MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019793	GCC	2	6	222070	222075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217910
5002	NC_019793	GCG	2	6	222104	222109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217910
5003	NC_019793	CAAC	2	8	222121	222128	50 %	0 %	0 %	50 %	429217910
5004	NC_019793	GCT	2	6	222129	222134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217910
5005	NC_019793	GGTA	2	8	222153	222160	25 %	25 %	50 %	0 %	429217910
5006	NC_019793	GC	3	6	222169	222174	0 %	0 %	50 %	50 %	429217910
5007	NC_019793	CG	3	6	222211	222216	0 %	0 %	50 %	50 %	429217910
5008	NC_019793	GCA	2	6	222234	222239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217910
5009	NC_019793	TGGT	2	8	222290	222297	0 %	50 %	50 %	0 %	429217910
5010	NC_019793	GT	3	6	222310	222315	0 %	50 %	50 %	0 %	429217910
5011	NC_019793	TCC	2	6	222391	222396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_019793	CAT	2	6	222442	222447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_019793	AGGAA	2	10	222449	222458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_019793	CCT	2	6	222473	222478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_019793	TTCAG	2	10	222488	222497	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_019793	AGTGC	2	10	222511	222520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5017	NC_019793	GTG	2	6	222561	222566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217911
5018	NC_019793	GGC	2	6	222581	222586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217911
5019	NC_019793	GGC	2	6	222620	222625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217911
5020	NC_019793	CAC	2	6	222668	222673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217911
5021	NC_019793	CTG	2	6	222728	222733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217911
5022	NC_019793	CT	3	6	222952	222957	0 %	50 %	0 %	50 %	429217911
5023	NC_019793	TCG	2	6	222990	222995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217911
5024	NC_019793	A	6	6	223062	223067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019793	ACCGC	2	10	223128	223137	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5026	NC_019793	TTC	2	6	223153	223158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_019793	AGG	2	6	223159	223164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019793	GAAA	2	8	223189	223196	75 %	0 %	25 %	0 %	429217912
5029	NC_019793	TCAAGG	2	12	223197	223208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429217912
5030	NC_019793	GC	3	6	223332	223337	0 %	0 %	50 %	50 %	429217912
5031	NC_019793	GCC	2	6	223349	223354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217912
5032	NC_019793	GCC	2	6	223364	223369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217912
5033	NC_019793	CTG	2	6	223430	223435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5034	NC_019793	ACCT	2	8	223442	223449	25 %	25 %	0 %	50 %	429217912
5035	NC_019793	GCC	2	6	223457	223462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217912
5036	NC_019793	TGC	2	6	223485	223490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5037	NC_019793	ACC	2	6	223499	223504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217912
5038	NC_019793	CGA	2	6	223531	223536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5039	NC_019793	GC	3	6	223539	223544	0 %	0 %	50 %	50 %	429217912
5040	NC_019793	TAC	2	6	223604	223609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217912
5041	NC_019793	TGC	2	6	223638	223643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5042	NC_019793	GCG	2	6	223647	223652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217912
5043	NC_019793	GTC	2	6	223679	223684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5044	NC_019793	CGG	2	6	223687	223692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217912
5045	NC_019793	GC	3	6	223739	223744	0 %	0 %	50 %	50 %	429217912
5046	NC_019793	CGA	2	6	223786	223791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5047	NC_019793	TTC	2	6	223796	223801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217912
5048	NC_019793	GCC	2	6	223803	223808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217912
5049	NC_019793	CAC	2	6	223810	223815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217912
5050	NC_019793	ATG	2	6	223817	223822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217912
5051	NC_019793	CG	3	6	223841	223846	0 %	0 %	50 %	50 %	429217912
5052	NC_019793	CGG	2	6	223873	223878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217912
5053	NC_019793	CG	3	6	223917	223922	0 %	0 %	50 %	50 %	429217912
5054	NC_019793	CCA	2	6	224004	224009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217912
5055	NC_019793	ACG	2	6	224013	224018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5056	NC_019793	GTG	2	6	224042	224047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217912
5057	NC_019793	GC	3	6	224162	224167	0 %	0 %	50 %	50 %	429217912
5058	NC_019793	AGC	2	6	224246	224251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217912
5059	NC_019793	AGA	2	6	224296	224301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_019793	CTG	2	6	224330	224335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_019793	CTG	2	6	224350	224355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_019793	CGT	2	6	224384	224389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_019793	GGC	2	6	224424	224429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_019793	GAC	2	6	224469	224474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_019793	CAC	2	6	224520	224525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217913
5066	NC_019793	TGC	2	6	224538	224543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217913
5067	NC_019793	GCGCT	2	10	224545	224554	0 %	20 %	40 %	40 %	429217913
5068	NC_019793	GCT	2	6	224568	224573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217913
5069	NC_019793	GCCG	2	8	224574	224581	0 %	0 %	50 %	50 %	429217913
5070	NC_019793	GCT	2	6	224628	224633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217913
5071	NC_019793	CCG	2	6	224717	224722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217913
5072	NC_019793	GAT	2	6	224751	224756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217913
5073	NC_019793	GACC	2	8	224766	224773	25 %	0 %	25 %	50 %	429217913
5074	NC_019793	AGC	2	6	224837	224842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217913
5075	NC_019793	T	6	6	224847	224852	0 %	100 %	0 %	0 %	429217913
5076	NC_019793	CTG	2	6	224896	224901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217913
5077	NC_019793	TC	3	6	224922	224927	0 %	50 %	0 %	50 %	429217913
5078	NC_019793	GCC	2	6	224949	224954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217913
5079	NC_019793	ACCG	2	8	225042	225049	25 %	0 %	25 %	50 %	429217913
5080	NC_019793	ACG	2	6	225074	225079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217913
5081	NC_019793	TCGC	2	8	225181	225188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_019793	GACT	2	8	225198	225205	25 %	25 %	25 %	25 %	429217914
5083	NC_019793	AGGC	2	8	225211	225218	25 %	0 %	50 %	25 %	429217914
5084	NC_019793	GGGC	2	8	225222	225229	0 %	0 %	75 %	25 %	429217914
5085	NC_019793	TCC	2	6	225230	225235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217914
5086	NC_019793	G	6	6	225250	225255	0 %	0 %	100 %	0 %	429217914
5087	NC_019793	CAG	2	6	225304	225309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217914
5088	NC_019793	GCAT	2	8	225372	225379	25 %	25 %	25 %	25 %	429217914
5089	NC_019793	C	6	6	225518	225523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5090	NC_019793	CATCAC	2	12	225575	225586	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429217915
5091	NC_019793	GGC	2	6	225590	225595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217915
5092	NC_019793	CTCGC	2	10	225597	225606	0 %	20 %	20 %	60 %	429217915
5093	NC_019793	GC	3	6	225692	225697	0 %	0 %	50 %	50 %	429217915
5094	NC_019793	GC	3	6	225702	225707	0 %	0 %	50 %	50 %	429217915
5095	NC_019793	CGA	2	6	225728	225733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217915
5096	NC_019793	CGT	2	6	225758	225763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217915
5097	NC_019793	CG	3	6	225794	225799	0 %	0 %	50 %	50 %	429217915
5098	NC_019793	CGC	2	6	225915	225920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217916
5099	NC_019793	CTGG	2	8	225942	225949	0 %	25 %	50 %	25 %	429217916
5100	NC_019793	GT	3	6	225950	225955	0 %	50 %	50 %	0 %	429217916
5101	NC_019793	AG	3	6	226045	226050	50 %	0 %	50 %	0 %	429217916
5102	NC_019793	GC	3	6	226106	226111	0 %	0 %	50 %	50 %	429217916
5103	NC_019793	TC	3	6	226143	226148	0 %	50 %	0 %	50 %	429217916
5104	NC_019793	GC	3	6	226325	226330	0 %	0 %	50 %	50 %	429217916
5105	NC_019793	GC	3	6	226346	226351	0 %	0 %	50 %	50 %	429217916
5106	NC_019793	GC	3	6	226353	226358	0 %	0 %	50 %	50 %	429217916
5107	NC_019793	GCCC	2	8	226395	226402	0 %	0 %	25 %	75 %	429217916
5108	NC_019793	CGG	2	6	226428	226433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217916
5109	NC_019793	GTAC	2	8	226446	226453	25 %	25 %	25 %	25 %	429217916
5110	NC_019793	CACC	2	8	226499	226506	25 %	0 %	0 %	75 %	429217916
5111	NC_019793	CTG	2	6	226633	226638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217916
5112	NC_019793	CGA	2	6	226689	226694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217916
5113	NC_019793	GCC	2	6	226712	226717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217916
5114	NC_019793	TGC	2	6	226727	226732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217916
5115	NC_019793	GAGC	2	8	226752	226759	25 %	0 %	50 %	25 %	429217916
5116	NC_019793	GCA	2	6	226789	226794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217916
5117	NC_019793	TGG	2	6	226829	226834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217916
5118	NC_019793	CGTAT	2	10	226885	226894	20 %	40 %	20 %	20 %	429217916
5119	NC_019793	CGG	2	6	226896	226901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217916
5120	NC_019793	ATC	2	6	226969	226974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217916
5121	NC_019793	AAC	2	6	226981	226986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217916
5122	NC_019793	CTG	2	6	226996	227001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217916
5123	NC_019793	GCC	2	6	227002	227007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217916
5124	NC_019793	GCC	2	6	227080	227085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217916
5125	NC_019793	GCT	2	6	227118	227123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217916
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5130	NC_019793	GGT	2	6	227280	227285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217916
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5152	NC_019793	CGA	2	6	228550	228555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217917
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5157	NC_019793	CGT	2	6	228787	228792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217917
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5183	NC_019793	GCCC	2	8	229624	229631	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5218	NC_019793	CTC	2	6	230730	230735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217920
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5234	NC_019793	GTG	2	6	231688	231693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217920
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5242	NC_019793	GGC	2	6	231987	231992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217920
5243	NC_019793	GCA	2	6	232035	232040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217920
5244	NC_019793	GGA	2	6	232056	232061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217920
5245	NC_019793	CTG	3	9	232098	232106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217921
5246	NC_019793	CCG	2	6	232132	232137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217921
5247	NC_019793	GCCCTG	2	12	232179	232190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429217921
5248	NC_019793	GCT	2	6	232265	232270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217921
5249	NC_019793	GCG	2	6	232316	232321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217921
5250	NC_019793	TGC	2	6	232384	232389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217921
5251	NC_019793	CG	3	6	232406	232411	0 %	0 %	50 %	50 %	429217921
5252	NC_019793	CGGGC	2	10	232415	232424	0 %	0 %	60 %	40 %	429217921
5253	NC_019793	CTG	2	6	232431	232436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217921
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5267	NC_019793	GCT	2	6	232829	232834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217921
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5271	NC_019793	CAT	2	6	232946	232951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217921
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5276	NC_019793	CTT	2	6	233337	233342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5277	NC_019793	GTG	2	6	233346	233351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5286	NC_019793	GC	3	6	233560	233565	0 %	0 %	50 %	50 %	429217922
5287	NC_019793	GC	3	6	233567	233572	0 %	0 %	50 %	50 %	429217922
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5311	NC_019793	CTG	2	6	234799	234804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217923
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5321	NC_019793	GAG	2	6	235222	235227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217923
5322	NC_019793	GAG	2	6	235316	235321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217923
5323	NC_019793	CG	4	8	235422	235429	0 %	0 %	50 %	50 %	429217923
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5332	NC_019793	GGT	2	6	235584	235589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217923
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5340	NC_019793	CG	3	6	235961	235966	0 %	0 %	50 %	50 %	429217924
5341	NC_019793	TGGGCG	2	12	235978	235989	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	429217924
5342	NC_019793	GC	3	6	236042	236047	0 %	0 %	50 %	50 %	429217924
5343	NC_019793	GCG	2	6	236065	236070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217924
5344	NC_019793	TGG	3	9	236080	236088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217924
5345	NC_019793	CGA	2	6	236090	236095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217924
5346	NC_019793	GCG	2	6	236170	236175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217924
5347	NC_019793	CGG	3	9	236198	236206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217924
5348	NC_019793	CTG	2	6	236223	236228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217924
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5350	NC_019793	AC	3	6	236348	236353	50 %	0 %	0 %	50 %	429217924
5351	NC_019793	CAC	2	6	236368	236373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217924
5352	NC_019793	GGT	2	6	236384	236389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217924
5353	NC_019793	CTC	2	6	236482	236487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217924
5354	NC_019793	CGA	2	6	236603	236608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217924
5355	NC_019793	GC	5	10	236686	236695	0 %	0 %	50 %	50 %	429217924
5356	NC_019793	GGA	2	6	236696	236701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217924
5357	NC_019793	GCG	2	6	236726	236731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217924
5358	NC_019793	ACTGGA	2	12	236747	236758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429217924
5359	NC_019793	GCT	2	6	236839	236844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217925
5360	NC_019793	GGT	2	6	236896	236901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217925
5361	NC_019793	GGA	2	6	236978	236983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217925
5362	NC_019793	GCC	3	9	236990	236998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217925
5363	NC_019793	TCG	2	6	237019	237024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217925
5364	NC_019793	GC	3	6	237089	237094	0 %	0 %	50 %	50 %	429217925
5365	NC_019793	CAAG	2	8	237097	237104	50 %	0 %	25 %	25 %	429217925
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5488	NC_019793	GCA	2	6	243060	243065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217931
5489	NC_019793	CGT	2	6	243102	243107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217931
5490	NC_019793	GC	3	6	243114	243119	0 %	0 %	50 %	50 %	429217931
5491	NC_019793	ATC	2	6	243251	243256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217931
5492	NC_019793	CCG	2	6	243292	243297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217932
5493	NC_019793	GTC	2	6	243368	243373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217932
5494	NC_019793	CAA	2	6	243419	243424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217932
5495	NC_019793	CAG	2	6	243479	243484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217933
5496	NC_019793	GCGCG	2	10	243525	243534	0 %	0 %	60 %	40 %	429217933
5497	NC_019793	CG	4	8	243531	243538	0 %	0 %	50 %	50 %	429217933
5498	NC_019793	CG	3	6	243559	243564	0 %	0 %	50 %	50 %	429217933
5499	NC_019793	CAC	2	6	243565	243570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217933
5500	NC_019793	GA	3	6	243614	243619	50 %	0 %	50 %	0 %	429217933

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