MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TAAT	2	8	127	134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018066	CCGA	2	8	425	432	25 %	0 %	25 %	50 %	392423389
3	NC_018066	ATTC	2	8	1332	1339	25 %	50 %	0 %	25 %	392423390
4	NC_018066	TCAG	2	8	1345	1352	25 %	25 %	25 %	25 %	392423390
5	NC_018066	ACTC	2	8	1766	1773	25 %	25 %	0 %	50 %	392423391
6	NC_018066	TGGG	2	8	2246	2253	0 %	25 %	75 %	0 %	392423391
7	NC_018066	TTGA	2	8	2759	2766	25 %	50 %	25 %	0 %	392423391
8	NC_018066	TCTT	2	8	2963	2970	0 %	75 %	0 %	25 %	392423392
9	NC_018066	ATTA	2	8	3225	3232	50 %	50 %	0 %	0 %	392423392
10	NC_018066	GAAA	2	8	3742	3749	75 %	0 %	25 %	0 %	392423392
11	NC_018066	TTAT	2	8	3818	3825	25 %	75 %	0 %	0 %	392423392
12	NC_018066	TTAC	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	392423393
13	NC_018066	TTCT	2	8	4230	4237	0 %	75 %	0 %	25 %	392423393
14	NC_018066	ATCT	2	8	4347	4354	25 %	50 %	0 %	25 %	392423393
15	NC_018066	TATC	2	8	4911	4918	25 %	50 %	0 %	25 %	392423394
16	NC_018066	TTTA	2	8	5309	5316	25 %	75 %	0 %	0 %	392423396
17	NC_018066	AATT	2	8	5636	5643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018066	CAAT	2	8	5865	5872	50 %	25 %	0 %	25 %	392423397
19	NC_018066	GACA	2	8	5874	5881	50 %	0 %	25 %	25 %	392423397
20	NC_018066	GCAA	2	8	5886	5893	50 %	0 %	25 %	25 %	392423397
21	NC_018066	TTTA	2	8	5946	5953	25 %	75 %	0 %	0 %	392423397
22	NC_018066	AAGC	2	8	6317	6324	50 %	0 %	25 %	25 %	392423397
23	NC_018066	ATGT	2	8	6736	6743	25 %	50 %	25 %	0 %	392423398
24	NC_018066	GTTT	2	8	6747	6754	0 %	75 %	25 %	0 %	392423398
25	NC_018066	TTTG	2	8	7346	7353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018066	AGGG	2	8	7436	7443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018066	GATG	2	8	7711	7718	25 %	25 %	50 %	0 %	392423399
28	NC_018066	TATT	2	8	7829	7836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018066	GTAT	2	8	8449	8456	25 %	50 %	25 %	0 %	392423401
30	NC_018066	ACCG	2	8	8948	8955	25 %	0 %	25 %	50 %	392423403
31	NC_018066	TAAA	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018066	TAAA	2	8	10053	10060	75 %	25 %	0 %	0 %	392423404
33	NC_018066	CAGA	2	8	10187	10194	50 %	0 %	25 %	25 %	392423404
34	NC_018066	AGAC	2	8	10248	10255	50 %	0 %	25 %	25 %	392423404
35	NC_018066	ATCA	2	8	10897	10904	50 %	25 %	0 %	25 %	392423405
36	NC_018066	ATGG	2	8	11097	11104	25 %	25 %	50 %	0 %	392423405
37	NC_018066	GGTG	2	8	11771	11778	0 %	25 %	75 %	0 %	392423406
38	NC_018066	GACC	2	8	11813	11820	25 %	0 %	25 %	50 %	392423406
39	NC_018066	AATC	2	8	12098	12105	50 %	25 %	0 %	25 %	392423406
40	NC_018066	TCTT	2	8	12256	12263	0 %	75 %	0 %	25 %	392423407
41	NC_018066	GGTC	2	8	12445	12452	0 %	25 %	50 %	25 %	392423407
42	NC_018066	GTAT	2	8	13828	13835	25 %	50 %	25 %	0 %	392423407
43	NC_018066	CTGT	2	8	14650	14657	0 %	50 %	25 %	25 %	392423407
44	NC_018066	CCAA	2	8	15231	15238	50 %	0 %	0 %	50 %	392423407
45	NC_018066	ATTT	2	8	15259	15266	25 %	75 %	0 %	0 %	392423407
46	NC_018066	TCAA	2	8	15356	15363	50 %	25 %	0 %	25 %	392423407
47	NC_018066	AATT	2	8	15404	15411	50 %	50 %	0 %	0 %	392423407
48	NC_018066	ACAA	2	8	15563	15570	75 %	0 %	0 %	25 %	392423407
49	NC_018066	TATT	2	8	15784	15791	25 %	75 %	0 %	0 %	392423407
50	NC_018066	GGAT	2	8	15986	15993	25 %	25 %	50 %	0 %	392423407
51	NC_018066	AGTA	2	8	16010	16017	50 %	25 %	25 %	0 %	392423407
52	NC_018066	CCAA	2	8	16327	16334	50 %	0 %	0 %	50 %	392423407
53	NC_018066	CAAA	2	8	16407	16414	75 %	0 %	0 %	25 %	392423407
54	NC_018066	AATC	2	8	16421	16428	50 %	25 %	0 %	25 %	392423407
55	NC_018066	GGAT	2	8	17010	17017	25 %	25 %	50 %	0 %	392423407
56	NC_018066	GGTT	2	8	17396	17403	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
57	NC_018066	AACC	2	8	17526	17533	50 %	0 %	0 %	50 %	392423407
58	NC_018066	TCAA	2	8	17534	17541	50 %	25 %	0 %	25 %	392423407
59	NC_018066	ATCT	2	8	17579	17586	25 %	50 %	0 %	25 %	392423407
60	NC_018066	TCCG	2	8	17714	17721	0 %	25 %	25 %	50 %	392423407
61	NC_018066	ATTA	2	8	18068	18075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018066	ATTT	2	8	18237	18244	25 %	75 %	0 %	0 %	392423408
63	NC_018066	ATTT	2	8	18444	18451	25 %	75 %	0 %	0 %	392423408
64	NC_018066	ATTT	2	8	19064	19071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018066	ACCA	2	8	19856	19863	50 %	0 %	0 %	50 %	392423410
66	NC_018066	TGAA	2	8	20009	20016	50 %	25 %	25 %	0 %	392423410
67	NC_018066	TTGC	2	8	20318	20325	0 %	50 %	25 %	25 %	392423410
68	NC_018066	AGCA	2	8	20341	20348	50 %	0 %	25 %	25 %	392423410
69	NC_018066	TTTA	2	8	20871	20878	25 %	75 %	0 %	0 %	392423411
70	NC_018066	ATGA	2	8	21203	21210	50 %	25 %	25 %	0 %	392423411
71	NC_018066	TTGT	2	8	21881	21888	0 %	75 %	25 %	0 %	392423412
72	NC_018066	TACT	2	8	22068	22075	25 %	50 %	0 %	25 %	392423413
73	NC_018066	TCGG	2	8	22804	22811	0 %	25 %	50 %	25 %	392423413
74	NC_018066	GTAT	2	8	22848	22855	25 %	50 %	25 %	0 %	392423413
75	NC_018066	ATTT	2	8	23050	23057	25 %	75 %	0 %	0 %	392423413
76	NC_018066	TGAG	2	8	23577	23584	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018066	GGGA	2	8	24432	24439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018066	TTCG	2	8	24505	24512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018066	TATT	2	8	24529	24536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018066	CAGG	2	8	24765	24772	25 %	0 %	50 %	25 %	392423417
81	NC_018066	CCGT	2	8	25025	25032	0 %	25 %	25 %	50 %	392423418
82	NC_018066	GTAA	2	8	25501	25508	50 %	25 %	25 %	0 %	392423418
83	NC_018066	TCTT	2	8	25677	25684	0 %	75 %	0 %	25 %	392423418
84	NC_018066	TTTG	2	8	26292	26299	0 %	75 %	25 %	0 %	392423419
85	NC_018066	CGTC	2	8	26339	26346	0 %	25 %	25 %	50 %	392423419
86	NC_018066	AATT	2	8	26419	26426	50 %	50 %	0 %	0 %	392423419
87	NC_018066	TTTG	2	8	26852	26859	0 %	75 %	25 %	0 %	392423419
88	NC_018066	ACAT	2	8	26993	27000	50 %	25 %	0 %	25 %	392423419
89	NC_018066	TTTA	2	8	27358	27365	25 %	75 %	0 %	0 %	392423420
90	NC_018066	CTTT	2	8	27435	27442	0 %	75 %	0 %	25 %	392423420
91	NC_018066	AGCA	2	8	27748	27755	50 %	0 %	25 %	25 %	392423420
92	NC_018066	TTAT	2	8	28471	28478	25 %	75 %	0 %	0 %	392423421
93	NC_018066	TAAT	2	8	28991	28998	50 %	50 %	0 %	0 %	392423422
94	NC_018066	TGAA	2	8	29048	29055	50 %	25 %	25 %	0 %	392423422
95	NC_018066	TATT	2	8	29166	29173	25 %	75 %	0 %	0 %	392423422
96	NC_018066	ATTT	2	8	29763	29770	25 %	75 %	0 %	0 %	392423423
97	NC_018066	TTAT	2	8	29852	29859	25 %	75 %	0 %	0 %	392423423
98	NC_018066	CTTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	392423423
99	NC_018066	ATTT	2	8	31213	31220	25 %	75 %	0 %	0 %	392423425
100	NC_018066	TCGT	2	8	31353	31360	0 %	50 %	25 %	25 %	392423425
101	NC_018066	AATG	2	8	31942	31949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018066	AATG	2	8	32043	32050	50 %	25 %	25 %	0 %	392423426
103	NC_018066	ATTC	2	8	32087	32094	25 %	50 %	0 %	25 %	392423426
104	NC_018066	TGCT	2	8	32443	32450	0 %	50 %	25 %	25 %	392423426
105	NC_018066	TTCC	2	8	32485	32492	0 %	50 %	0 %	50 %	392423426
106	NC_018066	TTTG	2	8	34082	34089	0 %	75 %	25 %	0 %	392423428
107	NC_018066	TCTG	2	8	34780	34787	0 %	50 %	25 %	25 %	392423429
108	NC_018066	CTAC	2	8	34834	34841	25 %	25 %	0 %	50 %	392423429
109	NC_018066	TCCT	2	8	35248	35255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018066	ATAG	2	8	35262	35269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018066	TTCG	2	8	36465	36472	0 %	50 %	25 %	25 %	392423430
112	NC_018066	TGCT	2	8	36705	36712	0 %	50 %	25 %	25 %	392423430
113	NC_018066	TGGT	2	8	37163	37170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018066	TCCT	2	8	37367	37374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018066	AAAG	2	8	37535	37542	75 %	0 %	25 %	0 %	392423432
116	NC_018066	GTTC	2	8	37849	37856	0 %	50 %	25 %	25 %	392423432
117	NC_018066	TGAG	2	8	38120	38127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018066	AGGA	2	8	38395	38402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018066	TTTG	2	8	38846	38853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018066	GCTT	2	8	39743	39750	0 %	50 %	25 %	25 %	392423434
121	NC_018066	GCTT	2	8	40007	40014	0 %	50 %	25 %	25 %	392423435
122	NC_018066	GAGC	2	8	40324	40331	25 %	0 %	50 %	25 %	392423435
123	NC_018066	GGAA	2	8	40515	40522	50 %	0 %	50 %	0 %	392423435
124	NC_018066	TAAG	2	8	40731	40738	50 %	25 %	25 %	0 %	392423435
125	NC_018066	ATGA	2	8	40785	40792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018066	GATC	2	8	41368	41375	25 %	25 %	25 %	25 %	392423436
127	NC_018066	TTTA	2	8	41434	41441	25 %	75 %	0 %	0 %	392423436
128	NC_018066	GAGT	2	8	41745	41752	25 %	25 %	50 %	0 %	392423437
129	NC_018066	AGTT	2	8	42034	42041	25 %	50 %	25 %	0 %	392423438
130	NC_018066	AAAG	2	8	42248	42255	75 %	0 %	25 %	0 %	392423439
131	NC_018066	AGTA	2	8	42880	42887	50 %	25 %	25 %	0 %	392423440
132	NC_018066	CCAT	2	8	43018	43025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018066	AATT	2	8	43236	43243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018066	AAAC	2	8	43684	43691	75 %	0 %	0 %	25 %	392423441
135	NC_018066	TAAT	2	8	44091	44098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018066	AAAG	2	8	44191	44198	75 %	0 %	25 %	0 %	392423442
137	NC_018066	TTAA	2	8	44356	44363	50 %	50 %	0 %	0 %	392423442
138	NC_018066	CATT	2	8	44673	44680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018066	GTTA	2	8	44985	44992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018066	AAAT	2	8	45093	45100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018066	ATGG	2	8	45253	45260	25 %	25 %	50 %	0 %	392423443
142	NC_018066	CATT	2	8	45923	45930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018066	AATG	2	8	45947	45954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018066	TTTA	2	8	45957	45964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018066	TAAA	2	8	46155	46162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018066	TTAT	2	8	46614	46621	25 %	75 %	0 %	0 %	392423446
147	NC_018066	TTGT	2	8	47243	47250	0 %	75 %	25 %	0 %	392423446
148	NC_018066	CATA	2	8	47393	47400	50 %	25 %	0 %	25 %	392423446
149	NC_018066	TAAT	2	8	47637	47644	50 %	50 %	0 %	0 %	392423446
150	NC_018066	TACC	2	8	47878	47885	25 %	25 %	0 %	50 %	392423446
151	NC_018066	AAGA	2	8	48217	48224	75 %	0 %	25 %	0 %	392423447
152	NC_018066	ATGA	2	8	48373	48380	50 %	25 %	25 %	0 %	392423448
153	NC_018066	CTGG	2	8	48492	48499	0 %	25 %	50 %	25 %	392423448
154	NC_018066	GAAA	2	8	49065	49072	75 %	0 %	25 %	0 %	392423449
155	NC_018066	TTTC	2	8	49196	49203	0 %	75 %	0 %	25 %	392423449
156	NC_018066	AAAG	2	8	49613	49620	75 %	0 %	25 %	0 %	392423450
157	NC_018066	CTTC	2	8	49758	49765	0 %	50 %	0 %	50 %	392423450
158	NC_018066	GTAT	2	8	50033	50040	25 %	50 %	25 %	0 %	392423450
159	NC_018066	AAAT	2	8	50212	50219	75 %	25 %	0 %	0 %	392423450
160	NC_018066	GAAA	2	8	50254	50261	75 %	0 %	25 %	0 %	392423450
161	NC_018066	TTTA	2	8	50759	50766	25 %	75 %	0 %	0 %	392423450
162	NC_018066	AGGG	2	8	51287	51294	25 %	0 %	75 %	0 %	392423451
163	NC_018066	ATCC	2	8	52103	52110	25 %	25 %	0 %	50 %	392423452
164	NC_018066	TAAA	2	8	52302	52309	75 %	25 %	0 %	0 %	392423452
165	NC_018066	ATCG	2	8	53151	53158	25 %	25 %	25 %	25 %	392423453
166	NC_018066	AGAA	2	8	53346	53353	75 %	0 %	25 %	0 %	392423453
167	NC_018066	GAAG	2	8	53748	53755	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
168	NC_018066	CAAG	2	8	55399	55406	50 %	0 %	25 %	25 %	392423453
169	NC_018066	GTAG	2	8	55407	55414	25 %	25 %	50 %	0 %	392423453
170	NC_018066	CAGT	2	8	55863	55870	25 %	25 %	25 %	25 %	392423454
171	NC_018066	TGAG	2	8	57067	57074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018066	TTCT	2	8	57375	57382	0 %	75 %	0 %	25 %	392423455
173	NC_018066	CATT	2	8	58104	58111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_018066	ATGT	2	8	58115	58122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018066	CATA	2	8	58156	58163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_018066	AAGC	2	8	58315	58322	50 %	0 %	25 %	25 %	392423456
177	NC_018066	ATTT	2	8	58618	58625	25 %	75 %	0 %	0 %	392423457
178	NC_018066	AAAT	2	8	58824	58831	75 %	25 %	0 %	0 %	392423457
179	NC_018066	TTTA	2	8	58980	58987	25 %	75 %	0 %	0 %	392423457
180	NC_018066	AGCT	2	8	59186	59193	25 %	25 %	25 %	25 %	392423457
181	NC_018066	TAAT	2	8	59714	59721	50 %	50 %	0 %	0 %	392423457
182	NC_018066	TCCA	2	8	60034	60041	25 %	25 %	0 %	50 %	392423458
183	NC_018066	GGAG	2	8	60064	60071	25 %	0 %	75 %	0 %	392423458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.