MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 1698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019790	GAC	2	6	65673	65678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221912
1502	NC_019790	GCG	2	6	65692	65697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221912
1503	NC_019790	AAG	3	9	65713	65721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221912
1504	NC_019790	ACC	2	6	65767	65772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_019790	GAGTT	2	10	65793	65802	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019790	GCG	2	6	65811	65816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_019790	GCTG	2	8	65840	65847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_019790	GCA	2	6	65879	65884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_019790	CCA	3	9	65897	65905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_019790	CAG	2	6	66059	66064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_019790	ACC	2	6	66078	66083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_019790	CCA	3	9	66090	66098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_019790	AGC	2	6	66118	66123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_019790	CTG	2	6	66128	66133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_019790	TCA	2	6	66192	66197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_019790	CGC	2	6	66274	66279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_019790	GCG	2	6	66304	66309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_019790	TGC	2	6	66348	66353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_019790	GCAC	2	8	66376	66383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_019790	TCG	2	6	66474	66479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_019790	GCAC	2	8	66503	66510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_019790	GCA	2	6	66538	66543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019790	GGC	2	6	66560	66565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019790	TCA	2	6	66613	66618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221913
1525	NC_019790	TCC	2	6	66669	66674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221913
1526	NC_019790	AGCG	2	8	66679	66686	25 %	0 %	50 %	25 %	429221913
1527	NC_019790	CTCC	2	8	66718	66725	0 %	25 %	0 %	75 %	429221913
1528	NC_019790	ACG	2	6	66753	66758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221913
1529	NC_019790	ACC	2	6	66805	66810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221914
1530	NC_019790	CACCT	2	10	66849	66858	20 %	20 %	0 %	60 %	429221914
1531	NC_019790	AAC	2	6	66889	66894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221914
1532	NC_019790	CG	3	6	66897	66902	0 %	0 %	50 %	50 %	429221914
1533	NC_019790	GC	3	6	66933	66938	0 %	0 %	50 %	50 %	429221914
1534	NC_019790	AGA	2	6	66944	66949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221914
1535	NC_019790	GTG	2	6	66962	66967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221914
1536	NC_019790	CGA	2	6	66987	66992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221914
1537	NC_019790	GC	3	6	67052	67057	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
1538	NC_019790	TCG	2	6	67092	67097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221915
1539	NC_019790	TGG	2	6	67103	67108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221915
1540	NC_019790	TCC	2	6	67398	67403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221915
1541	NC_019790	GGC	2	6	67408	67413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221915
1542	NC_019790	TCG	2	6	67419	67424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221915
1543	NC_019790	CGG	2	6	67576	67581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221915
1544	NC_019790	CGA	2	6	67600	67605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221915
1545	NC_019790	GC	4	8	67625	67632	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
1546	NC_019790	CCT	2	6	67675	67680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221915
1547	NC_019790	CGA	3	9	67708	67716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221915
1548	NC_019790	GC	3	6	67792	67797	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
1549	NC_019790	CGC	2	6	67915	67920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221915
1550	NC_019790	CGAAAC	2	12	67924	67935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	429221915
1551	NC_019790	CG	3	6	67966	67971	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
1552	NC_019790	CGC	2	6	68052	68057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221915
1553	NC_019790	CAA	2	6	68086	68091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221915
1554	NC_019790	TGC	3	9	68208	68216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221915
1555	NC_019790	GA	3	6	68225	68230	50 %	0 %	50 %	0 %	429221915
1556	NC_019790	TGGCGG	2	12	68349	68360	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	429221915
1557	NC_019790	CGG	2	6	68369	68374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221915
1558	NC_019790	TGGA	2	8	68387	68394	25 %	25 %	50 %	0 %	429221915
1559	NC_019790	TGC	2	6	68427	68432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221915
1560	NC_019790	C	6	6	68459	68464	0 %	0 %	0 %	100 %	429221915
1561	NC_019790	CTG	2	6	68616	68621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_019790	GTT	2	6	68661	68666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019790	TGTGG	2	10	68763	68772	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019790	GC	3	6	68811	68816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_019790	C	8	8	68854	68861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1566	NC_019790	TC	3	6	68929	68934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_019790	TGA	2	6	68943	68948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_019790	AGG	2	6	69031	69036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_019790	CTG	2	6	69167	69172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1570	NC_019790	GTC	2	6	69196	69201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1571	NC_019790	CCA	2	6	69207	69212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221916
1572	NC_019790	TGC	2	6	69309	69314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1573	NC_019790	CCCT	2	8	69341	69348	0 %	25 %	0 %	75 %	429221916
1574	NC_019790	TTG	2	6	69431	69436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221916
1575	NC_019790	GAG	2	6	69518	69523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221916
1576	NC_019790	TCG	2	6	69537	69542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1577	NC_019790	TG	3	6	69567	69572	0 %	50 %	50 %	0 %	429221916
1578	NC_019790	CTG	2	6	69599	69604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1579	NC_019790	CCG	2	6	69700	69705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221916
1580	NC_019790	GC	3	6	69710	69715	0 %	0 %	50 %	50 %	429221916
1581	NC_019790	CGC	2	6	69908	69913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221916
1582	NC_019790	CG	4	8	69943	69950	0 %	0 %	50 %	50 %	429221916
1583	NC_019790	CGTG	2	8	69955	69962	0 %	25 %	50 %	25 %	429221916
1584	NC_019790	TGC	2	6	69969	69974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1585	NC_019790	GAC	2	6	69989	69994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1586	NC_019790	GGA	2	6	70048	70053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221916
1587	NC_019790	GGA	2	6	70069	70074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221916
1588	NC_019790	TGAACG	2	12	70083	70094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429221916
1589	NC_019790	CCT	2	6	70096	70101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221916
1590	NC_019790	GGT	2	6	70120	70125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221916
1591	NC_019790	GCG	2	6	70141	70146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221916
1592	NC_019790	GGC	2	6	70191	70196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221916
1593	NC_019790	CTG	2	6	70225	70230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1594	NC_019790	GGC	2	6	70231	70236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221916
1595	NC_019790	GGC	2	6	70288	70293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221916
1596	NC_019790	TGC	2	6	70359	70364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221916
1597	NC_019790	GTTG	2	8	70365	70372	0 %	50 %	50 %	0 %	429221916
1598	NC_019790	GAA	2	6	70375	70380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221916
1599	NC_019790	GA	3	6	70399	70404	50 %	0 %	50 %	0 %	429221916
1600	NC_019790	ATG	2	6	70493	70498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_019790	AG	3	6	70506	70511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_019790	TGC	2	6	70622	70627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_019790	TC	3	6	70635	70640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_019790	CGT	2	6	70646	70651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_019790	CTA	2	6	70666	70671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_019790	TTC	2	6	70673	70678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_019790	GAA	2	6	70686	70691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019790	ATG	2	6	70896	70901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_019790	GC	3	6	70988	70993	0 %	0 %	50 %	50 %	429221917
1610	NC_019790	GGCA	2	8	71025	71032	25 %	0 %	50 %	25 %	429221917
1611	NC_019790	CAA	2	6	71046	71051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221917
1612	NC_019790	GCG	2	6	71057	71062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221917
1613	NC_019790	CTC	2	6	71071	71076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221917
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1615	NC_019790	GCA	2	6	71142	71147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221917
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1618	NC_019790	ATC	2	6	71470	71475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221917
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1620	NC_019790	CCCA	2	8	71557	71564	25 %	0 %	0 %	75 %	429221917
1621	NC_019790	CG	3	6	71697	71702	0 %	0 %	50 %	50 %	429221917
1622	NC_019790	CG	3	6	71751	71756	0 %	0 %	50 %	50 %	429221917
1623	NC_019790	CA	4	8	71788	71795	50 %	0 %	0 %	50 %	429221917
1624	NC_019790	CAGC	2	8	71863	71870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_019790	CCA	2	6	71929	71934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_019790	GCC	2	6	71996	72001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_019790	CGG	2	6	72055	72060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_019790	CCG	2	6	72168	72173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_019790	CTG	2	6	72232	72237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_019790	CTG	2	6	72279	72284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_019790	AGC	2	6	72330	72335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_019790	CCTC	2	8	72388	72395	0 %	25 %	0 %	75 %	429221918
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.