MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TC	4	8	578	585	0 %	50 %	0 %	50 %	392423389
2	NC_018066	AT	3	6	1917	1922	50 %	50 %	0 %	0 %	392423391
3	NC_018066	AG	3	6	2191	2196	50 %	0 %	50 %	0 %	392423391
4	NC_018066	CT	3	6	2203	2208	0 %	50 %	0 %	50 %	392423391
5	NC_018066	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	392423392
6	NC_018066	CT	3	6	3267	3272	0 %	50 %	0 %	50 %	392423392
7	NC_018066	TA	3	6	3301	3306	50 %	50 %	0 %	0 %	392423392
8	NC_018066	TC	3	6	4930	4935	0 %	50 %	0 %	50 %	392423394
9	NC_018066	TG	3	6	7576	7581	0 %	50 %	50 %	0 %	392423399
10	NC_018066	GT	3	6	8024	8029	0 %	50 %	50 %	0 %	392423400
11	NC_018066	GA	3	6	8778	8783	50 %	0 %	50 %	0 %	392423402
12	NC_018066	AG	3	6	10259	10264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018066	AT	3	6	11141	11146	50 %	50 %	0 %	0 %	392423405
14	NC_018066	AT	4	8	12183	12190	50 %	50 %	0 %	0 %	392423406
15	NC_018066	TG	3	6	14492	14497	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
16	NC_018066	TG	3	6	14753	14758	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
17	NC_018066	TA	3	6	15004	15009	50 %	50 %	0 %	0 %	392423407
18	NC_018066	TG	3	6	15196	15201	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
19	NC_018066	CA	3	6	17936	17941	50 %	0 %	0 %	50 %	392423407
20	NC_018066	AG	3	6	18090	18095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018066	TG	3	6	18803	18808	0 %	50 %	50 %	0 %	392423408
22	NC_018066	GA	3	6	18809	18814	50 %	0 %	50 %	0 %	392423408
23	NC_018066	CA	3	6	19075	19080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018066	TA	3	6	19085	19090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018066	GC	3	6	20324	20329	0 %	0 %	50 %	50 %	392423410
26	NC_018066	CT	3	6	20901	20906	0 %	50 %	0 %	50 %	392423411
27	NC_018066	TA	3	6	21540	21545	50 %	50 %	0 %	0 %	392423411
28	NC_018066	AT	3	6	21630	21635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018066	AG	3	6	21997	22002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018066	TA	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	392423414
31	NC_018066	AG	4	8	24968	24975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018066	AG	3	6	24980	24985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018066	CA	3	6	25632	25637	50 %	0 %	0 %	50 %	392423418
34	NC_018066	AG	3	6	25810	25815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018066	AG	3	6	25857	25862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018066	AG	3	6	26520	26525	50 %	0 %	50 %	0 %	392423419
37	NC_018066	AT	3	6	26546	26551	50 %	50 %	0 %	0 %	392423419
38	NC_018066	AT	3	6	26838	26843	50 %	50 %	0 %	0 %	392423419
39	NC_018066	GA	3	6	26897	26902	50 %	0 %	50 %	0 %	392423419
40	NC_018066	AG	3	6	27409	27414	50 %	0 %	50 %	0 %	392423420
41	NC_018066	TA	3	6	27944	27949	50 %	50 %	0 %	0 %	392423421
42	NC_018066	AT	3	6	28420	28425	50 %	50 %	0 %	0 %	392423421
43	NC_018066	GA	3	6	28770	28775	50 %	0 %	50 %	0 %	392423422
44	NC_018066	GA	3	6	29326	29331	50 %	0 %	50 %	0 %	392423422
45	NC_018066	TA	3	6	29477	29482	50 %	50 %	0 %	0 %	392423423
46	NC_018066	GA	3	6	30577	30582	50 %	0 %	50 %	0 %	392423424
47	NC_018066	AG	3	6	30966	30971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018066	CT	4	8	31345	31352	0 %	50 %	0 %	50 %	392423425
49	NC_018066	AT	4	8	31576	31583	50 %	50 %	0 %	0 %	392423425
50	NC_018066	CT	3	6	31680	31685	0 %	50 %	0 %	50 %	392423425
51	NC_018066	CT	3	6	31779	31784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018066	AT	3	6	31790	31795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018066	TA	3	6	31817	31822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018066	TA	3	6	32915	32920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018066	TA	3	6	33545	33550	50 %	50 %	0 %	0 %	392423427
56	NC_018066	CT	3	6	34961	34966	0 %	50 %	0 %	50 %	392423429
57	NC_018066	TA	3	6	35001	35006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018066	AT	3	6	35027	35032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018066	AT	3	6	35374	35379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018066	TC	3	6	35499	35504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018066	GA	4	8	37182	37189	50 %	0 %	50 %	0 %	392423431
62	NC_018066	GA	3	6	38381	38386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018066	AT	3	6	38872	38877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018066	AT	3	6	39978	39983	50 %	50 %	0 %	0 %	392423435
65	NC_018066	AT	3	6	40109	40114	50 %	50 %	0 %	0 %	392423435
66	NC_018066	AG	3	6	40208	40213	50 %	0 %	50 %	0 %	392423435
67	NC_018066	AG	3	6	41950	41955	50 %	0 %	50 %	0 %	392423438
68	NC_018066	AT	3	6	42186	42191	50 %	50 %	0 %	0 %	392423439
69	NC_018066	AT	3	6	42547	42552	50 %	50 %	0 %	0 %	392423439
70	NC_018066	GA	3	6	42563	42568	50 %	0 %	50 %	0 %	392423439
71	NC_018066	TA	3	6	42913	42918	50 %	50 %	0 %	0 %	392423440
72	NC_018066	TA	3	6	43301	43306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018066	TA	4	8	43331	43338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018066	TG	3	6	43510	43515	0 %	50 %	50 %	0 %	392423441
75	NC_018066	GA	3	6	43593	43598	50 %	0 %	50 %	0 %	392423441
76	NC_018066	AT	3	6	44023	44028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018066	AT	3	6	44047	44052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018066	AT	3	6	44751	44756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018066	AT	3	6	45058	45063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018066	AT	3	6	45701	45706	50 %	50 %	0 %	0 %	392423444
81	NC_018066	TC	3	6	46962	46967	0 %	50 %	0 %	50 %	392423446
82	NC_018066	AT	3	6	47301	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	392423446
83	NC_018066	AT	3	6	48615	48620	50 %	50 %	0 %	0 %	392423448
84	NC_018066	GA	3	6	49793	49798	50 %	0 %	50 %	0 %	392423450
85	NC_018066	CT	3	6	50722	50727	0 %	50 %	0 %	50 %	392423450
86	NC_018066	GA	3	6	50963	50968	50 %	0 %	50 %	0 %	392423450
87	NC_018066	AG	3	6	51155	51160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018066	CA	3	6	53675	53680	50 %	0 %	0 %	50 %	392423453
89	NC_018066	GA	3	6	53732	53737	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
90	NC_018066	GA	3	6	54709	54714	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
91	NC_018066	GA	4	8	54830	54837	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
92	NC_018066	AG	3	6	55333	55338	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
93	NC_018066	AT	3	6	56650	56655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018066	AT	3	6	57199	57204	50 %	50 %	0 %	0 %	392423455
95	NC_018066	TA	3	6	59566	59571	50 %	50 %	0 %	0 %	392423457
96	NC_018066	CT	3	6	59797	59802	0 %	50 %	0 %	50 %	392423458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.