MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 94432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018068	CCT	2	6	163288	163293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_018068	CAA	2	6	163327	163332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_018068	GCA	2	6	163409	163414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_018068	TCAT	2	8	163441	163448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_018068	AAAC	2	8	163673	163680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_018068	TATCG	2	10	164013	164022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_018068	AAT	3	9	164102	164110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_018068	AAT	2	6	164189	164194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_018068	AAGAA	2	10	164220	164229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_018068	GAG	2	6	164281	164286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_018068	ATT	2	6	164311	164316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423583
3012	NC_018068	A	6	6	164341	164346	100 %	0 %	0 %	0 %	392423583
3013	NC_018068	TTG	2	6	164431	164436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423583
3014	NC_018068	CTT	2	6	164514	164519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423583
3015	NC_018068	CAT	2	6	164520	164525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423583
3016	NC_018068	TGC	2	6	164558	164563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423583
3017	NC_018068	ATTTA	2	10	164565	164574	40 %	60 %	0 %	0 %	392423583
3018	NC_018068	TGC	2	6	164651	164656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423583
3019	NC_018068	AGC	2	6	164820	164825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423584
3020	NC_018068	GGT	2	6	164827	164832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423584
3021	NC_018068	A	6	6	164872	164877	100 %	0 %	0 %	0 %	392423584
3022	NC_018068	ATC	2	6	165001	165006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423584
3023	NC_018068	TTA	2	6	165080	165085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423584
3024	NC_018068	ACA	2	6	165141	165146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423584
3025	NC_018068	A	6	6	165153	165158	100 %	0 %	0 %	0 %	392423584
3026	NC_018068	GAA	2	6	165175	165180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423584
3027	NC_018068	TGAG	2	8	165212	165219	25 %	25 %	50 %	0 %	392423584
3028	NC_018068	ACCTTT	2	12	165265	165276	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392423584
3029	NC_018068	TAT	2	6	165336	165341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423584
3030	NC_018068	CT	3	6	165456	165461	0 %	50 %	0 %	50 %	392423584
3031	NC_018068	AATT	2	8	165524	165531	50 %	50 %	0 %	0 %	392423584
3032	NC_018068	AT	3	6	165586	165591	50 %	50 %	0 %	0 %	392423584
3033	NC_018068	GTA	2	6	165610	165615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423584
3034	NC_018068	AT	3	6	165621	165626	50 %	50 %	0 %	0 %	392423584
3035	NC_018068	GA	3	6	165720	165725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_018068	TTG	2	6	165812	165817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423585
3037	NC_018068	ATC	2	6	165828	165833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423585
3038	NC_018068	GAA	3	9	165860	165868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423585
3039	NC_018068	CCG	2	6	165882	165887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423585
3040	NC_018068	GCA	3	9	165896	165904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423585
3041	NC_018068	CAATAA	2	12	165964	165975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392423585
3042	NC_018068	TG	3	6	165981	165986	0 %	50 %	50 %	0 %	392423585
3043	NC_018068	GAA	2	6	166028	166033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423585
3044	NC_018068	TGT	2	6	166054	166059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423585
3045	NC_018068	AAG	2	6	166077	166082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423585
3046	NC_018068	TGT	2	6	166168	166173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423585
3047	NC_018068	TTA	2	6	166302	166307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423585
3048	NC_018068	CCT	2	6	166455	166460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423585
3049	NC_018068	A	6	6	166502	166507	100 %	0 %	0 %	0 %	392423585
3050	NC_018068	GAT	2	6	166513	166518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423585
3051	NC_018068	AGA	2	6	166550	166555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_018068	ATAA	2	8	166563	166570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_018068	AAT	2	6	166631	166636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_018068	AAT	2	6	166663	166668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_018068	ATA	2	6	166717	166722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_018068	TGC	2	6	166756	166761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_018068	CGG	2	6	166763	166768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_018068	AGT	2	6	166778	166783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_018068	GTT	2	6	166928	166933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423586
3060	NC_018068	CTTC	2	8	167026	167033	0 %	50 %	0 %	50 %	392423587
3061	NC_018068	TTTA	2	8	167055	167062	25 %	75 %	0 %	0 %	392423587
3062	NC_018068	TCC	2	6	167122	167127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423587
3063	NC_018068	T	7	7	167134	167140	0 %	100 %	0 %	0 %	392423587
3064	NC_018068	TTC	2	6	167319	167324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423587
3065	NC_018068	ACA	2	6	167389	167394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423587
3066	NC_018068	AAT	2	6	167460	167465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423587
3067	NC_018068	AACC	2	8	167521	167528	50 %	0 %	0 %	50 %	392423587
3068	NC_018068	TTC	2	6	167577	167582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423587
3069	NC_018068	TAT	2	6	167594	167599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423587
3070	NC_018068	CCT	2	6	167600	167605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423587
3071	NC_018068	AAT	2	6	167625	167630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423587
3072	NC_018068	GAG	2	6	167661	167666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423587
3073	NC_018068	T	6	6	167744	167749	0 %	100 %	0 %	0 %	392423587
3074	NC_018068	CTT	2	6	167764	167769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423587
3075	NC_018068	TCT	2	6	167776	167781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423587
3076	NC_018068	AAG	2	6	167936	167941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423587
3077	NC_018068	CT	3	6	168129	168134	0 %	50 %	0 %	50 %	392423587
3078	NC_018068	CAA	2	6	168142	168147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423587
3079	NC_018068	ATT	2	6	168181	168186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423587
3080	NC_018068	GTTT	2	8	168209	168216	0 %	75 %	25 %	0 %	392423588
3081	NC_018068	GAA	2	6	168230	168235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423588
3082	NC_018068	AAG	2	6	168245	168250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423588
3083	NC_018068	AG	3	6	168344	168349	50 %	0 %	50 %	0 %	392423588
3084	NC_018068	GAA	2	6	168358	168363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423588
3085	NC_018068	CAA	2	6	168409	168414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423588
3086	NC_018068	GA	3	6	168486	168491	50 %	0 %	50 %	0 %	392423588
3087	NC_018068	AACG	2	8	168535	168542	50 %	0 %	25 %	25 %	392423588
3088	NC_018068	GTTTT	2	10	168661	168670	0 %	80 %	20 %	0 %	392423588
3089	NC_018068	T	7	7	168667	168673	0 %	100 %	0 %	0 %	392423588
3090	NC_018068	TAA	2	6	168695	168700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423588
3091	NC_018068	TAC	2	6	168710	168715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423588
3092	NC_018068	T	6	6	168772	168777	0 %	100 %	0 %	0 %	392423588
3093	NC_018068	CAG	2	6	168821	168826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423588
3094	NC_018068	AAAG	2	8	168928	168935	75 %	0 %	25 %	0 %	392423588
3095	NC_018068	GTT	2	6	168975	168980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423588
3096	NC_018068	AAG	2	6	168981	168986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423588
3097	NC_018068	AAG	2	6	169040	169045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423588
3098	NC_018068	ATA	2	6	169120	169125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423588
3099	NC_018068	A	6	6	169221	169226	100 %	0 %	0 %	0 %	392423588
3100	NC_018068	GAA	2	6	169316	169321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018068	ATTT	2	8	169327	169334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018068	AGG	2	6	169404	169409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423589
3103	NC_018068	CCA	2	6	169479	169484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423589
3104	NC_018068	AAT	2	6	169494	169499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423589
3105	NC_018068	TGA	2	6	169576	169581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423589
3106	NC_018068	GTG	2	6	169663	169668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423589
3107	NC_018068	GAC	2	6	169686	169691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423589
3108	NC_018068	AGG	2	6	169694	169699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423589
3109	NC_018068	CGG	2	6	169748	169753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423589
3110	NC_018068	GCT	2	6	169759	169764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423589
3111	NC_018068	TGA	2	6	169948	169953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423589
3112	NC_018068	AAAG	2	8	169998	170005	75 %	0 %	25 %	0 %	392423589
3113	NC_018068	AAT	2	6	170051	170056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423589
3114	NC_018068	AATA	2	8	170086	170093	75 %	25 %	0 %	0 %	392423589
3115	NC_018068	GTCA	2	8	170121	170128	25 %	25 %	25 %	25 %	392423589
3116	NC_018068	TCC	2	6	170138	170143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423589
3117	NC_018068	CTT	2	6	170291	170296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423589
3118	NC_018068	ATG	2	6	170342	170347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423589
3119	NC_018068	GTTT	2	8	170353	170360	0 %	75 %	25 %	0 %	392423589
3120	NC_018068	ACGA	2	8	170463	170470	50 %	0 %	25 %	25 %	392423589
3121	NC_018068	TTC	2	6	170487	170492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423589
3122	NC_018068	TCG	2	6	170593	170598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423589
3123	NC_018068	CTT	2	6	170609	170614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423589
3124	NC_018068	GTC	2	6	170808	170813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423589
3125	NC_018068	T	6	6	170859	170864	0 %	100 %	0 %	0 %	392423589
3126	NC_018068	GA	3	6	170899	170904	50 %	0 %	50 %	0 %	392423589
3127	NC_018068	T	7	7	170925	170931	0 %	100 %	0 %	0 %	392423589
3128	NC_018068	CCT	2	6	170978	170983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_018068	GGAT	2	8	171009	171016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_018068	ACAG	2	8	171022	171029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_018068	AAGG	2	8	171168	171175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_018068	TGC	2	6	171185	171190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3134	NC_018068	A	6	6	171218	171223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_018068	TTC	2	6	171246	171251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_018068	TCC	2	6	171280	171285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_018068	TTGG	2	8	171320	171327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_018068	T	7	7	171364	171370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_018068	T	8	8	171382	171389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_018068	CTTC	2	8	171403	171410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_018068	ATCATG	2	12	171416	171427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3142	NC_018068	A	6	6	171473	171478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_018068	AAGA	2	8	171481	171488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_018068	AAG	2	6	171499	171504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_018068	ACGA	2	8	171507	171514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3146	NC_018068	AC	3	6	171557	171562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3147	NC_018068	TA	4	8	171563	171570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_018068	TA	4	8	171594	171601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_018068	G	6	6	171602	171607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_018068	GAA	2	6	171609	171614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3160	NC_018068	ATA	2	6	172098	172103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_018068	A	6	6	172146	172151	100 %	0 %	0 %	0 %	392423591
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3203	NC_018068	TAA	3	9	174559	174567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3204	NC_018068	TAA	2	6	174609	174614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3222	NC_018068	AT	3	6	175458	175463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_018068	GAT	2	6	175532	175537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423593
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3232	NC_018068	TTG	2	6	176048	176053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_018068	GGA	2	6	176083	176088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423594
3234	NC_018068	AAT	2	6	176105	176110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423594
3235	NC_018068	CGAC	2	8	176217	176224	25 %	0 %	25 %	50 %	392423594
3236	NC_018068	CTC	2	6	176248	176253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423594
3237	NC_018068	AG	3	6	176295	176300	50 %	0 %	50 %	0 %	392423594
3238	NC_018068	AAC	2	6	176303	176308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423594
3239	NC_018068	AG	3	6	176377	176382	50 %	0 %	50 %	0 %	392423594
3240	NC_018068	GCT	2	6	176415	176420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423594
3241	NC_018068	CTTT	2	8	176430	176437	0 %	75 %	0 %	25 %	392423594
3242	NC_018068	A	6	6	176440	176445	100 %	0 %	0 %	0 %	392423594
3243	NC_018068	TAA	2	6	176464	176469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423594
3244	NC_018068	AGTTA	2	10	176512	176521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_018068	TCAC	2	8	176656	176663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3246	NC_018068	T	6	6	176695	176700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_018068	TGT	2	6	176708	176713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_018068	AAG	2	6	176728	176733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_018068	TAAC	2	8	176838	176845	50 %	25 %	0 %	25 %	392423595
3250	NC_018068	GAA	2	6	176914	176919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423595
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