MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 3426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	AGATA	2	10	1509	1518	60 %	20 %	20 %	0 %	392423461
2	NC_018068	TCAGA	2	10	6633	6642	40 %	20 %	20 %	20 %	392423465
3	NC_018068	AAATG	2	10	8535	8544	60 %	20 %	20 %	0 %	392423466
4	NC_018068	AAAAT	2	10	9226	9235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018068	GTAAA	2	10	10803	10812	60 %	20 %	20 %	0 %	392423468
6	NC_018068	AGATA	2	10	15162	15171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018068	CAAAA	2	10	16048	16057	80 %	0 %	0 %	20 %	392423473
8	NC_018068	ATTAA	2	10	16279	16288	60 %	40 %	0 %	0 %	392423473
9	NC_018068	AAATT	2	10	19208	19217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018068	GTGCA	2	10	19448	19457	20 %	20 %	40 %	20 %	392423477
11	NC_018068	TAATG	2	10	20184	20193	40 %	40 %	20 %	0 %	392423477
12	NC_018068	CTGCC	2	10	21507	21516	0 %	20 %	20 %	60 %	392423477
13	NC_018068	CAGAA	2	10	23330	23339	60 %	0 %	20 %	20 %	392423478
14	NC_018068	CATTC	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018068	ATTAT	2	10	26781	26790	40 %	60 %	0 %	0 %	392423480
16	NC_018068	AAACC	2	10	27043	27052	60 %	0 %	0 %	40 %	392423481
17	NC_018068	AAGAT	2	10	27977	27986	60 %	20 %	20 %	0 %	392423481
18	NC_018068	GTTAA	2	10	28060	28069	40 %	40 %	20 %	0 %	392423481
19	NC_018068	TTTGA	2	10	28716	28725	20 %	60 %	20 %	0 %	392423483
20	NC_018068	GAAGT	2	10	32337	32346	40 %	20 %	40 %	0 %	392423487
21	NC_018068	AAATT	2	10	33386	33395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018068	TAAAT	2	10	37010	37019	60 %	40 %	0 %	0 %	392423491
23	NC_018068	CTGAA	2	10	39128	39137	40 %	20 %	20 %	20 %	392423493
24	NC_018068	AGTTG	2	10	39800	39809	20 %	40 %	40 %	0 %	392423493
25	NC_018068	TCAAA	2	10	43176	43185	60 %	20 %	0 %	20 %	392423496
26	NC_018068	ATGGA	2	10	46552	46561	40 %	20 %	40 %	0 %	392423499
27	NC_018068	AGGGT	2	10	46725	46734	20 %	20 %	60 %	0 %	392423500
28	NC_018068	CTTTA	2	10	49861	49870	20 %	60 %	0 %	20 %	392423503
29	NC_018068	AACAT	2	10	52000	52009	60 %	20 %	0 %	20 %	392423504
30	NC_018068	TTAAT	2	10	52694	52703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018068	ATGTT	2	10	54314	54323	20 %	60 %	20 %	0 %	392423506
32	NC_018068	TAAAC	2	10	55718	55727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018068	GAGAA	2	10	57090	57099	60 %	0 %	40 %	0 %	392423509
34	NC_018068	AATAT	2	10	58473	58482	60 %	40 %	0 %	0 %	392423511
35	NC_018068	TTTGC	2	10	60377	60386	0 %	60 %	20 %	20 %	392423514
36	NC_018068	TGGGT	2	10	65797	65806	0 %	40 %	60 %	0 %	392423517
37	NC_018068	ATATA	2	10	69073	69082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018068	GTGGA	2	10	71069	71078	20 %	20 %	60 %	0 %	392423525
39	NC_018068	GATGG	2	10	71414	71423	20 %	20 %	60 %	0 %	392423525
40	NC_018068	AAATC	2	10	71701	71710	60 %	20 %	0 %	20 %	392423525
41	NC_018068	TGGAT	2	10	71799	71808	20 %	40 %	40 %	0 %	392423525
42	NC_018068	ATGGA	2	10	78034	78043	40 %	20 %	40 %	0 %	392423531
43	NC_018068	ATGTT	2	10	80741	80750	20 %	60 %	20 %	0 %	392423535
44	NC_018068	ACCCG	2	10	81058	81067	20 %	0 %	20 %	60 %	392423535
45	NC_018068	GAAGG	2	10	82510	82519	40 %	0 %	60 %	0 %	392423537
46	NC_018068	TCAAG	2	10	82803	82812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018068	ATGAA	2	10	82861	82870	60 %	20 %	20 %	0 %	392423538
48	NC_018068	CAATA	2	10	86131	86140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018068	AATGA	2	10	88511	88520	60 %	20 %	20 %	0 %	392423544
50	NC_018068	GATAA	2	10	89493	89502	60 %	20 %	20 %	0 %	392423546
51	NC_018068	TTTAT	2	10	91420	91429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018068	TCGTG	2	10	92978	92987	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018068	GAAGC	2	10	93164	93173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018068	AGAGG	2	10	95913	95922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018068	TTGAA	2	10	95942	95951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018068	GACAG	2	10	96109	96118	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018068	TCGGA	2	10	96791	96800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018068	CAAGA	2	10	99831	99840	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018068	TGGCA	2	10	101805	101814	20 %	20 %	40 %	20 %	392423549
60	NC_018068	TACAT	2	10	105297	105306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018068	TCGTG	2	10	106556	106565	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018068	GAAGC	2	10	106742	106751	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018068	AGAGG	2	10	109493	109502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018068	TTGAA	2	10	109522	109531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018068	GACAG	2	10	109689	109698	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018068	TCGGA	2	10	110371	110380	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018068	TATCG	2	10	111426	111435	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018068	TTCTT	2	10	112151	112160	0 %	80 %	0 %	20 %	392423551
69	NC_018068	CAGTT	2	10	113960	113969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018068	TGCTT	2	10	116960	116969	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018068	CCGTT	2	10	118082	118091	0 %	40 %	20 %	40 %	392423554
72	NC_018068	GGCTT	2	10	119191	119200	0 %	40 %	40 %	20 %	392423555
73	NC_018068	ATTTT	2	10	119235	119244	20 %	80 %	0 %	0 %	392423555
74	NC_018068	TGGAT	2	10	121111	121120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018068	TCCTC	2	10	121794	121803	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_018068	ATGCC	2	10	124096	124105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018068	GGACG	2	10	125248	125257	20 %	0 %	60 %	20 %	392423560
78	NC_018068	AAGCC	2	10	125996	126005	40 %	0 %	20 %	40 %	392423561
79	NC_018068	GAAAG	2	10	128260	128269	60 %	0 %	40 %	0 %	392423562
80	NC_018068	TACAA	2	10	128642	128651	60 %	20 %	0 %	20 %	392423562
81	NC_018068	ATAGA	2	10	128668	128677	60 %	20 %	20 %	0 %	392423562
82	NC_018068	TTTGG	2	10	130802	130811	0 %	60 %	40 %	0 %	392423564
83	NC_018068	AACCC	2	10	131259	131268	40 %	0 %	0 %	60 %	392423564
84	NC_018068	ATGAT	2	10	133815	133824	40 %	40 %	20 %	0 %	392423567
85	NC_018068	ATTGG	2	10	135432	135441	20 %	40 %	40 %	0 %	392423568
86	NC_018068	CAAAA	2	10	135657	135666	80 %	0 %	0 %	20 %	392423568
87	NC_018068	GATTC	2	10	135786	135795	20 %	40 %	20 %	20 %	392423568
88	NC_018068	GCTTG	2	10	138255	138264	0 %	40 %	40 %	20 %	392423570
89	NC_018068	GAAAA	2	10	140332	140341	80 %	0 %	20 %	0 %	392423572
90	NC_018068	TCTTA	2	10	141438	141447	20 %	60 %	0 %	20 %	392423574
91	NC_018068	ATGCT	2	10	141895	141904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018068	TGCTC	2	10	143727	143736	0 %	40 %	20 %	40 %	392423576
93	NC_018068	CATTC	2	10	144980	144989	20 %	40 %	0 %	40 %	392423576
94	NC_018068	CTGGA	2	10	147521	147530	20 %	20 %	40 %	20 %	392423578
95	NC_018068	TCTAA	2	10	149037	149046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018068	GTTAT	2	10	149704	149713	20 %	60 %	20 %	0 %	392423579
97	NC_018068	AGCTG	2	10	150887	150896	20 %	20 %	40 %	20 %	392423579
98	NC_018068	AATAA	2	10	153499	153508	80 %	20 %	0 %	0 %	392423580
99	NC_018068	CAAAA	2	10	156326	156335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018068	TCGTG	2	10	157586	157595	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018068	GAAGC	2	10	157772	157781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018068	AGAGG	2	10	160334	160343	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018068	TTGAA	2	10	160363	160372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018068	GACAG	2	10	160530	160539	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018068	TCGGA	2	10	161212	161221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018068	ATCTT	2	10	161988	161997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018068	TATCG	2	10	164013	164022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018068	AAGAA	2	10	164220	164229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018068	ATTTA	2	10	164565	164574	40 %	60 %	0 %	0 %	392423583
110	NC_018068	GTTTT	2	10	168661	168670	0 %	80 %	20 %	0 %	392423588
111	NC_018068	AGAAA	2	10	174405	174414	80 %	0 %	20 %	0 %	392423591
112	NC_018068	AGTTA	2	10	176512	176521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018068	TGGAT	2	10	177034	177043	20 %	40 %	40 %	0 %	392423595
114	NC_018068	CTTAA	2	10	177461	177470	40 %	40 %	0 %	20 %	392423595
115	NC_018068	GTCTT	2	10	178518	178527	0 %	60 %	20 %	20 %	392423596
116	NC_018068	TTTTC	2	10	179991	180000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018068	GGATT	2	10	181413	181422	20 %	40 %	40 %	0 %	392423600
118	NC_018068	TTAAT	2	10	182736	182745	40 %	60 %	0 %	0 %	392423601
119	NC_018068	TCAAT	2	10	185867	185876	40 %	40 %	0 %	20 %	392423603
120	NC_018068	TCTAT	2	10	185917	185926	20 %	60 %	0 %	20 %	392423603
121	NC_018068	AATAT	2	10	187471	187480	60 %	40 %	0 %	0 %	392423604
122	NC_018068	GAAAA	2	10	195380	195389	80 %	0 %	20 %	0 %	392423610
123	NC_018068	ATTGA	2	10	196461	196470	40 %	40 %	20 %	0 %	392423611
124	NC_018068	AAGCA	2	10	196768	196777	60 %	0 %	20 %	20 %	392423611
125	NC_018068	GATAT	2	10	197230	197239	40 %	40 %	20 %	0 %	392423611
126	NC_018068	AAAAG	2	10	199087	199096	80 %	0 %	20 %	0 %	392423613
127	NC_018068	GAAAT	2	10	199265	199274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018068	ATTAT	2	10	200076	200085	40 %	60 %	0 %	0 %	392423614
129	NC_018068	TGGAT	2	10	201271	201280	20 %	40 %	40 %	0 %	392423614
130	NC_018068	ATTGT	2	10	201471	201480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018068	AGAAA	2	10	203115	203124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018068	GAGAA	2	10	203301	203310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018068	ACTTA	2	10	203987	203996	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018068	AGGAA	2	10	204411	204420	60 %	0 %	40 %	0 %	392423620
135	NC_018068	GTTTT	2	10	205560	205569	0 %	80 %	20 %	0 %	392423621
136	NC_018068	GAAAA	2	10	205742	205751	80 %	0 %	20 %	0 %	392423621
137	NC_018068	AGTCC	2	10	206799	206808	20 %	20 %	20 %	40 %	392423622
138	NC_018068	GGAAG	2	10	208242	208251	40 %	0 %	60 %	0 %	392423623
139	NC_018068	ATCGT	2	10	209661	209670	20 %	40 %	20 %	20 %	392423625
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141	NC_018068	CAAAT	2	10	213165	213174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018068	ATTAA	2	10	214502	214511	60 %	40 %	0 %	0 %	392423631
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253	NC_018068	ATTAT	2	10	382374	382383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_018068	GTTAT	2	10	405455	405464	20 %	60 %	20 %	0 %	392423809
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402	NC_018068	CATGC	2	10	614282	614291	20 %	20 %	20 %	40 %	392424014
403	NC_018068	TGTGC	2	10	617507	617516	0 %	40 %	40 %	20 %	392424015
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