MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 94432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018068	AG	3	6	212381	212386	50 %	0 %	50 %	0 %	392423629
4002	NC_018068	CTTC	2	8	212583	212590	0 %	50 %	0 %	50 %	392423629
4003	NC_018068	TGC	2	6	212607	212612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423629
4004	NC_018068	AAT	2	6	212636	212641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423629
4005	NC_018068	ATA	2	6	212647	212652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423629
4006	NC_018068	ATCA	2	8	212725	212732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_018068	GAAT	2	8	212783	212790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018068	ATT	2	6	212814	212819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018068	ATG	2	6	212823	212828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018068	AAAGG	2	10	212877	212886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018068	ACA	2	6	212887	212892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_018068	GA	3	6	212959	212964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018068	ATA	2	6	212993	212998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018068	TTAA	2	8	213063	213070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018068	CAAAT	2	10	213165	213174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4016	NC_018068	GCA	2	6	213250	213255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423630
4017	NC_018068	GAA	2	6	213261	213266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423630
4018	NC_018068	TGA	2	6	213281	213286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423630
4019	NC_018068	TTTG	2	8	213289	213296	0 %	75 %	25 %	0 %	392423630
4020	NC_018068	TTG	2	6	213298	213303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423630
4021	NC_018068	CCG	2	6	213360	213365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423630
4022	NC_018068	GAG	2	6	213375	213380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423630
4023	NC_018068	ATG	2	6	213388	213393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423630
4024	NC_018068	AGT	2	6	213572	213577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423630
4025	NC_018068	TCCT	2	8	213649	213656	0 %	50 %	0 %	50 %	392423630
4026	NC_018068	GGA	2	6	213819	213824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423630
4027	NC_018068	TGCC	2	8	213889	213896	0 %	25 %	25 %	50 %	392423630
4028	NC_018068	CCA	2	6	213961	213966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423630
4029	NC_018068	AAG	2	6	214114	214119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423630
4030	NC_018068	GA	3	6	214154	214159	50 %	0 %	50 %	0 %	392423630
4031	NC_018068	CGT	2	6	214230	214235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423630
4032	NC_018068	AGG	2	6	214477	214482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423630
4033	NC_018068	ATTAA	2	10	214502	214511	60 %	40 %	0 %	0 %	392423631
4034	NC_018068	GATT	2	8	214549	214556	25 %	50 %	25 %	0 %	392423631
4035	NC_018068	CAA	2	6	214617	214622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
4036	NC_018068	GAGC	2	8	214661	214668	25 %	0 %	50 %	25 %	392423631
4037	NC_018068	GAA	2	6	214703	214708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4038	NC_018068	AGC	2	6	214738	214743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4039	NC_018068	GGC	2	6	214745	214750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423631
4040	NC_018068	TCG	2	6	214783	214788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4041	NC_018068	AGATG	2	10	214873	214882	40 %	20 %	40 %	0 %	392423631
4042	NC_018068	GAA	2	6	214895	214900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4043	NC_018068	AGA	2	6	214918	214923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4044	NC_018068	GTT	2	6	214937	214942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423631
4045	NC_018068	AGC	2	6	215100	215105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4046	NC_018068	TGC	2	6	215170	215175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4047	NC_018068	AGA	2	6	215377	215382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4048	NC_018068	AAG	2	6	215409	215414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4049	NC_018068	A	7	7	215463	215469	100 %	0 %	0 %	0 %	392423631
4050	NC_018068	TTC	2	6	215532	215537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423631
4051	NC_018068	AGAAA	2	10	215680	215689	80 %	0 %	20 %	0 %	392423631
4052	NC_018068	AGTT	2	8	215767	215774	25 %	50 %	25 %	0 %	392423631
4053	NC_018068	GCA	2	6	215956	215961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4054	NC_018068	CAG	2	6	215989	215994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4055	NC_018068	GGA	2	6	216055	216060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423631
4056	NC_018068	TC	3	6	216090	216095	0 %	50 %	0 %	50 %	392423631
4057	NC_018068	CAA	2	6	216104	216109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
4058	NC_018068	AG	3	6	216176	216181	50 %	0 %	50 %	0 %	392423631
4059	NC_018068	GAAA	2	8	216192	216199	75 %	0 %	25 %	0 %	392423631
4060	NC_018068	TGG	2	6	216204	216209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423631
4061	NC_018068	TCA	2	6	216292	216297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423631
4062	NC_018068	GAA	2	6	216335	216340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4063	NC_018068	TAA	2	6	216343	216348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423631
4064	NC_018068	AG	3	6	216400	216405	50 %	0 %	50 %	0 %	392423631
4065	NC_018068	CAA	2	6	216408	216413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
4066	NC_018068	GGCG	2	8	216414	216421	0 %	0 %	75 %	25 %	392423631
4067	NC_018068	GCT	2	6	216440	216445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4068	NC_018068	GACA	2	8	216481	216488	50 %	0 %	25 %	25 %	392423631
4069	NC_018068	GTT	2	6	216500	216505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423631
4070	NC_018068	GAA	2	6	216515	216520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4071	NC_018068	TAT	2	6	216522	216527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423631
4072	NC_018068	GAT	2	6	216530	216535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423631
4073	NC_018068	GAA	2	6	216551	216556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4074	NC_018068	GAG	2	6	216581	216586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423631
4075	NC_018068	AGA	2	6	216685	216690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4076	NC_018068	T	6	6	216766	216771	0 %	100 %	0 %	0 %	392423631
4077	NC_018068	G	6	6	216813	216818	0 %	0 %	100 %	0 %	392423631
4078	NC_018068	TC	3	6	216822	216827	0 %	50 %	0 %	50 %	392423631
4079	NC_018068	GCC	2	6	216875	216880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423631
4080	NC_018068	CAG	2	6	216941	216946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4081	NC_018068	GAA	2	6	216961	216966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4082	NC_018068	TGAGCT	2	12	216973	216984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392423631
4083	NC_018068	AGC	2	6	217012	217017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4084	NC_018068	CAG	2	6	217122	217127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4085	NC_018068	AAG	2	6	217139	217144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4086	NC_018068	AAG	2	6	217161	217166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4087	NC_018068	AGTA	2	8	217195	217202	50 %	25 %	25 %	0 %	392423631
4088	NC_018068	AGA	2	6	217291	217296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4089	NC_018068	CT	3	6	217349	217354	0 %	50 %	0 %	50 %	392423631
4090	NC_018068	CAG	2	6	217361	217366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4091	NC_018068	GAA	2	6	217436	217441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4092	NC_018068	TGGC	2	8	217442	217449	0 %	25 %	50 %	25 %	392423631
4093	NC_018068	GAA	2	6	217550	217555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
4094	NC_018068	CTTA	2	8	217603	217610	25 %	50 %	0 %	25 %	392423631
4095	NC_018068	CTG	2	6	217681	217686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423631
4096	NC_018068	AAC	2	6	217707	217712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
4097	NC_018068	GATA	2	8	217738	217745	50 %	25 %	25 %	0 %	392423631
4098	NC_018068	GAT	2	6	217769	217774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423631
4099	NC_018068	C	6	6	217887	217892	0 %	0 %	0 %	100 %	392423631
4100	NC_018068	TTC	2	6	217898	217903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423631
4101	NC_018068	TGA	2	6	217953	217958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423631
4102	NC_018068	AAT	2	6	217999	218004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423631
4103	NC_018068	ATT	2	6	218140	218145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018068	AAT	2	6	218148	218153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018068	TA	3	6	218186	218191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018068	AAG	2	6	218197	218202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018068	AGT	2	6	218284	218289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018068	ACT	2	6	218359	218364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_018068	CGTT	2	8	218438	218445	0 %	50 %	25 %	25 %	392423632
4110	NC_018068	AGA	2	6	218473	218478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423632
4111	NC_018068	GA	3	6	218573	218578	50 %	0 %	50 %	0 %	392423632
4112	NC_018068	GAAC	2	8	218587	218594	50 %	0 %	25 %	25 %	392423632
4113	NC_018068	CTT	2	6	218635	218640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423632
4114	NC_018068	ATT	2	6	218695	218700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423632
4115	NC_018068	TGC	2	6	218721	218726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423632
4116	NC_018068	TGA	2	6	218728	218733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423632
4117	NC_018068	TA	3	6	218745	218750	50 %	50 %	0 %	0 %	392423632
4118	NC_018068	CTG	2	6	218823	218828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423632
4119	NC_018068	GAG	2	6	218858	218863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423632
4120	NC_018068	AGA	2	6	218986	218991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423632
4121	NC_018068	TTTG	2	8	219009	219016	0 %	75 %	25 %	0 %	392423632
4122	NC_018068	ATT	2	6	219033	219038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423632
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4124	NC_018068	A	6	6	219125	219130	100 %	0 %	0 %	0 %	392423632
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4249	NC_018068	AAG	2	6	227054	227059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423640
4250	NC_018068	AAC	2	6	227131	227136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423640
4251	NC_018068	TGT	2	6	227172	227177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423640
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4256	NC_018068	AACGT	2	10	227363	227372	40 %	20 %	20 %	20 %	392423640
4257	NC_018068	ATT	2	6	227396	227401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423640
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4265	NC_018068	ATTT	2	8	227874	227881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_018068	TTA	2	6	227897	227902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423641
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4269	NC_018068	TGC	2	6	228147	228152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423641
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4293	NC_018068	TGC	2	6	229201	229206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4296	NC_018068	AATA	2	8	229309	229316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_018068	GAG	2	6	229325	229330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4310	NC_018068	AG	3	6	230140	230145	50 %	0 %	50 %	0 %	392423643
4311	NC_018068	ATC	3	9	230185	230193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423643
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4313	NC_018068	AACC	2	8	230278	230285	50 %	0 %	0 %	50 %	392423643
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4352	NC_018068	GGCCA	2	10	232229	232238	20 %	0 %	40 %	40 %	392423645
4353	NC_018068	CAT	2	6	232328	232333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423645
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4355	NC_018068	AG	4	8	232384	232391	50 %	0 %	50 %	0 %	392423645
4356	NC_018068	GCA	2	6	232392	232397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423645
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4358	NC_018068	TCC	2	6	232508	232513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423645
4359	NC_018068	A	6	6	232563	232568	100 %	0 %	0 %	0 %	392423645
4360	NC_018068	ACC	2	6	232572	232577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4361	NC_018068	ACT	2	6	232600	232605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4362	NC_018068	TAC	2	6	232630	232635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4363	NC_018068	T	6	6	232650	232655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_018068	ATA	2	6	232701	232706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_018068	AAGG	2	8	232707	232714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_018068	GCT	2	6	232805	232810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423646
4367	NC_018068	GTTA	2	8	232856	232863	25 %	50 %	25 %	0 %	392423646
4368	NC_018068	C	6	6	232866	232871	0 %	0 %	0 %	100 %	392423646
4369	NC_018068	AAG	2	6	232994	232999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423646
4370	NC_018068	TTA	2	6	233067	233072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423646
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4372	NC_018068	TGC	2	6	233133	233138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423646
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4498	NC_018068	TA	3	6	239277	239282	50 %	50 %	0 %	0 %	392423651
4499	NC_018068	A	6	6	239292	239297	100 %	0 %	0 %	0 %	392423651
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