	6	209345	209350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839915
4021	NC_020055	TTC	2	6	209372	209377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839915
4022	NC_020055	CT	3	6	209387	209392	0 %	50 %	0 %	50 %	436839915
4023	NC_020055	TAG	2	6	209404	209409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839915
4024	NC_020055	GAG	2	6	209482	209487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839916
4025	NC_020055	GGCAG	2	10	209544	209553	20 %	0 %	60 %	20 %	436839916
4026	NC_020055	T	7	7	209562	209568	0 %	100 %	0 %	0 %	436839916
4027	NC_020055	T	8	8	209605	209612	0 %	100 %	0 %	0 %	436839916
4028	NC_020055	TGG	2	6	209679	209684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839916
4029	NC_020055	GAA	2	6	209840	209845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839916
4030	NC_020055	A	9	9	209915	209923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020055	TAA	2	6	209969	209974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020055	GCA	2	6	209985	209990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020055	GAA	2	6	210028	210033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020055	ATG	2	6	210128	210133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020055	T	8	8	210186	210193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020055	GAG	2	6	210194	210199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_020055	TGA	2	6	210271	210276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839917
4038	NC_020055	TGA	2	6	210325	210330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839917
4039	NC_020055	CCG	2	6	210338	210343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839917
4040	NC_020055	GAT	2	6	210359	210364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839917
4041	NC_020055	TGC	2	6	210391	210396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839917
4042	NC_020055	GAA	2	6	210398	210403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839917
4043	NC_020055	GTT	2	6	210458	210463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839917
4044	NC_020055	A	6	6	210479	210484	100 %	0 %	0 %	0 %	436839917
4045	NC_020055	TGT	3	9	210577	210585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839917
4046	NC_020055	CGG	2	6	210622	210627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839917
4047	NC_020055	AGC	2	6	210667	210672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839917
4048	NC_020055	TCTTGA	2	12	210733	210744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436839917
4049	NC_020055	AGC	2	6	210745	210750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839917
4050	NC_020055	GTT	2	6	210761	210766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839917
4051	NC_020055	ACA	2	6	210774	210779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839917
4052	NC_020055	CTG	2	6	211053	211058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839918
4053	NC_020055	CGG	2	6	211078	211083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839918
4054	NC_020055	CTC	2	6	211113	211118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839918
4055	NC_020055	TTTG	2	8	211169	211176	0 %	75 %	25 %	0 %	436839918
4056	NC_020055	GATCA	2	10	211293	211302	40 %	20 %	20 %	20 %	436839918
4057	NC_020055	A	6	6	211331	211336	100 %	0 %	0 %	0 %	436839918
4058	NC_020055	TCA	2	6	211339	211344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839918
4059	NC_020055	CAGG	2	8	211355	211362	25 %	0 %	50 %	25 %	436839918
4060	NC_020055	TGA	2	6	211388	211393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839918
4061	NC_020055	TG	3	6	211395	211400	0 %	50 %	50 %	0 %	436839918
4062	NC_020055	CTT	2	6	211411	211416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839918
4063	NC_020055	GCTGGT	2	12	211439	211450	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436839918
4064	NC_020055	T	8	8	211450	211457	0 %	100 %	0 %	0 %	436839918
4065	NC_020055	CGG	2	6	211478	211483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839918
4066	NC_020055	CGC	2	6	211567	211572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839918
4067	NC_020055	TTG	2	6	211575	211580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839918
4068	NC_020055	TTTA	2	8	211590	211597	25 %	75 %	0 %	0 %	436839918
4069	NC_020055	TGCC	2	8	211606	211613	0 %	25 %	25 %	50 %	436839918
4070	NC_020055	CGCT	2	8	211633	211640	0 %	25 %	25 %	50 %	436839918
4071	NC_020055	GCT	3	9	211638	211646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839918
4072	NC_020055	AGA	2	6	211715	211720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839918
4073	NC_020055	TCA	2	6	211840	211845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839918
4074	NC_020055	CCA	2	6	211864	211869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839918
4075	NC_020055	GC	3	6	211889	211894	0 %	0 %	50 %	50 %	436839918
4076	NC_020055	CAGAT	2	10	211897	211906	40 %	20 %	20 %	20 %	436839918
4077	NC_020055	GCT	2	6	211944	211949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839918
4078	NC_020055	ATCT	2	8	211953	211960	25 %	50 %	0 %	25 %	436839918
4079	NC_020055	CTTT	2	8	211981	211988	0 %	75 %	0 %	25 %	436839918
4080	NC_020055	GTC	2	6	212061	212066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839919
4081	NC_020055	AAG	2	6	212067	212072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839919
4082	NC_020055	GTG	2	6	212119	212124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839919
4083	NC_020055	CTT	2	6	212214	212219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839919
4084	NC_020055	AGA	2	6	212278	212283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839919
4085	NC_020055	CAG	2	6	212322	212327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839919
4086	NC_020055	AGA	2	6	212425	212430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839919
4087	NC_020055	AGC	2	6	212497	212502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839919
4088	NC_020055	GAT	2	6	212540	212545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839919
4089	NC_020055	GAC	2	6	212622	212627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839919
4090	NC_020055	T	6	6	212739	212744	0 %	100 %	0 %	0 %	436839919
4091	NC_020055	TTTA	2	8	212807	212814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020055	CTTTT	2	10	212852	212861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_020055	GT	3	6	212900	212905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020055	ATA	2	6	212921	212926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839920
4095	NC_020055	TTA	2	6	212973	212978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839920
4096	NC_020055	GCTT	2	8	213025	213032	0 %	50 %	25 %	25 %	436839920
4097	NC_020055	GTA	2	6	213108	213113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839920
4098	NC_020055	GGT	2	6	213157	213162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839920
4099	NC_020055	ATTAT	2	10	213195	213204	40 %	60 %	0 %	0 %	436839920
4100	NC_020055	TGC	2	6	213238	213243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839920
4101	NC_020055	T	6	6	213245	213250	0 %	100 %	0 %	0 %	436839920
4102	NC_020055	GCT	2	6	213272	213277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839920
4103	NC_020055	CGG	2	6	213279	213284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839920
4104	NC_020055	CTG	2	6	213308	213313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839920
4105	NC_020055	T	6	6	213399	213404	0 %	100 %	0 %	0 %	436839920
4106	NC_020055	CTGA	2	8	213458	213465	25 %	25 %	25 %	25 %	436839920
4107	NC_020055	ATT	2	6	213474	213479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839920
4108	NC_020055	GTA	2	6	213504	213509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839920
4109	NC_020055	TGA	2	6	213529	213534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839920
4110	NC_020055	GCG	2	6	213562	213567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839920
4111	NC_020055	TGT	2	6	213673	213678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839920
4112	NC_020055	GTC	2	6	213693	213698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839920
4113	NC_020055	T	6	6	213720	213725	0 %	100 %	0 %	0 %	436839920
4114	NC_020055	TGT	2	6	213769	213774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839920
4115	NC_020055	AG	3	6	213860	213865	50 %	0 %	50 %	0 %	436839920
4116	NC_020055	TGA	2	6	213907	213912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839920
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4118	NC_020055	A	6	6	214035	214040	100 %	0 %	0 %	0 %	436839921
4119	NC_020055	ATTTC	2	10	214059	214068	20 %	60 %	0 %	20 %	436839921
4120	NC_020055	AGC	2	6	214112	214117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839921
4121	NC_020055	TCA	2	6	214168	214173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839921
4122	NC_020055	TCGG	2	8	214182	214189	0 %	25 %	50 %	25 %	436839921
4123	NC_020055	CAT	2	6	214240	214245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839921
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4125	NC_020055	CTGTAG	2	12	214369	214380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436839921
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4240	NC_020055	T	6	6	220374	220379	0 %	100 %	0 %	0 %	436839926
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4245	NC_020055	TAA	2	6	220606	220611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_020055	ACT	2	6	220629	220634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_020055	A	8	8	220688	220695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_020055	CAC	2	6	220717	220722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4249	NC_020055	GCA	2	6	220783	220788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_020055	CTTT	2	8	220812	220819	0 %	75 %	0 %	25 %	436839927
4251	NC_020055	GAC	2	6	220824	220829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839927
4252	NC_020055	ACC	2	6	220830	220835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839927
4253	NC_020055	CAG	2	6	220990	220995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839927
4254	NC_020055	CAC	2	6	221031	221036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_020055	CAT	2	6	221126	221131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_020055	CAA	2	6	221179	221184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_020055	A	6	6	221192	221197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_020055	GGA	2	6	221212	221217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_020055	CGC	2	6	221232	221237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839928
4260	NC_020055	CAG	2	6	221350	221355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839928
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4262	NC_020055	CAT	2	6	221459	221464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839928
4263	NC_020055	AT	3	6	221532	221537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_020055	TTAA	2	8	221548	221555	50 %	50 %	0 %	0 %	436839929
4265	NC_020055	AAGC	2	8	221569	221576	50 %	0 %	25 %	25 %	436839929
4266	NC_020055	TCA	2	6	221701	221706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839929
4267	NC_020055	CTT	2	6	221741	221746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_020055	ATT	2	6	221771	221776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_020055	AAT	2	6	221813	221818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_020055	ACG	2	6	221844	221849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839930
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4273	NC_020055	GGC	2	6	221946	221951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839930
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4276	NC_020055	AG	3	6	222038	222043	50 %	0 %	50 %	0 %	436839930
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4281	NC_020055	AAGG	2	8	222327	222334	50 %	0 %	50 %	0 %	436839930
4282	NC_020055	TTC	2	6	222406	222411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839930
4283	NC_020055	TAT	2	6	222453	222458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839930
4284	NC_020055	GCT	2	6	222513	222518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839930
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4286	NC_020055	CCG	2	6	222587	222592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839930
4287	NC_020055	ATGT	2	8	222651	222658	25 %	50 %	25 %	0 %	436839930
4288	NC_020055	TTG	2	6	222706	222711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839930
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4302	NC_020055	GCATAG	2	12	223702	223713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436839930
4303	NC_020055	GGC	2	6	223737	223742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839930
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4309	NC_020055	CAAA	2	8	223913	223920	75 %	0 %	0 %	25 %	436839930
4310	NC_020055	TG	3	6	223921	223926	0 %	50 %	50 %	0 %	436839930
4311	NC_020055	AGG	2	6	223963	223968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4312	NC_020055	CA	3	6	223986	223991	50 %	0 %	0 %	50 %	436839931
4313	NC_020055	ACTGA	2	10	224021	224030	40 %	20 %	20 %	20 %	436839931
4314	NC_020055	GT	3	6	224073	224078	0 %	50 %	50 %	0 %	436839931
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4317	NC_020055	GA	3	6	224322	224327	50 %	0 %	50 %	0 %	436839931
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4325	NC_020055	GCA	2	6	224775	224780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839932
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4331	NC_020055	TGA	2	6	225359	225364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839933
4332	NC_020055	AGC	2	6	225479	225484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839933
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4334	NC_020055	CAA	2	6	225629	225634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839933
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4336	NC_020055	TGAG	2	8	225648	225655	25 %	25 %	50 %	0 %	436839934
4337	NC_020055	ACA	2	6	225672	225677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839934
4338	NC_020055	ACAG	2	8	225722	225729	50 %	0 %	25 %	25 %	436839934
4339	NC_020055	GCA	2	6	225762	225767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839934
4340	NC_020055	CCTG	2	8	225793	225800	0 %	25 %	25 %	50 %	436839934
4341	NC_020055	GCT	2	6	225824	225829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839934
4342	NC_020055	AGC	2	6	225943	225948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4346	NC_020055	AGC	2	6	226218	226223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839935
4347	NC_020055	CTGA	2	8	226229	226236	25 %	25 %	25 %	25 %	436839936
4348	NC_020055	TGC	2	6	226260	226265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839936
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4350	NC_020055	TCA	2	6	226356	226361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839936
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4352	NC_020055	CA	3	6	226401	226406	50 %	0 %	0 %	50 %	436839936
4353	NC_020055	AGC	2	6	226557	226562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839936
4354	NC_020055	CAT	3	9	226629	226637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839937
4355	NC_020055	GCC	2	6	226639	226644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839937
4356	NC_020055	GTT	2	6	226645	226650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839937
4357	NC_020055	GAG	2	6	226700	226705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839937
4358	NC_020055	AT	3	6	226723	226728	50 %	50 %	0 %	0 %	436839937
4359	NC_020055	GACC	2	8	226744	226751	25 %	0 %	25 %	50 %	436839937
4360	NC_020055	GAAT	2	8	226836	226843	50 %	25 %	25 %	0 %	436839937
4361	NC_020055	GCT	2	6	226873	226878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839937
4362	NC_020055	GGTT	2	8	226938	226945	0 %	50 %	50 %	0 %	436839937
4363	NC_020055	AGC	2	6	226953	226958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839937
4364	NC_020055	TTTCC	2	10	227157	227166	0 %	60 %	0 %	40 %	436839938
4365	NC_020055	A	6	6	227209	227214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_020055	TCT	2	6	227272	227277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839939
4367	NC_020055	TGA	2	6	227281	227286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839939
4368	NC_020055	CAG	2	6	227306	227311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839939
4369	NC_020055	TAA	2	6	227332	227337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839939
4370	NC_020055	ATA	2	6	227349	227354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839939
4371	NC_020055	AGT	2	6	227455	227460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839939
4372	NC_020055	CAGA	2	8	227491	227498	50 %	0 %	25 %	25 %	436839939
4373	NC_020055	T	6	6	227499	227504	0 %	100 %	0 %	0 %	436839939
4374	NC_020055	TTG	2	6	227523	227528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839939
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4378	NC_020055	GTT	2	6	227923	227928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_020055	CTTT	2	8	228008	228015	0 %	75 %	0 %	25 %	436839940
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4496	NC_020055	AT	3	6	235149	235154	50 %	50 %	0 %	0 %	436839953
4497	NC_020055	TTGG	2	8	235422	235429	0 %	50 %	50 %	0 %	436839953
4498	NC_020055	CAACAG	2	12	235440	235451	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	436839953
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