MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 94432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018068	GGCT	2	8	603288	603295	0 %	25 %	50 %	25 %	392424003
11502	NC_018068	GCG	2	6	603319	603324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392424003
11503	NC_018068	CGG	2	6	603331	603336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392424003
11504	NC_018068	ATC	2	6	603337	603342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424003
11505	NC_018068	GGC	2	6	603372	603377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392424003
11506	NC_018068	GCA	2	6	603378	603383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392424003
11507	NC_018068	GATA	2	8	603412	603419	50 %	25 %	25 %	0 %	392424003
11508	NC_018068	CTC	2	6	603463	603468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392424003
11509	NC_018068	TCT	2	6	603518	603523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392424003
11510	NC_018068	TCA	2	6	603585	603590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424003
11511	NC_018068	TGA	2	6	603604	603609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_018068	AGC	2	6	603675	603680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_018068	CTC	2	6	603713	603718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392424004
11514	NC_018068	CCT	2	6	603831	603836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392424005
11515	NC_018068	TCGG	2	8	603842	603849	0 %	25 %	50 %	25 %	392424005
11516	NC_018068	ACTT	2	8	603872	603879	25 %	50 %	0 %	25 %	392424005
11517	NC_018068	AGA	2	6	603899	603904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424005
11518	NC_018068	TCT	2	6	603912	603917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392424005
11519	NC_018068	TTC	2	6	604004	604009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392424005
11520	NC_018068	CAT	2	6	604124	604129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424005
11521	NC_018068	GAA	2	6	604135	604140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424005
11522	NC_018068	TTAGA	2	10	604147	604156	40 %	40 %	20 %	0 %	392424005
11523	NC_018068	GAG	2	6	604222	604227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424005
11524	NC_018068	TCT	2	6	604302	604307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392424005
11525	NC_018068	TCC	2	6	604344	604349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392424005
11526	NC_018068	GAA	2	6	604371	604376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424005
11527	NC_018068	AGG	3	9	604460	604468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424005
11528	NC_018068	TA	3	6	604493	604498	50 %	50 %	0 %	0 %	392424005
11529	NC_018068	TGT	2	6	604644	604649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392424005
11530	NC_018068	CAG	2	6	604697	604702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392424005
11531	NC_018068	GAG	2	6	604774	604779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424005
11532	NC_018068	AGA	2	6	605016	605021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424005
11533	NC_018068	CCTT	2	8	605027	605034	0 %	50 %	0 %	50 %	392424005
11534	NC_018068	TAA	2	6	605048	605053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392424005
11535	NC_018068	AAC	2	6	605108	605113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392424005
11536	NC_018068	CGG	2	6	605247	605252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392424005
11537	NC_018068	GTT	2	6	605289	605294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392424005
11538	NC_018068	CGTT	2	8	605338	605345	0 %	50 %	25 %	25 %	392424005
11539	NC_018068	AAC	2	6	605351	605356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392424005
11540	NC_018068	GAG	2	6	605464	605469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424005
11541	NC_018068	ATTC	2	8	605488	605495	25 %	50 %	0 %	25 %	392424005
11542	NC_018068	GTT	2	6	605562	605567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_018068	ATT	2	6	605620	605625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_018068	GCG	2	6	605666	605671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392424006
11545	NC_018068	GAA	2	6	605673	605678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424006
11546	NC_018068	AGTGT	2	10	605698	605707	20 %	40 %	40 %	0 %	392424006
11547	NC_018068	AAG	2	6	605710	605715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424006
11548	NC_018068	GAG	2	6	605793	605798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424006
11549	NC_018068	TGT	2	6	605859	605864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392424006
11550	NC_018068	TTG	2	6	605959	605964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392424006
11551	NC_018068	AG	3	6	605993	605998	50 %	0 %	50 %	0 %	392424006
11552	NC_018068	GGGAT	2	10	606071	606080	20 %	20 %	60 %	0 %	392424006
11553	NC_018068	TTA	2	6	606086	606091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392424006
11554	NC_018068	TGC	2	6	606095	606100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392424006
11555	NC_018068	TGCA	2	8	606199	606206	25 %	25 %	25 %	25 %	392424006
11556	NC_018068	CGA	2	6	606224	606229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392424006
11557	NC_018068	TTC	2	6	606252	606257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392424006
11558	NC_018068	GAG	2	6	606335	606340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424006
11559	NC_018068	GCT	3	9	606358	606366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392424006
11560	NC_018068	TAA	2	6	606386	606391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392424006
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11562	NC_018068	ACAT	2	8	606547	606554	50 %	25 %	0 %	25 %	392424006
11563	NC_018068	GTT	2	6	606627	606632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392424006
11564	NC_018068	TGA	2	6	606641	606646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392424006
11565	NC_018068	TAT	2	6	606656	606661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392424006
11566	NC_018068	CGC	2	6	606662	606667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392424006
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11569	NC_018068	TGA	2	6	606893	606898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392424006
11570	NC_018068	TCG	2	6	607007	607012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392424006
11571	NC_018068	CGA	2	6	607121	607126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392424006
11572	NC_018068	TA	3	6	607145	607150	50 %	50 %	0 %	0 %	392424006
11573	NC_018068	TG	3	6	607199	607204	0 %	50 %	50 %	0 %	392424006
11574	NC_018068	C	7	7	607209	607215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11575	NC_018068	T	6	6	607216	607221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_018068	GTATT	2	10	607255	607264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_018068	AC	3	6	607285	607290	50 %	0 %	0 %	50 %	392424007
11578	NC_018068	TGC	2	6	607323	607328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392424007
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11580	NC_018068	GTG	2	6	607489	607494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392424007
11581	NC_018068	TAGC	2	8	607495	607502	25 %	25 %	25 %	25 %	392424007
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11584	NC_018068	TGA	2	6	607677	607682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392424007
11585	NC_018068	AAG	2	6	607689	607694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424007
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11587	NC_018068	AAT	2	6	607790	607795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392424007
11588	NC_018068	GCG	2	6	607837	607842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392424007
11589	NC_018068	AAATA	2	10	607897	607906	80 %	20 %	0 %	0 %	392424007
11590	NC_018068	GCT	2	6	607922	607927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392424007
11591	NC_018068	AGA	2	6	607930	607935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424007
11592	NC_018068	AAT	2	6	607952	607957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392424007
11593	NC_018068	TCA	2	6	608001	608006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424007
11594	NC_018068	CAT	2	6	608011	608016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424007
11595	NC_018068	AT	3	6	608015	608020	50 %	50 %	0 %	0 %	392424007
11596	NC_018068	CGGGGA	2	12	608085	608096	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	392424007
11597	NC_018068	GA	3	6	608167	608172	50 %	0 %	50 %	0 %	392424007
11598	NC_018068	AAG	2	6	608225	608230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392424007
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11601	NC_018068	ATAA	2	8	608276	608283	75 %	25 %	0 %	0 %	392424007
11602	NC_018068	CCT	2	6	608300	608305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_018068	TAA	2	6	608317	608322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_018068	TAA	2	6	608333	608338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_018068	CTG	2	6	608481	608486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_018068	ACA	2	6	608500	608505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_018068	TCC	2	6	608520	608525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11608	NC_018068	TCAA	2	8	608553	608560	50 %	25 %	0 %	25 %	392424008
11609	NC_018068	CAT	3	9	608792	608800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424008
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11611	NC_018068	CAT	2	6	608893	608898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424008
11612	NC_018068	GA	3	6	608922	608927	50 %	0 %	50 %	0 %	392424008
11613	NC_018068	ATG	2	6	609012	609017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392424008
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11615	NC_018068	ACG	2	6	609060	609065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392424009
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11617	NC_018068	ACT	2	6	609115	609120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392424009
11618	NC_018068	A	6	6	609124	609129	100 %	0 %	0 %	0 %	392424009
11619	NC_018068	AGG	2	6	609136	609141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392424009
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11621	NC_018068	GTT	2	6	609483	609488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392424009
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11862	NC_018068	TA	3	6	624820	624825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11863	NC_018068	AAAG	2	8	624832	624839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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