MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 12378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	ATTT	2	8	45	52	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018068	CAAG	2	8	308	315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018068	TTGG	2	8	747	754	0 %	50 %	50 %	0 %	392423461
4	NC_018068	TCAA	2	8	789	796	50 %	25 %	0 %	25 %	392423461
5	NC_018068	ATGC	2	8	1075	1082	25 %	25 %	25 %	25 %	392423461
6	NC_018068	ATGC	2	8	1846	1853	25 %	25 %	25 %	25 %	392423461
7	NC_018068	AATT	2	8	1913	1920	50 %	50 %	0 %	0 %	392423461
8	NC_018068	CAAA	2	8	2255	2262	75 %	0 %	0 %	25 %	392423462
9	NC_018068	ATCA	2	8	2489	2496	50 %	25 %	0 %	25 %	392423462
10	NC_018068	TCCT	2	8	2537	2544	0 %	50 %	0 %	50 %	392423462
11	NC_018068	AGAA	2	8	3568	3575	75 %	0 %	25 %	0 %	392423463
12	NC_018068	ATCA	2	8	3586	3593	50 %	25 %	0 %	25 %	392423463
13	NC_018068	ATTA	2	8	4563	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	392423464
14	NC_018068	TAGT	2	8	4709	4716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018068	TATT	2	8	4719	4726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018068	TTTA	2	8	4749	4756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018068	GTTT	2	8	5108	5115	0 %	75 %	25 %	0 %	392423465
18	NC_018068	TGCA	2	8	5597	5604	25 %	25 %	25 %	25 %	392423465
19	NC_018068	GGAC	2	8	6870	6877	25 %	0 %	50 %	25 %	392423466
20	NC_018068	TTTA	2	8	6900	6907	25 %	75 %	0 %	0 %	392423466
21	NC_018068	AGCC	2	8	8481	8488	25 %	0 %	25 %	50 %	392423466
22	NC_018068	ATAA	2	8	9314	9321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018068	TTCC	2	8	9479	9486	0 %	50 %	0 %	50 %	392423467
24	NC_018068	TTTG	2	8	9709	9716	0 %	75 %	25 %	0 %	392423467
25	NC_018068	TGAT	2	8	10786	10793	25 %	50 %	25 %	0 %	392423468
26	NC_018068	ATAC	2	8	11867	11874	50 %	25 %	0 %	25 %	392423469
27	NC_018068	TGTA	2	8	12852	12859	25 %	50 %	25 %	0 %	392423470
28	NC_018068	CCGT	2	8	13241	13248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018068	ATTT	2	8	13276	13283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018068	ATTT	2	8	13467	13474	25 %	75 %	0 %	0 %	392423471
31	NC_018068	CTAA	2	8	13921	13928	50 %	25 %	0 %	25 %	392423471
32	NC_018068	AAAT	2	8	14118	14125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018068	ATTT	2	8	14180	14187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018068	AAGA	2	8	14192	14199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018068	CAAT	2	8	16167	16174	50 %	25 %	0 %	25 %	392423473
36	NC_018068	TGGT	2	8	16673	16680	0 %	50 %	50 %	0 %	392423473
37	NC_018068	GTTG	2	8	16698	16705	0 %	50 %	50 %	0 %	392423473
38	NC_018068	ACGG	2	8	16750	16757	25 %	0 %	50 %	25 %	392423473
39	NC_018068	ACCC	2	8	17137	17144	25 %	0 %	0 %	75 %	392423473
40	NC_018068	AGTG	2	8	18633	18640	25 %	25 %	50 %	0 %	392423475
41	NC_018068	AAGA	2	8	18647	18654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018068	CTGG	2	8	18678	18685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018068	TCTT	2	8	18736	18743	0 %	75 %	0 %	25 %	392423476
44	NC_018068	AATT	2	8	18893	18900	50 %	50 %	0 %	0 %	392423476
45	NC_018068	ATGG	2	8	19264	19271	25 %	25 %	50 %	0 %	392423477
46	NC_018068	GGAA	2	8	19381	19388	50 %	0 %	50 %	0 %	392423477
47	NC_018068	GGAA	2	8	20481	20488	50 %	0 %	50 %	0 %	392423477
48	NC_018068	CGAT	2	8	20972	20979	25 %	25 %	25 %	25 %	392423477
49	NC_018068	TTTG	2	8	21846	21853	0 %	75 %	25 %	0 %	392423477
50	NC_018068	CCTT	2	8	22435	22442	0 %	50 %	0 %	50 %	392423477
51	NC_018068	AACC	2	8	22607	22614	50 %	0 %	0 %	50 %	392423477
52	NC_018068	AATT	2	8	22884	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018068	TTAT	2	8	23125	23132	25 %	75 %	0 %	0 %	392423478
54	NC_018068	GCAG	2	8	23205	23212	25 %	0 %	50 %	25 %	392423478
55	NC_018068	TTTA	2	8	23588	23595	25 %	75 %	0 %	0 %	392423478
56	NC_018068	CAAT	2	8	23619	23626	50 %	25 %	0 %	25 %	392423478
57	NC_018068	ACTT	2	8	24152	24159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018068	TTCT	2	8	26244	26251	0 %	75 %	0 %	25 %	392423480
59	NC_018068	TGCC	2	8	26385	26392	0 %	25 %	25 %	50 %	392423480
60	NC_018068	GAAA	2	8	27882	27889	75 %	0 %	25 %	0 %	392423481
61	NC_018068	TGTT	2	8	28226	28233	0 %	75 %	25 %	0 %	392423482
62	NC_018068	GTGG	2	8	28830	28837	0 %	25 %	75 %	0 %	392423483
63	NC_018068	CTGA	2	8	29106	29113	25 %	25 %	25 %	25 %	392423483
64	NC_018068	ATTT	2	8	30494	30501	25 %	75 %	0 %	0 %	392423484
65	NC_018068	TTTA	2	8	30732	30739	25 %	75 %	0 %	0 %	392423484
66	NC_018068	GTTA	2	8	30853	30860	25 %	50 %	25 %	0 %	392423484
67	NC_018068	AATG	2	8	31652	31659	50 %	25 %	25 %	0 %	392423485
68	NC_018068	GGGA	2	8	31932	31939	25 %	0 %	75 %	0 %	392423486
69	NC_018068	TTGT	2	8	31984	31991	0 %	75 %	25 %	0 %	392423486
70	NC_018068	TATG	2	8	32075	32082	25 %	50 %	25 %	0 %	392423487
71	NC_018068	GTGG	2	8	32744	32751	0 %	25 %	75 %	0 %	392423487
72	NC_018068	TTCT	2	8	33160	33167	0 %	75 %	0 %	25 %	392423488
73	NC_018068	TCAC	2	8	33292	33299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018068	GTAC	2	8	33660	33667	25 %	25 %	25 %	25 %	392423489
75	NC_018068	TAAT	2	8	34183	34190	50 %	50 %	0 %	0 %	392423489
76	NC_018068	AATT	2	8	34420	34427	50 %	50 %	0 %	0 %	392423489
77	NC_018068	GTAC	2	8	35247	35254	25 %	25 %	25 %	25 %	392423489
78	NC_018068	AGAA	2	8	35512	35519	75 %	0 %	25 %	0 %	392423490
79	NC_018068	CATC	2	8	35629	35636	25 %	25 %	0 %	50 %	392423490
80	NC_018068	AGAC	2	8	36045	36052	50 %	0 %	25 %	25 %	392423490
81	NC_018068	GAAA	2	8	36710	36717	75 %	0 %	25 %	0 %	392423491
82	NC_018068	CAAC	2	8	37314	37321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018068	ACTT	2	8	37564	37571	25 %	50 %	0 %	25 %	392423492
84	NC_018068	AATT	2	8	37585	37592	50 %	50 %	0 %	0 %	392423492
85	NC_018068	CAAG	2	8	39244	39251	50 %	0 %	25 %	25 %	392423493
86	NC_018068	TGAT	2	8	39836	39843	25 %	50 %	25 %	0 %	392423493
87	NC_018068	AGGC	2	8	40031	40038	25 %	0 %	50 %	25 %	392423493
88	NC_018068	TGTT	2	8	40230	40237	0 %	75 %	25 %	0 %	392423493
89	NC_018068	GGCA	2	8	40887	40894	25 %	0 %	50 %	25 %	392423494
90	NC_018068	AGCG	2	8	41197	41204	25 %	0 %	50 %	25 %	392423494
91	NC_018068	ATTG	2	8	41271	41278	25 %	50 %	25 %	0 %	392423494
92	NC_018068	TTTG	2	8	41473	41480	0 %	75 %	25 %	0 %	392423494
93	NC_018068	ACGC	2	8	41652	41659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018068	AAGG	2	8	41836	41843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018068	AATT	2	8	42750	42757	50 %	50 %	0 %	0 %	392423495
96	NC_018068	TAAT	2	8	42971	42978	50 %	50 %	0 %	0 %	392423495
97	NC_018068	CATA	2	8	43011	43018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018068	TTCT	2	8	43525	43532	0 %	75 %	0 %	25 %	392423496
99	NC_018068	AATA	2	8	44232	44239	75 %	25 %	0 %	0 %	392423496
100	NC_018068	AAAG	2	8	45293	45300	75 %	0 %	25 %	0 %	392423498
101	NC_018068	AGAA	2	8	45481	45488	75 %	0 %	25 %	0 %	392423498
102	NC_018068	GATG	2	8	45578	45585	25 %	25 %	50 %	0 %	392423498
103	NC_018068	TCAG	2	8	45709	45716	25 %	25 %	25 %	25 %	392423498
104	NC_018068	TGAG	2	8	45787	45794	25 %	25 %	50 %	0 %	392423498
105	NC_018068	TAAA	2	8	46518	46525	75 %	25 %	0 %	0 %	392423499
106	NC_018068	AATT	2	8	46885	46892	50 %	50 %	0 %	0 %	392423500
107	NC_018068	ATTT	2	8	47703	47710	25 %	75 %	0 %	0 %	392423501
108	NC_018068	GATT	2	8	48877	48884	25 %	50 %	25 %	0 %	392423502
109	NC_018068	ATAA	2	8	49022	49029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018068	GGAA	2	8	49085	49092	50 %	0 %	50 %	0 %	392423503
111	NC_018068	ATTG	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	392423504
112	NC_018068	CAAC	2	8	50528	50535	50 %	0 %	0 %	50 %	392423504
113	NC_018068	AACT	2	8	50602	50609	50 %	25 %	0 %	25 %	392423504
114	NC_018068	AATG	2	8	50696	50703	50 %	25 %	25 %	0 %	392423504
115	NC_018068	AGAT	2	8	51013	51020	50 %	25 %	25 %	0 %	392423504
116	NC_018068	AATT	2	8	51193	51200	50 %	50 %	0 %	0 %	392423504
117	NC_018068	TGAT	2	8	51457	51464	25 %	50 %	25 %	0 %	392423504
118	NC_018068	ATTT	2	8	51501	51508	25 %	75 %	0 %	0 %	392423504
119	NC_018068	AACG	2	8	51665	51672	50 %	0 %	25 %	25 %	392423504
120	NC_018068	GTGG	2	8	52590	52597	0 %	25 %	75 %	0 %	392423504
121	NC_018068	CTTG	2	8	53269	53276	0 %	50 %	25 %	25 %	392423505
122	NC_018068	AACG	2	8	54124	54131	50 %	0 %	25 %	25 %	392423506
123	NC_018068	CGGA	2	8	54201	54208	25 %	0 %	50 %	25 %	392423506
124	NC_018068	AAGC	2	8	54626	54633	50 %	0 %	25 %	25 %	392423507
125	NC_018068	GGGT	2	8	54671	54678	0 %	25 %	75 %	0 %	392423507
126	NC_018068	CCGC	2	8	54719	54726	0 %	0 %	25 %	75 %	392423507
127	NC_018068	ATTA	2	8	54891	54898	50 %	50 %	0 %	0 %	392423507
128	NC_018068	TTAT	2	8	55112	55119	25 %	75 %	0 %	0 %	392423507
129	NC_018068	CCAA	2	8	55864	55871	50 %	0 %	0 %	50 %	392423509
130	NC_018068	CATT	2	8	56934	56941	25 %	50 %	0 %	25 %	392423509
131	NC_018068	CCAA	2	8	57308	57315	50 %	0 %	0 %	50 %	392423510
132	NC_018068	TGAT	2	8	57342	57349	25 %	50 %	25 %	0 %	392423510
133	NC_018068	TGAT	2	8	57771	57778	25 %	50 %	25 %	0 %	392423510
134	NC_018068	TGGC	2	8	58133	58140	0 %	25 %	50 %	25 %	392423511
135	NC_018068	TAAC	2	8	58553	58560	50 %	25 %	0 %	25 %	392423511
136	NC_018068	AATG	2	8	58859	58866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018068	CGAA	2	8	59019	59026	50 %	0 %	25 %	25 %	392423512
138	NC_018068	GGCC	2	8	59304	59311	0 %	0 %	50 %	50 %	392423512
139	NC_018068	TTCT	2	8	59341	59348	0 %	75 %	0 %	25 %	392423512
140	NC_018068	TGAA	2	8	59666	59673	50 %	25 %	25 %	0 %	392423513
141	NC_018068	AAAT	2	8	59733	59740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018068	GACG	2	8	59820	59827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018068	GCAG	2	8	60623	60630	25 %	0 %	50 %	25 %	392423514
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