MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

< Previous12345678910111213...144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2041	NC_020055	GA	3	6	105194	105199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_020055	CTTTA	2	10	105227	105236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2124	NC_020055	ATA	2	6	109617	109622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839821
2125	NC_020055	AGG	2	6	109725	109730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839821
2126	NC_020055	ATT	2	6	109863	109868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839822
2127	NC_020055	ACA	2	6	109902	109907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839822
2128	NC_020055	TA	3	6	109954	109959	50 %	50 %	0 %	0 %	436839822
2129	NC_020055	AGA	2	6	110111	110116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839822
2130	NC_020055	CGC	2	6	110157	110162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839822
2131	NC_020055	AGC	2	6	110194	110199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839822
2132	NC_020055	TGA	2	6	110252	110257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839822
2133	NC_020055	TTA	2	6	110281	110286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839822
2134	NC_020055	A	7	7	110310	110316	100 %	0 %	0 %	0 %	436839822
2135	NC_020055	CAA	2	6	110318	110323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839822
2136	NC_020055	ATA	2	6	110415	110420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839822
2137	NC_020055	CAG	2	6	110429	110434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839822
2138	NC_020055	CTG	2	6	110442	110447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839822
2139	NC_020055	GAATT	2	10	110563	110572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_020055	TTG	2	6	110574	110579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_020055	CTG	2	6	110627	110632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_020055	TTG	2	6	110641	110646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_020055	TA	3	6	110729	110734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_020055	CTG	2	6	110775	110780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2145	NC_020055	CTG	2	6	110813	110818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_020055	TAATG	2	10	110857	110866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_020055	TCTTT	2	10	110872	110881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2148	NC_020055	ATA	2	6	110885	110890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2149	NC_020055	TTC	2	6	110985	110990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839823
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2151	NC_020055	A	6	6	111176	111181	100 %	0 %	0 %	0 %	436839823
2152	NC_020055	TAT	2	6	111310	111315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839823
2153	NC_020055	GAA	2	6	111416	111421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839823
2154	NC_020055	CTG	2	6	111458	111463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839823
2155	NC_020055	GTT	2	6	111464	111469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839823
2156	NC_020055	GAA	2	6	111473	111478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839823
2157	NC_020055	A	6	6	111524	111529	100 %	0 %	0 %	0 %	436839823
2158	NC_020055	CAA	2	6	111540	111545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839823
2159	NC_020055	GCA	2	6	111575	111580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839823
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2161	NC_020055	CAC	2	6	111826	111831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839823
2162	NC_020055	AGC	2	6	111880	111885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839823
2163	NC_020055	TGT	2	6	111949	111954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839823
2164	NC_020055	ATG	2	6	111986	111991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839823
2165	NC_020055	GAA	2	6	112093	112098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839823
2166	NC_020055	CAA	2	6	112132	112137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839823
2167	NC_020055	TTG	2	6	112155	112160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839823
2168	NC_020055	ATC	2	6	112205	112210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839823
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2170	NC_020055	GCC	2	6	112295	112300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839823
2171	NC_020055	AAAG	2	8	112307	112314	75 %	0 %	25 %	0 %	436839823
2172	NC_020055	ATC	2	6	112331	112336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839823
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2175	NC_020055	GTC	2	6	112382	112387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2176	NC_020055	GCA	2	6	112390	112395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839824
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2179	NC_020055	CGG	2	6	112549	112554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839824
2180	NC_020055	CTG	2	6	112601	112606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839824
2181	NC_020055	GGC	2	6	112667	112672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839824
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2183	NC_020055	TAC	2	6	112834	112839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839824
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2185	NC_020055	TGA	2	6	112867	112872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839824
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2188	NC_020055	CGG	2	6	113065	113070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839824
2189	NC_020055	TGT	2	6	113083	113088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839824
2190	NC_020055	CTG	2	6	113096	113101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839824
2191	NC_020055	TGCAT	2	10	113124	113133	20 %	40 %	20 %	20 %	436839824
2192	NC_020055	TTG	2	6	113136	113141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839824
2193	NC_020055	TGC	2	6	113151	113156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839824
2194	NC_020055	TGA	2	6	113170	113175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839824
2195	NC_020055	TGAATC	2	12	113386	113397	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436839824
2196	NC_020055	CAG	2	6	113412	113417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839824
2197	NC_020055	CAC	2	6	113429	113434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839824
2198	NC_020055	GAA	2	6	113453	113458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839824
2199	NC_020055	TCCCGG	2	12	113566	113577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	436839824
2200	NC_020055	GAA	2	6	113609	113614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839824
2201	NC_020055	ATGC	2	8	113660	113667	25 %	25 %	25 %	25 %	436839824
2202	NC_020055	CTG	2	6	113708	113713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839824
2203	NC_020055	GTT	2	6	113885	113890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839824
2204	NC_020055	TCC	2	6	113900	113905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839824
2205	NC_020055	GCC	2	6	113908	113913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839824
2206	NC_020055	T	9	9	114083	114091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2207	NC_020055	ATA	2	6	114110	114115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839825
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2209	NC_020055	A	7	7	114232	114238	100 %	0 %	0 %	0 %	436839825
2210	NC_020055	ATG	2	6	114245	114250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839825
2211	NC_020055	CTG	3	9	114278	114286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839825
2212	NC_020055	GAAA	2	8	114292	114299	75 %	0 %	25 %	0 %	436839825
2213	NC_020055	A	6	6	114334	114339	100 %	0 %	0 %	0 %	436839825
2214	NC_020055	GCAGAA	2	12	114340	114351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	436839825
2215	NC_020055	GCTGAA	2	12	114373	114384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436839825
2216	NC_020055	AAGAGA	2	12	114496	114507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839826
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2219	NC_020055	GAC	2	6	114645	114650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839826
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2221	NC_020055	GAT	3	9	114663	114671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2222	NC_020055	TTG	2	6	114823	114828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839826
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2226	NC_020055	GAT	2	6	114995	115000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2227	NC_020055	GTA	2	6	115059	115064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2228	NC_020055	T	6	6	115083	115088	0 %	100 %	0 %	0 %	436839826
2229	NC_020055	TGA	2	6	115100	115105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2230	NC_020055	ATT	3	9	115157	115165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839826
2231	NC_020055	GCA	2	6	115246	115251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839826
2232	NC_020055	TCTGC	2	10	115282	115291	0 %	40 %	20 %	40 %	436839826
2233	NC_020055	CCG	2	6	115302	115307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839826
2234	NC_020055	A	6	6	115410	115415	100 %	0 %	0 %	0 %	436839826
2235	NC_020055	GAT	2	6	115446	115451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2236	NC_020055	CGG	2	6	115463	115468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839826
2237	NC_020055	GAGG	2	8	115497	115504	25 %	0 %	75 %	0 %	436839826
2238	NC_020055	TGA	2	6	115514	115519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2239	NC_020055	GCT	2	6	115533	115538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839826
2240	NC_020055	ATG	2	6	115558	115563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
2241	NC_020055	A	6	6	115574	115579	100 %	0 %	0 %	0 %	436839826
2242	NC_020055	ACG	2	6	115615	115620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839826
2243	NC_020055	AG	3	6	115668	115673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_020055	TAC	2	6	115710	115715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839827
2245	NC_020055	TGA	2	6	115811	115816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839827
2246	NC_020055	TGATCT	2	12	115833	115844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436839827
2247	NC_020055	CAT	2	6	115876	115881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839827
2248	NC_020055	A	6	6	115939	115944	100 %	0 %	0 %	0 %	436839827
2249	NC_020055	TTG	2	6	115991	115996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839827
2250	NC_020055	GTG	2	6	115999	116004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839827
2251	NC_020055	ATG	2	6	116036	116041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839827
2252	NC_020055	ATT	2	6	116059	116064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839827
2253	NC_020055	TCA	2	6	116163	116168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839827
2254	NC_020055	CTGT	2	8	116218	116225	0 %	50 %	25 %	25 %	436839827
2255	NC_020055	CCTA	2	8	116238	116245	25 %	25 %	0 %	50 %	436839827
2256	NC_020055	GGC	2	6	116322	116327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839828
2257	NC_020055	CTATTG	2	12	116374	116385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436839828
2258	NC_020055	AGGA	2	8	116440	116447	50 %	0 %	50 %	0 %	436839828
2259	NC_020055	AAG	2	6	116457	116462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839828
2260	NC_020055	GCA	2	6	116471	116476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839828
2261	NC_020055	TGA	2	6	116480	116485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839828
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2267	NC_020055	T	6	6	117000	117005	0 %	100 %	0 %	0 %	436839829
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2272	NC_020055	ATC	2	6	117407	117412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839829
2273	NC_020055	CAG	2	6	117424	117429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839829
2274	NC_020055	TGC	2	6	117502	117507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839829
2275	NC_020055	CGG	2	6	117508	117513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839829
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2277	NC_020055	GAT	2	6	117676	117681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2278	NC_020055	CT	3	6	117708	117713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2279	NC_020055	CCT	2	6	117717	117722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2280	NC_020055	AAATGC	2	12	117865	117876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436839830
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2282	NC_020055	TAA	2	6	117924	117929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839830
2283	NC_020055	GTC	2	6	117976	117981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2284	NC_020055	T	7	7	118018	118024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_020055	TAAAT	2	10	118117	118126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2286	NC_020055	ATT	2	6	118263	118268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_020055	AGGG	2	8	118453	118460	25 %	0 %	75 %	0 %	436839831
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2293	NC_020055	A	7	7	118904	118910	100 %	0 %	0 %	0 %	436839833
2294	NC_020055	GTTTT	2	10	118956	118965	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2295	NC_020055	AATA	2	8	118979	118986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2305	NC_020055	AAATT	2	10	119733	119742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2306	NC_020055	A	7	7	119748	119754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2312	NC_020055	TAAA	2	8	120064	120071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2324	NC_020055	GC	3	6	120719	120724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2325	NC_020055	T	6	6	120792	120797	0 %	100 %	0 %	0 %	436839837
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2333	NC_020055	ATA	2	6	121035	121040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2352	NC_020055	T	6	6	121935	121940	0 %	100 %	0 %	0 %	436839839
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2354	NC_020055	TTAG	2	8	122103	122110	25 %	50 %	25 %	0 %	436839840
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2365	NC_020055	A	7	7	122538	122544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2490	NC_020055	TCTT	2	8	129419	129426	0 %	75 %	0 %	25 %	436839847
2491	NC_020055	TGC	2	6	129466	129471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839847
2492	NC_020055	T	6	6	129497	129502	0 %	100 %	0 %	0 %	436839847
2493	NC_020055	TCAAGA	2	12	129636	129647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436839847
2494	NC_020055	CGC	2	6	129661	129666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839847
2495	NC_020055	AATT	2	8	129755	129762	50 %	50 %	0 %	0 %	436839847
2496	NC_020055	ATT	2	6	129807	129812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839847
2497	NC_020055	CA	3	6	129844	129849	50 %	0 %	0 %	50 %	436839847
2498	NC_020055	AGG	2	6	129881	129886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839848
2499	NC_020055	TCA	2	6	129905	129910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839848
2500	NC_020055	CTTTCC	2	12	130008	130019	0 %	50 %	0 %	50 %	436839848

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