MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 2266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018866	AATGA	2	10	550	559	60 %	20 %	20 %	0 %	410656643
2	NC_018866	TTTAT	2	10	1352	1361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018866	GATTT	2	10	1617	1626	20 %	60 %	20 %	0 %	410656644
4	NC_018866	GAAAA	2	10	3964	3973	80 %	0 %	20 %	0 %	410656646
5	NC_018866	CAAAT	2	10	4290	4299	60 %	20 %	0 %	20 %	410656647
6	NC_018866	GAAAA	2	10	7090	7099	80 %	0 %	20 %	0 %	410656648
7	NC_018866	TTCTT	2	10	7910	7919	0 %	80 %	0 %	20 %	410656648
8	NC_018866	TTTCC	2	10	11097	11106	0 %	60 %	0 %	40 %	410656651
9	NC_018866	TTAGA	2	10	11500	11509	40 %	40 %	20 %	0 %	410656651
10	NC_018866	GCGGA	2	10	11838	11847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018866	CGCAC	2	10	12637	12646	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018866	TCAAG	2	10	14106	14115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018866	TTCCG	2	10	14214	14223	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018866	GTTAA	2	10	16194	16203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018866	ATGTT	2	10	16268	16277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018866	ATTTG	2	10	16739	16748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018866	CCAGC	2	10	19491	19500	20 %	0 %	20 %	60 %	410656658
18	NC_018866	TCTGC	2	10	20975	20984	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018866	GAAAA	2	10	22878	22887	80 %	0 %	20 %	0 %	410656660
20	NC_018866	TTAAT	2	10	23444	23453	40 %	60 %	0 %	0 %	410656661
21	NC_018866	AAACA	2	10	23768	23777	80 %	0 %	0 %	20 %	410656661
22	NC_018866	TTTAT	2	10	28164	28173	20 %	80 %	0 %	0 %	410656665
23	NC_018866	ACATC	2	10	30224	30233	40 %	20 %	0 %	40 %	410656666
24	NC_018866	GATTG	2	10	32965	32974	20 %	40 %	40 %	0 %	410656669
25	NC_018866	AGCAA	2	10	33535	33544	60 %	0 %	20 %	20 %	410656670
26	NC_018866	GAAAA	2	10	34253	34262	80 %	0 %	20 %	0 %	410656670
27	NC_018866	TATTG	2	10	37310	37319	20 %	60 %	20 %	0 %	410656676
28	NC_018866	AAAAC	2	10	39072	39081	80 %	0 %	0 %	20 %	410656678
29	NC_018866	TAAAA	2	10	42335	42344	80 %	20 %	0 %	0 %	410656681
30	NC_018866	AAAAT	2	10	42395	42404	80 %	20 %	0 %	0 %	410656682
31	NC_018866	TCTTT	2	10	42809	42818	0 %	80 %	0 %	20 %	410656682
32	NC_018866	GAAAA	2	10	44169	44178	80 %	0 %	20 %	0 %	410656683
33	NC_018866	AGCTG	2	10	45695	45704	20 %	20 %	40 %	20 %	410656685
34	NC_018866	AAGGA	2	10	46324	46333	60 %	0 %	40 %	0 %	410656685
35	NC_018866	CTTTT	2	10	48339	48348	0 %	80 %	0 %	20 %	410656687
36	NC_018866	ACCAT	2	10	49476	49485	40 %	20 %	0 %	40 %	410656691
37	NC_018866	GGCTC	2	10	49623	49632	0 %	20 %	40 %	40 %	410656691
38	NC_018866	GTCCA	2	10	49915	49924	20 %	20 %	20 %	40 %	410656691
39	NC_018866	TCCAG	2	10	50933	50942	20 %	20 %	20 %	40 %	410656694
40	NC_018866	AAGGG	2	10	52524	52533	40 %	0 %	60 %	0 %	410656694
41	NC_018866	GAAAA	2	10	57002	57011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018866	TGCCG	2	10	58900	58909	0 %	20 %	40 %	40 %	410656702
43	NC_018866	GTCCG	2	10	59060	59069	0 %	20 %	40 %	40 %	410656702
44	NC_018866	TCACC	2	10	59485	59494	20 %	20 %	0 %	60 %	410656703
45	NC_018866	TTTTC	2	10	59510	59519	0 %	80 %	0 %	20 %	410656703
46	NC_018866	GAAAC	2	10	60762	60771	60 %	0 %	20 %	20 %	410656703
47	NC_018866	ACATC	2	10	61954	61963	40 %	20 %	0 %	40 %	410656704
48	NC_018866	GAAAA	2	10	62268	62277	80 %	0 %	20 %	0 %	410656704
49	NC_018866	GAAAA	2	10	62778	62787	80 %	0 %	20 %	0 %	410656704
50	NC_018866	CCCAA	2	10	63359	63368	40 %	0 %	0 %	60 %	410656704
51	NC_018866	TCTGC	2	10	64700	64709	0 %	40 %	20 %	40 %	410656705
52	NC_018866	TGGAA	2	10	68291	68300	40 %	20 %	40 %	0 %	410656705
53	NC_018866	CCAGC	2	10	68411	68420	20 %	0 %	20 %	60 %	410656705
54	NC_018866	GTTTT	2	10	68763	68772	0 %	80 %	20 %	0 %	410656705
55	NC_018866	GAAAG	2	10	69038	69047	60 %	0 %	40 %	0 %	410656705
56	NC_018866	TGCCT	2	10	70070	70079	0 %	40 %	20 %	40 %	410656707
57	NC_018866	GTTCC	2	10	70399	70408	0 %	40 %	20 %	40 %	410656707
58	NC_018866	GAGGG	2	10	70974	70983	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018866	TTTTG	2	10	74455	74464	0 %	80 %	20 %	0 %	410656712
60	NC_018866	TATAA	2	10	75712	75721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018866	GCTTT	2	10	78662	78671	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018866	AACGG	2	10	79259	79268	40 %	0 %	40 %	20 %	410656714
63	NC_018866	AGATT	2	10	79507	79516	40 %	40 %	20 %	0 %	410656714
64	NC_018866	AAAAT	2	10	79995	80004	80 %	20 %	0 %	0 %	410656714
65	NC_018866	CAATT	2	10	80820	80829	40 %	40 %	0 %	20 %	410656715
66	NC_018866	ACCAA	2	10	84559	84568	60 %	0 %	0 %	40 %	410656718
67	NC_018866	CTTTT	2	10	85075	85084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018866	TTGGA	2	10	85281	85290	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018866	CAAAA	2	10	85999	86008	80 %	0 %	0 %	20 %	410656720
70	NC_018866	GAAAA	2	10	86194	86203	80 %	0 %	20 %	0 %	410656720
71	NC_018866	CTTTT	2	10	88321	88330	0 %	80 %	0 %	20 %	410656721
72	NC_018866	GAATT	2	10	88746	88755	40 %	40 %	20 %	0 %	410656721
73	NC_018866	GGACA	2	10	95107	95116	40 %	0 %	40 %	20 %	410656723
74	NC_018866	AATCT	2	10	95582	95591	40 %	40 %	0 %	20 %	410656724
75	NC_018866	CAAAA	2	10	96415	96424	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018866	ATTTT	2	10	97463	97472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018866	CTTTT	2	10	97581	97590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018866	CAGAA	2	10	98241	98250	60 %	0 %	20 %	20 %	410656726
79	NC_018866	AAAAC	2	10	98422	98431	80 %	0 %	0 %	20 %	410656727
80	NC_018866	CGAAA	2	10	99554	99563	60 %	0 %	20 %	20 %	410656728
81	NC_018866	GCCAA	2	10	100799	100808	40 %	0 %	20 %	40 %	410656729
82	NC_018866	AGGAA	2	10	103367	103376	60 %	0 %	40 %	0 %	410656732
83	NC_018866	CTGGA	2	10	103629	103638	20 %	20 %	40 %	20 %	410656732
84	NC_018866	GAGCC	2	10	104712	104721	20 %	0 %	40 %	40 %	410656734
85	NC_018866	ATGGT	2	10	104859	104868	20 %	40 %	40 %	0 %	410656734
86	NC_018866	AAGAC	2	10	105054	105063	60 %	0 %	20 %	20 %	410656735
87	NC_018866	AAAAG	2	10	105368	105377	80 %	0 %	20 %	0 %	410656736
88	NC_018866	AAATC	2	10	108825	108834	60 %	20 %	0 %	20 %	410656740
89	NC_018866	AGCAA	2	10	109178	109187	60 %	0 %	20 %	20 %	410656740
90	NC_018866	TCAAA	2	10	109196	109205	60 %	20 %	0 %	20 %	410656740
91	NC_018866	TTTTC	2	10	109710	109719	0 %	80 %	0 %	20 %	410656740
92	NC_018866	AAAAT	2	10	112990	112999	80 %	20 %	0 %	0 %	410656743
93	NC_018866	ACCGC	2	10	113181	113190	20 %	0 %	20 %	60 %	410656743
94	NC_018866	CCTGG	2	10	114148	114157	0 %	20 %	40 %	40 %	410656744
95	NC_018866	TACAA	2	10	116659	116668	60 %	20 %	0 %	20 %	410656747
96	NC_018866	GAGGG	2	10	118210	118219	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018866	AATGA	2	10	119186	119195	60 %	20 %	20 %	0 %	410656753
98	NC_018866	ATGGC	2	10	119988	119997	20 %	20 %	40 %	20 %	410656754
99	NC_018866	GTTTC	2	10	123334	123343	0 %	60 %	20 %	20 %	410656757
100	NC_018866	AGCAA	2	10	123509	123518	60 %	0 %	20 %	20 %	410656757
101	NC_018866	GCGGA	2	10	124225	124234	20 %	0 %	60 %	20 %	410656758
102	NC_018866	GAAGG	2	10	126578	126587	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018866	GTGCT	2	10	127244	127253	0 %	40 %	40 %	20 %	410656761
104	NC_018866	GTCAG	2	10	130229	130238	20 %	20 %	40 %	20 %	410656766
105	NC_018866	ATTTT	2	10	130401	130410	20 %	80 %	0 %	0 %	410656766
106	NC_018866	GAAGA	2	10	130542	130551	60 %	0 %	40 %	0 %	410656766
107	NC_018866	CTCAC	2	10	131255	131264	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_018866	CAAAA	2	10	132149	132158	80 %	0 %	0 %	20 %	410656767
109	NC_018866	TGTAC	2	10	132593	132602	20 %	40 %	20 %	20 %	410656767
110	NC_018866	GAAAG	2	10	134053	134062	60 %	0 %	40 %	0 %	410656769
111	NC_018866	ATATA	2	10	134191	134200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018866	TGAAA	2	10	135061	135070	60 %	20 %	20 %	0 %	410656770
113	NC_018866	CGAAT	2	10	135490	135499	40 %	20 %	20 %	20 %	410656770
114	NC_018866	CAAAA	2	10	136202	136211	80 %	0 %	0 %	20 %	410656772
115	NC_018866	AGAGA	2	10	137634	137643	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018866	ATCAT	2	10	137775	137784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018866	TGCTT	2	10	140928	140937	0 %	60 %	20 %	20 %	410656777
118	NC_018866	CTCGA	2	10	141421	141430	20 %	20 %	20 %	40 %	410656777
119	NC_018866	TAAAA	2	10	142182	142191	80 %	20 %	0 %	0 %	410656778
120	NC_018866	TCCTG	2	10	142992	143001	0 %	40 %	20 %	40 %	410656780
121	NC_018866	GACCA	2	10	145236	145245	40 %	0 %	20 %	40 %	410656782
122	NC_018866	GATAA	2	10	147655	147664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018866	TAAAT	2	10	148502	148511	60 %	40 %	0 %	0 %	410656785
124	NC_018866	AAATA	2	10	151597	151606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018866	ACATA	2	10	151628	151637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018866	ATTAT	2	10	151668	151677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018866	AGTTT	2	10	152112	152121	20 %	60 %	20 %	0 %	410656790
128	NC_018866	CATTT	2	10	152725	152734	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018866	TTATT	2	10	152903	152912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018866	TTTTA	2	10	153724	153733	20 %	80 %	0 %	0 %	410656792
131	NC_018866	TTGTG	2	10	156537	156546	0 %	60 %	40 %	0 %	410656796
132	NC_018866	TAAAA	2	10	157526	157535	80 %	20 %	0 %	0 %	410656797
133	NC_018866	GCTAA	3	15	158665	158679	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018866	ATTTA	2	10	162100	162109	40 %	60 %	0 %	0 %	410656804
135	NC_018866	ATATA	2	10	162956	162965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018866	GCCTT	2	10	167493	167502	0 %	40 %	20 %	40 %	410656813
137	NC_018866	TTGGG	2	10	169862	169871	0 %	40 %	60 %	0 %	410656816
138	NC_018866	TTTTC	2	10	170953	170962	0 %	80 %	0 %	20 %	410656816
139	NC_018866	GTGAT	2	10	171265	171274	20 %	40 %	40 %	0 %	410656816
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270	NC_018866	TCGGA	2	10	335629	335638	20 %	20 %	40 %	20 %	410656963
271	NC_018866	CTCTG	2	10	338705	338714	0 %	40 %	20 %	40 %	410656967
272	NC_018866	ATTAC	2	10	339019	339028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_018866	AAGAG	2	10	340396	340405	60 %	0 %	40 %	0 %	410656969
274	NC_018866	TGATT	2	10	340758	340767	20 %	60 %	20 %	0 %	410656969
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276	NC_018866	GCAAA	2	10	341637	341646	60 %	0 %	20 %	20 %	410656970
277	NC_018866	AGGTC	2	10	343034	343043	20 %	20 %	40 %	20 %	410656973
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280	NC_018866	CTGGA	2	10	345879	345888	20 %	20 %	40 %	20 %	410656976
281	NC_018866	AACGT	2	10	346003	346012	40 %	20 %	20 %	20 %	410656976
282	NC_018866	GCGCA	2	10	349054	349063	20 %	0 %	40 %	40 %	410656978
283	NC_018866	TAACA	2	10	350244	350253	60 %	20 %	0 %	20 %	410656980
284	NC_018866	TTATA	2	10	350613	350622	40 %	60 %	0 %	0 %	410656980
285	NC_018866	GCAGA	2	10	351425	351434	40 %	0 %	40 %	20 %	410656980
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287	NC_018866	TTCAG	2	10	354851	354860	20 %	40 %	20 %	20 %	410656983
288	NC_018866	GGGTT	2	10	355267	355276	0 %	40 %	60 %	0 %	410656983
289	NC_018866	TTCTT	2	10	357271	357280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_018866	TAGGT	2	10	358844	358853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018866	CAGGA	2	10	360423	360432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
292	NC_018866	TTGGT	2	10	360584	360593	0 %	60 %	40 %	0 %	410656990
293	NC_018866	GTTTT	2	10	361359	361368	0 %	80 %	20 %	0 %	410656991
294	NC_018866	GTACA	2	10	361975	361984	40 %	20 %	20 %	20 %	410656991
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371	NC_018866	GGATT	2	10	467119	467128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
372	NC_018866	TGAAA	2	10	468430	468439	60 %	20 %	20 %	0 %	410657114
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374	NC_018866	TCTAT	2	10	468663	468672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_018866	TCGAT	2	10	474255	474264	20 %	40 %	20 %	20 %	410657120
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435	NC_018866	GTCGA	2	10	534618	534627	20 %	20 %	40 %	20 %	410657178
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497	NC_018866	CGTTA	2	10	611729	611738	20 %	40 %	20 %	20 %	410657248
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500	NC_018866	GAACA	2	10	613710	613719	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

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