MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 10858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	TTAA	2	8	605	612	50 %	50 %	0 %	0 %	428778396
2	NC_019780	TGAT	2	8	675	682	25 %	50 %	25 %	0 %	428778396
3	NC_019780	CAAA	2	8	793	800	75 %	0 %	0 %	25 %	428778396
4	NC_019780	CCTA	2	8	1234	1241	25 %	25 %	0 %	50 %	428778396
5	NC_019780	TTGT	2	8	1483	1490	0 %	75 %	25 %	0 %	428778397
6	NC_019780	TAAA	2	8	1494	1501	75 %	25 %	0 %	0 %	428778397
7	NC_019780	TCCA	2	8	1567	1574	25 %	25 %	0 %	50 %	428778397
8	NC_019780	GAAC	2	8	1808	1815	50 %	0 %	25 %	25 %	428778397
9	NC_019780	GTTT	2	8	3091	3098	0 %	75 %	25 %	0 %	428778398
10	NC_019780	AGAA	2	8	3746	3753	75 %	0 %	25 %	0 %	428778400
11	NC_019780	TTCT	2	8	4342	4349	0 %	75 %	0 %	25 %	428778401
12	NC_019780	CTTC	2	8	4600	4607	0 %	50 %	0 %	50 %	428778401
13	NC_019780	AGAA	2	8	4859	4866	75 %	0 %	25 %	0 %	428778401
14	NC_019780	ACTT	2	8	4978	4985	25 %	50 %	0 %	25 %	428778401
15	NC_019780	TGAT	2	8	5406	5413	25 %	50 %	25 %	0 %	428778401
16	NC_019780	ACTA	2	8	5664	5671	50 %	25 %	0 %	25 %	428778402
17	NC_019780	ATAA	2	8	5805	5812	75 %	25 %	0 %	0 %	428778402
18	NC_019780	TTGA	2	8	5877	5884	25 %	50 %	25 %	0 %	428778402
19	NC_019780	TTAA	2	8	6175	6182	50 %	50 %	0 %	0 %	428778402
20	NC_019780	TATT	2	8	6265	6272	25 %	75 %	0 %	0 %	428778402
21	NC_019780	TAAT	2	8	6851	6858	50 %	50 %	0 %	0 %	428778403
22	NC_019780	GACA	2	8	8014	8021	50 %	0 %	25 %	25 %	428778404
23	NC_019780	TAAA	2	8	8473	8480	75 %	25 %	0 %	0 %	428778404
24	NC_019780	GGAT	2	8	8517	8524	25 %	25 %	50 %	0 %	428778404
25	NC_019780	CACC	2	8	9205	9212	25 %	0 %	0 %	75 %	428778404
26	NC_019780	CGAT	2	8	9889	9896	25 %	25 %	25 %	25 %	428778404
27	NC_019780	GTTT	2	8	10128	10135	0 %	75 %	25 %	0 %	428778404
28	NC_019780	CCAG	2	8	10346	10353	25 %	0 %	25 %	50 %	428778405
29	NC_019780	CATA	2	8	10435	10442	50 %	25 %	0 %	25 %	428778405
30	NC_019780	TAAT	2	8	11675	11682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019780	TAAT	2	8	11892	11899	50 %	50 %	0 %	0 %	428778407
32	NC_019780	TAAT	2	8	12210	12217	50 %	50 %	0 %	0 %	428778407
33	NC_019780	ATTG	2	8	12473	12480	25 %	50 %	25 %	0 %	428778407
34	NC_019780	TATG	2	8	12724	12731	25 %	50 %	25 %	0 %	428778407
35	NC_019780	ATAG	2	8	12749	12756	50 %	25 %	25 %	0 %	428778407
36	NC_019780	TTAA	2	8	12838	12845	50 %	50 %	0 %	0 %	428778407
37	NC_019780	ATTT	2	8	13071	13078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019780	CAAT	2	8	13416	13423	50 %	25 %	0 %	25 %	428778408
39	NC_019780	AATC	2	8	13643	13650	50 %	25 %	0 %	25 %	428778408
40	NC_019780	CAAA	2	8	13727	13734	75 %	0 %	0 %	25 %	428778408
41	NC_019780	AGGT	2	8	13945	13952	25 %	25 %	50 %	0 %	428778408
42	NC_019780	GGAA	2	8	13994	14001	50 %	0 %	50 %	0 %	428778408
43	NC_019780	ATGT	2	8	14050	14057	25 %	50 %	25 %	0 %	428778408
44	NC_019780	AGAC	2	8	14226	14233	50 %	0 %	25 %	25 %	428778408
45	NC_019780	AATC	2	8	14651	14658	50 %	25 %	0 %	25 %	428778409
46	NC_019780	TTGA	2	8	14720	14727	25 %	50 %	25 %	0 %	428778409
47	NC_019780	AATT	2	8	15181	15188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019780	AAGG	2	8	15490	15497	50 %	0 %	50 %	0 %	428778411
49	NC_019780	TCGA	2	8	15935	15942	25 %	25 %	25 %	25 %	428778411
50	NC_019780	GCAA	2	8	16113	16120	50 %	0 %	25 %	25 %	428778411
51	NC_019780	ATCG	2	8	16285	16292	25 %	25 %	25 %	25 %	428778411
52	NC_019780	GCCT	2	8	17514	17521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019780	TAAA	2	8	17951	17958	75 %	25 %	0 %	0 %	428778412
54	NC_019780	TTTA	2	8	18552	18559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019780	GGTG	2	8	18809	18816	0 %	25 %	75 %	0 %	428778413
56	NC_019780	TCGA	2	8	19465	19472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019780	GGTT	2	8	19513	19520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019780	GCTT	2	8	20101	20108	0 %	50 %	25 %	25 %	428778415
59	NC_019780	TCAA	2	8	20135	20142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019780	AGAC	2	8	20261	20268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019780	TTAC	2	8	20762	20769	25 %	50 %	0 %	25 %	428778416
62	NC_019780	TCGC	2	8	21065	21072	0 %	25 %	25 %	50 %	428778416
63	NC_019780	GTTG	2	8	21486	21493	0 %	50 %	50 %	0 %	428778416
64	NC_019780	GGAA	2	8	21663	21670	50 %	0 %	50 %	0 %	428778416
65	NC_019780	GGAT	2	8	21758	21765	25 %	25 %	50 %	0 %	428778416
66	NC_019780	CGAT	2	8	21770	21777	25 %	25 %	25 %	25 %	428778416
67	NC_019780	TGAT	2	8	22542	22549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019780	TGAT	2	8	22584	22591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019780	TGAT	2	8	22715	22722	25 %	50 %	25 %	0 %	428778417
70	NC_019780	TCGA	2	8	22876	22883	25 %	25 %	25 %	25 %	428778417
71	NC_019780	CGAT	2	8	23189	23196	25 %	25 %	25 %	25 %	428778417
72	NC_019780	GAAG	2	8	23767	23774	50 %	0 %	50 %	0 %	428778418
73	NC_019780	TGTT	2	8	24067	24074	0 %	75 %	25 %	0 %	428778418
74	NC_019780	TTAA	2	8	24238	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	428778418
75	NC_019780	AATC	2	8	24505	24512	50 %	25 %	0 %	25 %	428778418
76	NC_019780	ATCA	2	8	24867	24874	50 %	25 %	0 %	25 %	428778419
77	NC_019780	ATCA	2	8	24888	24895	50 %	25 %	0 %	25 %	428778419
78	NC_019780	TTCA	2	8	25090	25097	25 %	50 %	0 %	25 %	428778419
79	NC_019780	CTTT	2	8	25208	25215	0 %	75 %	0 %	25 %	428778420
80	NC_019780	GAAA	2	8	25571	25578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019780	CGAT	2	8	25994	26001	25 %	25 %	25 %	25 %	428778421
82	NC_019780	TAAA	2	8	26136	26143	75 %	25 %	0 %	0 %	428778421
83	NC_019780	TCGA	2	8	26685	26692	25 %	25 %	25 %	25 %	428778421
84	NC_019780	TCGA	2	8	26972	26979	25 %	25 %	25 %	25 %	428778421
85	NC_019780	ATCG	2	8	27028	27035	25 %	25 %	25 %	25 %	428778421
86	NC_019780	TCAA	2	8	27840	27847	50 %	25 %	0 %	25 %	428778422
87	NC_019780	TCGA	2	8	29926	29933	25 %	25 %	25 %	25 %	428778424
88	NC_019780	TCGA	2	8	29958	29965	25 %	25 %	25 %	25 %	428778424
89	NC_019780	ATCA	2	8	30156	30163	50 %	25 %	0 %	25 %	428778424
90	NC_019780	ATCG	2	8	30247	30254	25 %	25 %	25 %	25 %	428778424
91	NC_019780	TCGA	2	8	30341	30348	25 %	25 %	25 %	25 %	428778424
92	NC_019780	ATTA	2	8	31563	31570	50 %	50 %	0 %	0 %	428778424
93	NC_019780	TTTC	2	8	31625	31632	0 %	75 %	0 %	25 %	428778424
94	NC_019780	TTGT	2	8	32274	32281	0 %	75 %	25 %	0 %	428778424
95	NC_019780	CACG	2	8	32480	32487	25 %	0 %	25 %	50 %	428778424
96	NC_019780	TAAA	2	8	32654	32661	75 %	25 %	0 %	0 %	428778424
97	NC_019780	ATCG	3	12	33102	33113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019780	ATGA	2	8	33266	33273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019780	ATTA	2	8	33845	33852	50 %	50 %	0 %	0 %	428778426
100	NC_019780	CACC	2	8	34010	34017	25 %	0 %	0 %	75 %	428778426
101	NC_019780	ATTT	2	8	34701	34708	25 %	75 %	0 %	0 %	428778427
102	NC_019780	ATCG	2	8	34912	34919	25 %	25 %	25 %	25 %	428778427
103	NC_019780	GAAT	2	8	34983	34990	50 %	25 %	25 %	0 %	428778427
104	NC_019780	ATTA	2	8	35023	35030	50 %	50 %	0 %	0 %	428778427
105	NC_019780	CTTT	2	8	35336	35343	0 %	75 %	0 %	25 %	428778427
106	NC_019780	CGAT	2	8	35421	35428	25 %	25 %	25 %	25 %	428778427
107	NC_019780	TTTC	2	8	35922	35929	0 %	75 %	0 %	25 %	428778429
108	NC_019780	CGCT	2	8	35985	35992	0 %	25 %	25 %	50 %	428778429
109	NC_019780	AATT	2	8	36803	36810	50 %	50 %	0 %	0 %	428778431
110	NC_019780	GTTC	2	8	37013	37020	0 %	50 %	25 %	25 %	428778431
111	NC_019780	TCGA	2	8	38477	38484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019780	AAAT	2	8	39022	39029	75 %	25 %	0 %	0 %	428778435
113	NC_019780	ATTG	2	8	40437	40444	25 %	50 %	25 %	0 %	428778436
114	NC_019780	GTTT	2	8	40880	40887	0 %	75 %	25 %	0 %	428778436
115	NC_019780	TCGA	2	8	41182	41189	25 %	25 %	25 %	25 %	428778436
116	NC_019780	TTGA	2	8	41671	41678	25 %	50 %	25 %	0 %	428778437
117	NC_019780	ATTA	2	8	41800	41807	50 %	50 %	0 %	0 %	428778437
118	NC_019780	TAAT	2	8	41948	41955	50 %	50 %	0 %	0 %	428778437
119	NC_019780	TTGA	2	8	42168	42175	25 %	50 %	25 %	0 %	428778437
120	NC_019780	CGAT	2	8	42366	42373	25 %	25 %	25 %	25 %	428778438
121	NC_019780	TGGG	2	8	42829	42836	0 %	25 %	75 %	0 %	428778438
122	NC_019780	TGGC	2	8	42930	42937	0 %	25 %	50 %	25 %	428778438
123	NC_019780	AATT	2	8	43005	43012	50 %	50 %	0 %	0 %	428778438
124	NC_019780	ACGC	2	8	43046	43053	25 %	0 %	25 %	50 %	428778438
125	NC_019780	GCCA	2	8	43273	43280	25 %	0 %	25 %	50 %	428778438
126	NC_019780	AAAC	2	8	43671	43678	75 %	0 %	0 %	25 %	428778438
127	NC_019780	GGAA	2	8	43686	43693	50 %	0 %	50 %	0 %	428778438
128	NC_019780	CTTC	2	8	44286	44293	0 %	50 %	0 %	50 %	428778439
129	NC_019780	ATCA	2	8	44774	44781	50 %	25 %	0 %	25 %	428778439
130	NC_019780	GTTG	2	8	45275	45282	0 %	50 %	50 %	0 %	428778439
131	NC_019780	TCCT	2	8	46036	46043	0 %	50 %	0 %	50 %	428778440
132	NC_019780	ATCT	2	8	46135	46142	25 %	50 %	0 %	25 %	428778440
133	NC_019780	TTCT	2	8	46770	46777	0 %	75 %	0 %	25 %	428778441
134	NC_019780	TTAG	2	8	47545	47552	25 %	50 %	25 %	0 %	428778441
135	NC_019780	TCGT	2	8	47685	47692	0 %	50 %	25 %	25 %	428778441
136	NC_019780	TCGA	2	8	47907	47914	25 %	25 %	25 %	25 %	428778441
137	NC_019780	ATCG	2	8	48336	48343	25 %	25 %	25 %	25 %	428778441
138	NC_019780	AAAG	2	8	48943	48950	75 %	0 %	25 %	0 %	428778441
139	NC_019780	AGCA	2	8	49170	49177	50 %	0 %	25 %	25 %	428778441
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141	NC_019780	TCTT	2	8	49789	49796	0 %	75 %	0 %	25 %	428778442
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