MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 27985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018001	ATT	2	6	240516	240521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938009
5002	NC_018001	TGA	2	6	240539	240544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938009
5003	NC_018001	ACA	2	6	240571	240576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938009
5004	NC_018001	CCT	2	6	240579	240584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938009
5005	NC_018001	GGA	2	6	240645	240650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938009
5006	NC_018001	AT	3	6	240684	240689	50 %	50 %	0 %	0 %	390938009
5007	NC_018001	AT	3	6	240762	240767	50 %	50 %	0 %	0 %	390938009
5008	NC_018001	GA	3	6	240886	240891	50 %	0 %	50 %	0 %	390938009
5009	NC_018001	GGA	2	6	240958	240963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938009
5010	NC_018001	GAATA	2	10	240999	241008	60 %	20 %	20 %	0 %	390938009
5011	NC_018001	GGC	2	6	241021	241026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390938009
5012	NC_018001	TAT	2	6	241037	241042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938009
5013	NC_018001	GAA	2	6	241054	241059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938009
5014	NC_018001	TTG	2	6	241165	241170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938010
5015	NC_018001	GTT	2	6	241178	241183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938010
5016	NC_018001	TTA	2	6	241297	241302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938010
5017	NC_018001	ACT	2	6	241333	241338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938010
5018	NC_018001	GAA	2	6	241344	241349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938010
5019	NC_018001	AT	3	6	241359	241364	50 %	50 %	0 %	0 %	390938010
5020	NC_018001	GGT	2	6	241377	241382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938010
5021	NC_018001	AAG	2	6	241398	241403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938010
5022	NC_018001	AT	3	6	241404	241409	50 %	50 %	0 %	0 %	390938010
5023	NC_018001	AATA	2	8	241502	241509	75 %	25 %	0 %	0 %	390938010
5024	NC_018001	GTC	2	6	241524	241529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938010
5025	NC_018001	ACA	2	6	241539	241544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938010
5026	NC_018001	ACT	2	6	241556	241561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938010
5027	NC_018001	AAG	2	6	241590	241595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938010
5028	NC_018001	GCG	2	6	241620	241625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390938010
5029	NC_018001	AGG	2	6	241633	241638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938010
5030	NC_018001	TAC	2	6	241663	241668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938010
5031	NC_018001	CAC	2	6	241692	241697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938010
5032	NC_018001	GCC	2	6	241743	241748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390938010
5033	NC_018001	CAA	2	6	241759	241764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938010
5034	NC_018001	TATGCA	2	12	241769	241780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390938010
5035	NC_018001	AAG	2	6	241812	241817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938010
5036	NC_018001	AGG	2	6	241848	241853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938010
5037	NC_018001	CCA	2	6	241891	241896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938010
5038	NC_018001	GTG	2	6	241936	241941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938010
5039	NC_018001	AT	3	6	241944	241949	50 %	50 %	0 %	0 %	390938010
5040	NC_018001	GTA	2	6	242317	242322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938011
5041	NC_018001	AGG	2	6	242387	242392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938011
5042	NC_018001	TAG	2	6	242433	242438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938011
5043	NC_018001	ATG	2	6	242483	242488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938011
5044	NC_018001	TC	3	6	242517	242522	0 %	50 %	0 %	50 %	390938011
5045	NC_018001	TAA	2	6	242561	242566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938011
5046	NC_018001	ATA	2	6	242609	242614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938012
5047	NC_018001	T	6	6	242615	242620	0 %	100 %	0 %	0 %	390938012
5048	NC_018001	TAT	2	6	242714	242719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938012
5049	NC_018001	TAG	2	6	242723	242728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938012
5050	NC_018001	ATCT	2	8	242759	242766	25 %	50 %	0 %	25 %	390938012
5051	NC_018001	TA	3	6	242785	242790	50 %	50 %	0 %	0 %	390938012
5052	NC_018001	AGCC	2	8	242823	242830	25 %	0 %	25 %	50 %	390938012
5053	NC_018001	ACC	2	6	242847	242852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938012
5054	NC_018001	CTC	2	6	242860	242865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938012
5055	NC_018001	CTA	2	6	242871	242876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938012
5056	NC_018001	TAT	2	6	242975	242980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938012
5057	NC_018001	TAC	2	6	243017	243022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938012
5058	NC_018001	TAT	2	6	243104	243109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938012
5059	NC_018001	GAA	2	6	243110	243115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938012
5060	NC_018001	AAT	2	6	243197	243202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938012
5061	NC_018001	ATT	2	6	243224	243229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938012
5062	NC_018001	GA	3	6	243249	243254	50 %	0 %	50 %	0 %	390938012
5063	NC_018001	TTTC	2	8	243292	243299	0 %	75 %	0 %	25 %	390938012
5064	NC_018001	AT	3	6	243324	243329	50 %	50 %	0 %	0 %	390938012
5065	NC_018001	AT	3	6	243356	243361	50 %	50 %	0 %	0 %	390938012
5066	NC_018001	TAT	2	6	243413	243418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938012
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5069	NC_018001	TA	3	6	243521	243526	50 %	50 %	0 %	0 %	390938012
5070	NC_018001	GT	3	6	243562	243567	0 %	50 %	50 %	0 %	390938012
5071	NC_018001	ATT	2	6	243570	243575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938012
5072	NC_018001	CTC	2	6	243629	243634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938012
5073	NC_018001	TA	3	6	243677	243682	50 %	50 %	0 %	0 %	390938012
5074	NC_018001	AGA	2	6	243702	243707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938012
5075	NC_018001	CTC	2	6	243725	243730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938012
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5077	NC_018001	TAC	2	6	243866	243871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938012
5078	NC_018001	CTC	3	9	243875	243883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938012
5079	NC_018001	TAG	2	6	243929	243934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938012
5080	NC_018001	AT	3	6	244064	244069	50 %	50 %	0 %	0 %	390938012
5081	NC_018001	ATT	2	6	244132	244137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018001	TAT	2	6	244158	244163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018001	ATT	2	6	244172	244177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_018001	TTAC	2	8	244183	244190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_018001	AAG	2	6	244214	244219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938013
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5087	NC_018001	CAT	2	6	244288	244293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938013
5088	NC_018001	GTA	2	6	244304	244309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938013
5089	NC_018001	GAT	2	6	244374	244379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938013
5090	NC_018001	CGA	2	6	244437	244442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390938013
5091	NC_018001	GAG	2	6	244480	244485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938013
5092	NC_018001	TTG	2	6	244511	244516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938013
5093	NC_018001	GCG	2	6	244544	244549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390938013
5094	NC_018001	TC	3	6	244551	244556	0 %	50 %	0 %	50 %	390938013
5095	NC_018001	GGA	2	6	244567	244572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938013
5096	NC_018001	AT	3	6	244620	244625	50 %	50 %	0 %	0 %	390938013
5097	NC_018001	GTTGGT	2	12	244641	244652	0 %	50 %	50 %	0 %	390938013
5098	NC_018001	GTT	2	6	244695	244700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938013
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5103	NC_018001	TAA	2	6	244866	244871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938013
5104	NC_018001	GAG	2	6	244876	244881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938013
5105	NC_018001	AT	3	6	244904	244909	50 %	50 %	0 %	0 %	390938013
5106	NC_018001	GGC	2	6	244965	244970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390938013
5107	NC_018001	TGG	2	6	245096	245101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938013
5108	NC_018001	TA	3	6	245153	245158	50 %	50 %	0 %	0 %	390938013
5109	NC_018001	GAT	2	6	245166	245171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938013
5110	NC_018001	ACA	2	6	245404	245409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938013
5111	NC_018001	ACT	2	6	245418	245423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938013
5112	NC_018001	ATT	2	6	245483	245488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938013
5113	NC_018001	CAA	2	6	245618	245623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938013
5114	NC_018001	GAA	2	6	245788	245793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938013
5115	NC_018001	AATT	2	8	245816	245823	50 %	50 %	0 %	0 %	390938013
5116	NC_018001	AAAT	2	8	245826	245833	75 %	25 %	0 %	0 %	390938013
5117	NC_018001	GATA	2	8	245843	245850	50 %	25 %	25 %	0 %	390938013
5118	NC_018001	CTG	2	6	245889	245894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938014
5119	NC_018001	TA	3	6	245920	245925	50 %	50 %	0 %	0 %	390938014
5120	NC_018001	AT	3	6	245971	245976	50 %	50 %	0 %	0 %	390938014
5121	NC_018001	TA	3	6	246129	246134	50 %	50 %	0 %	0 %	390938014
5122	NC_018001	GAG	2	6	246168	246173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938014
5123	NC_018001	AAT	2	6	246185	246190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938014
5124	NC_018001	ACC	2	6	246275	246280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938014
5125	NC_018001	TA	3	6	246396	246401	50 %	50 %	0 %	0 %	390938014
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5128	NC_018001	AT	3	6	246511	246516	50 %	50 %	0 %	0 %	390938014
5129	NC_018001	TGAT	2	8	246517	246524	25 %	50 %	25 %	0 %	390938014
5130	NC_018001	CGT	2	6	246548	246553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938014
5131	NC_018001	GA	3	6	246588	246593	50 %	0 %	50 %	0 %	390938014
5132	NC_018001	TAGAG	2	10	246620	246629	40 %	20 %	40 %	0 %	390938014
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5140	NC_018001	CCCTA	2	10	246904	246913	20 %	20 %	0 %	60 %	390938014
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5172	NC_018001	TAT	2	6	248759	248764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_018001	TAG	2	6	252187	252192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938020
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5367	NC_018001	CT	3	6	258345	258350	0 %	50 %	0 %	50 %	390938026
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5492	NC_018001	AT	3	6	263985	263990	50 %	50 %	0 %	0 %	390938032
5493	NC_018001	ATG	2	6	264044	264049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938032
5494	NC_018001	TAAA	2	8	264059	264066	75 %	25 %	0 %	0 %	390938032
5495	NC_018001	TATGA	2	10	264157	264166	40 %	40 %	20 %	0 %	390938032
5496	NC_018001	ATC	3	9	264173	264181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938032
5497	NC_018001	AAT	2	6	264183	264188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938032
5498	NC_018001	GGA	2	6	264198	264203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938032
5499	NC_018001	ATG	2	6	264250	264255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938032
5500	NC_018001	CAG	2	6	264260	264265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390938032

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