MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 2298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018867	AATGA	2	10	550	559	60 %	20 %	20 %	0 %	410659621
2	NC_018867	TTTAT	2	10	1352	1361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018867	GATTT	2	10	1617	1626	20 %	60 %	20 %	0 %	410659622
4	NC_018867	GAAAA	2	10	3964	3973	80 %	0 %	20 %	0 %	410659624
5	NC_018867	CAAAT	2	10	4290	4299	60 %	20 %	0 %	20 %	410659625
6	NC_018867	GAAAA	2	10	7090	7099	80 %	0 %	20 %	0 %	410659626
7	NC_018867	TTCTT	2	10	7910	7919	0 %	80 %	0 %	20 %	410659626
8	NC_018867	TTTCC	2	10	11097	11106	0 %	60 %	0 %	40 %	410659629
9	NC_018867	TTAGA	2	10	11500	11509	40 %	40 %	20 %	0 %	410659629
10	NC_018867	GCGGA	2	10	11838	11847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018867	CGCAC	2	10	12637	12646	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018867	ACATC	2	10	13772	13781	40 %	20 %	0 %	40 %	410659632
13	NC_018867	GAAAA	2	10	14086	14095	80 %	0 %	20 %	0 %	410659632
14	NC_018867	GAAAA	2	10	14596	14605	80 %	0 %	20 %	0 %	410659632
15	NC_018867	CCCAA	2	10	15177	15186	40 %	0 %	0 %	60 %	410659632
16	NC_018867	TCAAG	2	10	16267	16276	40 %	20 %	20 %	20 %	410659633
17	NC_018867	TTCCG	2	10	16375	16384	0 %	40 %	20 %	40 %	410659633
18	NC_018867	GTTAA	2	10	18355	18364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018867	ATGTT	2	10	18429	18438	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018867	ATTTG	2	10	18900	18909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018867	ATAAA	2	10	19518	19527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018867	ATAGA	2	10	21103	21112	60 %	20 %	20 %	0 %	410659638
23	NC_018867	TGTCT	2	10	21194	21203	0 %	60 %	20 %	20 %	410659638
24	NC_018867	GAAAA	2	10	23976	23985	80 %	0 %	20 %	0 %	410659641
25	NC_018867	CTATC	2	10	24009	24018	20 %	40 %	0 %	40 %	410659641
26	NC_018867	AAAAG	2	10	25088	25097	80 %	0 %	20 %	0 %	410659642
27	NC_018867	CTGCT	2	10	28653	28662	0 %	40 %	20 %	40 %	410659646
28	NC_018867	CTGAA	2	10	29864	29873	40 %	20 %	20 %	20 %	410659648
29	NC_018867	GAGGC	2	10	30077	30086	20 %	0 %	60 %	20 %	410659648
30	NC_018867	AAAGC	2	10	31719	31728	60 %	0 %	20 %	20 %	410659649
31	NC_018867	GCCTT	2	10	32574	32583	0 %	40 %	20 %	40 %	410659650
32	NC_018867	AATAA	2	10	34580	34589	80 %	20 %	0 %	0 %	410659651
33	NC_018867	GGCAA	2	10	35030	35039	40 %	0 %	40 %	20 %	410659652
34	NC_018867	GATTG	2	10	35949	35958	20 %	40 %	40 %	0 %	410659654
35	NC_018867	CCATG	2	10	36731	36740	20 %	20 %	20 %	40 %	410659654
36	NC_018867	CAATC	2	10	37066	37075	40 %	20 %	0 %	40 %	410659654
37	NC_018867	GCAAA	2	10	37405	37414	60 %	0 %	20 %	20 %	410659654
38	NC_018867	AAGGA	2	10	37528	37537	60 %	0 %	40 %	0 %	410659654
39	NC_018867	GACTG	2	10	38646	38655	20 %	20 %	40 %	20 %	410659656
40	NC_018867	TGACC	2	10	39646	39655	20 %	20 %	20 %	40 %	410659657
41	NC_018867	CCTTT	2	10	40075	40084	0 %	60 %	0 %	40 %	410659658
42	NC_018867	CTATC	2	10	41442	41451	20 %	40 %	0 %	40 %	410659658
43	NC_018867	ATTTT	2	10	42340	42349	20 %	80 %	0 %	0 %	410659658
44	NC_018867	CCGCA	2	10	43248	43257	20 %	0 %	20 %	60 %	410659658
45	NC_018867	AATTC	2	10	43763	43772	40 %	40 %	0 %	20 %	410659658
46	NC_018867	AAACA	2	10	47031	47040	80 %	0 %	0 %	20 %	410659660
47	NC_018867	AGACA	2	10	48753	48762	60 %	0 %	20 %	20 %	410659663
48	NC_018867	TAATG	2	10	50352	50361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018867	GCAAA	2	10	50391	50400	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018867	GGAAT	2	10	54310	54319	40 %	20 %	40 %	0 %	410659667
51	NC_018867	ATCAG	2	10	54478	54487	40 %	20 %	20 %	20 %	410659667
52	NC_018867	ATGAA	2	10	55951	55960	60 %	20 %	20 %	0 %	410659668
53	NC_018867	AAAAG	2	10	56174	56183	80 %	0 %	20 %	0 %	410659668
54	NC_018867	TCCTA	2	10	57531	57540	20 %	40 %	0 %	40 %	410659668
55	NC_018867	ATTTT	2	10	58138	58147	20 %	80 %	0 %	0 %	410659669
56	NC_018867	CTTCC	2	10	58467	58476	0 %	40 %	0 %	60 %	410659670
57	NC_018867	CAATC	2	10	60462	60471	40 %	20 %	0 %	40 %	410659671
58	NC_018867	GAAAG	2	10	61075	61084	60 %	0 %	40 %	0 %	410659671
59	NC_018867	GGTCG	2	10	65784	65793	0 %	20 %	60 %	20 %	410659673
60	NC_018867	ATTCC	2	10	65831	65840	20 %	40 %	0 %	40 %	410659673
61	NC_018867	TTGAT	2	10	66305	66314	20 %	60 %	20 %	0 %	410659674
62	NC_018867	CTTTT	2	10	66342	66351	0 %	80 %	0 %	20 %	410659674
63	NC_018867	CACAG	2	10	71142	71151	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018867	CTAAA	2	10	72369	72378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018867	AAAAG	2	10	72791	72800	80 %	0 %	20 %	0 %	410659680
66	NC_018867	TTTTA	2	10	73778	73787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018867	AGACA	2	10	73860	73869	60 %	0 %	20 %	20 %	410659682
68	NC_018867	TGTCA	2	10	76348	76357	20 %	40 %	20 %	20 %	410659684
69	NC_018867	ATAAC	2	10	79039	79048	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018867	AAAGC	2	10	81103	81112	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018867	TGCCT	2	10	81562	81571	0 %	40 %	20 %	40 %	410659693
72	NC_018867	ATATT	2	10	81720	81729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018867	CCAGC	2	10	86017	86026	20 %	0 %	20 %	60 %	410659697
74	NC_018867	TCTGC	2	10	87501	87510	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018867	GAAAA	2	10	89404	89413	80 %	0 %	20 %	0 %	410659699
76	NC_018867	TTAAT	2	10	89970	89979	40 %	60 %	0 %	0 %	410659700
77	NC_018867	AAACA	2	10	90294	90303	80 %	0 %	0 %	20 %	410659700
78	NC_018867	TTTAT	2	10	94690	94699	20 %	80 %	0 %	0 %	410659704
79	NC_018867	ACATC	2	10	96750	96759	40 %	20 %	0 %	40 %	410659705
80	NC_018867	GATTG	2	10	99491	99500	20 %	40 %	40 %	0 %	410659708
81	NC_018867	AGCAA	2	10	100061	100070	60 %	0 %	20 %	20 %	410659709
82	NC_018867	GCTGC	2	10	101100	101109	0 %	20 %	40 %	40 %	410659711
83	NC_018867	GAAAA	2	10	102049	102058	80 %	0 %	20 %	0 %	410659712
84	NC_018867	TATTG	2	10	105106	105115	20 %	60 %	20 %	0 %	410659717
85	NC_018867	AAAAC	2	10	106868	106877	80 %	0 %	0 %	20 %	410659719
86	NC_018867	TAAAA	2	10	110131	110140	80 %	20 %	0 %	0 %	410659722
87	NC_018867	AAAAT	2	10	110191	110200	80 %	20 %	0 %	0 %	410659723
88	NC_018867	TCTTT	2	10	110605	110614	0 %	80 %	0 %	20 %	410659723
89	NC_018867	GAAAA	2	10	111965	111974	80 %	0 %	20 %	0 %	410659724
90	NC_018867	AGCTG	2	10	113491	113500	20 %	20 %	40 %	20 %	410659726
91	NC_018867	AAGGA	2	10	114120	114129	60 %	0 %	40 %	0 %	410659726
92	NC_018867	CTTTT	2	10	116135	116144	0 %	80 %	0 %	20 %	410659728
93	NC_018867	ACCAT	2	10	117272	117281	40 %	20 %	0 %	40 %	410659732
94	NC_018867	GGCTC	2	10	117419	117428	0 %	20 %	40 %	40 %	410659732
95	NC_018867	GTCCA	2	10	117711	117720	20 %	20 %	20 %	40 %	410659732
96	NC_018867	TCCAG	2	10	118729	118738	20 %	20 %	20 %	40 %	410659735
97	NC_018867	AAGGG	2	10	120320	120329	40 %	0 %	60 %	0 %	410659735
98	NC_018867	GAAAA	2	10	124798	124807	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018867	TGCCG	2	10	126696	126705	0 %	20 %	40 %	40 %	410659743
100	NC_018867	GTCCG	2	10	126856	126865	0 %	20 %	40 %	40 %	410659743
101	NC_018867	TCACC	2	10	127281	127290	20 %	20 %	0 %	60 %	410659744
102	NC_018867	TTTTC	2	10	127306	127315	0 %	80 %	0 %	20 %	410659744
103	NC_018867	GAAAC	2	10	128558	128567	60 %	0 %	20 %	20 %	410659744
104	NC_018867	TCTGC	2	10	130327	130336	0 %	40 %	20 %	40 %	410659744
105	NC_018867	TGGAA	2	10	133918	133927	40 %	20 %	40 %	0 %	410659744
106	NC_018867	CCAGC	2	10	134038	134047	20 %	0 %	20 %	60 %	410659744
107	NC_018867	GTTTT	2	10	134390	134399	0 %	80 %	20 %	0 %	410659744
108	NC_018867	GAAAG	2	10	134665	134674	60 %	0 %	40 %	0 %	410659744
109	NC_018867	TGCCT	2	10	135697	135706	0 %	40 %	20 %	40 %	410659746
110	NC_018867	GTTCC	2	10	136026	136035	0 %	40 %	20 %	40 %	410659746
111	NC_018867	GAGGG	2	10	136601	136610	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018867	TTTTG	2	10	140082	140091	0 %	80 %	20 %	0 %	410659752
113	NC_018867	TATAA	2	10	141339	141348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018867	GCTTT	2	10	144289	144298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018867	AACGG	2	10	144886	144895	40 %	0 %	40 %	20 %	410659754
116	NC_018867	AGATT	2	10	145134	145143	40 %	40 %	20 %	0 %	410659754
117	NC_018867	AAAAT	2	10	145622	145631	80 %	20 %	0 %	0 %	410659754
118	NC_018867	CAATT	2	10	146447	146456	40 %	40 %	0 %	20 %	410659755
119	NC_018867	ACCAA	2	10	150186	150195	60 %	0 %	0 %	40 %	410659757
120	NC_018867	CTTTT	2	10	150702	150711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018867	TTGGA	2	10	150908	150917	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018867	CAAAA	2	10	151626	151635	80 %	0 %	0 %	20 %	410659759
123	NC_018867	GAAAA	2	10	151821	151830	80 %	0 %	20 %	0 %	410659759
124	NC_018867	CTTTT	2	10	153948	153957	0 %	80 %	0 %	20 %	410659760
125	NC_018867	GAATT	2	10	154373	154382	40 %	40 %	20 %	0 %	410659760
126	NC_018867	GGACA	2	10	160734	160743	40 %	0 %	40 %	20 %	410659762
127	NC_018867	AATCT	2	10	161209	161218	40 %	40 %	0 %	20 %	410659763
128	NC_018867	CAAAA	2	10	162042	162051	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018867	CATTA	2	10	162965	162974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018867	AAATT	2	10	163041	163050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018867	TACCT	2	10	163762	163771	20 %	40 %	0 %	40 %	410659766
132	NC_018867	AAGTA	2	10	164602	164611	60 %	20 %	20 %	0 %	410659767
133	NC_018867	CTGGA	2	10	164719	164728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018867	ATTTT	2	10	165057	165066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018867	CTTTT	2	10	165175	165184	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018867	CAGAA	2	10	165835	165844	60 %	0 %	20 %	20 %	410659769
137	NC_018867	AAAAC	2	10	166016	166025	80 %	0 %	0 %	20 %	410659770
138	NC_018867	CGAAA	2	10	167148	167157	60 %	0 %	20 %	20 %	410659771
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